Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G17250.1
CDS Infomation	\| Alkaline-phosphatase-like family protein \| Chr5:5668993-5673516 REVERSE LENGTH=2841 \| 201606
Sequence	ATGGAGACATATCTGAAGAACAAGAAGTTGACAGCTTTAGGATTTCTCTTGATTCACGCC ATCGCCATTTTGATCTTCACGCGTGGGTTTCTTCTCACGCGAACAGAGCTTCCTTTCCAC AGTACTTGCTCCGACGTTTCTCTCTCTCCTTGCCTTGCTTCTCCACGCTCCAATCACGAT TCAAGCTCGGGTCAATCTAATCAGACTCAGCCGAAATGTTGGACCAAACCAGTTGTTGAT CGTGTCATCATAATTGTCTTAGATGCACTCAGAATCGATTTTGTTGCCCCGAGTGCTTTT TTCCCAGAACCAAAGCCATGGATGGATAAATTAACAATCTTGCAGACGCTTGCATTTGCT AATGATTCATCTGCTAAGATCTTTAAGGCTTTTGCTGATCCTCCTACAACTAGTTTACAG CGTCTCAAGGGATTAACAACTGGAGGATTGCCTACTTTTATTGATATTGGGAATAGTTTC GGTGCTCCTGCTATTGTTGAGGATAACTTCATTAATCAGTTAGTGCTAAATGGGAAACGG TTGGTGATGATGGGTGATGATACTTGGACACAGTTGTTCCCAAATCAATTTCAAAAGTCA TATCCTTTCCCCTCTTTCAATGTTAAAGACCTGGATACTGTTGACAATGGATGCATTGAG CACCTATTCCCAACCCTTTTCAAAGATGATTGGGATGTTCTAATTGCGCATTTTCTCGGC GTGGACCATGCAGGACACATATTTGGAGTGGATTCCAGCCCAATGATTAATAAGTTGGAG CAATATAATTCAGTTTTAGAGAAAGTCATCAATATATTGGAGAGCCAGGCGGGACCAGGT GGTTTGCATGAGAATACTATGCTTATAGTAATGGGTGACCATGGGCAGACATTAAATGGG GATCATGGCGGAGGGACTGCAGAAGAGGTAGAAACAACCATGTTTGCCATGAGTACAAAG AAGCACACAACTTTGGTTCCTCCTGAGTTCGATACCTCATCTTGTAAACAAAACAAGGAC GGGAAGCAGATGTGTATCAGCTACATTGAGCAGCTTGATTTTGCAGCAACATTGTCAGCT TTGCTTGGGATATCCTTTCCTTTCGGAAGCATTGGGCATGTCAACCCTGAGCTATATGCC CTTGGTTCCAGTAGCTGGAATTTGGATAAGTCAGATTTGGGCAATTTTGGCACCCAATCG GCTGCTAACGAGTGGATGAAACATTACGTTGATGTACTTTGTGTGAATGCTTGGCAGGTG AAAAGATATATAGATGTGTATTCTAATTCATCGGTTGTTGGTTTCTCTTCCGATGATATG TCAAGGATATCAGATCTCTATTCTGCAGCAGAACAGAATTGGTCCAATTCTGTCAAACAC ATATTGATGGATAGAAATGGAGATGACGGCAGTACAGATATATCTGCCCTTCTTAAAGAG CAAATTGCTGAATATTTGAATTTCTTCTCAAGCGTTGTTGAACTTGCCCGGTCTAAGTGG ACAGAGTTCAATCTGAATCTAATGATTACTGGGTTTGGGATATTGGTTATATCACTCATC CTTCAGTTTCTTGCTGTTTTCCATGGCGACAAATCTTATGCAGTGGGTTCTTGGTTATCC