Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G16860.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:5543834-5546386 FORWARD LENGTH=2553 \| 201606
Sequence	ATGATCCGCCGCCTTCTCATCCCCAACGCCGCCGCAAAATCTCACCAGTACATTAAAGTC TCTCTCTTCTCGACATCGGCGCCGGAGATAACACCGCCGTTTATTCACAAATGCAAAACC ATCTCTCAGGTCAAGCTTATTCACCAGAAACTCCTCTCTTTCGGAATCCTAACCTTGAAT CTCACTTCCCACCTCATTTCCACCTATATCTCCGTCGGTTGCTTATCTCATGCCGTATCT CTCCTCCGTCGTTTTCCTCCATCTGACGCTGGTGTCTACCATTGGAATTCACTCATTCGC AGCTACGGCGACAATGGCTGCGCCAATAAATGTCTCTATTTGTTCGGCCTTATGCATTCT CTGTCATGGACGCCGGATAATTACACATTCCCCTTCGTCTTCAAGGCTTGCGGCGAGATA TCCTCCGTTCGTTGTGGAGAATCTGCTCACGCGCTTTCTCTGGTAACTGGATTTATCTCC AATGTCTTTGTTGGGAATGCGCTTGTTGCTATGTATTCCCGTTGTCGTTCATTGAGTGAT GCACGGAAGGTGTTCGACGAAATGTCTGTTTGGGATGTTGTATCGTGGAACTCTATAATA GAAAGTTATGCAAAGTTAGGCAAACCTAAGGTGGCGCTTGAAATGTTTAGCAGGATGACC AATGAATTCGGATGTAGACCTGATAATATTACCCTTGTGAATGTTCTTCCTCCTTGTGCT TCCCTAGGAACTCATTCACTAGGGAAGCAATTGCATTGTTTTGCAGTCACAAGTGAGATG ATACAGAATATGTTTGTAGGGAATTGCTTGGTGGATATGTATGCAAAGTGTGGGATGATG GATGAGGCAAACACGGTGTTTTCGAACATGTCAGTGAAGGACGTAGTATCTTGGAATGCT ATGGTTGCTGGGTATTCACAGATTGGAAGGTTTGAAGATGCTGTTAGGTTATTTGAGAAG ATGCAGGAAGAGAAAATAAAAATGGATGTTGTTACTTGGAGTGCTGCTATTTCAGGGTAT GCTCAACGGGGACTTGGATATGAAGCTTTGGGTGTGTGTAGGCAGATGTTGTCTTCTGGG ATAAAACCAAATGAAGTCACGCTTATTTCGGTTCTTTCGGGTTGTGCTTCTGTTGGAGCA TTGATGCATGGTAAAGAGATTCATTGTTATGCCATCAAATATCCCATAGACTTGCGTAAG AACGGTCATGGTGATGAGAATATGGTAATCAATCAACTGATTGACATGTACGCTAAGTGC AAAAAGGTTGATACTGCACGTGCTATGTTTGATTCACTTTCCCCCAAGGAAAGGGATGTT GTGACTTGGACTGTGATGATAGGTGGATACTCCCAGCACGGGGATGCAAATAAAGCTCTC GAACTTTTATCTGAGATGTTTGAGGAAGATTGCCAAACAAGACCAAATGCTTTTACCATA TCATGTGCCCTCGTGGCATGTGCCAGTTTGGCTGCACTAAGAATTGGCAAGCAGATTCAT GCTTATGCGTTGCGCAACCAGCAGAATGCAGTACCGCTGTTCGTATCAAACTGTCTAATA GACATGTATGCAAAATGTGGAAGCATCAGTGATGCCCGCCTTGTATTTGACAATATGATG GCGAAAAATGAAGTTACTTGGACATCTCTAATGACGGGTTATGGTATGCATGGTTATGGA GAAGAAGCTCTTGGAATCTTTGATGAAATGAGGAGAATAGGTTTTAAGCTTGATGGTGTT ACATTACTTGTTGTATTATATGCTTGTAGTCATTCAGGAATGATTGATCAGGGCATGGAG TATTTCAATAGAATGAAAACTGTTTTTGGGGTTAGTCCTGGTCCGGAGCATTATGCATGT TTGGTTGACTTGTTAGGTCGTGCTGGCCGGTTGAATGCAGCTTTGCGTCTCATTGAAGAA ATGCCAATGGAGCCTCCTCCTGTGGTATGGGTTGCTTTTCTCAGTTGCTGCAGAATCCAC GGAAAAGTTGAACTCGGGGAGTACGCTGCGGAAAAAATAACAGAATTAGCATCTAATCAT