Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT4G35130.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr4:16721084-16723498 REVERSE LENGTH=2415 \| 201606
Sequence	ATGGCTGCGACTCTGCTGTCTCAATGCTACCGTATCTACAATTCCGATGCGTGCAAGTGT GTTTCTTCTGAGAATCACCAGACGACGGGGAAGCGAAATGGGAATCGAAATCTCGAATTC GACTCGGGAATTTCGAAACCAGCACGGCTAGTACTTCGAGACCGATACAAGGTAACTAAG CAGGTCAATGATCCTGCGCTGACTAGGGCTTTACGTGGTTTCGCTGATTCCCGTCTTATG GAGGATGCACTCCAACTGTTCGATGAAATGAACAAAGCTGATGCTTTTCTGTGGAATGTG ATGATTAAAGGTTTCACTAGCTGTGGGTTGTACATTGAAGCAGTTCAATTTTATAGCAGA ATGGTGTTTGCAGGGGTCAAAGCTGATACCTTTACTTATCCTTTCGTGATTAAATCGGTT GCGGGAATTTCCTCATTGGAAGAAGGGAAGAAGATTCATGCGATGGTGATTAAGCTTGGG TTTGTTTCAGATGTTTACGTCTGTAATTCTCTTATATCTTTATACATGAAGCTTGGGTGT GCTTGGGATGCAGAGAAAGTGTTCGAAGAAATGCCTGAGAGAGACATTGTTTCGTGGAAT TCCATGATTTCTGGATATCTTGCGCTTGGAGATGGCTTTAGCTCGTTGATGCTGTTTAAA GAAATGCTGAAATGTGGGTTTAAACCGGACAGGTTCAGTACCATGAGTGCTCTTGGTGCT TGTTCTCATGTGTATAGTCCAAAAATGGGAAAAGAGATACATTGCCACGCTGTTCGAAGT AGGATTGAAACTGGTGATGTTATGGTAATGACATCAATTCTTGACATGTACAGTAAATAT GGTGAAGTGAGTTATGCGGAGAGGATATTTAACGGTATGATCCAGAGGAACATCGTAGCT TGGAACGTTATGATAGGGTGTTATGCTAGAAATGGCCGAGTCACTGATGCTTTCCTCTGC TTTCAGAAAATGTCAGAGCAAAATGGGTTGCAGCCAGATGTTATCACATCGATTAATCTG CTTCCTGCTTCTGCGATCTTAGAGGGTAGAACGATTCACGGGTATGCTATGAGGAGAGGC TTTCTTCCCCATATGGTATTGGAAACTGCTCTGATTGATATGTATGGAGAATGTGGGCAG TTAAAATCAGCTGAGGTTATATTTGATCGAATGGCTGAAAAGAATGTGATCTCATGGAAC TCGATTATTGCTGCCTATGTGCAGAACGGGAAGAACTATTCAGCCTTGGAGCTATTTCAA GAGCTCTGGGATTCATCGCTTGTACCTGATTCCACAACAATTGCTAGTATTCTACCAGCT TATGCAGAATCTCTATCCTTGAGTGAAGGTAGAGAAATCCATGCTTATATTGTTAAGTCT AGATACTGGTCAAACACCATCATCTTGAATTCACTTGTTCACATGTATGCCATGTGTGGT GACCTTGAGGATGCAAGAAAATGTTTCAACCACATCTTGTTAAAGGATGTTGTTTCATGG AACAGCATCATCATGGCATATGCAGTACATGGTTTTGGGAGAATTTCGGTTTGGTTATTC TCTGAGATGATTGCTTCTAGAGTAAATCCAAACAAGAGCACCTTTGCTTCACTATTAGCA GCATGTAGCATTTCTGGTATGGTTGATGAAGGATGGGAATATTTCGAGTCGATGAAAAGA GAATACGGGATAGATCCTGGAATAGAGCATTATGGGTGCATGCTGGATCTCATTGGCCGT ACAGGAAACTTCAGCGCAGCCAAGAGATTCCTTGAAGAAATGCCATTTGTGCCAACAGCT AGGATTTGGGGATCGTTGTTAAACGCAAGCAGAAACCACAAGGACATAACCATAGCTGAA TTTGCGGCAGAACAGATATTTAAGATGGAACACGATAACACGGGATGTTATGTCTTGCTT TTGAACATGTATGCAGAAGCTGGAAGATGGGAAGATGTAAATAGGATTAAGCTTCTCATG