Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G13230.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:4222514-4224982 FORWARD LENGTH=2469 \| 201606
Sequence	ATGATCGTGTTCATGAGAATAATTCATGTTGCGCAGACTCGCAGATTGATGATCCGATGC AATCGCATTCGACAATGTGGGTTTTCTGTGAAAACTGCGGCATTGGATTTAGAATCGTCG GATTCGATAATCCCAGGCTTAGACTCTCATGCTTACGGTGCAATGCTCCGTCGCTGCATT CAGAAGAACGACCCAATTTCAGCAAAGGCTATTCATTGCGACATCTTGAAGAAAGGAAGC TGCTTAGACCTTTTCGCCACAAACATTCTACTCAACGCTTATGTGAAAGCTGGCTTTGAC AAAGATGCGTTAAACCTGTTCGACGAAATGCCTGAGAGAAATAATGTCTCTTTTGTTACT CTTGCGCAAGGGTATGCGTGTCAAGATCCCATTGGTTTGTATTCCAGGTTGCATCGAGAG GGTCATGAGCTTAATCCACACGTCTTCACTTCTTTCTTGAAGTTGTTTGTTAGTTTGGAC AAAGCTGAGATTTGTCCATGGTTGCATTCTCCTATCGTTAAGCTCGGTTATGATTCTAAT GCTTTTGTTGGAGCTGCGCTTATTAATGCTTACTCTGTCTGTGGTTCTGTTGATAGTGCA AGAACTGTTTTTGAAGGGATTTTGTGCAAAGACATTGTTGTTTGGGCAGGAATTGTATCT TGCTATGTAGAAAATGGATATTTCGAGGATTCTCTTAAGCTGCTATCTTGTATGAGGATG GCTGGTTTCATGCCCAACAACTACACCTTTGACACGGCGCTTAAGGCTAGTATTGGGCTA GGCGCATTTGATTTCGCGAAAGGTGTTCATGGCCAAATCTTAAAAACATGTTATGTGTTG GATCCTCGTGTGGGTGTTGGTTTGCTTCAGTTGTATACACAACTCGGAGACATGTCTGAT GCTTTCAAAGTGTTTAATGAGATGCCAAAGAATGATGTGGTACCTTGGAGTTTTATGATT GCTCGTTTTTGTCAAAACGGTTTCTGCAACGAGGCGGTTGATCTTTTTATTCGAATGAGG GAAGCTTTTGTTGTCCCTAACGAGTTTACTTTAAGCAGTATTTTGAATGGCTGTGCCATC GGAAAGTGTTCTGGCTTAGGTGAGCAACTCCATGGTCTTGTAGTCAAAGTTGGCTTTGAT TTGGATATCTATGTCTCAAATGCTCTTATTGATGTATATGCCAAATGTGAGAAAATGGAT ACCGCTGTGAAGTTATTTGCTGAGTTATCAAGTAAAAATGAGGTAAGCTGGAACACAGTC ATTGTCGGGTATGAGAATCTAGGCGAAGGAGGAAAAGCGTTCAGCATGTTTCGTGAAGCG CTCAGAAATCAGGTGTCGGTAACTGAAGTAACTTTCTCAAGTGCTCTTGGAGCTTGTGCT TCATTGGCGAGCATGGACCTCGGTGTCCAAGTTCATGGACTGGCGATAAAAACCAATAAT GCCAAAAAAGTTGCAGTGAGTAACTCATTGATAGATATGTATGCAAAATGTGGTGATATC AAATTCGCACAATCGGTGTTCAACGAGATGGAAACGATAGATGTCGCTTCATGGAATGCG TTGATCTCAGGCTATTCCACACATGGACTGGGTAGACAGGCATTGAGAATCCTCGACATT ATGAAGGATAGAGATTGCAAGCCAAATGGTTTAACATTTCTTGGTGTTCTTTCTGGATGC AGCAATGCAGGATTAATAGATCAAGGTCAAGAATGTTTTGAATCAATGATTCGTGATCAT GGTATTGAACCATGTTTGGAACATTATACGTGTATGGTCAGGCTTTTGGGAAGATCAGGG CAGCTTGACAAAGCAATGAAGCTGATTGAAGGGATTCCATATGAGCCTAGCGTTATGATC TGGAGGGCAATGCTTAGTGCCTCTATGAATCAGAACAATGAAGAGTTTGCAAGGAGATCG