Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G15300.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr5:4968384-4970030 REVERSE LENGTH=1647 \| 201606
Sequence	ATGATCAGGAGACAAACAAACGACCGAACCACCAATCGCCGTCGTCCGAAACTATGGCAA AACTGCAAAAATATCCGAACTTTGAAGCAAATTCATGCTTCTATGGTTGTTAATGGACTC ATGTCTAATCTTTCTGTTGTTGGTGAGCTAATTTACTCAGCTTCTTTGTCGGTTCCTGGT GCGCTTAAGTATGCACACAAGTTGTTCGACGAAATTCCTAAACCAGACGTATCTATTTGT AACCATGTTTTGCGTGGCTCTGCTCAGAGCATGAAACCTGAAAAAACGGTTTCTTTGTAT ACTGAGATGGAGAAACGAGGTGTGTCGCCTGATAGGTATACGTTTACGTTTGTTCTCAAG GCGTGTTCGAAGCTTGAGTGGAGAAGTAATGGTTTTGCGTTTCATGGGAAAGTGGTGAGA CATGGGTTTGTGTTGAATGAGTATGTTAAGAATGCTTTGATCCTTTTTCATGCTAATTGT GGAGATTTGGGAATTGCAAGTGAGCTTTTTGATGATTCTGCGAAAGCTCATAAGGTTGCT TGGTCTTCTATGACTTCTGGGTATGCTAAGAGAGGGAAGATTGATGAGGCGATGAGGCTT TTTGATGAAATGCCTTACAAAGATCAGGTAGCTTGGAATGTGATGATTACTGGTTGTTTG AAATGTAAGGAGATGGATTCAGCAAGAGAGCTCTTTGATAGGTTTACAGAGAAAGATGTT GTTACTTGGAATGCGATGATCTCTGGATATGTAAATTGCGGGTACCCTAAAGAAGCGCTA GGTATATTCAAGGAGATGAGGGATGCTGGTGAACACCCAGATGTTGTGACAATACTGAGT TTGTTATCTGCTTGTGCAGTCTTAGGAGATTTGGAAACTGGGAAGAGACTTCATATCTAT ATCTTGGAAACGGCTTCTGTTTCGAGTTCCATATATGTGGGCACTCCTATTTGGAATGCT CTAATTGACATGTATGCAAAGTGTGGAAGCATAGATAGAGCAATTGAAGTGTTCAGAGGA GTGAAAGATCGGGACTTGTCAACATGGAATACTTTGATAGTTGGTTTGGCTTTGCATCAT GCAGAGGGATCAATTGAAATGTTCGAAGAAATGCAAAGATTGAAAGTCTGGCCAAATGAG GTGACTTTCATTGGAGTTATATTAGCTTGCAGCCATTCGGGGAGAGTTGATGAAGGGCGT AAGTATTTCAGCCTTATGAGGGATATGTATAATATTGAACCAAACATAAAGCATTATGGT TGTATGGTAGACATGTTGGGACGAGCAGGGCAATTAGAGGAAGCATTCATGTTTGTGGAG TCTATGAAGATTGAGCCTAACGCTATTGTATGGCGAACGCTATTAGGTGCATGTAAGATT TATGGGAATGTCGAGTTAGGGAAGTATGCAAATGAGAAACTGCTCAGTATGAGAAAGGAC GAGAGTGGTGATTATGTGTTGCTATCCAACATATATGCTTCCACAGGTCAGTGGGACGGG GTGCAGAAAGTAAGGAAGATGTTTGATGATACAAGAGTGAAAAAACCGACTGGCGTTAGC TTGATCGAGGAAGATGACGACAAATTGATGATGAGATATTTACTTTCGTCAGAACCTGAG TCAAGATCAAGAGGTCGGATTAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G15300.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr5:4968384-4970030 REVERSE LENGTH=548 \| 201606
Sequence	MIRRQTNDRTTNRRRPKLWQNCKNIRTLKQIHASMVVNGLMSNLSVVGELIYSASLSVPG ALKYAHKLFDEIPKPDVSICNHVLRGSAQSMKPEKTVSLYTEMEKRGVSPDRYTFTFVLK ACSKLEWRSNGFAFHGKVVRHGFVLNEYVKNALILFHANCGDLGIASELFDDSAKAHKVA WSSMTSGYAKRGKIDEAMRLFDEMPYKDQVAWNVMITGCLKCKEMDSARELFDRFTEKDV VTWNAMISGYVNCGYPKEALGIFKEMRDAGEHPDVVTILSLLSACAVLGDLETGKRLHIY ILETASVSSSIYVGTPIWNALIDMYAKCGSIDRAIEVFRGVKDRDLSTWNTLIVGLALHH AEGSIEMFEEMQRLKVWPNEVTFIGVILACSHSGRVDEGRKYFSLMRDMYNIEPNIKHYG CMVDMLGRAGQLEEAFMFVESMKIEPNAIVWRTLLGACKIYGNVELGKYANEKLLSMRKD ESGDYVLLSNIYASTGQWDGVQKVRKMFDDTRVKKPTGVSLIEEDDDKLMMRYLLSSEPE SRSRGRIN

