Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT4G34890.1
CDS Infomation	\| xanthine dehydrogenase 1 \| Chr4:16618736-16624983 REVERSE LENGTH=4086 \| 201606
Sequence	ATGGGTTCACTGAAAAAGGACGGCGAGATCGGAGATGAGTTTACGGAGGCGTTACTGTAC GTTAACGGCGTTCGTAGAGTCTTGCCTGATGGATTGGCTCATATGACACTTCTCGAATAT CTCAGAGATTTAGGATTGACCGGTACAAAGCTGGGATGCGGCGAAGGTGGTTGTGGGGCT TGCACGGTGATGGTGTCTAGTTATGACAGGAAGTCAAAGACCTCTGTGCATTATGCTGTC AACGCTTGCCTAGCACCTCTCTATTCTGTAGAAGGGATGCATGTAATATCCATTGAGGGA CTTGGGCATCGCAAACTTGGCTTGCACCCTGTCCAGGAGTCTTTGGCATCTTCCCATGGT TCCCAATGTGGGTTTTGTACTCCCGGGTTTATCATGTCCATGTATTCGTTGTTGAGGTCA AGTAAAAACTCACCTTCTGAGGAGGAGATTGAAGAATGTCTTGCAGGAAATCTATGTCGT TGTACTGGTTATCGACCCATTGTTGATGCGTTTCGGGTTTTTGCAAAATCTGATGATGCT CTCTACTGTGGTGTATCTTCACTTAGCCTTCAAGATGGTTCTACTATTTGCCCATCTACT GGCAAACCTTGCTCTTGTGGATCAAAAACAACAAATGAAGTTGCCAGTTGTAATGAAGAT AGATTTCAGTCAATCTCTTATAGTGATATAGATGGAGCTAAGTATACAGATAAGGAGCTT ATTTTCCCCCCTGAACTTTTGCTGAGGAAGTTAACTCCCTTAAAGTTAAGGGGAAATGGG GGGATTACCTGGTATAGACCCGTATGTCTTCAGAACTTGCTTGAGCTCAAAGCAAATTAT CCTGATGCAAAACTACTGGTAGGTAATACAGAGGTGGGAATCGAAATGAGATTGAAGAGG TTACAGTATCAGGTGCTGATCTCTGTTGCTCAAGTCCCAGAACTCAACGCATTGAATGTC AATGACAATGGGATAGAGGTTGGTTCAGCTTTGAGACTTTCTGAACTCCTGAGGTTATTC AGGAAGATAGTAAAGGAGCGTCCTGCACATGAAACATCAGCATGCAAGGCTTTTATCGAA CAGCTGAAGTGGTTTGCTGGGACACAAATAAGAAATGTTGCTTGCATTGGTGGAAACATC TGTACAGCTAGTCCAATATCTGATTTAAATCCTCTTTGGATGGCTTCAAGAGCAGAGTTT CGGATAACCAACTGCAATGGAGATGTTAGGTCTATACCTGCAAAAGATTTCTTCCTCGGT TATCGTAAAGTGGATATGGGGAGCAACGAGATCTTGTTGTCGGTATTCCTTCCATGGACA AGACCCTTAGAGTATGTGAAAGAATTTAAGCAGGCCCATCGCAGGGATGATGATATAGCT ATTGTCAATGGTGGAATGCGTGTGTTTCTTGAAGACAAGGGTCAACAATTGTTCGTTTCT GATGCATCCATTGCTTATGGAGGTGTGGCTCCTCTTTCTTTGTGTGCGAGAAAGACTGAA GAGTTTCTAATTGGAAAGAATTGGAATAAAGATCTTCTGCAGGATGCGCTTAAGGTCATA CAGAGCGATGTCGTGATTAAGGAAGATGCTCCTGGGGGAATGGTGGAGTTTCGGAAATCT CTAACCCTAAGCTTCTTCTTTAAATTTTTCTTATGGGTTTCTCATAATGTCAATAATGCA AATTCTGCGATAGAGACCTTCCCACCCTCCCATATGTCAGCTGTGCAACCTGTTCCTCGG TTATCTAGAATTGGAAAACAAGACTATGAGACAGTAAAGCAGGGAACATCTGTTGGCTCG TCGGAGGTGCATCTTTCAGCGAGAATGCAGGTCACAGGGGAAGCGGAATATACTGATGAT ACTCCAGTACCTCCTAATACCTTACATGCTGCCTTTGTGCTAAGCAAAGTGCCACATGCC