Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G27110.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:9538572-9540647 REVERSE LENGTH=2076 \| 201606
Sequence	ATGGAATCTTCAAAGTTGTTGTCTTTATTGCGAGAGTGTACCAATAGCACCAAGTCTCTA AGAAGAATCAAGCTTGTGCATCAGAGAATACTCACGTTGGGGTTACGAAGAGACGTAGTT TTATGCAAAAGTCTCATCAATGTCTACTTTACTTGTAAAGACCATTGCTCAGCGAGACAC GTCTTCGAGAACTTCGATATACGATCGGATGTTTACATATGGAACTCTTTAATGTCTGGT TATTCAAAGAACTCAATGTTTCATGACACTCTTGAGGTTTTCAAGAGGTTGTTGAATTGC TCAATTTGTGTCCCTGATTCGTTTACTTTTCCGAATGTGATTAAGGCTTATGGTGCGTTG GGTAGAGAGTTTCTTGGTAGGATGATTCATACTCTTGTGGTGAAGAGTGGGTATGTTTGT GATGTGGTTGTGGCGAGTTCTTTGGTTGGTATGTATGCAAAGTTTAACTTGTTTGAGAAT TCACTACAAGTGTTCGATGAAATGCCTGAGAGAGATGTAGCATCTTGGAACACGGTTATT TCGTGTTTTTATCAAAGTGGAGAGGCAGAGAAGGCTTTGGAGTTGTTTGGAAGAATGGAA AGTTCTGGCTTTGAACCAAATTCAGTTTCGTTGACGGTGGCTATATCGGCGTGTTCAAGG CTGTTGTGGTTGGAGAGAGGGAAGGAGATACATAGAAAATGTGTGAAGAAAGGGTTTGAG TTAGATGAGTATGTAAACTCTGCCCTTGTTGATATGTATGGGAAATGTGACTGCTTGGAG GTGGCTAGGGAGGTTTTTCAGAAAATGCCTAGAAAGAGTTTGGTTGCTTGGAATTCTATG ATCAAAGGTTATGTCGCTAAAGGAGACAGTAAGTCATGTGTTGAGATTTTGAATAGAATG ATCATAGAAGGAACTCGACCGAGTCAGACAACCTTGACCAGCATTTTGATGGCTTGCTCT CGCTCACGGAATCTCCTACATGGAAAATTTATACACGGTTATGTGATTAGAAGCGTTGTA AATGCAGATATCTATGTGAACTGTTCCTTGATTGATCTATACTTCAAGTGTGGTGAAGCA AATTTGGCTGAAACCGTCTTTTCAAAGACACAGAAGGACGTTGCTGAGTCATGGAATGTC ATGATTTCTAGTTATATCAGTGTAGGTAATTGGTTTAAGGCTGTTGAAGTGTATGACCAA ATGGTGAGTGTTGGAGTGAAGCCAGACGTGGTAACTTTCACAAGTGTTTTACCTGCTTGT TCGCAACTGGCTGCGTTAGAGAAAGGCAAACAGATTCATTTGTCCATTAGTGAGAGCAGG CTCGAAACAGACGAGTTGCTTTTGAGTGCGCTTCTTGACATGTATTCTAAATGCGGCAAT GAAAAAGAGGCTTTTAGGATTTTCAACAGTATACCAAAGAAGGATGTTGTATCATGGACG GTAATGATCTCTGCGTATGGATCTCATGGTCAACCCAGAGAAGCACTTTACCAGTTTGAT GAAATGCAGAAGTTTGGTCTAAAACCTGATGGGGTTACTCTTCTTGCTGTATTGTCAGCT TGTGGTCATGCTGGGCTAATTGATGAGGGTCTCAAATTTTTCAGTCAAATGAGATCAAAG TACGGAATCGAGCCTATTATTGAACATTACTCGTGCATGATTGACATTCTTGGCCGAGCA GGTCGGTTGCTTGAAGCTTATGAAATTATTCAACAAACACCAGAGACAAGTGACAATGCA GAGCTTCTCAGTACTCTCTTCTCTGCTTGTTGCTTGCACCTGGAACATTCATTGGGAGAT AGAATCGCAAGATTGCTTGTTGAGAATTATCCAGATGATGCATCAACCTACATGGTCTTG TTCAATTTGTATGCTTCTGGTGAGTCATGGGATGCAGCAAGACGAGTCAGATTAAAAATG AAAGAAATGGGATTGAGGAAGAAACCGGGCTGCAGTTGGATTGAGATGAGTGACAAAGTG TGCCATTTCTTTGCTGAGGACAGGTCTCATTTACGAGCTGAGAACGTTTATGAGTGTCTT GCTCTTTTGAGTGGTCACATGGAATCCGGTCAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G27110.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:9538572-9540647 REVERSE LENGTH=691 \| 201606
