Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT4G39400.1
CDS Infomation	\| Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein \| Chr4:18324826-18328416 FORWARD LENGTH=3591 \| 201606
Sequence	ATGAAGACTTTTTCAAGCTTCTTTCTCTCTGTAACAACTCTCTTCTTCTTCTCCTTCTTT TCTCTTTCATTTCAAGCTTCACCATCTCAGTCTTTATACAGAGAAATCCATCAGCTTATA AGCTTCAAAGACGTTCTTCCTGACAAGAATCTTCTCCCAGACTGGTCTTCCAACAAAAAC CCGTGTACTTTCGATGGCGTTACTTGCAGAGACGACAAAGTTACTTCGATTGATCTCAGC TCCAAGCCTCTCAACGTCGGATTCAGTGCCGTGTCCTCGTCTCTCCTGTCTCTCACCGGA TTAGAGTCTCTGTTTCTCTCAAACTCACACATCAATGGCTCCGTTTCTGGCTTCAAGTGC TCTGCTTCTTTAACCAGCTTGGATCTATCTAGAAACTCTCTTTCGGGTCCTGTAACGACT CTAACAAGCCTTGGTTCTTGCTCCGGTCTGAAGTTTCTTAACGTCTCTTCCAATACACTT GATTTTCCCGGGAAAGTTTCAGGTGGGTTGAAGCTAAACAGCTTGGAAGTTCTGGATCTT TCTGCGAATTCAATCTCCGGTGCTAACGTCGTTGGTTGGGTTCTCTCCGATGGGTGTGGA GAGTTGAAACATTTAGCGATTAGCGGAAACAAAATCAGTGGAGACGTCGATGTTTCTCGC TGCGTGAATCTCGAGTTTCTCGATGTTTCCTCCAACAATTTCTCCACTGGGATTCCTTTC CTCGGAGATTGCTCTGCTCTGCAACATCTTGACATCTCCGGGAACAAATTATCCGGCGAT TTCTCCCGTGCTATCTCTACTTGCACAGAGCTCAAGTTGTTGAACATCTCTAGTAACCAA TTCGTCGGACCAATCCCTCCGCTACCGCTTAAAAGTCTCCAATACCTCTCTCTGGCCGAG AACAAATTCACCGGCGAGATCCCTGACTTTCTCTCCGGCGCGTGTGATACACTCACTGGT CTCGATCTCTCTGGAAATCATTTCTACGGTGCGGTTCCTCCATTCTTCGGTTCATGTTCT CTTCTCGAATCACTCGCGTTGTCGAGTAACAACTTCTCTGGCGAGTTACCGATGGATACG TTGTTGAAGATGAGAGGACTCAAAGTACTTGATCTGTCTTTCAACGAGTTTTCCGGCGAA TTACCGGAATCTCTGACGAATCTATCCGCTTCGTTGCTAACGTTAGATCTCAGCTCCAAC AATTTCTCCGGTCCGATTCTCCCAAATCTCTGCCAGAACCCTAAAAACACTCTGCAGGAG CTTTACCTTCAGAACAATGGCTTCACCGGGAAGATTCCACCGACTTTAAGCAACTGTTCT GAGCTGGTTTCGCTTCACTTGAGCTTCAATTACCTCTCCGGGACAATCCCTTCGAGCTTA GGCTCTCTATCGAAGCTTCGAGATCTGAAACTATGGCTGAATATGTTAGAAGGAGAGATC CCTCAGGAGCTCATGTATGTCAAGACCTTAGAGACTCTGATCCTCGACTTCAACGATTTA ACCGGTGAAATCCCTTCCGGTTTAAGTAACTGTACCAATCTTAACTGGATTTCTCTGTCG AATAACCGGTTAACCGGTGAGATTCCGAAATGGATTGGCCGGTTAGAGAATCTCGCTATC CTCAAGCTAAGCAACAATTCATTCTCCGGGAACATTCCGGCTGAGCTCGGCGACTGCAGA AGCTTAATCTGGCTTGATCTCAACACCAATCTCTTCAATGGAACGATTCCGGCGGCGATG