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G15300.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr5:4968089-4970045 REVERSE LENGTH=1957 \| 201606
Sequence	AAGAAAGAAAACGCGATGATCAGGAGACAAACAAACGACCGAACCACCAATCGCCGTCGT CCGAAACTATGGCAAAACTGCAAAAATATCCGAACTTTGAAGCAAATTCATGCTTCTATG GTTGTTAATGGACTCATGTCTAATCTTTCTGTTGTTGGTGAGCTAATTTACTCAGCTTCT TTGTCGGTTCCTGGTGCGCTTAAGTATGCACACAAGTTGTTCGACGAAATTCCTAAACCA GACGTATCTATTTGTAACCATGTTTTGCGTGGCTCTGCTCAGAGCATGAAACCTGAAAAA ACGGTTTCTTTGTATACTGAGATGGAGAAACGAGGTGTGTCGCCTGATAGGTATACGTTT ACGTTTGTTCTCAAGGCGTGTTCGAAGCTTGAGTGGAGAAGTAATGGTTTTGCGTTTCAT GGGAAAGTGGTGAGACATGGGTTTGTGTTGAATGAGTATGTTAAGAATGCTTTGATCCTT TTTCATGCTAATTGTGGAGATTTGGGAATTGCAAGTGAGCTTTTTGATGATTCTGCGAAA GCTCATAAGGTTGCTTGGTCTTCTATGACTTCTGGGTATGCTAAGAGAGGGAAGATTGAT GAGGCGATGAGGCTTTTTGATGAAATGCCTTACAAAGATCAGGTAGCTTGGAATGTGATG ATTACTGGTTGTTTGAAATGTAAGGAGATGGATTCAGCAAGAGAGCTCTTTGATAGGTTT ACAGAGAAAGATGTTGTTACTTGGAATGCGATGATCTCTGGATATGTAAATTGCGGGTAC CCTAAAGAAGCGCTAGGTATATTCAAGGAGATGAGGGATGCTGGTGAACACCCAGATGTT GTGACAATACTGAGTTTGTTATCTGCTTGTGCAGTCTTAGGAGATTTGGAAACTGGGAAG AGACTTCATATCTATATCTTGGAAACGGCTTCTGTTTCGAGTTCCATATATGTGGGCACT CCTATTTGGAATGCTCTAATTGACATGTATGCAAAGTGTGGAAGCATAGATAGAGCAATT GAAGTGTTCAGAGGAGTGAAAGATCGGGACTTGTCAACATGGAATACTTTGATAGTTGGT TTGGCTTTGCATCATGCAGAGGGATCAATTGAAATGTTCGAAGAAATGCAAAGATTGAAA GTCTGGCCAAATGAGGTGACTTTCATTGGAGTTATATTAGCTTGCAGCCATTCGGGGAGA GTTGATGAAGGGCGTAAGTATTTCAGCCTTATGAGGGATATGTATAATATTGAACCAAAC ATAAAGCATTATGGTTGTATGGTAGACATGTTGGGACGAGCAGGGCAATTAGAGGAAGCA TTCATGTTTGTGGAGTCTATGAAGATTGAGCCTAACGCTATTGTATGGCGAACGCTATTA GGTGCATGTAAGATTTATGGGAATGTCGAGTTAGGGAAGTATGCAAATGAGAAACTGCTC AGTATGAGAAAGGACGAGAGTGGTGATTATGTGTTGCTATCCAACATATATGCTTCCACA GGTCAGTGGGACGGGGTGCAGAAAGTAAGGAAGATGTTTGATGATACAAGAGTGAAAAAA CCGACTGGCGTTAGCTTGATCGAGGAAGATGACGACAAATTGATGATGAGATATTTACTT TCGTCAGAACCTGAGTCAAGATCAAGAGGTCGGATTAATTAAGGTGAAAAACCAACGCTT CATTGGCGAACTATGGACAGTAAGATTGCATAACTCAATGCAATGATGATAACTTTGATA GATTCATTCCTTTTTTGTTCTCTTGAGTTTTTGAGTTCTTAACTTAGAACTCTGAGCACC ACATTTTATAGGAAGTTTCGACATCGATGTTTATGCTCTTAACCTTCGAGATGATCCTTC ACAGAATCATTGTGTAACATATAGGTAACCTGTTAATGTTATAAACCTAGCATTTTCCTG TCATCTATTACTGTATGTTGTTTTCATGAATCTGGAT