Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT4G38010.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein \| Chr4:17859582-17861261 REVERSE LENGTH=1680 \| 201606
Sequence	ATGTATTTGCCGGAGAAATCAGTTCTTCTGGAATTGATCAGCCGATGCAGCTCTCTTCGC GTTTTCAAACAGATACAGACTCAATTGATTACTCGTGATCTTCTTCGTGATGACTTAATC ATCAACAAAGTCGTGACCTTTCTGGGCAAATCCGCAGATTTTGCATCTTACAGCTCTGTA ATTCTCCACAGTATCCGTTCTGTGTTGAGCTCTTTCTCATACAACACGCTTTTATCAAGC TATGCAGTTTGTGATAAACCAAGAGTGACGATTTTTGCTTACAAAACATTTGTGAGTAAT GGGTTTTCACCGGACATGTTCACGTTTCCTCCAGTTTTTAAGGCTTGTGGGAAGTTTTCA GGGATCAGAGAAGGGAAACAGATTCATGGAATTGTTACGAAGATGGGTTTTTACGATGAT ATCTATGTGCAAAACTCGCTTGTTCATTTTTATGGTGTGTGTGGAGAATCAAGGAATGCA TGTAAAGTGTTCGGTGAAATGCCTGTGAGAGATGTTGTTTCGTGGACTGGGATTATAACT GGTTTCACGAGGACTGGGTTGTATAAGGAAGCTTTGGATACGTTTTCAAAGATGGATGTT GAGCCTAATTTGGCTACGTATGTTTGTGTATTGGTCTCAAGTGGGCGGGTAGGGTGTTTA AGTTTAGGGAAAGGAATCCATGGGTTGATCTTAAAAAGGGCATCTTTGATCAGCTTAGAG ACTGGTAATGCTCTTATAGATATGTATGTGAAATGTGAGCAATTGTCTGATGCGATGAGA GTTTTTGGTGAGTTGGAAAAGAAAGATAAAGTTTCTTGGAATAGTATGATTAGTGGGTTG GTTCACTGTGAAAGATCTAAGGAGGCGATTGACTTGTTTTCTCTGATGCAAACGTCTTCT GGTATAAAGCCAGATGGGCATATACTTACAAGTGTTCTCTCTGCGTGTGCTAGCTTAGGA GCTGTGGATCACGGAAGATGGGTTCATGAGTATATTTTAACCGCTGGAATCAAATGGGAT ACGCATATTGGAACTGCCATTGTTGATATGTATGCAAAATGTGGCTACATCGAAACAGCT TTGGAGATTTTCAACGGAATTAGAAGTAAGAATGTGTTTACTTGGAATGCTCTGTTAGGT GGTTTAGCTATCCATGGGCATGGACTTGAATCCCTTAGATACTTTGAAGAAATGGTTAAG CTAGGTTTTAAGCCGAACCTGGTAACTTTTCTCGCGGCTCTAAATGCTTGTTGCCACACA GGTTTAGTCGATGAAGGGAGAAGATATTTCCATAAAATGAAAAGCAGAGAATACAATCTA TTTCCTAAGCTAGAACATTATGGATGCATGATTGATTTGCTTTGTAGAGCTGGATTGTTA GATGAAGCATTGGAACTCGTCAAAGCAATGCCGGTTAAACCGGATGTACGTATATGTGGA GCTATTCTTAGTGCTTGTAAGAATAGAGGGACATTAATGGAGCTTCCTAAAGAGATATTA GATAGTTTTTTAGATATTGAGTTTGAAGATAGTGGTGTTTATGTGTTGCTGTCTAATATT TTTGCTGCTAATAGAAGATGGGATGATGTTGCGAGAATCAGGAGGTTGATGAAGGTAAAA GGTATCTCGAAGGTTCCAGGATCAAGTTATATAGAGAAGTTTATGACTTTAGACCAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT4G38010.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein \| Chr4:17859582-17861261 REVERSE LENGTH=559 \| 201606
Sequence	MYLPEKSVLLELISRCSSLRVFKQIQTQLITRDLLRDDLIINKVVTFLGKSADFASYSSV ILHSIRSVLSSFSYNTLLSSYAVCDKPRVTIFAYKTFVSNGFSPDMFTFPPVFKACGKFS GIREGKQIHGIVTKMGFYDDIYVQNSLVHFYGVCGESRNACKVFGEMPVRDVVSWTGIIT GFTRTGLYKEALDTFSKMDVEPNLATYVCVLVSSGRVGCLSLGKGIHGLILKRASLISLE TGNALIDMYVKCEQLSDAMRVFGELEKKDKVSWNSMISGLVHCERSKEAIDLFSLMQTSS GIKPDGHILTSVLSACASLGAVDHGRWVHEYILTAGIKWDTHIGTAIVDMYAKCGYIETA LEIFNGIRSKNVFTWNALLGGLAIHGHGLESLRYFEEMVKLGFKPNLVTFLAALNACCHT GLVDEGRRYFHKMKSREYNLFPKLEHYGCMIDLLCRAGLLDEALELVKAMPVKPDVRICG AILSACKNRGTLMELPKEILDSFLDIEFEDSGVYVLLSNIFAANRRWDDVARIRRLMKVK GISKVPGSSYIEKFMTLDQ