GAGAGCAAAGGCATATCCAGAACATCAAGTCGCAGTACTGTTGAGGCGAAGGGCAAAAGT CATGTGTTCACAAATGGAGACAGATCCCACGTGGCGACGAACAAGATCTATGAAGTCTTA GATGTCGTCTCGAGGATGGTTGGAGAAGAAGACATTTATGTTCACTGTGTCTCGAGGTTG AGACCAGAGACTCTAGTTAAGAGCAGAAGCAATTCACCAAGAAGACATTCGGTAAGGCTC GCCACGTGTTTTGGATTGATCTCTACGGAAACGGGAAGAAGAGTTACGGTGAGGAATAAC ACGAGAATCTGCAGAAAATGTCACGAGTTCTTGGAAAAAGCTTCGAGATTGACGAGAAGA GAGATCGTTGTGGGAGATTCCAAGATTTTTCATCACTTCTCCAATGGTCGCTGCTCGTGT GGAAATTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT4G35130.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr4:16721084-16723498 REVERSE LENGTH=804 \| 201606
Sequence	MAATLLSQCYRIYNSDACKCVSSENHQTTGKRNGNRNLEFDSGISKPARLVLRDRYKVTK QVNDPALTRALRGFADSRLMEDALQLFDEMNKADAFLWNVMIKGFTSCGLYIEAVQFYSR MVFAGVKADTFTYPFVIKSVAGISSLEEGKKIHAMVIKLGFVSDVYVCNSLISLYMKLGC AWDAEKVFEEMPERDIVSWNSMISGYLALGDGFSSLMLFKEMLKCGFKPDRFSTMSALGA CSHVYSPKMGKEIHCHAVRSRIETGDVMVMTSILDMYSKYGEVSYAERIFNGMIQRNIVA WNVMIGCYARNGRVTDAFLCFQKMSEQNGLQPDVITSINLLPASAILEGRTIHGYAMRRG FLPHMVLETALIDMYGECGQLKSAEVIFDRMAEKNVISWNSIIAAYVQNGKNYSALELFQ ELWDSSLVPDSTTIASILPAYAESLSLSEGREIHAYIVKSRYWSNTIILNSLVHMYAMCG DLEDARKCFNHILLKDVVSWNSIIMAYAVHGFGRISVWLFSEMIASRVNPNKSTFASLLA ACSISGMVDEGWEYFESMKREYGIDPGIEHYGCMLDLIGRTGNFSAAKRFLEEMPFVPTA RIWGSLLNASRNHKDITIAEFAAEQIFKMEHDNTGCYVLLLNMYAEAGRWEDVNRIKLLM ESKGISRTSSRSTVEAKGKSHVFTNGDRSHVATNKIYEVLDVVSRMVGEEDIYVHCVSRL RPETLVKSRSNSPRRHSVRLATCFGLISTETGRRVTVRNNTRICRKCHEFLEKASRLTRR EIVVGDSKIFHHFSNGRCSCGNYW

Transcript Sequence

Transcript ID	AT4G35130.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr4:16720944-16723665 REVERSE LENGTH=2722 \| 201606
Sequence	GTAGTAATTCGGAATTTATCTTCTTTTAAGAACACAGAGAAAAATAATAGGGTTAATTAC GTCATTGTAGACAATTTTCCGCGGGAAAATGAAGATGCAAAAGACGACGACGAAAGACAA ATTTGCTTGAATTCTTTCAGTTTTCCGGTGAAAATTCGCCGGAATCCATGGCTGCGACTC TGCTGTCTCAATGCTACCGTATCTACAATTCCGATGCGTGCAAGTGTGTTTCTTCTGAGA ATCACCAGACGACGGGGAAGCGAAATGGGAATCGAAATCTCGAATTCGACTCGGGAATTT CGAAACCAGCACGGCTAGTACTTCGAGACCGATACAAGGTAACTAAGCAGGTCAATGATC CTGCGCTGACTAGGGCTTTACGTGGTTTCGCTGATTCCCGTCTTATGGAGGATGCACTCC AACTGTTCGATGAAATGAACAAAGCTGATGCTTTTCTGTGGAATGTGATGATTAAAGGTT TCACTAGCTGTGGGTTGTACATTGAAGCAGTTCAATTTTATAGCAGAATGGTGTTTGCAG GGGTCAAAGCTGATACCTTTACTTATCCTTTCGTGATTAAATCGGTTGCGGGAATTTCCT