Sequence	MESSKLLSLLRECTNSTKSLRRIKLVHQRILTLGLRRDVVLCKSLINVYFTCKDHCSARH VFENFDIRSDVYIWNSLMSGYSKNSMFHDTLEVFKRLLNCSICVPDSFTFPNVIKAYGAL GREFLGRMIHTLVVKSGYVCDVVVASSLVGMYAKFNLFENSLQVFDEMPERDVASWNTVI SCFYQSGEAEKALELFGRMESSGFEPNSVSLTVAISACSRLLWLERGKEIHRKCVKKGFE LDEYVNSALVDMYGKCDCLEVAREVFQKMPRKSLVAWNSMIKGYVAKGDSKSCVEILNRM IIEGTRPSQTTLTSILMACSRSRNLLHGKFIHGYVIRSVVNADIYVNCSLIDLYFKCGEA NLAETVFSKTQKDVAESWNVMISSYISVGNWFKAVEVYDQMVSVGVKPDVVTFTSVLPAC SQLAALEKGKQIHLSISESRLETDELLLSALLDMYSKCGNEKEAFRIFNSIPKKDVVSWT VMISAYGSHGQPREALYQFDEMQKFGLKPDGVTLLAVLSACGHAGLIDEGLKFFSQMRSK YGIEPIIEHYSCMIDILGRAGRLLEAYEIIQQTPETSDNAELLSTLFSACCLHLEHSLGD RIARLLVENYPDDASTYMVLFNLYASGESWDAARRVRLKMKEMGLRKKPGCSWIEMSDKV CHFFAEDRSHLRAENVYECLALLSGHMESGQ

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G27110.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:9538572-9540666 REVERSE LENGTH=2095 \| 201606
Sequence	AAAAAAATGTGAACTTGAAATGGAATCTTCAAAGTTGTTGTCTTTATTGCGAGAGTGTAC CAATAGCACCAAGTCTCTAAGAAGAATCAAGCTTGTGCATCAGAGAATACTCACGTTGGG GTTACGAAGAGACGTAGTTTTATGCAAAAGTCTCATCAATGTCTACTTTACTTGTAAAGA CCATTGCTCAGCGAGACACGTCTTCGAGAACTTCGATATACGATCGGATGTTTACATATG GAACTCTTTAATGTCTGGTTATTCAAAGAACTCAATGTTTCATGACACTCTTGAGGTTTT CAAGAGGTTGTTGAATTGCTCAATTTGTGTCCCTGATTCGTTTACTTTTCCGAATGTGAT TAAGGCTTATGGTGCGTTGGGTAGAGAGTTTCTTGGTAGGATGATTCATACTCTTGTGGT GAAGAGTGGGTATGTTTGTGATGTGGTTGTGGCGAGTTCTTTGGTTGGTATGTATGCAAA GTTTAACTTGTTTGAGAATTCACTACAAGTGTTCGATGAAATGCCTGAGAGAGATGTAGC ATCTTGGAACACGGTTATTTCGTGTTTTTATCAAAGTGGAGAGGCAGAGAAGGCTTTGGA GTTGTTTGGAAGAATGGAAAGTTCTGGCTTTGAACCAAATTCAGTTTCGTTGACGGTGGC TATATCGGCGTGTTCAAGGCTGTTGTGGTTGGAGAGAGGGAAGGAGATACATAGAAAATG TGTGAAGAAAGGGTTTGAGTTAGATGAGTATGTAAACTCTGCCCTTGTTGATATGTATGG GAAATGTGACTGCTTGGAGGTGGCTAGGGAGGTTTTTCAGAAAATGCCTAGAAAGAGTTT GGTTGCTTGGAATTCTATGATCAAAGGTTATGTCGCTAAAGGAGACAGTAAGTCATGTGT TGAGATTTTGAATAGAATGATCATAGAAGGAACTCGACCGAGTCAGACAACCTTGACCAG CATTTTGATGGCTTGCTCTCGCTCACGGAATCTCCTACATGGAAAATTTATACACGGTTA TGTGATTAGAAGCGTTGTAAATGCAGATATCTATGTGAACTGTTCCTTGATTGATCTATA CTTCAAGTGTGGTGAAGCAAATTTGGCTGAAACCGTCTTTTCAAAGACACAGAAGGACGT TGCTGAGTCATGGAATGTCATGATTTCTAGTTATATCAGTGTAGGTAATTGGTTTAAGGC TGTTGAAGTGTATGACCAAATGGTGAGTGTTGGAGTGAAGCCAGACGTGGTAACTTTCAC AAGTGTTTTACCTGCTTGTTCGCAACTGGCTGCGTTAGAGAAAGGCAAACAGATTCATTT GTCCATTAGTGAGAGCAGGCTCGAAACAGACGAGTTGCTTTTGAGTGCGCTTCTTGACAT GTATTCTAAATGCGGCAATGAAAAAGAGGCTTTTAGGATTTTCAACAGTATACCAAAGAA GGATGTTGTATCATGGACGGTAATGATCTCTGCGTATGGATCTCATGGTCAACCCAGAGA AGCACTTTACCAGTTTGATGAAATGCAGAAGTTTGGTCTAAAACCTGATGGGGTTACTCT TCTTGCTGTATTGTCAGCTTGTGGTCATGCTGGGCTAATTGATGAGGGTCTCAAATTTTT CAGTCAAATGAGATCAAAGTACGGAATCGAGCCTATTATTGAACATTACTCGTGCATGAT TGACATTCTTGGCCGAGCAGGTCGGTTGCTTGAAGCTTATGAAATTATTCAACAAACACC AGAGACAAGTGACAATGCAGAGCTTCTCAGTACTCTCTTCTCTGCTTGTTGCTTGCACCT GGAACATTCATTGGGAGATAGAATCGCAAGATTGCTTGTTGAGAATTATCCAGATGATGC ATCAACCTACATGGTCTTGTTCAATTTGTATGCTTCTGGTGAGTCATGGGATGCAGCAAG ACGAGTCAGATTAAAAATGAAAGAAATGGGATTGAGGAAGAAACCGGGCTGCAGTTGGAT TGAGATGAGTGACAAAGTGTGCCATTTCTTTGCTGAGGACAGGTCTCATTTACGAGCTGA GAACGTTTATGAGTGTCTTGCTCTTTTGAGTGGTCACATGGAATCCGGTCAATGA