TTTAAACAATCCGGGAAAATCGCTGCCAATTTCATCGCCGGTAAGAGGTACGTTTATATC AAAAACGATGGGATGAAGAAAGAGTGTCATGGAGCTGGTAATTTACTTGAGTTTCAAGGA ATCAGATCCGAACAATTAAACCGGCTTTCAACGAGGAACCCTTGTAATATCACTAGCAGA GTCTATGGAGGTCACACTTCGCCGACGTTTGATAACAATGGTTCGATGATGTTTCTGGAC ATGTCTTACAACATGTTGTCTGGATACATACCGAAGGAGATTGGTTCGATGCCTTATCTG TTTATTCTCAATTTGGGTCATAACGATATCTCTGGTTCGATTCCTGATGAGGTAGGTGAT CTAAGAGGTTTAAACATTCTTGATCTTTCAAGCAATAAGCTCGATGGGAGGATTCCTCAG GCTATGTCAGCTCTTACTATGCTTACGGAAATCGATTTGTCGAATAATAATTTGTCTGGT CCGATTCCTGAGATGGGTCAGTTTGAGACTTTTCCACCGGCTAAGTTCTTGAACAATCCT GGTCTCTGTGGTTATCCTCTTCCGCGGTGTGATCCTTCAAATGCAGACGGTTATGCTCAT CATCAGAGATCTCATGGAAGGAGACCAGCGTCCCTTGCTGGTAGTGTGGCGATGGGATTG TTGTTCTCTTTTGTGTGTATATTTGGGCTGATCCTTGTTGGTAGAGAGATGAGGAAGAGA CGGAGAAAGAAAGAGGCGGAGTTGGAGATGTATGCGGAAGGACATGGAAACTCTGGCGAT AGAACTGCTAACAACACCAATTGGAAGCTGACTGGTGTGAAAGAAGCCTTGAGTATCAAT CTTGCTGCTTTCGAGAAGCCATTGCGGAAGCTCACGTTTGCGGATCTTCTTCAGGCTACC AATGGTTTCCATAATGATAGTCTGATTGGTTCTGGTGGGTTTGGAGATGTTTACAAAGCG ATTTTGAAAGATGGAAGCGCGGTGGCTATCAAGAAACTGATTCATGTTAGCGGTCAAGGT GATAGAGAGTTCATGGCGGAGATGGAAACCATTGGGAAGATCAAACATCGAAATCTTGTG CCTCTTCTTGGTTATTGCAAAGTTGGAGACGAGCGGCTTCTTGTGTATGAGTTTATGAAG TATGGAAGTTTAGAAGATGTTTTGCACGACCCCAAGAAAGCTGGGGTGAAACTAAACTGG TCCACACGGCGGAAGATTGCGATAGGATCAGCTAGAGGGCTTGCTTTCCTTCACCACAAC TGCAGTCCGCATATCATCCACAGAGACATGAAATCCAGTAATGTGTTGCTTGATGAGAAT TTGGAAGCTCGGGTTTCAGATTTTGGCATGGCGAGGCTGATGAGTGCGATGGATACGCAT TTAAGCGTCAGTACATTAGCTGGTACACCGGGTTACGTTCCTCCAGAGTATTACCAAAGT TTCAGGTGTTCAACAAAAGGAGACGTTTATAGTTACGGTGTGGTCTTACTCGAGCTACTC ACGGGTAAACGGCCAACGGATTCACCGGATTTTGGAGATAACAACCTTGTTGGATGGGTG AAACAGCACGCAAAACTGCGGATTAGCGATGTGTTTGACCCCGAGCTTATGAAGGAAGAT CCAGCATTAGAGATCGAACTTTTACAACATTTAAAAGTTGCGGTTGCGTGTTTGGATGAT CGGGCTTGGAGACGACCGACAATGGTACAAGTCATGGCCATGTTTAAGGAGATACAAGCC GGGTCAGGGATAGATTCACAGTCAACGATCAGATCAATAGAGGATGGAGGGTTCAGTACA ATAGAGATGGTTGATATGAGTATAAAAGAAGTTCCTGAAGGAAAATTATGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT4G39400.1