CGCATCCTTTCAATCGATGATTCGGCAGCCAAATCTTCATCTGGTTTTGTTGGTCTGTTT CTTGCCAAAGATATTCCTGGGGATAATATGATTGGACCAATTGTTCCCGACGAAGAATTA TTTGCTACAGATGTGGTCACGTGTGTGGGACAAGTCATTGGTGTGGTCGTCGCGGATACA CATGAAAATGCAAAAACTGCAGCAGGAAAAGTTGACGTTAGGTATGAGGAACTACCAGCA ATATTATCAATCAAGGAGGCTATTAATGCTAAAAGTTTCCATCCGAACACAGAGAAAAGG CTAAGAAAAGGGGATGTCGAGCTGTGTTTTCAATCTGGTCAGTGTGACAGGGTAATAGAG GGAGAGGTTCAAATGGGTGGTCAGGAACACTTCTACTTGGAGCCTAATGGTAGTTTGGTT TGGACAGTAGATGGGGGCAGCGAAGTTCATATGATTTCATCCACACAGGCTCCTCAAAAG CACCAGAAATATGTGTCGCATGTTCTTGGTCTTCCGATGTCTAAAGTGGTATGCAAAACC AAACGAATTGGTGGTGGCTTTGGTGGTAAAGAAACAAGATCAGCTTTCATTGCTGCGGCA GCTTCTGTTCCTTCCTACCTATTGAATCGACCTGTGAAACTCATACTGGACCGAGATGTG GACATGATGATAACTGGTCATCGTCATAGTTTTCTTGGAAAGTACAAGGTTGGATTTACG AACGAAGGAAAAATATTGGCGTTGGACCTTGAAATTTACAACAATGGTGGCAACTCTTTG GATCTCTCCCTTTCTGTTCTTGAACGTGCCATGTTTCACTCGGATAACGTTTATGAGATC CCGCATGTAAGGATTGTTGGGAATGTTTGCTTTACTAATTTTCCTAGCAACACTGCTTTC CGAGGGTTTGGAGGCCCCCAAGGTATGCTTATAACTGAAAACTGGATTCAAAGAATCGCA GCTGAGCTTAATAAAAGCCCTGAAGAAATCAAAGAGATGAACTTTCAAGTGGAAGGATCA GTCACCCATTACTGTCAGACTCTTCAGCACTGCACATTGCATCAGCTCTGGAAAGAGCTG AAAGTATCGTGCAACTTCTTAAAGGCCCGCAGAGAAGCTGACGAATTTAATAGTCATAAT CGGTGGAAAAAGCGTGGTGTAGCTATGGTTCCCACAAAATTTGGCATATCATTTACCACA AAGTTCATGAATCAGGCCGGAGCTCTTGTTCATGTTTACACTGACGGGACTGTTTTAGTG ACTCATGGTGGTGTGGAGATGGGTCAAGGATTGCATACAAAGGTCGCTCAAGTTGCTGCA TCCGCCTTTAACATTCCACTTAGCTCAGTTTTCGTGTCAGAGACAAGCACTGACAAGGTT CCTAATGCGTCACCAACTGCTGCTTCTGCGAGCTCTGATATGTATGGTGCTGCAGTTTTA GACGCTTGTGAGCAGATTATAGCAAGAATGGAACCTGTTGCATCTAAGCACAATTTCAAC ACATTTACTGAGCTAGTAAGTGCCTGCTACTTTCAACGGATAGACCTATCAGCTCATGGT TTTCACATAGTTCCTGATCTTGGGTTTGACTGGATATCTGGAAAAGGGAACGCCTTTAGA TATTACACATATGGAGCTGCCTTTGCGGAAGTTGAGATAGATACATTGACTGGTGATTTC CACACAAGAGCAGCTGATATAATGTTGGACCTCGGATATTCTCTTAACCCAGCCATTGAT GTTGGACAAATAGAAGGAGCGTTTGTACAAGGACTGGGTTGGGTAGCTTTAGAAGAACTC AAATGGGGAGATGCAGCTCATAAATGGATTAAACCAGGAAGTTTACTCACTTGCGGACCC GGAAACTACAAAATACCTTCCATCAACGACATGCCGTTCAACCTCAATGTTTCGCTTCTC AAGGGGAATCCGAATACAAAGGCAATACATTCATCTAAAGCAGTGGGTGAGCCACCATTC TTTCTTGCATCATCGGTTTTCTTTGCGATAAAGGAAGCTATTAAAGCGGCTAGAACCGAG GTGGGTCTCACAGACTGGTTCCCTCTAGAGAGTCCAGCCACTCCAGAGCGTATCAGGATG GCTTGTTTCGACGAATTTTCAGCTCCTTTTGTAAATTCAGATTTCTACCCTAATCTTAGT GTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT4G34890.1