GATGGATCATATACATTACTCTCAAATTTGTATGCAAATGCAGGGCGTTGGAAAGATGTG ACTAGGATCAGATCATTGATGAGACATAAAGGAGTTAAGAAAAGACCTGGTTGTAGTTGG GTTGAAGGAATTAAAGGAACTACTACGTTCTTCGTGGGTGATAAAACTCATCCACACGCT AAGGAAATATACCAGGTCCTCTTAGATCACATGCAACGCATCAAGGACATTGGTTATGTT CCTGAAACAGGCTTTGCTCTTCATGATGTAGACGATGAAGAGAAAGATGATCTTCTTTTC GAGCATAGTGAGAAGTTAGCTCTTGCATATGGTATTCTAACAACTCCGCAAGGTGCTGCT ATCAGGATTACTAAGAATTTACGGGTATGTGGTGATTGCCATACAGCATTCACATACATG TCCAGAATCATTGATCATGATATTATATTGAGGGACTCAAGTCGCTTCCATCATTTCAAA AATGGATCGTGTTCATGCAAAGGTTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G16860.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:5543834-5546386 FORWARD LENGTH=850 \| 201606
Sequence	MIRRLLIPNAAAKSHQYIKVSLFSTSAPEITPPFIHKCKTISQVKLIHQKLLSFGILTLN LTSHLISTYISVGCLSHAVSLLRRFPPSDAGVYHWNSLIRSYGDNGCANKCLYLFGLMHS LSWTPDNYTFPFVFKACGEISSVRCGESAHALSLVTGFISNVFVGNALVAMYSRCRSLSD ARKVFDEMSVWDVVSWNSIIESYAKLGKPKVALEMFSRMTNEFGCRPDNITLVNVLPPCA SLGTHSLGKQLHCFAVTSEMIQNMFVGNCLVDMYAKCGMMDEANTVFSNMSVKDVVSWNA MVAGYSQIGRFEDAVRLFEKMQEEKIKMDVVTWSAAISGYAQRGLGYEALGVCRQMLSSG IKPNEVTLISVLSGCASVGALMHGKEIHCYAIKYPIDLRKNGHGDENMVINQLIDMYAKC KKVDTARAMFDSLSPKERDVVTWTVMIGGYSQHGDANKALELLSEMFEEDCQTRPNAFTI SCALVACASLAALRIGKQIHAYALRNQQNAVPLFVSNCLIDMYAKCGSISDARLVFDNMM AKNEVTWTSLMTGYGMHGYGEEALGIFDEMRRIGFKLDGVTLLVVLYACSHSGMIDQGME YFNRMKTVFGVSPGPEHYACLVDLLGRAGRLNAALRLIEEMPMEPPPVVWVAFLSCCRIH GKVELGEYAAEKITELASNHDGSYTLLSNLYANAGRWKDVTRIRSLMRHKGVKKRPGCSW VEGIKGTTTFFVGDKTHPHAKEIYQVLLDHMQRIKDIGYVPETGFALHDVDDEEKDDLLF EHSEKLALAYGILTTPQGAAIRITKNLRVCGDCHTAFTYMSRIIDHDIILRDSSRFHHFK NGSCSCKGYW

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G16860.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:5543834-5546537 FORWARD LENGTH=2704 \| 201606
Sequence	ATGATCCGCCGCCTTCTCATCCCCAACGCCGCCGCAAAATCTCACCAGTACATTAAAGTC TCTCTCTTCTCGACATCGGCGCCGGAGATAACACCGCCGTTTATTCACAAATGCAAAACC ATCTCTCAGGTCAAGCTTATTCACCAGAAACTCCTCTCTTTCGGAATCCTAACCTTGAAT CTCACTTCCCACCTCATTTCCACCTATATCTCCGTCGGTTGCTTATCTCATGCCGTATCT CTCCTCCGTCGTTTTCCTCCATCTGACGCTGGTGTCTACCATTGGAATTCACTCATTCGC AGCTACGGCGACAATGGCTGCGCCAATAAATGTCTCTATTTGTTCGGCCTTATGCATTCT CTGTCATGGACGCCGGATAATTACACATTCCCCTTCGTCTTCAAGGCTTGCGGCGAGATA TCCTCCGTTCGTTGTGGAGAATCTGCTCACGCGCTTTCTCTGGTAACTGGATTTATCTCC