Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT4G39530.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr4:18374736-18377240 REVERSE LENGTH=2505 \| 201606
Sequence	ATGAGAAGCTATCGCTGTTGGCGTAAAGTCCAAGAAACCATACGTTTATACTCCTCTTCA TCTTCTTCTGCTTCAAGTCTTTTGGAATTTGTAAACGCAGATTTTCCTTCTACGATAGGA ATCCGAGGAAGGCGCGAATTTGCTCGTCTCTTGCAGCTGCGTGCGTCAGATGATCTGTTG CATTATCAAAATGTAGTTCATGGTCAGATTATTGTTTGGGGCCTCGAGTTAGATACGTAT CTTAGCAACATTTTGATCAATTTGTATTCGAGAGCTGGTGGTATGGTTTATGCACGTAAG GTGTTCGAGAAAATGCCTGAGAGAAACTTAGTTTCTTGGTCTACCATGGTTTCAGCTTGC AACCATCATGGGATTTATGAGGAATCTTTGGTGGTTTTCTTAGAGTTCTGGAGAACTAGA AAAGACAGTCCGAATGAATATATTTTGTCGAGTTTTATTCAAGCTTGCTCAGGCTTAGAT GGTCGTGGGCGTTGGATGGTGTTTCAACTACAAAGTTTTCTTGTCAAGAGTGGGTTTGAT AGGGATGTTTATGTTGGTACCTTGTTGATTGATTTTTATTTGAAGGATGGTAATATCGAT TATGCGAGGCTTGTGTTTGATGCTTTACCAGAGAAATCTACTGTGACTTGGACGACCATG ATCAGTGGGTGTGTAAAAATGGGAAGAAGCTACGTTTCATTACAGCTGTTCTACCAACTA ATGGAAGACAATGTTGTTCCAGATGGCTACATCCTTTCGACGGTTCTAAGTGCATGTTCA ATACTTCCGTTTCTTGAAGGTGGGAAGCAGATTCATGCGCACATCTTAAGATATGGACTT GAGATGGATGCCTCACTGATGAATGTGCTTATAGATTCTTATGTGAAGTGTGGCAGAGTT ATAGCGGCTCATAAGCTATTCAATGGAATGCCGAATAAAAACATCATTTCGTGGACCACT TTGCTCTCTGGTTATAAGCAGAACGCTCTTCATAAAGAAGCCATGGAATTGTTTACCAGT ATGTCAAAGTTTGGTTTAAAGCCGGATATGTATGCTTGCTCTAGCATACTCACATCTTGT GCCTCACTTCATGCTTTGGGATTTGGAACACAAGTTCATGCTTACACTATCAAAGCCAAT CTTGGCAATGATAGCTATGTGACTAACAGCTTGATTGACATGTATGCGAAATGTGACTGT TTGACCGATGCCAGAAAAGTTTTTGATATTTTCGCTGCTGCTGATGTGGTTTTATTCAAT GCAATGATTGAAGGTTACTCGAGACTTGGGACACAATGGGAACTACATGAAGCATTGAAC ATCTTTCGTGACATGAGGTTCAGATTGATTCGACCTAGCCTATTGACTTTTGTTAGCCTT CTACGTGCATCTGCTTCTTTAACAAGCTTGGGACTGAGTAAACAAATCCATGGATTGATG TTCAAATATGGGTTAAACTTAGATATATTTGCTGGAAGCGCTTTGATTGATGTTTACTCA AATTGCTACTGCCTCAAGGATTCCAGGCTTGTGTTTGATGAAATGAAAGTGAAAGATCTT GTTATCTGGAATTCTATGTTTGCAGGTTATGTTCAACAATCAGAGAACGAAGAAGCTCTC AACCTGTTTCTGGAATTACAGTTATCAAGAGAAAGACCTGACGAATTCACGTTTGCCAAC ATGGTTACAGCAGCTGGCAACCTAGCAAGTGTTCAATTGGGTCAAGAGTTCCATTGCCAG CTTCTGAAAAGAGGCTTGGAATGTAATCCGTATATTACAAATGCTCTACTAGATATGTAC GCCAAATGTGGTAGTCCCGAAGACGCTCATAAGGCTTTTGATTCAGCAGCTTCAAGAGAT GTAGTTTGTTGGAATTCTGTCATCTCATCTTATGCGAATCATGGAGAAGGCAAAAAGGCT CTTCAGATGCTTGAAAAAATGATGAGTGAGGGAATAGAGCCTAACTACATCACCTTTGTT GGAGTTCTATCAGCGTGTAGCCATGCTGGTCTTGTAGAAGATGGACTTAAGCAATTTGAG TTAATGCTTCGATTTGGAATTGAACCTGAAACTGAGCACTATGTTTGTATGGTATCTCTT