PEP Infomation	\| xanthine dehydrogenase 1 \| Chr4:16618736-16624983 REVERSE LENGTH=1361 \| 201606
Sequence	MGSLKKDGEIGDEFTEALLYVNGVRRVLPDGLAHMTLLEYLRDLGLTGTKLGCGEGGCGA CTVMVSSYDRKSKTSVHYAVNACLAPLYSVEGMHVISIEGLGHRKLGLHPVQESLASSHG SQCGFCTPGFIMSMYSLLRSSKNSPSEEEIEECLAGNLCRCTGYRPIVDAFRVFAKSDDA LYCGVSSLSLQDGSTICPSTGKPCSCGSKTTNEVASCNEDRFQSISYSDIDGAKYTDKEL IFPPELLLRKLTPLKLRGNGGITWYRPVCLQNLLELKANYPDAKLLVGNTEVGIEMRLKR LQYQVLISVAQVPELNALNVNDNGIEVGSALRLSELLRLFRKIVKERPAHETSACKAFIE QLKWFAGTQIRNVACIGGNICTASPISDLNPLWMASRAEFRITNCNGDVRSIPAKDFFLG YRKVDMGSNEILLSVFLPWTRPLEYVKEFKQAHRRDDDIAIVNGGMRVFLEDKGQQLFVS DASIAYGGVAPLSLCARKTEEFLIGKNWNKDLLQDALKVIQSDVVIKEDAPGGMVEFRKS LTLSFFFKFFLWVSHNVNNANSAIETFPPSHMSAVQPVPRLSRIGKQDYETVKQGTSVGS SEVHLSARMQVTGEAEYTDDTPVPPNTLHAAFVLSKVPHARILSIDDSAAKSSSGFVGLF LAKDIPGDNMIGPIVPDEELFATDVVTCVGQVIGVVVADTHENAKTAAGKVDVRYEELPA ILSIKEAINAKSFHPNTEKRLRKGDVELCFQSGQCDRVIEGEVQMGGQEHFYLEPNGSLV WTVDGGSEVHMISSTQAPQKHQKYVSHVLGLPMSKVVCKTKRIGGGFGGKETRSAFIAAA ASVPSYLLNRPVKLILDRDVDMMITGHRHSFLGKYKVGFTNEGKILALDLEIYNNGGNSL DLSLSVLERAMFHSDNVYEIPHVRIVGNVCFTNFPSNTAFRGFGGPQGMLITENWIQRIA AELNKSPEEIKEMNFQVEGSVTHYCQTLQHCTLHQLWKELKVSCNFLKARREADEFNSHN RWKKRGVAMVPTKFGISFTTKFMNQAGALVHVYTDGTVLVTHGGVEMGQGLHTKVAQVAA SAFNIPLSSVFVSETSTDKVPNASPTAASASSDMYGAAVLDACEQIIARMEPVASKHNFN TFTELVSACYFQRIDLSAHGFHIVPDLGFDWISGKGNAFRYYTYGAAFAEVEIDTLTGDF HTRAADIMLDLGYSLNPAIDVGQIEGAFVQGLGWVALEELKWGDAAHKWIKPGSLLTCGP GNYKIPSINDMPFNLNVSLLKGNPNTKAIHSSKAVGEPPFFLASSVFFAIKEAIKAARTE VGLTDWFPLESPATPERIRMACFDEFSAPFVNSDFYPNLSV

Transcript Sequence

Transcript ID	AT4G34890.1
Transcript Infomation	\| xanthine dehydrogenase 1 \| Chr4:16618573-16625191 REVERSE LENGTH=4457 \| 201606
Sequence	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGACTGCACAAGTGATGATGATGAAGATGCGTATTCAT TCGGTGGATGCTATCGGAAAGGAACACGAATTTTATTATTAAAAAAGGAAAATGTTATTC CTTTTTTGCTTCTCTTGACTTGGCGTAATCAACTTCGCCATCTTCGTTTTTGTTTCGATC CCAATCGAGTTTTCTCTCAATTTGAGAAATGGGTTCACTGAAAAAGGACGGCGAGATCGG AGATGAGTTTACGGAGGCGTTACTGTACGTTAACGGCGTTCGTAGAGTCTTGCCTGATGG