Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT4G31070.1
CDS Infomation	\| PPR superfamily protein \| Chr4:15118696-15120570 REVERSE LENGTH=1875 \| 201606
Sequence	ATGAGATGGGTTAAACTAGGCCGTCGTGTTATAATGTCAAGGGCGTTGTCTTCCCGCTTA AACTTGGAGCTCGGCAATAAGCTGAAGGGTTTGGTGTCGGACCAATTCTACGATGAAGCA TTGAGACTGTACAAGCTAAAGATTCATTCTTTAGGGACCAATGGCTTCACAGCTATTCTT CCTTCTGTCATCAAAGCTTGCGCTTTTCAACAAGAGCCTTTCTTACTTGGCGCACAGCTT CATTGCCTTTGTCTCAAAGCAGGTGCAGATTGTGATACAGTTGTTTCCAATTCTCTCATC TCTATGTATGCGAAATTCTCGAGAAAATATGCTGTACGTAAGGTATTCGATGAAATGCTT CACAGAGATACAGTTAGCTATTGTTCCATCATCAATAGTTGTTGCCAGGATGGGTTGTTG TATGAAGCGATGAAGTTGATTAAGGAGATGTATTTTTATGGTTTTATTCCCAAGTCCGAG CTGGTTGCATCTCTATTGGCTCTCTGCACTCGCATGGGAAGCAGCAGTAAGGTAGCAAGA ATGTTTCATGCTCTTGTTCTTGTTGATGAGAGGATGCAGGAATCAGTTCTATTATCAACG GCTTTGGTTGATATGTACTTAAAGTTTGATGATCATGCGGCGGCTTTCCATGTGTTTGAT CAGATGGAGGTGAAGAATGAGGTCTCATGGACTGCCATGATCTCCGGTTGTGTTGCAAAT CAGAATTATGAAATGGGCGTTGATTTGTTTCGAGCAATGCAGAGAGAAAACTTGAGGCCC AATCGTGTCACACTGTTGTCTGTTTTACCTGCATGTGTAGAATTGAATTATGGCTCAAGT CTGGTGAAGGAGATTCATGGATTTTCTTTTCGTCATGGATGCCATGCTGACGAGCGGTTA ACAGCTGCTTTTATGACCATGTACTGCAGATGTGGTAATGTAAGTCTCTCTAGGGTTCTT TTCGAAACATCAAAAGTGAGAGATGTTGTAATGTGGAGTTCAATGATTAGCGGCTATGCG GAGACTGGAGATTGCTCTGAAGTTATGAATCTGTTAAATCAAATGAGAAAAGAAGGAATT GAAGCCAACTCGGTTACTCTATTGGCAATTGTCTCAGCTTGTACCAATTCGACATTGTTG AGTTTTGCATCTACAGTCCATTCTCAAATCCTGAAATGTGGCTTCATGTCACATATCTTA TTGGGAAACGCCCTCATAGATATGTATGCAAAGTGTGGCAGTCTTTCTGCAGCGCGTGAA GTATTTTATGAACTTACTGAGAAAGATCTTGTGTCATGGAGCTCAATGATTAACGCATAC GGTCTTCATGGACATGGTTCAGAAGCTTTAGAAATCTTTAAAGGGATGATAAAAGGTGGA CATGAAGTAGATGATATGGCGTTTCTTGCAATTTTATCGGCTTGCAACCATGCTGGCCTG GTAGAAGAAGCTCAAACCATATTCACACAAGCTGGGAAATACCACATGCCAGTCACATTG GAGCATTATGCTTGCTATATCAATCTTCTTGGCAGGTTTGGGAAGATTGACGATGCCTTT GAGGTCACAATAAATATGCCAATGAAACCAAGTGCCAGAATATGGAGTTCTCTGCTATCT GCTTGCGAGACTCATGGCAGGCTTGATGTTGCAGGAAAAATTATTGCAAACGAGCTAATG AAATCTGAACCCGATAATCCAGCCAATTATGTATTGCTTAGCAAGATTCACACAGAATCT GGTAACTACCATGCTGCAGAAGAAGTAAGGAGGGTTATGCAAAGACGGAAACTGAACAAA TGCTACGGATTCAGTAAAATTGAACCTGAATTACAGATTGAAGATTACCAAGGAAAATCG TGGAGTCCTATATGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT4G31070.1