TTAGGCCGTGCTGGTAGATTGAACAAAGCAAGGGAGTTAATTGAGAAAATGCCGACAAAA CCAGCTGCTATAGTATGGAGGAGCTTGCTGAGTGGATGCGCAAAGGCCGGTAACGTCGAG TTAGCTGAACATGCTGCTGAAATGGCTATTTTGTCTGATCCCAAGGACAGTGGATCGTTT ACTATGCTTTCTAATATTTACGCGTCCAAGGGTATGTGGACTGAAGCTAAGAAGGTGAGA GAAAGAATGAAGGTTGAAGGTGTGGTGAAAGAACCTGGACGTAGTTGGATTGGGATTAAT AAGGAGGTTCATATATTTTTGTCTAAGGATAAATCTCACTGCAAGGCTAATCAAATTTAT GAAGTGTTAGACGACTTACTTGTGCAGATCAGAGGAGTTAGTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT4G39530.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr4:18374736-18377240 REVERSE LENGTH=834 \| 201606
Sequence	MRSYRCWRKVQETIRLYSSSSSSASSLLEFVNADFPSTIGIRGRREFARLLQLRASDDLL HYQNVVHGQIIVWGLELDTYLSNILINLYSRAGGMVYARKVFEKMPERNLVSWSTMVSAC NHHGIYEESLVVFLEFWRTRKDSPNEYILSSFIQACSGLDGRGRWMVFQLQSFLVKSGFD RDVYVGTLLIDFYLKDGNIDYARLVFDALPEKSTVTWTTMISGCVKMGRSYVSLQLFYQL MEDNVVPDGYILSTVLSACSILPFLEGGKQIHAHILRYGLEMDASLMNVLIDSYVKCGRV IAAHKLFNGMPNKNIISWTTLLSGYKQNALHKEAMELFTSMSKFGLKPDMYACSSILTSC ASLHALGFGTQVHAYTIKANLGNDSYVTNSLIDMYAKCDCLTDARKVFDIFAAADVVLFN AMIEGYSRLGTQWELHEALNIFRDMRFRLIRPSLLTFVSLLRASASLTSLGLSKQIHGLM FKYGLNLDIFAGSALIDVYSNCYCLKDSRLVFDEMKVKDLVIWNSMFAGYVQQSENEEAL NLFLELQLSRERPDEFTFANMVTAAGNLASVQLGQEFHCQLLKRGLECNPYITNALLDMY AKCGSPEDAHKAFDSAASRDVVCWNSVISSYANHGEGKKALQMLEKMMSEGIEPNYITFV GVLSACSHAGLVEDGLKQFELMLRFGIEPETEHYVCMVSLLGRAGRLNKARELIEKMPTK PAAIVWRSLLSGCAKAGNVELAEHAAEMAILSDPKDSGSFTMLSNIYASKGMWTEAKKVR ERMKVEGVVKEPGRSWIGINKEVHIFLSKDKSHCKANQIYEVLDDLLVQIRGVS

Transcript Sequence

Transcript ID	AT4G39530.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr4:18374368-18377309 REVERSE LENGTH=2942 \| 201606
Sequence	TTCGCTTATGACAAAAAACGGCAGCATGTTTATTCGTCACAGCACGCTCTGTTCTTCTCA CTCAGGAGGATGAGAAGCTATCGCTGTTGGCGTAAAGTCCAAGAAACCATACGTTTATAC TCCTCTTCATCTTCTTCTGCTTCAAGTCTTTTGGAATTTGTAAACGCAGATTTTCCTTCT ACGATAGGAATCCGAGGAAGGCGCGAATTTGCTCGTCTCTTGCAGCTGCGTGCGTCAGAT GATCTGTTGCATTATCAAAATGTAGTTCATGGTCAGATTATTGTTTGGGGCCTCGAGTTA GATACGTATCTTAGCAACATTTTGATCAATTTGTATTCGAGAGCTGGTGGTATGGTTTAT GCACGTAAGGTGTTCGAGAAAATGCCTGAGAGAAACTTAGTTTCTTGGTCTACCATGGTT TCAGCTTGCAACCATCATGGGATTTATGAGGAATCTTTGGTGGTTTTCTTAGAGTTCTGG AGAACTAGAAAAGACAGTCCGAATGAATATATTTTGTCGAGTTTTATTCAAGCTTGCTCA GGCTTAGATGGTCGTGGGCGTTGGATGGTGTTTCAACTACAAAGTTTTCTTGTCAAGAGT GGGTTTGATAGGGATGTTTATGTTGGTACCTTGTTGATTGATTTTTATTTGAAGGATGGT