GCAGAGGAAATACTAAAGATCAATCCAAAGGACGAGGCGACATATGTTCTGGTATCAAAC ATGTACGCAGGTGCAAAACAATGGGCAAACGTAGCTTCCATTAGGAAAAGCATGAAGGAA ATGGGTGTCAAGAAGGAACCTGGTTTAAGTTGGATAGAACATCAAGGTGATGTGCATTAC TTCAGTGTGGGGTTATCAGATCATCCGGATATGAAGCTCATAAATGGAATGTTGGAATGG CTTAACATGAAAGCAACTCGAGCTGGTTACGTTCCTGATCGGAATGCGGTCCTGCTCGAT ATGGATGATGAAGAAAAGGATAAGAGATTGTGGGTTCATAGCGAGAGGTTGGCTTTGGCG TATGGGCTTGTTCGAATGCCATCATCAAGAAATCGCATACTGATCATGAAGAATCTACGG ATATGTTCAGATTGCCACAGTGCTATGAAAGTGATTTCAAGTATCGTACAGCGAGATCTG GTTATAAGAGATATGAACCGGTTCCATCATTTTCATGCAGGAGTCTGCTCTTGCGGCGAC CACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G13230.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:4222514-4224982 FORWARD LENGTH=822 \| 201606
Sequence	MIVFMRIIHVAQTRRLMIRCNRIRQCGFSVKTAALDLESSDSIIPGLDSHAYGAMLRRCI QKNDPISAKAIHCDILKKGSCLDLFATNILLNAYVKAGFDKDALNLFDEMPERNNVSFVT LAQGYACQDPIGLYSRLHREGHELNPHVFTSFLKLFVSLDKAEICPWLHSPIVKLGYDSN AFVGAALINAYSVCGSVDSARTVFEGILCKDIVVWAGIVSCYVENGYFEDSLKLLSCMRM AGFMPNNYTFDTALKASIGLGAFDFAKGVHGQILKTCYVLDPRVGVGLLQLYTQLGDMSD AFKVFNEMPKNDVVPWSFMIARFCQNGFCNEAVDLFIRMREAFVVPNEFTLSSILNGCAI GKCSGLGEQLHGLVVKVGFDLDIYVSNALIDVYAKCEKMDTAVKLFAELSSKNEVSWNTV IVGYENLGEGGKAFSMFREALRNQVSVTEVTFSSALGACASLASMDLGVQVHGLAIKTNN AKKVAVSNSLIDMYAKCGDIKFAQSVFNEMETIDVASWNALISGYSTHGLGRQALRILDI MKDRDCKPNGLTFLGVLSGCSNAGLIDQGQECFESMIRDHGIEPCLEHYTCMVRLLGRSG QLDKAMKLIEGIPYEPSVMIWRAMLSASMNQNNEEFARRSAEEILKINPKDEATYVLVSN MYAGAKQWANVASIRKSMKEMGVKKEPGLSWIEHQGDVHYFSVGLSDHPDMKLINGMLEW LNMKATRAGYVPDRNAVLLDMDDEEKDKRLWVHSERLALAYGLVRMPSSRNRILIMKNLR ICSDCHSAMKVISSIVQRDLVIRDMNRFHHFHAGVCSCGDHW

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G13230.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:4222512-4224982 FORWARD LENGTH=2471 \| 201606
Sequence	GCATGATCGTGTTCATGAGAATAATTCATGTTGCGCAGACTCGCAGATTGATGATCCGAT GCAATCGCATTCGACAATGTGGGTTTTCTGTGAAAACTGCGGCATTGGATTTAGAATCGT CGGATTCGATAATCCCAGGCTTAGACTCTCATGCTTACGGTGCAATGCTCCGTCGCTGCA TTCAGAAGAACGACCCAATTTCAGCAAAGGCTATTCATTGCGACATCTTGAAGAAAGGAA GCTGCTTAGACCTTTTCGCCACAAACATTCTACTCAACGCTTATGTGAAAGCTGGCTTTG ACAAAGATGCGTTAAACCTGTTCGACGAAATGCCTGAGAGAAATAATGTCTCTTTTGTTA