AATGTCTTTGTTGGGAATGCGCTTGTTGCTATGTATTCCCGTTGTCGTTCATTGAGTGAT GCACGGAAGGTGTTCGACGAAATGTCTGTTTGGGATGTTGTATCGTGGAACTCTATAATA GAAAGTTATGCAAAGTTAGGCAAACCTAAGGTGGCGCTTGAAATGTTTAGCAGGATGACC AATGAATTCGGATGTAGACCTGATAATATTACCCTTGTGAATGTTCTTCCTCCTTGTGCT TCCCTAGGAACTCATTCACTAGGGAAGCAATTGCATTGTTTTGCAGTCACAAGTGAGATG ATACAGAATATGTTTGTAGGGAATTGCTTGGTGGATATGTATGCAAAGTGTGGGATGATG GATGAGGCAAACACGGTGTTTTCGAACATGTCAGTGAAGGACGTAGTATCTTGGAATGCT ATGGTTGCTGGGTATTCACAGATTGGAAGGTTTGAAGATGCTGTTAGGTTATTTGAGAAG ATGCAGGAAGAGAAAATAAAAATGGATGTTGTTACTTGGAGTGCTGCTATTTCAGGGTAT GCTCAACGGGGACTTGGATATGAAGCTTTGGGTGTGTGTAGGCAGATGTTGTCTTCTGGG ATAAAACCAAATGAAGTCACGCTTATTTCGGTTCTTTCGGGTTGTGCTTCTGTTGGAGCA TTGATGCATGGTAAAGAGATTCATTGTTATGCCATCAAATATCCCATAGACTTGCGTAAG AACGGTCATGGTGATGAGAATATGGTAATCAATCAACTGATTGACATGTACGCTAAGTGC AAAAAGGTTGATACTGCACGTGCTATGTTTGATTCACTTTCCCCCAAGGAAAGGGATGTT GTGACTTGGACTGTGATGATAGGTGGATACTCCCAGCACGGGGATGCAAATAAAGCTCTC GAACTTTTATCTGAGATGTTTGAGGAAGATTGCCAAACAAGACCAAATGCTTTTACCATA TCATGTGCCCTCGTGGCATGTGCCAGTTTGGCTGCACTAAGAATTGGCAAGCAGATTCAT GCTTATGCGTTGCGCAACCAGCAGAATGCAGTACCGCTGTTCGTATCAAACTGTCTAATA GACATGTATGCAAAATGTGGAAGCATCAGTGATGCCCGCCTTGTATTTGACAATATGATG GCGAAAAATGAAGTTACTTGGACATCTCTAATGACGGGTTATGGTATGCATGGTTATGGA GAAGAAGCTCTTGGAATCTTTGATGAAATGAGGAGAATAGGTTTTAAGCTTGATGGTGTT ACATTACTTGTTGTATTATATGCTTGTAGTCATTCAGGAATGATTGATCAGGGCATGGAG TATTTCAATAGAATGAAAACTGTTTTTGGGGTTAGTCCTGGTCCGGAGCATTATGCATGT TTGGTTGACTTGTTAGGTCGTGCTGGCCGGTTGAATGCAGCTTTGCGTCTCATTGAAGAA ATGCCAATGGAGCCTCCTCCTGTGGTATGGGTTGCTTTTCTCAGTTGCTGCAGAATCCAC GGAAAAGTTGAACTCGGGGAGTACGCTGCGGAAAAAATAACAGAATTAGCATCTAATCAT GATGGATCATATACATTACTCTCAAATTTGTATGCAAATGCAGGGCGTTGGAAAGATGTG ACTAGGATCAGATCATTGATGAGACATAAAGGAGTTAAGAAAAGACCTGGTTGTAGTTGG GTTGAAGGAATTAAAGGAACTACTACGTTCTTCGTGGGTGATAAAACTCATCCACACGCT AAGGAAATATACCAGGTCCTCTTAGATCACATGCAACGCATCAAGGACATTGGTTATGTT CCTGAAACAGGCTTTGCTCTTCATGATGTAGACGATGAAGAGAAAGATGATCTTCTTTTC GAGCATAGTGAGAAGTTAGCTCTTGCATATGGTATTCTAACAACTCCGCAAGGTGCTGCT ATCAGGATTACTAAGAATTTACGGGTATGTGGTGATTGCCATACAGCATTCACATACATG TCCAGAATCATTGATCATGATATTATATTGAGGGACTCAAGTCGCTTCCATCATTTCAAA AATGGATCGTGTTCATGCAAAGGTTACTGGTGATGATGCTCTCTCTATGCACTCTACCAA ACACGGAAGCAACCTGAGGGTTTTGACATGGCTACAGCAGATTTCAGGAACGATCTAAAG GGACAAAGAAAGGGATAATAAGCACTGTGTTAAACACCTCATGTAGATTATATAATTTAA GCAA