Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G15340.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr5:4982273-4984144 REVERSE LENGTH=1872 \| 201606
Sequence	ATGAAATGCTTATCCTACCAAAAAGTTCGTCTCCTTCTCCGACATTGCGCTCACCGTTCG TTTCTCCGTCCCGGCAAGGAATTGCACGCCGTTTTAACCACTTCTGGATTGAAGAAAGCT CCCAGGTCGTATCTTAGCAATGCGCTATTTCAGTTTTATGCTTCCTCTGGTGAAATGGTT ACTGCCCAGAAACTGTTCGACGAAATTCCTCTTTCAGAAAAAGACAATGTGGATTGGACC ACTTTGTTATCCTCTTTTTCTCGGTATGGATTGTTGGTTAATTCGATGAAGCTCTTCGTG GAAATGAGAAGGAAAAGAGTAGAGATTGATGATGTTTCTGTAGTTTGTTTGTTTGGCGTG TGTGCCAAGCTGGAGGATTTGGGTTTCGCTCAACAAGGACATGGGGTTGCTGTAAAGATG GGGGTTTTGACTAGTGTAAAGGTTTGTAATGCCTTGATGGATATGTATGGGAAATGTGGG CTTGTGAGTGAAGTCAAACGTATTTTCGAGGAGTTAGAGGAGAAGAGCGTTGTTTCATGG ACGGTGGTTTTGGACACGGTTGTGAAATGGGAGGGGTTAGAGAGAGGAAGAGAGGTTTTT CACGAAATGCCTGAGAGAAATGCTGTTGCTTGGACGGTTATGGTTGCTGGGTATTTGGGA GCTGGGTTTACAAGGGAAGTATTGGAGCTTCTGGCAGAAATGGTGTTTAGATGTGGGCAT GGTTTGAACTTTGTCACTCTTTGCTCGATGCTATCGGCTTGTGCTCAATCGGGAAATCTG GTAGTTGGAAGATGGGTTCATGTGTATGCATTGAAGAAGGAAATGATGATGGGGGAGGAA GCAAGTTATGATGATGTGATGGTGGGAACGGCATTGGTTGATATGTATGCTAAATGCGGA AACATAGATTCTTCCATGAACGTCTTCAGATTGATGCGTAAGAGGAATGTGGTGACATGG AATGCTTTGTTCAGCGGGTTAGCAATGCACGGGAAAGGTAGAATGGTGATTGACATGTTC CCACAGATGATAAGAGAGGTGAAGCCAGATGACTTAACCTTCACTGCTGTCTTAAGTGCT TGCAGCCACTCGGGGATAGTAGATGAAGGGTGGCGATGTTTCCACAGCCTCCGGTTCTAT GGTTTGGAACCTAAGGTTGACCATTATGCATGTATGGTAGATCTTTTGGGCCGAGCTGGT CTTATTGAAGAAGCAGAGATCTTGATGAGGGAAATGCCAGTGCCTCCGAATGAAGTTGTC CTCGGTTCGCTTCTAGGCTCGTGCAGTGTCCATGGAAAGGTGGAGATAGCCGAACGAATT AAAAGAGAGCTTATTCAGATGAGTCCAGGCAACACAGAGTATCAAATACTTATGTCCAAC ATGTATGTTGCAGAAGGAAGGAGTGACATTGCTGATGGGTTAAGGGGAAGTCTGAGAAAG CGAGGCATCAGAAAAATACCTGGTTTGAGTTCCATTTATGTTAATGACTCAGTACATCGG TTTAGTTCAGGAGATAGATCACATCCGAGAACGAAAGAGATCTACTTGAAGTTGAATGAA GTGATTGAACGGATAAGATCAGCTGGCTACGTCCCTGATGTCTCTGGCCTGGTTTCACAT TCGGAGGGTGACTTGGAGGAAAAAGAGCAAGCTTTGTGCTGTCACAGCGAGAAATTGGCT GTCTGTTTCGGGCTTCTGGAAACAAAACCGAGTACACCTCTTCTTGTCTTCAAGAATCTG AGGATATGTCGAGATTGTCATTCGGCTATGAAGATTGTTTCAAAGGTCTATGACCGAGAA ATCATCATCAGAGACAGAAATAGATTTCATCAGTTCAAGGGAGGTTCTTGTTCTTGTTCC GATTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G15340.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr5:4982273-4984144 REVERSE LENGTH=623 \| 201606
