Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G08490.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:2745208-2747757 REVERSE LENGTH=2550 \| 201606
Sequence	ATGGGCCCTTTACGGCAATTTGTTCAGAATTTCAGACTTTTGTCTGGTTTTGGAACTGAT CACAGGGTTTTTCTGGATGTTGTCAAAGCTTGTGCTTCAGTGTCTGATCTCACATCAGGG AGGGCTCTGCACGGTTGCGTGTTCAAGCTTGGTCATATAGCCTGCTCTGAGGTTTCGAAG TCAGTTCTTAACATGTATGCGAAATGCAGGAGAATGGATGATTGCCAGAAGATGTTTAGG CAAATGGACAGTCTTGATCCTGTTGTTTGGAATATTGTTCTGACTGGACTTTCTGTTTCT TGCGGTCGTGAAACGATGAGGTTTTTCAAAGCAATGCACTTTGCAGATGAACCTAAGCCG AGCTCTGTTACCTTTGCGATTGTTCTTCCTTTGTGTGTTCGCCTTGGGGATTCATACAAT GGGAAGAGTATGCATTCTTATATTATTAAAGCCGGTTTGGAGAAAGATACACTTGTGGGG AATGCTTTGGTTTCCATGTATGCCAAATTTGGTTTTATTTTTCCCGATGCTTATACTGCA TTTGATGGTATAGCTGATAAAGATGTTGTCTCTTGGAATGCGATTATTGCTGGGTTTTCT GAGAATAATATGATGGCTGATGCATTTAGATCGTTTTGTCTAATGCTGAAGGAACCTACA GAGCCAAATTATGCAACAATTGCAAATGTTTTGCCTGTTTGCGCTTCTATGGACAAGAAC ATTGCATGTCGAAGTGGTAGACAGATTCACAGTTATGTTGTGCAGAGGTCTTGGCTGCAA ACCCATGTTTTTGTATGTAATTCACTTGTTAGTTTCTATTTGAGAGTCGGAAGGATAGAA GAAGCAGCCTCATTGTTTACCAGGATGGGTTCTAAAGATCTAGTTTCATGGAATGTTGTC ATAGCTGGTTATGCATCAAATTGTGAGTGGTTTAAAGCATTTCAGTTATTTCACAACTTG GTGCATAAGGGGGATGTTTCTCCTGATTCGGTAACTATTATCAGTATCCTTCCTGTCTGT GCGCAATTAACTGACTTGGCCTCTGGGAAAGAGATCCACAGTTATATATTGCGCCATTCT TACCTTTTGGAGGATACATCAGTTGGGAATGCTCTCATTAGTTTCTATGCAAGATTTGGT GACACAAGTGCAGCATATTGGGCCTTTTCACTGATGTCCACGAAGGATATAATATCTTGG AATGCTATACTTGATGCCTTTGCAGACAGTCCAAAGCAGTTTCAATTTTTGAATCTCTTG CACCACTTACTTAATGAAGCAATCACTCTTGACTCTGTTACTATTTTAAGCCTACTAAAG TTTTGCATAAATGTACAGGGAATTGGTAAAGTAAAAGAAGTTCATGGGTACTCAGTTAAG GCTGGTCTTTTACACGATGAAGAGGAACCCAAGCTTGGCAATGCATTGCTTGATGCATAT GCCAAATGTGGTAATGTTGAATACGCTCATAAGATTTTTCTGGGTTTATCAGAGAGGAGA ACTTTGGTTTCCTATAACTCATTGTTATCAGGATATGTTAATAGTGGAAGTCATGATGAT GCTCAGATGCTCTTCACTGAGATGTCTACTACTGATCTCACCACTTGGAGTTTGATGGTT CGTATCTATGCTGAAAGTTGTTGCCCTAATGAAGCCATTGGTGTTTTCCGTGAGATTCAA GCTCGAGGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATCATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAG CTAGCCTCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCGGACTTGGT GATATCCGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCAT GCATATTCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTA GCTGGGTATGCTGTACATGGTAGGGGCAAGGAAGCACTTATGATCTACTCTCATATGACT GAATCAAACATAAAGCCCGATCATGTTTTCATAACTACTATGTTGACTGCATGCTGTCAT GCAGGGTTAATACAGGATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGACAGTTCACGGTATG AAACCTACAATGGAACAATATGCTTGTGCTGTAGATCTAATTGCTCGAGGGGGTCGACTT GATGATGCATATTCTTTTGTCACACAGATGCCAGTTGAACCTAATGCAAATATATGGGGA ACACTGTTAAGGGCGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAAT CATCTCTTGCAAGCTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTAT GCTGCAGATGCTAAATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAA ATGAAAAAGCCAGCGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTG TCTGGAGATTGTTCTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATAT CTTCAGATGAAAGAGCCTGTGGTGTTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G08490.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:2745208-2747757 REVERSE LENGTH=849 \| 201606