PEP Infomation	\| Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein \| Chr4:18324826-18328416 FORWARD LENGTH=1196 \| 201606
Sequence	MKTFSSFFLSVTTLFFFSFFSLSFQASPSQSLYREIHQLISFKDVLPDKNLLPDWSSNKN PCTFDGVTCRDDKVTSIDLSSKPLNVGFSAVSSSLLSLTGLESLFLSNSHINGSVSGFKC SASLTSLDLSRNSLSGPVTTLTSLGSCSGLKFLNVSSNTLDFPGKVSGGLKLNSLEVLDL SANSISGANVVGWVLSDGCGELKHLAISGNKISGDVDVSRCVNLEFLDVSSNNFSTGIPF LGDCSALQHLDISGNKLSGDFSRAISTCTELKLLNISSNQFVGPIPPLPLKSLQYLSLAE NKFTGEIPDFLSGACDTLTGLDLSGNHFYGAVPPFFGSCSLLESLALSSNNFSGELPMDT LLKMRGLKVLDLSFNEFSGELPESLTNLSASLLTLDLSSNNFSGPILPNLCQNPKNTLQE LYLQNNGFTGKIPPTLSNCSELVSLHLSFNYLSGTIPSSLGSLSKLRDLKLWLNMLEGEI PQELMYVKTLETLILDFNDLTGEIPSGLSNCTNLNWISLSNNRLTGEIPKWIGRLENLAI LKLSNNSFSGNIPAELGDCRSLIWLDLNTNLFNGTIPAAMFKQSGKIAANFIAGKRYVYI KNDGMKKECHGAGNLLEFQGIRSEQLNRLSTRNPCNITSRVYGGHTSPTFDNNGSMMFLD MSYNMLSGYIPKEIGSMPYLFILNLGHNDISGSIPDEVGDLRGLNILDLSSNKLDGRIPQ AMSALTMLTEIDLSNNNLSGPIPEMGQFETFPPAKFLNNPGLCGYPLPRCDPSNADGYAH HQRSHGRRPASLAGSVAMGLLFSFVCIFGLILVGREMRKRRRKKEAELEMYAEGHGNSGD RTANNTNWKLTGVKEALSINLAAFEKPLRKLTFADLLQATNGFHNDSLIGSGGFGDVYKA ILKDGSAVAIKKLIHVSGQGDREFMAEMETIGKIKHRNLVPLLGYCKVGDERLLVYEFMK YGSLEDVLHDPKKAGVKLNWSTRRKIAIGSARGLAFLHHNCSPHIIHRDMKSSNVLLDEN LEARVSDFGMARLMSAMDTHLSVSTLAGTPGYVPPEYYQSFRCSTKGDVYSYGVVLLELL TGKRPTDSPDFGDNNLVGWVKQHAKLRISDVFDPELMKEDPALEIELLQHLKVAVACLDD RAWRRPTMVQVMAMFKEIQAGSGIDSQSTIRSIEDGGFSTIEMVDMSIKEVPEGKL

Transcript Sequence

Transcript ID	AT4G39400.1
Transcript Infomation	\| Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein \| Chr4:18324457-18328831 FORWARD LENGTH=4375 \| 201606
Sequence	CTTGCATTAATTAACTTTTTTTTTATAACCACATACAATAATTAAAAGTAGTATTATTTG TTTGTATCTGTTATCGAAATTGAAATTAATATATATAATTTTTATAATAATCAGAAGAAG AGGTAACATGGCATGTGAGTGCACAGCTGTGACCACTCTTCCCTTCACCATTTGATAAAT ACCTTCTTCCATCTTCCTTCTTCTGTCTTTTGACTCTCTTCTCTCTCTCCTCTCTTTCTG CTTTCCTCAATCTCTCTCTTTCTATCTCTAGAGCTTCCACTTCCTCTCTAATGGTGGAAC CAAAACCCTAGATTCCCCCTTTCATCTTCTCTACTTCCCACACTTTTCTCTCTCACAAAC TCTTGAGAAATGAAGACTTTTTCAAGCTTCTTTCTCTCTGTAACAACTCTCTTCTTCTTC TCCTTCTTTTCTCTTTCATTTCAAGCTTCACCATCTCAGTCTTTATACAGAGAAATCCAT