CATTGGAAGAAGGGAAGAAGATTCATGCGATGGTGATTAAGCTTGGGTTTGTTTCAGATG TTTACGTCTGTAATTCTCTTATATCTTTATACATGAAGCTTGGGTGTGCTTGGGATGCAG AGAAAGTGTTCGAAGAAATGCCTGAGAGAGACATTGTTTCGTGGAATTCCATGATTTCTG GATATCTTGCGCTTGGAGATGGCTTTAGCTCGTTGATGCTGTTTAAAGAAATGCTGAAAT GTGGGTTTAAACCGGACAGGTTCAGTACCATGAGTGCTCTTGGTGCTTGTTCTCATGTGT ATAGTCCAAAAATGGGAAAAGAGATACATTGCCACGCTGTTCGAAGTAGGATTGAAACTG GTGATGTTATGGTAATGACATCAATTCTTGACATGTACAGTAAATATGGTGAAGTGAGTT ATGCGGAGAGGATATTTAACGGTATGATCCAGAGGAACATCGTAGCTTGGAACGTTATGA TAGGGTGTTATGCTAGAAATGGCCGAGTCACTGATGCTTTCCTCTGCTTTCAGAAAATGT CAGAGCAAAATGGGTTGCAGCCAGATGTTATCACATCGATTAATCTGCTTCCTGCTTCTG CGATCTTAGAGGGTAGAACGATTCACGGGTATGCTATGAGGAGAGGCTTTCTTCCCCATA TGGTATTGGAAACTGCTCTGATTGATATGTATGGAGAATGTGGGCAGTTAAAATCAGCTG AGGTTATATTTGATCGAATGGCTGAAAAGAATGTGATCTCATGGAACTCGATTATTGCTG CCTATGTGCAGAACGGGAAGAACTATTCAGCCTTGGAGCTATTTCAAGAGCTCTGGGATT CATCGCTTGTACCTGATTCCACAACAATTGCTAGTATTCTACCAGCTTATGCAGAATCTC TATCCTTGAGTGAAGGTAGAGAAATCCATGCTTATATTGTTAAGTCTAGATACTGGTCAA ACACCATCATCTTGAATTCACTTGTTCACATGTATGCCATGTGTGGTGACCTTGAGGATG CAAGAAAATGTTTCAACCACATCTTGTTAAAGGATGTTGTTTCATGGAACAGCATCATCA TGGCATATGCAGTACATGGTTTTGGGAGAATTTCGGTTTGGTTATTCTCTGAGATGATTG CTTCTAGAGTAAATCCAAACAAGAGCACCTTTGCTTCACTATTAGCAGCATGTAGCATTT CTGGTATGGTTGATGAAGGATGGGAATATTTCGAGTCGATGAAAAGAGAATACGGGATAG ATCCTGGAATAGAGCATTATGGGTGCATGCTGGATCTCATTGGCCGTACAGGAAACTTCA GCGCAGCCAAGAGATTCCTTGAAGAAATGCCATTTGTGCCAACAGCTAGGATTTGGGGAT CGTTGTTAAACGCAAGCAGAAACCACAAGGACATAACCATAGCTGAATTTGCGGCAGAAC AGATATTTAAGATGGAACACGATAACACGGGATGTTATGTCTTGCTTTTGAACATGTATG CAGAAGCTGGAAGATGGGAAGATGTAAATAGGATTAAGCTTCTCATGGAGAGCAAAGGCA TATCCAGAACATCAAGTCGCAGTACTGTTGAGGCGAAGGGCAAAAGTCATGTGTTCACAA ATGGAGACAGATCCCACGTGGCGACGAACAAGATCTATGAAGTCTTAGATGTCGTCTCGA GGATGGTTGGAGAAGAAGACATTTATGTTCACTGTGTCTCGAGGTTGAGACCAGAGACTC TAGTTAAGAGCAGAAGCAATTCACCAAGAAGACATTCGGTAAGGCTCGCCACGTGTTTTG GATTGATCTCTACGGAAACGGGAAGAAGAGTTACGGTGAGGAATAACACGAGAATCTGCA GAAAATGTCACGAGTTCTTGGAAAAAGCTTCGAGATTGACGAGAAGAGAGATCGTTGTGG GAGATTCCAAGATTTTTCATCACTTCTCCAATGGTCGCTGCTCGTGTGGAAATTACTGGT GAAAACACAGATTGTGGCTAAAGTAGGTATATGTATGTTGTCAGACTAATGTAAAAAGAA GAAAACATGTTTTAGCAACTAAAGTTATTAATGCTAAAACCCTCAAAGAAAAACAGAGGA AAAGCAGAGTAACAATATTTAT