Sequence	MGPLRQFVQNFRLLSGFGTDHRVFLDVVKACASVSDLTSGRALHGCVFKLGHIACSEVSK SVLNMYAKCRRMDDCQKMFRQMDSLDPVVWNIVLTGLSVSCGRETMRFFKAMHFADEPKP SSVTFAIVLPLCVRLGDSYNGKSMHSYIIKAGLEKDTLVGNALVSMYAKFGFIFPDAYTA FDGIADKDVVSWNAIIAGFSENNMMADAFRSFCLMLKEPTEPNYATIANVLPVCASMDKN IACRSGRQIHSYVVQRSWLQTHVFVCNSLVSFYLRVGRIEEAASLFTRMGSKDLVSWNVV IAGYASNCEWFKAFQLFHNLVHKGDVSPDSVTIISILPVCAQLTDLASGKEIHSYILRHS YLLEDTSVGNALISFYARFGDTSAAYWAFSLMSTKDIISWNAILDAFADSPKQFQFLNLL HHLLNEAITLDSVTILSLLKFCINVQGIGKVKEVHGYSVKAGLLHDEEEPKLGNALLDAY AKCGNVEYAHKIFLGLSERRTLVSYNSLLSGYVNSGSHDDAQMLFTEMSTTDLTTWSLMV RIYAESCCPNEAIGVFREIQARGMRPNTVTIMNLLPVCAQLASLHLVRQCHGYIIRGGLG DIRLKGTLLDVYAKCGSLKHAYSVFQSDARRDLVMFTAMVAGYAVHGRGKEALMIYSHMT ESNIKPDHVFITTMLTACCHAGLIQDGLQIYDSIRTVHGMKPTMEQYACAVDLIARGGRL DDAYSFVTQMPVEPNANIWGTLLRACTTYNRMDLGHSVANHLLQAESDDTGNHVLISNMY AADAKWEGVMELRNLMKKKEMKKPAGCSWLEVDGQRNVFVSGDCSHPRRDSIFDLVNALY LQMKEPVVF

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G08490.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:2743330-2747998 REVERSE LENGTH=4165 \| 201606
Sequence	GACAAAAACTGTCGCTTGTATGTGGAGGAGATGGAGACTGAGAGACACCTTCATTGCTTG ATAAATTGAGGAGCTTGATAAAGATATTGCTTTTTCAGTTTCTCTATGTCTGTTACATCT CGACAACGCTTATATCTAGAGAAACTGTTCTTGCATATCAGGTGTTTGTGAAAATGTCTG ACCCAATGTAACGTAGATTTTTTGCTAATAAAGGGCCGTTGTTGGGATATTCAGGGGAAA GATGGGCCCTTTACGGCAATTTGTTCAGAATTTCAGACTTTTGTCTGGTTTTGGAACTGA TCACAGGGTTTTTCTGGATGTTGTCAAAGCTTGTGCTTCAGTGTCTGATCTCACATCAGG GAGGGCTCTGCACGGTTGCGTGTTCAAGCTTGGTCATATAGCCTGCTCTGAGGTTTCGAA GTCAGTTCTTAACATGTATGCGAAATGCAGGAGAATGGATGATTGCCAGAAGATGTTTAG GCAAATGGACAGTCTTGATCCTGTTGTTTGGAATATTGTTCTGACTGGACTTTCTGTTTC TTGCGGTCGTGAAACGATGAGGTTTTTCAAAGCAATGCACTTTGCAGATGAACCTAAGCC GAGCTCTGTTACCTTTGCGATTGTTCTTCCTTTGTGTGTTCGCCTTGGGGATTCATACAA TGGGAAGAGTATGCATTCTTATATTATTAAAGCCGGTTTGGAGAAAGATACACTTGTGGG GAATGCTTTGGTTTCCATGTATGCCAAATTTGGTTTTATTTTTCCCGATGCTTATACTGC ATTTGATGGTATAGCTGATAAAGATGTTGTCTCTTGGAATGCGATTATTGCTGGGTTTTC TGAGAATAATATGATGGCTGATGCATTTAGATCGTTTTGTCTAATGCTGAAGGAACCTAC AGAGCCAAATTATGCAACAATTGCAAATGTTTTGCCTGTTTGCGCTTCTATGGACAAGAA CATTGCATGTCGAAGTGGTAGACAGATTCACAGTTATGTTGTGCAGAGGTCTTGGCTGCA AACCCATGTTTTTGTATGTAATTCACTTGTTAGTTTCTATTTGAGAGTCGGAAGGATAGA AGAAGCAGCCTCATTGTTTACCAGGATGGGTTCTAAAGATCTAGTTTCATGGAATGTTGT CATAGCTGGTTATGCATCAAATTGTGAGTGGTTTAAAGCATTTCAGTTATTTCACAACTT GGTGCATAAGGGGGATGTTTCTCCTGATTCGGTAACTATTATCAGTATCCTTCCTGTCTG TGCGCAATTAACTGACTTGGCCTCTGGGAAAGAGATCCACAGTTATATATTGCGCCATTC TTACCTTTTGGAGGATACATCAGTTGGGAATGCTCTCATTAGTTTCTATGCAAGATTTGG TGACACAAGTGCAGCATATTGGGCCTTTTCACTGATGTCCACGAAGGATATAATATCTTG GAATGCTATACTTGATGCCTTTGCAGACAGTCCAAAGCAGTTTCAATTTTTGAATCTCTT GCACCACTTACTTAATGAAGCAATCACTCTTGACTCTGTTACTATTTTAAGCCTACTAAA