CAGCTTATAAGCTTCAAAGACGTTCTTCCTGACAAGAATCTTCTCCCAGACTGGTCTTCC AACAAAAACCCGTGTACTTTCGATGGCGTTACTTGCAGAGACGACAAAGTTACTTCGATT GATCTCAGCTCCAAGCCTCTCAACGTCGGATTCAGTGCCGTGTCCTCGTCTCTCCTGTCT CTCACCGGATTAGAGTCTCTGTTTCTCTCAAACTCACACATCAATGGCTCCGTTTCTGGC TTCAAGTGCTCTGCTTCTTTAACCAGCTTGGATCTATCTAGAAACTCTCTTTCGGGTCCT GTAACGACTCTAACAAGCCTTGGTTCTTGCTCCGGTCTGAAGTTTCTTAACGTCTCTTCC AATACACTTGATTTTCCCGGGAAAGTTTCAGGTGGGTTGAAGCTAAACAGCTTGGAAGTT CTGGATCTTTCTGCGAATTCAATCTCCGGTGCTAACGTCGTTGGTTGGGTTCTCTCCGAT GGGTGTGGAGAGTTGAAACATTTAGCGATTAGCGGAAACAAAATCAGTGGAGACGTCGAT GTTTCTCGCTGCGTGAATCTCGAGTTTCTCGATGTTTCCTCCAACAATTTCTCCACTGGG ATTCCTTTCCTCGGAGATTGCTCTGCTCTGCAACATCTTGACATCTCCGGGAACAAATTA TCCGGCGATTTCTCCCGTGCTATCTCTACTTGCACAGAGCTCAAGTTGTTGAACATCTCT AGTAACCAATTCGTCGGACCAATCCCTCCGCTACCGCTTAAAAGTCTCCAATACCTCTCT CTGGCCGAGAACAAATTCACCGGCGAGATCCCTGACTTTCTCTCCGGCGCGTGTGATACA CTCACTGGTCTCGATCTCTCTGGAAATCATTTCTACGGTGCGGTTCCTCCATTCTTCGGT TCATGTTCTCTTCTCGAATCACTCGCGTTGTCGAGTAACAACTTCTCTGGCGAGTTACCG ATGGATACGTTGTTGAAGATGAGAGGACTCAAAGTACTTGATCTGTCTTTCAACGAGTTT TCCGGCGAATTACCGGAATCTCTGACGAATCTATCCGCTTCGTTGCTAACGTTAGATCTC AGCTCCAACAATTTCTCCGGTCCGATTCTCCCAAATCTCTGCCAGAACCCTAAAAACACT CTGCAGGAGCTTTACCTTCAGAACAATGGCTTCACCGGGAAGATTCCACCGACTTTAAGC AACTGTTCTGAGCTGGTTTCGCTTCACTTGAGCTTCAATTACCTCTCCGGGACAATCCCT TCGAGCTTAGGCTCTCTATCGAAGCTTCGAGATCTGAAACTATGGCTGAATATGTTAGAA GGAGAGATCCCTCAGGAGCTCATGTATGTCAAGACCTTAGAGACTCTGATCCTCGACTTC AACGATTTAACCGGTGAAATCCCTTCCGGTTTAAGTAACTGTACCAATCTTAACTGGATT TCTCTGTCGAATAACCGGTTAACCGGTGAGATTCCGAAATGGATTGGCCGGTTAGAGAAT CTCGCTATCCTCAAGCTAAGCAACAATTCATTCTCCGGGAACATTCCGGCTGAGCTCGGC GACTGCAGAAGCTTAATCTGGCTTGATCTCAACACCAATCTCTTCAATGGAACGATTCCG GCGGCGATGTTTAAACAATCCGGGAAAATCGCTGCCAATTTCATCGCCGGTAAGAGGTAC GTTTATATCAAAAACGATGGGATGAAGAAAGAGTGTCATGGAGCTGGTAATTTACTTGAG TTTCAAGGAATCAGATCCGAACAATTAAACCGGCTTTCAACGAGGAACCCTTGTAATATC ACTAGCAGAGTCTATGGAGGTCACACTTCGCCGACGTTTGATAACAATGGTTCGATGATG TTTCTGGACATGTCTTACAACATGTTGTCTGGATACATACCGAAGGAGATTGGTTCGATG