Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G05350.1
CDS Infomation	\| PLAC8 family protein \| Chr5:1585757-1587337 FORWARD LENGTH=1581 \| 201606
Sequence	ATGGGTTCAGTTGATGAGGTTGAGATATCTAAGACTAGGGTTTCATGTCCTCCTGCTCTC TCAACATCTCATAAGATTCTCATCAGTGAAGAGAAACCTAGGAGATGGTCCGAGAGTTCG TTGCCTGATGTCTCTAATAGGATTAAGCTTTTGAAATTTGGTTCCCCTTCTGCTAGACTC AAGAGAATGGCTGAGGAAAGAGATGAAGTTTCACGCTCTGTCAACAGCTCAAGCTCTAGC AGCCACGATGTGGTGTCTTCCCGGAAAATCGAGTGGGCTTGTTTGATGAAAATGGGTAAG CAATGGCTACAGAACCCGTTGAACATGGTTATGTTTTTGTGGATCTTTGTGGTTGCTGTC TCCGGTGCGATTCTATTCATGGTTATGACTGGTATGTTGAACCATGCTTTGCCCAAGAAA TCACAGAGAGATGTCTGGTTTGAAGTTAACAACCAAATCCTCAACGCATTGTTTACTCTG ATGTGTCTGTATCAACACCCGAAACGGTTTTACCACCTTGTGCTTCTCTGTAGATGGAAG CAAGACGATGTTACAACGCTTAGGAAGATATTCTGCAAGAACGGGACTTACAAGCCAAAC GAATGGATACACATGATGGTTGTTGTTCTTTTGCTTCACTTGAACTGTTTTGCTCAGTAT GCGCTTTGCGGTCTTAACTTAGGCTATAGAAGATCCGAGAGACCTGCCATTGGTGTAGCT ATATGTATATCTTTTGCAATAGCAGCTCCTACGGCTGCGGGTTTGTACACTATTCTTAGT CCACTTGGGAAAGATTATGATCCTCAAGGAGATGAGGAGAATCAAGTGCAGGCTGTGGGA GAAGGACCGGTTAGTAATCGCAAGTTATCTCTTGAAAGGAGATATTCATTTGCTTCTAAT GATGTGAGTAATCCTGAATGGAGAGAGGGAGTTCTTGACATATGGGAAGATATTTCATTG GCTTATCTCTCTCTGTTCTGCACTTTTTGTTTGTTTGGTTGGAACATGGAGAGGATTGGG TTTGGGAATATGTATGTGCACATTGCGACTTTTGTTCTCTTCTGTTTAGCTCCTTTCTTT ATATTCAACTTGGCTGCTATAAACATTGATAACGAGATGGTAAGGGATGCACTTGGATAT ACTGGGATTGTGCTTTGCTTGTTTGGTTTGCTCTATGGTGGTTTTTGGAGAATACAGATG AGGAAAAGATTCAAGTTGCCGGGCTATAACATCTGTTGCGGGAGACCCGCGATTGCTGAT TGTACACTCTGGTTGTTCTGTTGTTGGTGCTCTTTAGCTCAAGAAGTCCGGACCGCGAAT TCTTATGAAATAGTGGAGGATAAATTTTGCAAAAGAAGAGAAGAAAATAGTAAGATTGAT GATGAGGTTGTCGTATCTGCATTGCCTCGTGAAGACGGTGTGTTTGATCCGAGTTGCTTG CCTAAGAAGATGACCACGACGATGATAGCTAGCTCTACTCTTAGCCCGAGCAGACAGAAA GATGAAACTTGCTTGGGAGAGAAAGGTGATGAAGCTCTAAGTCCACCTTCTCCTCCATTC ATACACAGAGAAGCTAGTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G05350.1
PEP Infomation	\| PLAC8 family protein \| Chr5:1585757-1587337 FORWARD LENGTH=526 \| 201606
Sequence	MGSVDEVEISKTRVSCPPALSTSHKILISEEKPRRWSESSLPDVSNRIKLLKFGSPSARL KRMAEERDEVSRSVNSSSSSSHDVVSSRKIEWACLMKMGKQWLQNPLNMVMFLWIFVVAV SGAILFMVMTGMLNHALPKKSQRDVWFEVNNQILNALFTLMCLYQHPKRFYHLVLLCRWK QDDVTTLRKIFCKNGTYKPNEWIHMMVVVLLLHLNCFAQYALCGLNLGYRRSERPAIGVA ICISFAIAAPTAAGLYTILSPLGKDYDPQGDEENQVQAVGEGPVSNRKLSLERRYSFASN DVSNPEWREGVLDIWEDISLAYLSLFCTFCLFGWNMERIGFGNMYVHIATFVLFCLAPFF IFNLAAINIDNEMVRDALGYTGIVLCLFGLLYGGFWRIQMRKRFKLPGYNICCGRPAIAD CTLWLFCCWCSLAQEVRTANSYEIVEDKFCKRREENSKIDDEVVVSALPREDGVFDPSCL PKKMTTTMIASSTLSPSRQKDETCLGEKGDEALSPPSPPFIHREAS