AATATCGATTATGCGAGGCTTGTGTTTGATGCTTTACCAGAGAAATCTACTGTGACTTGG ACGACCATGATCAGTGGGTGTGTAAAAATGGGAAGAAGCTACGTTTCATTACAGCTGTTC TACCAACTAATGGAAGACAATGTTGTTCCAGATGGCTACATCCTTTCGACGGTTCTAAGT GCATGTTCAATACTTCCGTTTCTTGAAGGTGGGAAGCAGATTCATGCGCACATCTTAAGA TATGGACTTGAGATGGATGCCTCACTGATGAATGTGCTTATAGATTCTTATGTGAAGTGT GGCAGAGTTATAGCGGCTCATAAGCTATTCAATGGAATGCCGAATAAAAACATCATTTCG TGGACCACTTTGCTCTCTGGTTATAAGCAGAACGCTCTTCATAAAGAAGCCATGGAATTG TTTACCAGTATGTCAAAGTTTGGTTTAAAGCCGGATATGTATGCTTGCTCTAGCATACTC ACATCTTGTGCCTCACTTCATGCTTTGGGATTTGGAACACAAGTTCATGCTTACACTATC AAAGCCAATCTTGGCAATGATAGCTATGTGACTAACAGCTTGATTGACATGTATGCGAAA TGTGACTGTTTGACCGATGCCAGAAAAGTTTTTGATATTTTCGCTGCTGCTGATGTGGTT TTATTCAATGCAATGATTGAAGGTTACTCGAGACTTGGGACACAATGGGAACTACATGAA GCATTGAACATCTTTCGTGACATGAGGTTCAGATTGATTCGACCTAGCCTATTGACTTTT GTTAGCCTTCTACGTGCATCTGCTTCTTTAACAAGCTTGGGACTGAGTAAACAAATCCAT GGATTGATGTTCAAATATGGGTTAAACTTAGATATATTTGCTGGAAGCGCTTTGATTGAT GTTTACTCAAATTGCTACTGCCTCAAGGATTCCAGGCTTGTGTTTGATGAAATGAAAGTG AAAGATCTTGTTATCTGGAATTCTATGTTTGCAGGTTATGTTCAACAATCAGAGAACGAA GAAGCTCTCAACCTGTTTCTGGAATTACAGTTATCAAGAGAAAGACCTGACGAATTCACG TTTGCCAACATGGTTACAGCAGCTGGCAACCTAGCAAGTGTTCAATTGGGTCAAGAGTTC CATTGCCAGCTTCTGAAAAGAGGCTTGGAATGTAATCCGTATATTACAAATGCTCTACTA GATATGTACGCCAAATGTGGTAGTCCCGAAGACGCTCATAAGGCTTTTGATTCAGCAGCT TCAAGAGATGTAGTTTGTTGGAATTCTGTCATCTCATCTTATGCGAATCATGGAGAAGGC AAAAAGGCTCTTCAGATGCTTGAAAAAATGATGAGTGAGGGAATAGAGCCTAACTACATC ACCTTTGTTGGAGTTCTATCAGCGTGTAGCCATGCTGGTCTTGTAGAAGATGGACTTAAG CAATTTGAGTTAATGCTTCGATTTGGAATTGAACCTGAAACTGAGCACTATGTTTGTATG GTATCTCTTTTAGGCCGTGCTGGTAGATTGAACAAAGCAAGGGAGTTAATTGAGAAAATG CCGACAAAACCAGCTGCTATAGTATGGAGGAGCTTGCTGAGTGGATGCGCAAAGGCCGGT AACGTCGAGTTAGCTGAACATGCTGCTGAAATGGCTATTTTGTCTGATCCCAAGGACAGT GGATCGTTTACTATGCTTTCTAATATTTACGCGTCCAAGGGTATGTGGACTGAAGCTAAG AAGGTGAGAGAAAGAATGAAGGTTGAAGGTGTGGTGAAAGAACCTGGACGTAGTTGGATT GGGATTAATAAGGAGGTTCATATATTTTTGTCTAAGGATAAATCTCACTGCAAGGCTAAT CAAATTTATGAAGTGTTAGACGACTTACTTGTGCAGATCAGAGGAGTTAGTTAATAACTA CCATACAAGAACTCATTTTCTATTGGAGTGATGGACTCTATTTGGTTAAAGACCAATGCA GCAGATGAAGCTTAAAAGCGAGCCAAAGAAGAAAGAATAAGCCATGGTTAATATCGAGAA GCTGAAGGGGTAGCTAGCTCAGGAGAGCAAAGATGTTGCTATTAAGTTTTGTAATCAAGG GAAAATCGATTCTGTTCCGTTCAAATCCGAAGGAAGACTCAAAAATTAACCCCGGTTCAG TTCTCAGTTTCTTCTCATCATCTCCTAAAACCGGGTTGAGAGAGAAGTTGTAATGGTGAA TGCATGAATGGTATGTTGTACATGATTCATTTGAATTTAGTTAAACCGTTTTTGAAATCA AC