CCTTATCTGTTTATTCTCAATTTGGGTCATAACGATATCTCTGGTTCGATTCCTGATGAG GTAGGTGATCTAAGAGGTTTAAACATTCTTGATCTTTCAAGCAATAAGCTCGATGGGAGG ATTCCTCAGGCTATGTCAGCTCTTACTATGCTTACGGAAATCGATTTGTCGAATAATAAT TTGTCTGGTCCGATTCCTGAGATGGGTCAGTTTGAGACTTTTCCACCGGCTAAGTTCTTG AACAATCCTGGTCTCTGTGGTTATCCTCTTCCGCGGTGTGATCCTTCAAATGCAGACGGT TATGCTCATCATCAGAGATCTCATGGAAGGAGACCAGCGTCCCTTGCTGGTAGTGTGGCG ATGGGATTGTTGTTCTCTTTTGTGTGTATATTTGGGCTGATCCTTGTTGGTAGAGAGATG AGGAAGAGACGGAGAAAGAAAGAGGCGGAGTTGGAGATGTATGCGGAAGGACATGGAAAC TCTGGCGATAGAACTGCTAACAACACCAATTGGAAGCTGACTGGTGTGAAAGAAGCCTTG AGTATCAATCTTGCTGCTTTCGAGAAGCCATTGCGGAAGCTCACGTTTGCGGATCTTCTT CAGGCTACCAATGGTTTCCATAATGATAGTCTGATTGGTTCTGGTGGGTTTGGAGATGTT TACAAAGCGATTTTGAAAGATGGAAGCGCGGTGGCTATCAAGAAACTGATTCATGTTAGC GGTCAAGGTGATAGAGAGTTCATGGCGGAGATGGAAACCATTGGGAAGATCAAACATCGA AATCTTGTGCCTCTTCTTGGTTATTGCAAAGTTGGAGACGAGCGGCTTCTTGTGTATGAG TTTATGAAGTATGGAAGTTTAGAAGATGTTTTGCACGACCCCAAGAAAGCTGGGGTGAAA CTAAACTGGTCCACACGGCGGAAGATTGCGATAGGATCAGCTAGAGGGCTTGCTTTCCTT CACCACAACTGCAGTCCGCATATCATCCACAGAGACATGAAATCCAGTAATGTGTTGCTT GATGAGAATTTGGAAGCTCGGGTTTCAGATTTTGGCATGGCGAGGCTGATGAGTGCGATG GATACGCATTTAAGCGTCAGTACATTAGCTGGTACACCGGGTTACGTTCCTCCAGAGTAT TACCAAAGTTTCAGGTGTTCAACAAAAGGAGACGTTTATAGTTACGGTGTGGTCTTACTC GAGCTACTCACGGGTAAACGGCCAACGGATTCACCGGATTTTGGAGATAACAACCTTGTT GGATGGGTGAAACAGCACGCAAAACTGCGGATTAGCGATGTGTTTGACCCCGAGCTTATG AAGGAAGATCCAGCATTAGAGATCGAACTTTTACAACATTTAAAAGTTGCGGTTGCGTGT TTGGATGATCGGGCTTGGAGACGACCGACAATGGTACAAGTCATGGCCATGTTTAAGGAG ATACAAGCCGGGTCAGGGATAGATTCACAGTCAACGATCAGATCAATAGAGGATGGAGGG TTCAGTACAATAGAGATGGTTGATATGAGTATAAAAGAAGTTCCTGAAGGAAAATTATGA GAGTTAGAAACAGAGCCAAAGCAGATTCTTTGAACATCAAAATCATCTAAGGGTCAGTCC GATTTTCCTTGGGTCTATTTTTTTTGTATTTTCTACTATATGCTAAGTGTATGTATCTAT GTTATTTATACATAAGACGGATGTTTTTTTTTTCGGGCTCGGTCGAATTGGGGGTGGTGG AGAATAGAACTAAGTAATAACTTTGTTAAGAATATGTAAATATACAGTTTTTTGGGGAGG GATTTGTAATGTTTTCGTTTTTAGTTCTATGGAAATTTCTACGTTGCTAACAAATTAAAT TTATAATGAATCATGAAGAAACAAAGAGCCAATGTGTATTAAATTTCGACTGATCATGTT CATGTAAATGCACGTGACCTATTAATTCATTATTGTCGGAATTAATTTGGGGAAT