GTTTTGCATAAATGTACAGGGAATTGGTAAAGTAAAAGAAGTTCATGGGTACTCAGTTAA GGCTGGTCTTTTACACGATGAAGAGGAACCCAAGCTTGGCAATGCATTGCTTGATGCATA TGCCAAATGTGGTAATGTTGAATACGCTCATAAGATTTTTCTGGGTTTATCAGAGAGGAG AACTTTGGTTTCCTATAACTCATTGTTATCAGGATATGTTAATAGTGGAAGTCATGATGA TGCTCAGATGCTCTTCACTGAGATGTCTACTACTGATCTCACCACTTGGAGTTTGATGGT TCGTATCTATGCTGAAAGTTGTTGCCCTAATGAAGCCATTGGTGTTTTCCGTGAGATTCA AGCTCGAGGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATCATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCA GCTAGCCTCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCGGACTTGG TGATATCCGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCA TGCATATTCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGT AGCTGGGTATGCTGTACATGGTAGGGGCAAGGAAGCACTTATGATCTACTCTCATATGAC TGAATCAAACATAAAGCCCGATCATGTTTTCATAACTACTATGTTGACTGCATGCTGTCA TGCAGGGTTAATACAGGATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGACAGTTCACGGTAT GAAACCTACAATGGAACAATATGCTTGTGCTGTAGATCTAATTGCTCGAGGGGGTCGACT TGATGATGCATATTCTTTTGTCACACAGATGCCAGTTGAACCTAATGCAAATATATGGGG AACACTGTTAAGGGCGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAA TCATCTCTTGCAAGCTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTA TGCTGCAGATGCTAAATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGA AATGAAAAAGCCAGCGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGT GTCTGGAGATTGTTCTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATA TCTTCAGATGAAAGAGCCTGTGGTGTTTTAATCGATGAAAATTGTTAAAACGCTGCGAAG CTAGATCATGATGGTCTACACAAAGCAATTGCACATATGACACAGACAAATCTTGAGTGA ACAATGTAAGAGAACAATCTTCCTCTTCCAATGATATTGTTGTGAAACTCTACATGTACA TAATCTTTGGGATAGTAGGCAGAGAACAAACTTATGATTAATCTGTCGGGTTTATGGTTT GCCACTCGAATTGGGAGATGTTAAAGGAAACAAAGTAAGCAATTCTGGTTCTGTATACCC CGGTTTAGACCTTGGCGATGGATGCAAGTAAAAGCGTCTTTCTTTAATGGCTTTCTCCTC TTCTTCGATGTTTGTTGTACAACTATCTGGTTCCCCTTCTATCAAGGACAAGTTAGAGAA CAATGAAGAAGGGGTGCCCACTGGACTTGTTAAAAGGTTGGTATTACCAGATTTAGATGA TGGTGTCGTACCAGTGGGCTTAAAGCTCAGAGGAGGTTTGACAATTTCAAGCTTTGGCCT CATACATTGCCTTCTCTCATGGAGCTTTGAAGTTGGCCTCTTTTGTATGGCGGTTTTTAT CACTGTTGCTTCTGGTGTTGCTGCTGCAGCGTTGTTCTCTGTTGGACCTGTCAAGCGCTG CACAATTTCTCTGAAAGTGTTGGTGTCAGTTTGGACAAATGTAGTGACAGGCTTGCAGGT TGTTGCAACGTTTTGACTCCCTTTGCTATTCATATTTGATGAGAAGATGAAAAAATATTC AAACATGAAAGGTCCTATCAAGAGAACCGAGGAATGTCAACTTCATGTGAGTTCAGAGAT TAGATTGATGGAAGGAGTCAGAGAGAATGATAAAAAGGTCAAAAGGCATACCTGAAGAGC AAGCCGAGGCAACAAGTGGAGGTAAAATCGAATGAGAATGCCGGATTTTTTTCTGAAGAA ATAGAACTTAAAACAGAAGAAGGAAATAAAAAGAGAGAGAAAGAACTAAAAGAAGATATA AAGACTGTTGTTGGTCTAATGGTCACAGCTCAGAACTTGTTCATATTACCAGAAAAGAGA AGAAAATGAAAAGAGGAAAATCAGGAGAAGAATATGGAGAGGAAAGAGGAAAAGGACTCT TTTATCCCTTTGTTCTTAACCGTTTTTGGGTTTGGGTTTTTGTCACACAAAAAAGATAAT AAATTATTTTGTTTATAGAACTAAGTTTGTTTGGTCAAACATCAAAATGACATAATTTGT GATGAGTTTATTTCATTGTTGTCGTGAAGGAATGGAGAAAGGAAGTTAAAGAAGGAAGAA ATGCATGCCGTTTCGGTTAAGGAGATGGGTAGAGAGAGACGTCACAGCAACCTCTCTCCC CCGCCCAATTTATAAACCAATCGTT