PEP Infomation	\| PPR superfamily protein \| Chr4:15118696-15120570 REVERSE LENGTH=624 \| 201606
Sequence	MRWVKLGRRVIMSRALSSRLNLELGNKLKGLVSDQFYDEALRLYKLKIHSLGTNGFTAIL PSVIKACAFQQEPFLLGAQLHCLCLKAGADCDTVVSNSLISMYAKFSRKYAVRKVFDEML HRDTVSYCSIINSCCQDGLLYEAMKLIKEMYFYGFIPKSELVASLLALCTRMGSSSKVAR MFHALVLVDERMQESVLLSTALVDMYLKFDDHAAAFHVFDQMEVKNEVSWTAMISGCVAN QNYEMGVDLFRAMQRENLRPNRVTLLSVLPACVELNYGSSLVKEIHGFSFRHGCHADERL TAAFMTMYCRCGNVSLSRVLFETSKVRDVVMWSSMISGYAETGDCSEVMNLLNQMRKEGI EANSVTLLAIVSACTNSTLLSFASTVHSQILKCGFMSHILLGNALIDMYAKCGSLSAARE VFYELTEKDLVSWSSMINAYGLHGHGSEALEIFKGMIKGGHEVDDMAFLAILSACNHAGL VEEAQTIFTQAGKYHMPVTLEHYACYINLLGRFGKIDDAFEVTINMPMKPSARIWSSLLS ACETHGRLDVAGKIIANELMKSEPDNPANYVLLSKIHTESGNYHAAEEVRRVMQRRKLNK CYGFSKIEPELQIEDYQGKSWSPI

Transcript Sequence

Transcript ID	AT4G31070.1
Transcript Infomation	\| PPR superfamily protein \| Chr4:15117756-15120608 REVERSE LENGTH=2662 \| 201606
Sequence	AATACAGTCATAGTGGGCACGTCATTATTACCCGTCCGATGAGATGGGTTAAACTAGGCC GTCGTGTTATAATGTCAAGGGCGTTGTCTTCCCGCTTAAACTTGGAGCTCGGCAATAAGC TGAAGGGTTTGGTGTCGGACCAATTCTACGATGAAGCATTGAGACTGTACAAGCTAAAGA TTCATTCTTTAGGGACCAATGGCTTCACAGCTATTCTTCCTTCTGTCATCAAAGCTTGCG CTTTTCAACAAGAGCCTTTCTTACTTGGCGCACAGCTTCATTGCCTTTGTCTCAAAGCAG GTGCAGATTGTGATACAGTTGTTTCCAATTCTCTCATCTCTATGTATGCGAAATTCTCGA GAAAATATGCTGTACGTAAGGTATTCGATGAAATGCTTCACAGAGATACAGTTAGCTATT GTTCCATCATCAATAGTTGTTGCCAGGATGGGTTGTTGTATGAAGCGATGAAGTTGATTA AGGAGATGTATTTTTATGGTTTTATTCCCAAGTCCGAGCTGGTTGCATCTCTATTGGCTC TCTGCACTCGCATGGGAAGCAGCAGTAAGGTAGCAAGAATGTTTCATGCTCTTGTTCTTG TTGATGAGAGGATGCAGGAATCAGTTCTATTATCAACGGCTTTGGTTGATATGTACTTAA AGTTTGATGATCATGCGGCGGCTTTCCATGTGTTTGATCAGATGGAGGTGAAGAATGAGG TCTCATGGACTGCCATGATCTCCGGTTGTGTTGCAAATCAGAATTATGAAATGGGCGTTG