ATTGGCTCATATGACACTTCTCGAATATCTCAGAGATTTAGGATTGACCGGTACAAAGCT GGGATGCGGCGAAGGTGGTTGTGGGGCTTGCACGGTGATGGTGTCTAGTTATGACAGGAA GTCAAAGACCTCTGTGCATTATGCTGTCAACGCTTGCCTAGCACCTCTCTATTCTGTAGA AGGGATGCATGTAATATCCATTGAGGGACTTGGGCATCGCAAACTTGGCTTGCACCCTGT CCAGGAGTCTTTGGCATCTTCCCATGGTTCCCAATGTGGGTTTTGTACTCCCGGGTTTAT CATGTCCATGTATTCGTTGTTGAGGTCAAGTAAAAACTCACCTTCTGAGGAGGAGATTGA AGAATGTCTTGCAGGAAATCTATGTCGTTGTACTGGTTATCGACCCATTGTTGATGCGTT TCGGGTTTTTGCAAAATCTGATGATGCTCTCTACTGTGGTGTATCTTCACTTAGCCTTCA AGATGGTTCTACTATTTGCCCATCTACTGGCAAACCTTGCTCTTGTGGATCAAAAACAAC AAATGAAGTTGCCAGTTGTAATGAAGATAGATTTCAGTCAATCTCTTATAGTGATATAGA TGGAGCTAAGTATACAGATAAGGAGCTTATTTTCCCCCCTGAACTTTTGCTGAGGAAGTT AACTCCCTTAAAGTTAAGGGGAAATGGGGGGATTACCTGGTATAGACCCGTATGTCTTCA GAACTTGCTTGAGCTCAAAGCAAATTATCCTGATGCAAAACTACTGGTAGGTAATACAGA GGTGGGAATCGAAATGAGATTGAAGAGGTTACAGTATCAGGTGCTGATCTCTGTTGCTCA AGTCCCAGAACTCAACGCATTGAATGTCAATGACAATGGGATAGAGGTTGGTTCAGCTTT GAGACTTTCTGAACTCCTGAGGTTATTCAGGAAGATAGTAAAGGAGCGTCCTGCACATGA AACATCAGCATGCAAGGCTTTTATCGAACAGCTGAAGTGGTTTGCTGGGACACAAATAAG AAATGTTGCTTGCATTGGTGGAAACATCTGTACAGCTAGTCCAATATCTGATTTAAATCC TCTTTGGATGGCTTCAAGAGCAGAGTTTCGGATAACCAACTGCAATGGAGATGTTAGGTC TATACCTGCAAAAGATTTCTTCCTCGGTTATCGTAAAGTGGATATGGGGAGCAACGAGAT CTTGTTGTCGGTATTCCTTCCATGGACAAGACCCTTAGAGTATGTGAAAGAATTTAAGCA GGCCCATCGCAGGGATGATGATATAGCTATTGTCAATGGTGGAATGCGTGTGTTTCTTGA AGACAAGGGTCAACAATTGTTCGTTTCTGATGCATCCATTGCTTATGGAGGTGTGGCTCC TCTTTCTTTGTGTGCGAGAAAGACTGAAGAGTTTCTAATTGGAAAGAATTGGAATAAAGA TCTTCTGCAGGATGCGCTTAAGGTCATACAGAGCGATGTCGTGATTAAGGAAGATGCTCC TGGGGGAATGGTGGAGTTTCGGAAATCTCTAACCCTAAGCTTCTTCTTTAAATTTTTCTT ATGGGTTTCTCATAATGTCAATAATGCAAATTCTGCGATAGAGACCTTCCCACCCTCCCA TATGTCAGCTGTGCAACCTGTTCCTCGGTTATCTAGAATTGGAAAACAAGACTATGAGAC AGTAAAGCAGGGAACATCTGTTGGCTCGTCGGAGGTGCATCTTTCAGCGAGAATGCAGGT CACAGGGGAAGCGGAATATACTGATGATACTCCAGTACCTCCTAATACCTTACATGCTGC CTTTGTGCTAAGCAAAGTGCCACATGCCCGCATCCTTTCAATCGATGATTCGGCAGCCAA ATCTTCATCTGGTTTTGTTGGTCTGTTTCTTGCCAAAGATATTCCTGGGGATAATATGAT TGGACCAATTGTTCCCGACGAAGAATTATTTGCTACAGATGTGGTCACGTGTGTGGGACA AGTCATTGGTGTGGTCGTCGCGGATACACATGAAAATGCAAAAACTGCAGCAGGAAAAGT TGACGTTAGGTATGAGGAACTACCAGCAATATTATCAATCAAGGAGGCTATTAATGCTAA