ACTGGTGCAGCTTTCACTCTCTTTATAGTAACGATTCGAGCTTGCAGCTTTCTTTCAAAT AGCTATATCTTGGAAGAAGGAAAAGTTGCAAACTTTCTCCTGGCAACAACTGGACTTATC AAGCTGCGGTACTCTGTTATGAGAAAAACAATGCGGAAAGAAGCTTTTATGTTTCTTGCT ATGGTTTTTGTTCTCAGAGTTTCTATAGATATTGGGCTAACAAAGCAAGCTGCAACTTCT CAGTTTATGAGTAGCTCACCATCGTGGATGCTAGGGATAGCTCCAGACCATCCAGCATTG ACATATGCGATTGAAATTGCACCAATTCTGTCAGTGGTTATACTCATTTGCGTGCTCTAC GTAGCCATTGCGAAAGCACCCAATGAGGGGGTGTGGAAGTATGTTACTGTTGGTAGTATG GTAAGCTACTTTTTCATAGCATTGCTTTGGGCTTCGGAGAGCAAGATATTTGGTTTGGAT CAGTTGCTTCAAGTGACGGGAGGAAGAAACCGCATTCCTCAAACGGTTTATGTAATTGGA TTGGTGCAGCTCTGCCTTTTAGCTTCTGCACGTATGTTTTGCACAGAAAAAGACAAGAAT TGGGCCATCAGAACTGTCGCTCTTGTATCTGCTTGTAGTTCGCCAATAATTCTATTGTCG GGGAAGCAAGGATCAATGCTTGCATTAGTATATTTAGTGGCTGGCTATTGTATAATGAGG CTGGAGGGTGTAGAGAGAAGAACCAAATCAGATGGACAGAGCAAATTCTCAAAACTAAAT CCTCTCTGTGTGGTGCAATGGAGTCTTCTTTCTATATGCATGTTCTTCGCCAGCGGGCAT TGGTGCGCCTTTGATGGCCTTCGTTATGGAGCTGCATTTGTGGGGTTTGATGAGTTTGTG CTTATACGACAAGCCATTCTTTTGACAATCGAGACATTTGGATTCTCGATCATCCTTTCT GTATTTGGACTTCCTCTCCTCATACCTTTTCACTCTCAAACTCCTCAGGCTCATGGCGAA AAGCGCCACCAGTTGTTTCAAATGTATATGCTCTTTGGAGTTATATCTGCAACCACAGTC ACAGCTACAATTCTCTGCGTCACCATCCAGAGAAGACATCTGATGGTTTGGGGTTTGTTT GCTCCAAAGTTCGTCTTTGACGTTGTTGATCTCATCCTTACTGATCTCCTCATCTGTTTG GCTTCAGCTTACTATCTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G17250.1
PEP Infomation	\| Alkaline-phosphatase-like family protein \| Chr5:5668993-5673516 REVERSE LENGTH=946 \| 201606
Sequence	METYLKNKKLTALGFLLIHAIAILIFTRGFLLTRTELPFHSTCSDVSLSPCLASPRSNHD SSSGQSNQTQPKCWTKPVVDRVIIIVLDALRIDFVAPSAFFPEPKPWMDKLTILQTLAFA NDSSAKIFKAFADPPTTSLQRLKGLTTGGLPTFIDIGNSFGAPAIVEDNFINQLVLNGKR LVMMGDDTWTQLFPNQFQKSYPFPSFNVKDLDTVDNGCIEHLFPTLFKDDWDVLIAHFLG VDHAGHIFGVDSSPMINKLEQYNSVLEKVINILESQAGPGGLHENTMLIVMGDHGQTLNG DHGGGTAEEVETTMFAMSTKKHTTLVPPEFDTSSCKQNKDGKQMCISYIEQLDFAATLSA LLGISFPFGSIGHVNPELYALGSSSWNLDKSDLGNFGTQSAANEWMKHYVDVLCVNAWQV KRYIDVYSNSSVVGFSSDDMSRISDLYSAAEQNWSNSVKHILMDRNGDDGSTDISALLKE