ATTTGTTTCGAGCAATGCAGAGAGAAAACTTGAGGCCCAATCGTGTCACACTGTTGTCTG TTTTACCTGCATGTGTAGAATTGAATTATGGCTCAAGTCTGGTGAAGGAGATTCATGGAT TTTCTTTTCGTCATGGATGCCATGCTGACGAGCGGTTAACAGCTGCTTTTATGACCATGT ACTGCAGATGTGGTAATGTAAGTCTCTCTAGGGTTCTTTTCGAAACATCAAAAGTGAGAG ATGTTGTAATGTGGAGTTCAATGATTAGCGGCTATGCGGAGACTGGAGATTGCTCTGAAG TTATGAATCTGTTAAATCAAATGAGAAAAGAAGGAATTGAAGCCAACTCGGTTACTCTAT TGGCAATTGTCTCAGCTTGTACCAATTCGACATTGTTGAGTTTTGCATCTACAGTCCATT CTCAAATCCTGAAATGTGGCTTCATGTCACATATCTTATTGGGAAACGCCCTCATAGATA TGTATGCAAAGTGTGGCAGTCTTTCTGCAGCGCGTGAAGTATTTTATGAACTTACTGAGA AAGATCTTGTGTCATGGAGCTCAATGATTAACGCATACGGTCTTCATGGACATGGTTCAG AAGCTTTAGAAATCTTTAAAGGGATGATAAAAGGTGGACATGAAGTAGATGATATGGCGT TTCTTGCAATTTTATCGGCTTGCAACCATGCTGGCCTGGTAGAAGAAGCTCAAACCATAT TCACACAAGCTGGGAAATACCACATGCCAGTCACATTGGAGCATTATGCTTGCTATATCA ATCTTCTTGGCAGGTTTGGGAAGATTGACGATGCCTTTGAGGTCACAATAAATATGCCAA TGAAACCAAGTGCCAGAATATGGAGTTCTCTGCTATCTGCTTGCGAGACTCATGGCAGGC TTGATGTTGCAGGAAAAATTATTGCAAACGAGCTAATGAAATCTGAACCCGATAATCCAG CCAATTATGTATTGCTTAGCAAGATTCACACAGAATCTGGTAACTACCATGCTGCAGAAG AAGTAAGGAGGGTTATGCAAAGACGGAAACTGAACAAATGCTACGGATTCAGTAAAATTG AACCTGAATTACAGATTGAAGATTACCAAGGAAAATCGTGGAGTCCTATATGAAGATTCT ATCTAAGCACTGTTCTCTTTCTGCATTTCAAAAGCAGCATCACTGATGCAGAATGTTCCA ACAACTCAATGTGATCATTTCACGAGTATATGATGTGCTCTGCTTTGCTACGGATCCATT TCTCAAACTGATCTGAGCCTTTTCTAAGTGATGTTTTGTTGATGTGCTACTACGCTAAAT ATGGATCTGAAAGAGATACCATAAGTGAAGCCTGCAATTTCTGAAGCCTGAAGGAGGATA TTAGCATAAACTACCATGCAGTATCTTTCTTACTGATATATTCACTATCAATATAAGTGA TTATGGGATTTGAGCAACTTATTAGAGAGAAAACCAAAATCACTGCAAAACTGGAATCCA AACAGCTCACAGAGGCTTGGTGTTGAGGCTTTGCCAACGGAACTGATATACTGGATGTTC AAGAACCGACACCCAGAAGTAGCAATTTGGTTGATCAAAGCATGATGGAGGAAGAAGAGA AAGCTGAAGAAGATGTTGATGTGAATATGGAAGAAGCAGAGAATGATGTCATTGTGTTGG ATTGATTGAGGAAACTCAAAACACCAAGAACAGAAACCAAAATATAGGTGATAGTTTTGA TGTAGTAGATATCATAGAATTTCATTTCAAACATGGGATAGATAGAAGTATATGTATTTG AGACCATAAGAAGACAACCCTTGTAGCCTAGCACAAGTATATGCTGGCATAATGTTGTAT TATATCCACAAGTTGATTATAA