AAGTTTCCATCCGAACACAGAGAAAAGGCTAAGAAAAGGGGATGTCGAGCTGTGTTTTCA ATCTGGTCAGTGTGACAGGGTAATAGAGGGAGAGGTTCAAATGGGTGGTCAGGAACACTT CTACTTGGAGCCTAATGGTAGTTTGGTTTGGACAGTAGATGGGGGCAGCGAAGTTCATAT GATTTCATCCACACAGGCTCCTCAAAAGCACCAGAAATATGTGTCGCATGTTCTTGGTCT TCCGATGTCTAAAGTGGTATGCAAAACCAAACGAATTGGTGGTGGCTTTGGTGGTAAAGA AACAAGATCAGCTTTCATTGCTGCGGCAGCTTCTGTTCCTTCCTACCTATTGAATCGACC TGTGAAACTCATACTGGACCGAGATGTGGACATGATGATAACTGGTCATCGTCATAGTTT TCTTGGAAAGTACAAGGTTGGATTTACGAACGAAGGAAAAATATTGGCGTTGGACCTTGA AATTTACAACAATGGTGGCAACTCTTTGGATCTCTCCCTTTCTGTTCTTGAACGTGCCAT GTTTCACTCGGATAACGTTTATGAGATCCCGCATGTAAGGATTGTTGGGAATGTTTGCTT TACTAATTTTCCTAGCAACACTGCTTTCCGAGGGTTTGGAGGCCCCCAAGGTATGCTTAT AACTGAAAACTGGATTCAAAGAATCGCAGCTGAGCTTAATAAAAGCCCTGAAGAAATCAA AGAGATGAACTTTCAAGTGGAAGGATCAGTCACCCATTACTGTCAGACTCTTCAGCACTG CACATTGCATCAGCTCTGGAAAGAGCTGAAAGTATCGTGCAACTTCTTAAAGGCCCGCAG AGAAGCTGACGAATTTAATAGTCATAATCGGTGGAAAAAGCGTGGTGTAGCTATGGTTCC CACAAAATTTGGCATATCATTTACCACAAAGTTCATGAATCAGGCCGGAGCTCTTGTTCA TGTTTACACTGACGGGACTGTTTTAGTGACTCATGGTGGTGTGGAGATGGGTCAAGGATT GCATACAAAGGTCGCTCAAGTTGCTGCATCCGCCTTTAACATTCCACTTAGCTCAGTTTT CGTGTCAGAGACAAGCACTGACAAGGTTCCTAATGCGTCACCAACTGCTGCTTCTGCGAG CTCTGATATGTATGGTGCTGCAGTTTTAGACGCTTGTGAGCAGATTATAGCAAGAATGGA ACCTGTTGCATCTAAGCACAATTTCAACACATTTACTGAGCTAGTAAGTGCCTGCTACTT TCAACGGATAGACCTATCAGCTCATGGTTTTCACATAGTTCCTGATCTTGGGTTTGACTG GATATCTGGAAAAGGGAACGCCTTTAGATATTACACATATGGAGCTGCCTTTGCGGAAGT TGAGATAGATACATTGACTGGTGATTTCCACACAAGAGCAGCTGATATAATGTTGGACCT CGGATATTCTCTTAACCCAGCCATTGATGTTGGACAAATAGAAGGAGCGTTTGTACAAGG ACTGGGTTGGGTAGCTTTAGAAGAACTCAAATGGGGAGATGCAGCTCATAAATGGATTAA ACCAGGAAGTTTACTCACTTGCGGACCCGGAAACTACAAAATACCTTCCATCAACGACAT GCCGTTCAACCTCAATGTTTCGCTTCTCAAGGGGAATCCGAATACAAAGGCAATACATTC ATCTAAAGCAGTGGGTGAGCCACCATTCTTTCTTGCATCATCGGTTTTCTTTGCGATAAA GGAAGCTATTAAAGCGGCTAGAACCGAGGTGGGTCTCACAGACTGGTTCCCTCTAGAGAG TCCAGCCACTCCAGAGCGTATCAGGATGGCTTGTTTCGACGAATTTTCAGCTCCTTTTGT AAATTCAGATTTCTACCCTAATCTTAGTGTTTGAGCTTTGAACATCATCAGAGGGGAAAC AGATCGATCAATCTATTGTGAGAAAGTCATATCTGTAACTTATTTTCAGTCTCCATATAA ATGTAACATATCTGTAAAGATACATTTACCAAGCAGTATACACTATATATATTTATAAAG ATATGTTTCTCACAAGC