Sequence	MKCLSYQKVRLLLRHCAHRSFLRPGKELHAVLTTSGLKKAPRSYLSNALFQFYASSGEMV TAQKLFDEIPLSEKDNVDWTTLLSSFSRYGLLVNSMKLFVEMRRKRVEIDDVSVVCLFGV CAKLEDLGFAQQGHGVAVKMGVLTSVKVCNALMDMYGKCGLVSEVKRIFEELEEKSVVSW TVVLDTVVKWEGLERGREVFHEMPERNAVAWTVMVAGYLGAGFTREVLELLAEMVFRCGH GLNFVTLCSMLSACAQSGNLVVGRWVHVYALKKEMMMGEEASYDDVMVGTALVDMYAKCG NIDSSMNVFRLMRKRNVVTWNALFSGLAMHGKGRMVIDMFPQMIREVKPDDLTFTAVLSA CSHSGIVDEGWRCFHSLRFYGLEPKVDHYACMVDLLGRAGLIEEAEILMREMPVPPNEVV LGSLLGSCSVHGKVEIAERIKRELIQMSPGNTEYQILMSNMYVAEGRSDIADGLRGSLRK RGIRKIPGLSSIYVNDSVHRFSSGDRSHPRTKEIYLKLNEVIERIRSAGYVPDVSGLVSH SEGDLEEKEQALCCHSEKLAVCFGLLETKPSTPLLVFKNLRICRDCHSAMKIVSKVYDRE IIIRDRNRFHQFKGGSCSCSDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G15340.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr5:4982273-4984398 REVERSE LENGTH=2126 \| 201606
Sequence	ATTGCATCCTTGCAGATCAAAACCAAAACTTTTATTATGTCACTTATGTTGTACTGGACA AAAGATAAAAACATTATCCCACGCGCTCTAAATTTCTCATCAAGGCGCGTGAAGTGTATT TAAGAGCCCAGATTTTCTGTTTGTTTCCCGGGAAAATTGAACTCACGAGAAGTTAGAACC GTCGAAGGCAGAGATCTAACGCCATAGCTCTAAGATTCTATCAGTTATAGGACTAAAGGG ACGAGCTTAATCTTATGAAATGCTTATCCTACCAAAAAGTTCGTCTCCTTCTCCGACATT GCGCTCACCGTTCGTTTCTCCGTCCCGGCAAGGAATTGCACGCCGTTTTAACCACTTCTG GATTGAAGAAAGCTCCCAGGTCGTATCTTAGCAATGCGCTATTTCAGTTTTATGCTTCCT CTGGTGAAATGGTTACTGCCCAGAAACTGTTCGACGAAATTCCTCTTTCAGAAAAAGACA ATGTGGATTGGACCACTTTGTTATCCTCTTTTTCTCGGTATGGATTGTTGGTTAATTCGA TGAAGCTCTTCGTGGAAATGAGAAGGAAAAGAGTAGAGATTGATGATGTTTCTGTAGTTT GTTTGTTTGGCGTGTGTGCCAAGCTGGAGGATTTGGGTTTCGCTCAACAAGGACATGGGG TTGCTGTAAAGATGGGGGTTTTGACTAGTGTAAAGGTTTGTAATGCCTTGATGGATATGT ATGGGAAATGTGGGCTTGTGAGTGAAGTCAAACGTATTTTCGAGGAGTTAGAGGAGAAGA GCGTTGTTTCATGGACGGTGGTTTTGGACACGGTTGTGAAATGGGAGGGGTTAGAGAGAG GAAGAGAGGTTTTTCACGAAATGCCTGAGAGAAATGCTGTTGCTTGGACGGTTATGGTTG CTGGGTATTTGGGAGCTGGGTTTACAAGGGAAGTATTGGAGCTTCTGGCAGAAATGGTGT TTAGATGTGGGCATGGTTTGAACTTTGTCACTCTTTGCTCGATGCTATCGGCTTGTGCTC AATCGGGAAATCTGGTAGTTGGAAGATGGGTTCATGTGTATGCATTGAAGAAGGAAATGA TGATGGGGGAGGAAGCAAGTTATGATGATGTGATGGTGGGAACGGCATTGGTTGATATGT ATGCTAAATGCGGAAACATAGATTCTTCCATGAACGTCTTCAGATTGATGCGTAAGAGGA ATGTGGTGACATGGAATGCTTTGTTCAGCGGGTTAGCAATGCACGGGAAAGGTAGAATGG TGATTGACATGTTCCCACAGATGATAAGAGAGGTGAAGCCAGATGACTTAACCTTCACTG CTGTCTTAAGTGCTTGCAGCCACTCGGGGATAGTAGATGAAGGGTGGCGATGTTTCCACA GCCTCCGGTTCTATGGTTTGGAACCTAAGGTTGACCATTATGCATGTATGGTAGATCTTT TGGGCCGAGCTGGTCTTATTGAAGAAGCAGAGATCTTGATGAGGGAAATGCCAGTGCCTC CGAATGAAGTTGTCCTCGGTTCGCTTCTAGGCTCGTGCAGTGTCCATGGAAAGGTGGAGA TAGCCGAACGAATTAAAAGAGAGCTTATTCAGATGAGTCCAGGCAACACAGAGTATCAAA TACTTATGTCCAACATGTATGTTGCAGAAGGAAGGAGTGACATTGCTGATGGGTTAAGGG GAAGTCTGAGAAAGCGAGGCATCAGAAAAATACCTGGTTTGAGTTCCATTTATGTTAATG ACTCAGTACATCGGTTTAGTTCAGGAGATAGATCACATCCGAGAACGAAAGAGATCTACT TGAAGTTGAATGAAGTGATTGAACGGATAAGATCAGCTGGCTACGTCCCTGATGTCTCTG GCCTGGTTTCACATTCGGAGGGTGACTTGGAGGAAAAAGAGCAAGCTTTGTGCTGTCACA GCGAGAAATTGGCTGTCTGTTTCGGGCTTCTGGAAACAAAACCGAGTACACCTCTTCTTG TCTTCAAGAATCTGAGGATATGTCGAGATTGTCATTCGGCTATGAAGATTGTTTCAAAGG TCTATGACCGAGAAATCATCATCAGAGACAGAAATAGATTTCATCAGTTCAAGGGAGGTT CTTGTTCTTGTTCCGATTATTGGTGA