CTCTTGCGCAAGGGTATGCGTGTCAAGATCCCATTGGTTTGTATTCCAGGTTGCATCGAG AGGGTCATGAGCTTAATCCACACGTCTTCACTTCTTTCTTGAAGTTGTTTGTTAGTTTGG ACAAAGCTGAGATTTGTCCATGGTTGCATTCTCCTATCGTTAAGCTCGGTTATGATTCTA ATGCTTTTGTTGGAGCTGCGCTTATTAATGCTTACTCTGTCTGTGGTTCTGTTGATAGTG CAAGAACTGTTTTTGAAGGGATTTTGTGCAAAGACATTGTTGTTTGGGCAGGAATTGTAT CTTGCTATGTAGAAAATGGATATTTCGAGGATTCTCTTAAGCTGCTATCTTGTATGAGGA TGGCTGGTTTCATGCCCAACAACTACACCTTTGACACGGCGCTTAAGGCTAGTATTGGGC TAGGCGCATTTGATTTCGCGAAAGGTGTTCATGGCCAAATCTTAAAAACATGTTATGTGT TGGATCCTCGTGTGGGTGTTGGTTTGCTTCAGTTGTATACACAACTCGGAGACATGTCTG ATGCTTTCAAAGTGTTTAATGAGATGCCAAAGAATGATGTGGTACCTTGGAGTTTTATGA TTGCTCGTTTTTGTCAAAACGGTTTCTGCAACGAGGCGGTTGATCTTTTTATTCGAATGA GGGAAGCTTTTGTTGTCCCTAACGAGTTTACTTTAAGCAGTATTTTGAATGGCTGTGCCA TCGGAAAGTGTTCTGGCTTAGGTGAGCAACTCCATGGTCTTGTAGTCAAAGTTGGCTTTG ATTTGGATATCTATGTCTCAAATGCTCTTATTGATGTATATGCCAAATGTGAGAAAATGG ATACCGCTGTGAAGTTATTTGCTGAGTTATCAAGTAAAAATGAGGTAAGCTGGAACACAG TCATTGTCGGGTATGAGAATCTAGGCGAAGGAGGAAAAGCGTTCAGCATGTTTCGTGAAG CGCTCAGAAATCAGGTGTCGGTAACTGAAGTAACTTTCTCAAGTGCTCTTGGAGCTTGTG CTTCATTGGCGAGCATGGACCTCGGTGTCCAAGTTCATGGACTGGCGATAAAAACCAATA ATGCCAAAAAAGTTGCAGTGAGTAACTCATTGATAGATATGTATGCAAAATGTGGTGATA TCAAATTCGCACAATCGGTGTTCAACGAGATGGAAACGATAGATGTCGCTTCATGGAATG CGTTGATCTCAGGCTATTCCACACATGGACTGGGTAGACAGGCATTGAGAATCCTCGACA TTATGAAGGATAGAGATTGCAAGCCAAATGGTTTAACATTTCTTGGTGTTCTTTCTGGAT GCAGCAATGCAGGATTAATAGATCAAGGTCAAGAATGTTTTGAATCAATGATTCGTGATC ATGGTATTGAACCATGTTTGGAACATTATACGTGTATGGTCAGGCTTTTGGGAAGATCAG GGCAGCTTGACAAAGCAATGAAGCTGATTGAAGGGATTCCATATGAGCCTAGCGTTATGA TCTGGAGGGCAATGCTTAGTGCCTCTATGAATCAGAACAATGAAGAGTTTGCAAGGAGAT CGGCAGAGGAAATACTAAAGATCAATCCAAAGGACGAGGCGACATATGTTCTGGTATCAA ACATGTACGCAGGTGCAAAACAATGGGCAAACGTAGCTTCCATTAGGAAAAGCATGAAGG AAATGGGTGTCAAGAAGGAACCTGGTTTAAGTTGGATAGAACATCAAGGTGATGTGCATT ACTTCAGTGTGGGGTTATCAGATCATCCGGATATGAAGCTCATAAATGGAATGTTGGAAT GGCTTAACATGAAAGCAACTCGAGCTGGTTACGTTCCTGATCGGAATGCGGTCCTGCTCG ATATGGATGATGAAGAAAAGGATAAGAGATTGTGGGTTCATAGCGAGAGGTTGGCTTTGG CGTATGGGCTTGTTCGAATGCCATCATCAAGAAATCGCATACTGATCATGAAGAATCTAC GGATATGTTCAGATTGCCACAGTGCTATGAAAGTGATTTCAAGTATCGTACAGCGAGATC TGGTTATAAGAGATATGAACCGGTTCCATCATTTTCATGCAGGAGTCTGCTCTTGCGGCG ACCACTGGTGA