QIAEYLNFFSSVVELARSKWTEFNLNLMITGFGILVISLILQFLAVFHGDKSYAVGSWLS TGAAFTLFIVTIRACSFLSNSYILEEGKVANFLLATTGLIKLRYSVMRKTMRKEAFMFLA MVFVLRVSIDIGLTKQAATSQFMSSSPSWMLGIAPDHPALTYAIEIAPILSVVILICVLY VAIAKAPNEGVWKYVTVGSMVSYFFIALLWASESKIFGLDQLLQVTGGRNRIPQTVYVIG LVQLCLLASARMFCTEKDKNWAIRTVALVSACSSPIILLSGKQGSMLALVYLVAGYCIMR LEGVERRTKSDGQSKFSKLNPLCVVQWSLLSICMFFASGHWCAFDGLRYGAAFVGFDEFV LIRQAILLTIETFGFSIILSVFGLPLLIPFHSQTPQAHGEKRHQLFQMYMLFGVISATTV TATILCVTIQRRHLMVWGLFAPKFVFDVVDLILTDLLICLASAYYL

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G17250.1
Transcript Infomation	\| Alkaline-phosphatase-like family protein \| Chr5:5668993-5673656 REVERSE LENGTH=2981 \| 201606
Sequence	ACACTTACAATGATAAGTTATACGACGTCGTTTTCCATTCACGTCTTCATCACCTTCAAT AGTTTATTTTGCCGCGGTCAGTAGCCCGTCACGGCGAAATCTACTTATCGGAAATACGAC CGGAGAATTTTGATCCGGAGATGGAGACATATCTGAAGAACAAGAAGTTGACAGCTTTAG GATTTCTCTTGATTCACGCCATCGCCATTTTGATCTTCACGCGTGGGTTTCTTCTCACGC GAACAGAGCTTCCTTTCCACAGTACTTGCTCCGACGTTTCTCTCTCTCCTTGCCTTGCTT CTCCACGCTCCAATCACGATTCAAGCTCGGGTCAATCTAATCAGACTCAGCCGAAATGTT GGACCAAACCAGTTGTTGATCGTGTCATCATAATTGTCTTAGATGCACTCAGAATCGATT TTGTTGCCCCGAGTGCTTTTTTCCCAGAACCAAAGCCATGGATGGATAAATTAACAATCT TGCAGACGCTTGCATTTGCTAATGATTCATCTGCTAAGATCTTTAAGGCTTTTGCTGATC CTCCTACAACTAGTTTACAGCGTCTCAAGGGATTAACAACTGGAGGATTGCCTACTTTTA TTGATATTGGGAATAGTTTCGGTGCTCCTGCTATTGTTGAGGATAACTTCATTAATCAGT TAGTGCTAAATGGGAAACGGTTGGTGATGATGGGTGATGATACTTGGACACAGTTGTTCC CAAATCAATTTCAAAAGTCATATCCTTTCCCCTCTTTCAATGTTAAAGACCTGGATACTG TTGACAATGGATGCATTGAGCACCTATTCCCAACCCTTTTCAAAGATGATTGGGATGTTC TAATTGCGCATTTTCTCGGCGTGGACCATGCAGGACACATATTTGGAGTGGATTCCAGCC CAATGATTAATAAGTTGGAGCAATATAATTCAGTTTTAGAGAAAGTCATCAATATATTGG AGAGCCAGGCGGGACCAGGTGGTTTGCATGAGAATACTATGCTTATAGTAATGGGTGACC ATGGGCAGACATTAAATGGGGATCATGGCGGAGGGACTGCAGAAGAGGTAGAAACAACCA TGTTTGCCATGAGTACAAAGAAGCACACAACTTTGGTTCCTCCTGAGTTCGATACCTCAT