Transcript Sequence

Transcript ID	AT4G38010.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein \| Chr4:17859338-17861407 REVERSE LENGTH=2070 \| 201606
Sequence	CTCAGGTTAGCTCTCTGTTTCAGTCTTCCGCTTCTTCTCCGTCTATGAATCTGCAAATTT GGTTCTTTCTGTGAATCGAACTCGTTCTACAAATGCAGATTAACATAGAACCCCCATGTG ATTGTTTGATCACTATTTGCGACTAGATGTATTTGCCGGAGAAATCAGTTCTTCTGGAAT TGATCAGCCGATGCAGCTCTCTTCGCGTTTTCAAACAGATACAGACTCAATTGATTACTC GTGATCTTCTTCGTGATGACTTAATCATCAACAAAGTCGTGACCTTTCTGGGCAAATCCG CAGATTTTGCATCTTACAGCTCTGTAATTCTCCACAGTATCCGTTCTGTGTTGAGCTCTT TCTCATACAACACGCTTTTATCAAGCTATGCAGTTTGTGATAAACCAAGAGTGACGATTT TTGCTTACAAAACATTTGTGAGTAATGGGTTTTCACCGGACATGTTCACGTTTCCTCCAG TTTTTAAGGCTTGTGGGAAGTTTTCAGGGATCAGAGAAGGGAAACAGATTCATGGAATTG TTACGAAGATGGGTTTTTACGATGATATCTATGTGCAAAACTCGCTTGTTCATTTTTATG GTGTGTGTGGAGAATCAAGGAATGCATGTAAAGTGTTCGGTGAAATGCCTGTGAGAGATG TTGTTTCGTGGACTGGGATTATAACTGGTTTCACGAGGACTGGGTTGTATAAGGAAGCTT TGGATACGTTTTCAAAGATGGATGTTGAGCCTAATTTGGCTACGTATGTTTGTGTATTGG TCTCAAGTGGGCGGGTAGGGTGTTTAAGTTTAGGGAAAGGAATCCATGGGTTGATCTTAA AAAGGGCATCTTTGATCAGCTTAGAGACTGGTAATGCTCTTATAGATATGTATGTGAAAT GTGAGCAATTGTCTGATGCGATGAGAGTTTTTGGTGAGTTGGAAAAGAAAGATAAAGTTT CTTGGAATAGTATGATTAGTGGGTTGGTTCACTGTGAAAGATCTAAGGAGGCGATTGACT TGTTTTCTCTGATGCAAACGTCTTCTGGTATAAAGCCAGATGGGCATATACTTACAAGTG TTCTCTCTGCGTGTGCTAGCTTAGGAGCTGTGGATCACGGAAGATGGGTTCATGAGTATA TTTTAACCGCTGGAATCAAATGGGATACGCATATTGGAACTGCCATTGTTGATATGTATG CAAAATGTGGCTACATCGAAACAGCTTTGGAGATTTTCAACGGAATTAGAAGTAAGAATG TGTTTACTTGGAATGCTCTGTTAGGTGGTTTAGCTATCCATGGGCATGGACTTGAATCCC TTAGATACTTTGAAGAAATGGTTAAGCTAGGTTTTAAGCCGAACCTGGTAACTTTTCTCG CGGCTCTAAATGCTTGTTGCCACACAGGTTTAGTCGATGAAGGGAGAAGATATTTCCATA AAATGAAAAGCAGAGAATACAATCTATTTCCTAAGCTAGAACATTATGGATGCATGATTG ATTTGCTTTGTAGAGCTGGATTGTTAGATGAAGCATTGGAACTCGTCAAAGCAATGCCGG TTAAACCGGATGTACGTATATGTGGAGCTATTCTTAGTGCTTGTAAGAATAGAGGGACAT TAATGGAGCTTCCTAAAGAGATATTAGATAGTTTTTTAGATATTGAGTTTGAAGATAGTG GTGTTTATGTGTTGCTGTCTAATATTTTTGCTGCTAATAGAAGATGGGATGATGTTGCGA GAATCAGGAGGTTGATGAAGGTAAAAGGTATCTCGAAGGTTCCAGGATCAAGTTATATAG AGAAGTTTATGACTTTAGACCAATGATGATGGATGTATGATGTATCTATGACATGATCAT CAATTCATCATGTATGGGAATGTCTCACATACATAAGAGAGTTCATGAGTTTCTCACATG TCTCTGCCTAAAGCTGAACTTGTCCTCTTCTACTTCACGTTCCTCTTGCTTCTTCACCTT ATTATACGTGTATAATATTATAATGTCTATGCAGTTACATTGGTACATGATTATTATCAC AGAAATTCTTGATTCAGCGATTTATAATTA