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G05350.1
Transcript Infomation	\| PLAC8 family protein \| Chr5:1585249-1587517 FORWARD LENGTH=2269 \| 201606
Sequence	AATAAGACTATGGTGACATGTCCCAGTCCTATGGCTCATTAACAGTTTGTATACTTTTGA GGAGGCAAGACGTGGAAACCGCTCTTCTTCTCTACCAAAAACTTCTTCTTCCTTCGATGT CTCTCTCATCTGTTACATATCACAATCTTTTGCTTTAAATTGAGATCCTTCTTCAAAGCC GTATCTCTTTCTCTAGTGTAATTCTCCTCTGAAATTCAGCCTTAGTTCGTCTCTTTCGTT CTGGGTTTCTCTGTAATTGTAGCCCAATTCCAATCCTGGGCATGTATTTCAAAGTGTTTC CATCTTCTTTTGTCAAAGTTGAAGACTTTGCTCGTTTTGAATCCGTCCGCTAGTAGAATC TTCTTCTTTGAATCGATTTTGATATCTCTGCTTTATGGGTTTCCACACTTTTGCCAGCAA TGTCTAAGCTTCCAAGAACATGCCTTTGACTAGATTTTCCCGGTAAAGCTTTTTGCTTTT ACTTCTTTTTTCCTGGCACGAGAAATTAATGGGTTCAGTTGATGAGGTTGAGATATCTAA GACTAGGGTTTCATGTCCTCCTGCTCTCTCAACATCTCATAAGATTCTCATCAGTGAAGA GAAACCTAGGAGATGGTCCGAGAGTTCGTTGCCTGATGTCTCTAATAGGATTAAGCTTTT GAAATTTGGTTCCCCTTCTGCTAGACTCAAGAGAATGGCTGAGGAAAGAGATGAAGTTTC ACGCTCTGTCAACAGCTCAAGCTCTAGCAGCCACGATGTGGTGTCTTCCCGGAAAATCGA GTGGGCTTGTTTGATGAAAATGGGTAAGCAATGGCTACAGAACCCGTTGAACATGGTTAT GTTTTTGTGGATCTTTGTGGTTGCTGTCTCCGGTGCGATTCTATTCATGGTTATGACTGG TATGTTGAACCATGCTTTGCCCAAGAAATCACAGAGAGATGTCTGGTTTGAAGTTAACAA CCAAATCCTCAACGCATTGTTTACTCTGATGTGTCTGTATCAACACCCGAAACGGTTTTA CCACCTTGTGCTTCTCTGTAGATGGAAGCAAGACGATGTTACAACGCTTAGGAAGATATT CTGCAAGAACGGGACTTACAAGCCAAACGAATGGATACACATGATGGTTGTTGTTCTTTT GCTTCACTTGAACTGTTTTGCTCAGTATGCGCTTTGCGGTCTTAACTTAGGCTATAGAAG ATCCGAGAGACCTGCCATTGGTGTAGCTATATGTATATCTTTTGCAATAGCAGCTCCTAC GGCTGCGGGTTTGTACACTATTCTTAGTCCACTTGGGAAAGATTATGATCCTCAAGGAGA TGAGGAGAATCAAGTGCAGGCTGTGGGAGAAGGACCGGTTAGTAATCGCAAGTTATCTCT TGAAAGGAGATATTCATTTGCTTCTAATGATGTGAGTAATCCTGAATGGAGAGAGGGAGT TCTTGACATATGGGAAGATATTTCATTGGCTTATCTCTCTCTGTTCTGCACTTTTTGTTT GTTTGGTTGGAACATGGAGAGGATTGGGTTTGGGAATATGTATGTGCACATTGCGACTTT TGTTCTCTTCTGTTTAGCTCCTTTCTTTATATTCAACTTGGCTGCTATAAACATTGATAA CGAGATGGTAAGGGATGCACTTGGATATACTGGGATTGTGCTTTGCTTGTTTGGTTTGCT CTATGGTGGTTTTTGGAGAATACAGATGAGGAAAAGATTCAAGTTGCCGGGCTATAACAT CTGTTGCGGGAGACCCGCGATTGCTGATTGTACACTCTGGTTGTTCTGTTGTTGGTGCTC TTTAGCTCAAGAAGTCCGGACCGCGAATTCTTATGAAATAGTGGAGGATAAATTTTGCAA AAGAAGAGAAGAAAATAGTAAGATTGATGATGAGGTTGTCGTATCTGCATTGCCTCGTGA AGACGGTGTGTTTGATCCGAGTTGCTTGCCTAAGAAGATGACCACGACGATGATAGCTAG CTCTACTCTTAGCCCGAGCAGACAGAAAGATGAAACTTGCTTGGGAGAGAAAGGTGATGA AGCTCTAAGTCCACCTTCTCCTCCATTCATACACAGAGAAGCTAGTTAGAACTTAGAACT AACAGATTTTAATGAAAGTTTGTTAATGTAAAACCAGATATACTATATCTAATTGAAAGT AAAGTTTAAATTCGTTTTGGGGTTTATGGAATTTACGAGTTATAAACAATGTAAAACAGG TTTAGTTTTCTTTGAATTTTCACGTAGGAATACAAGTGTTGTTTGAAGT