CTTGTAAACAAAACAAGGACGGGAAGCAGATGTGTATCAGCTACATTGAGCAGCTTGATT TTGCAGCAACATTGTCAGCTTTGCTTGGGATATCCTTTCCTTTCGGAAGCATTGGGCATG TCAACCCTGAGCTATATGCCCTTGGTTCCAGTAGCTGGAATTTGGATAAGTCAGATTTGG GCAATTTTGGCACCCAATCGGCTGCTAACGAGTGGATGAAACATTACGTTGATGTACTTT GTGTGAATGCTTGGCAGGTGAAAAGATATATAGATGTGTATTCTAATTCATCGGTTGTTG GTTTCTCTTCCGATGATATGTCAAGGATATCAGATCTCTATTCTGCAGCAGAACAGAATT GGTCCAATTCTGTCAAACACATATTGATGGATAGAAATGGAGATGACGGCAGTACAGATA TATCTGCCCTTCTTAAAGAGCAAATTGCTGAATATTTGAATTTCTTCTCAAGCGTTGTTG AACTTGCCCGGTCTAAGTGGACAGAGTTCAATCTGAATCTAATGATTACTGGGTTTGGGA TATTGGTTATATCACTCATCCTTCAGTTTCTTGCTGTTTTCCATGGCGACAAATCTTATG CAGTGGGTTCTTGGTTATCCACTGGTGCAGCTTTCACTCTCTTTATAGTAACGATTCGAG CTTGCAGCTTTCTTTCAAATAGCTATATCTTGGAAGAAGGAAAAGTTGCAAACTTTCTCC TGGCAACAACTGGACTTATCAAGCTGCGGTACTCTGTTATGAGAAAAACAATGCGGAAAG AAGCTTTTATGTTTCTTGCTATGGTTTTTGTTCTCAGAGTTTCTATAGATATTGGGCTAA CAAAGCAAGCTGCAACTTCTCAGTTTATGAGTAGCTCACCATCGTGGATGCTAGGGATAG CTCCAGACCATCCAGCATTGACATATGCGATTGAAATTGCACCAATTCTGTCAGTGGTTA TACTCATTTGCGTGCTCTACGTAGCCATTGCGAAAGCACCCAATGAGGGGGTGTGGAAGT ATGTTACTGTTGGTAGTATGGTAAGCTACTTTTTCATAGCATTGCTTTGGGCTTCGGAGA GCAAGATATTTGGTTTGGATCAGTTGCTTCAAGTGACGGGAGGAAGAAACCGCATTCCTC AAACGGTTTATGTAATTGGATTGGTGCAGCTCTGCCTTTTAGCTTCTGCACGTATGTTTT GCACAGAAAAAGACAAGAATTGGGCCATCAGAACTGTCGCTCTTGTATCTGCTTGTAGTT CGCCAATAATTCTATTGTCGGGGAAGCAAGGATCAATGCTTGCATTAGTATATTTAGTGG CTGGCTATTGTATAATGAGGCTGGAGGGTGTAGAGAGAAGAACCAAATCAGATGGACAGA GCAAATTCTCAAAACTAAATCCTCTCTGTGTGGTGCAATGGAGTCTTCTTTCTATATGCA TGTTCTTCGCCAGCGGGCATTGGTGCGCCTTTGATGGCCTTCGTTATGGAGCTGCATTTG TGGGGTTTGATGAGTTTGTGCTTATACGACAAGCCATTCTTTTGACAATCGAGACATTTG GATTCTCGATCATCCTTTCTGTATTTGGACTTCCTCTCCTCATACCTTTTCACTCTCAAA CTCCTCAGGCTCATGGCGAAAAGCGCCACCAGTTGTTTCAAATGTATATGCTCTTTGGAG TTATATCTGCAACCACAGTCACAGCTACAATTCTCTGCGTCACCATCCAGAGAAGACATC TGATGGTTTGGGGTTTGTTTGCTCCAAAGTTCGTCTTTGACGTTGTTGATCTCATCCTTA CTGATCTCCTCATCTGTTTGGCTTCAGCTTACTATCTTTGA