Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT4G20770.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr4:11130762-11133086 REVERSE LENGTH=2325 \| 201606
Sequence	ATGCGTAGCGGAGGGAATAAGTATTTAGCGAGTCTCTTGCGTTGTTATAGAGATGAAAGG TGTAAACTTTCTGGGAAAGTTATACATGGGTTCATTGTTAGGATGGGAATGAAGAGTGAT ACTTATCTATGTAATCGTTTACTTGATTTGTATATTGAGTGTGGTGATGGGGATTATGCA CGGAAGGTGTTTGATGAAATGTCTGTAAGAGATGTTTATTCTTGGAATGCTTTTTTGACG TTTAGATGTAAAGTTGGGGATTTGGGGGAAGCGTGTGAGGTGTTTGATGGAATGCCTGAG AGAGATGTTGTGTCGTGGAATAATATGATTAGTGTTTTGGTGAGGAAAGGGTTTGAAGAG AAGGCTTTGGTTGTCTATAAGAGGATGGTTTGTGATGGGTTTTTGCCTTCTCGGTTCACG TTAGCTAGTGTTTTAAGTGCGTGTAGCAAGGTTTTGGATGGTGTTTTTGGTATGAGGTGT CATGGGGTTGCTGTTAAAACGGGTCTTGATAAGAATATTTTTGTTGGGAATGCGTTGTTG TCTATGTATGCAAAGTGTGGGTTTATTGTTGATTATGGTGTTCGAGTCTTTGAATCTCTC TCTCAGCCTAATGAAGTCTCTTATACAGCGGTGATTGGCGGGTTAGCTCGGGAAAATAAA GTGTTGGAGGCAGTTCAGATGTTCAGATTGATGTGCGAGAAAGGCGTGCAGGTGGATTCT GTTTGCTTATCTAATATTCTTAGCATCTCTGCTCCAAGAGAAGGATGTGATAGCCTGAGT GAAATCTATGGCAATGAGCTTGGGAAACAGATTCATTGTCTTGCTTTGAGACTTGGGTTT GGAGGAGATCTTCATCTGAACAATTCGTTGCTTGAAATATATGCAAAGAATAAAGACATG AATGGTGCAGAGCTAATTTTTGCTGAGATGCCTGAAGTGAATGTTGTCTCTTGGAACATA ATGATAGTTGGGTTTGGTCAGGAGTATCGAAGTGACAAATCTGTTGAATTCCTAACGAGA ATGAGAGATTCTGGTTTTCAACCAAATGAAGTTACTTGCATTAGTGTTCTTGGAGCGTGC TTTCGTTCAGGGGATGTCGAAACCGGAAGGAGAATATTCAGTAGCATTCCCCAGCCAAGT GTTAGCGCTTGGAATGCTATGCTTTCTGGTTATTCCAACTATGAACACTATGAGGAAGCA ATAAGCAATTTCAGACAAATGCAGTTTCAGAACCTGAAACCTGATAAAACCACTTTGAGT GTGATATTAAGTTCGTGTGCGAGATTGAGATTTCTGGAAGGAGGGAAGCAGATCCATGGG GTAGTGATAAGGACCGAGATTTCGAAGAACAGTCACATAGTTAGTGGTCTTATTGCAGTG TACTCCGAATGCGAGAAGATGGAGATATCTGAATGTATCTTTGATGATTGTATAAACGAA TTGGATATCGCTTGTTGGAACTCGATGATCTCAGGTTTTAGACACAACATGCTGGACACA AAAGCTCTAATACTCTTTAGAAGGATGCATCAGACTGCCGTGTTGTGTCCTAATGAAACT TCATTCGCTACTGTACTAAGTAGCTGTTCAAGGTTATGTAGTTTGCTCCATGGAAGACAG TTTCATGGACTGGTAGTGAAGAGTGGATATGTAAGTGATTCCTTTGTTGAAACCGCTCTT ACCGACATGTACTGCAAGTGTGGGGAAATAGATTCAGCTCGACAGTTCTTCGATGCTGTT TTGAGGAAAAACACGGTTATTTGGAATGAGATGATACATGGGTATGGTCATAATGGACGA GGTGATGAAGCTGTTGGTCTCTACAGAAAGATGATTTCATCAGGAGAGAAGCCTGATGGG ATAACCTTCGTTTCTGTCTTGACTGCTTGTAGCCACTCAGGACTGGTGGAAACCGGGCTT GAGATACTTAGTTCGATGCAGAGAATTCATGGAATTGAGCCGGAGCTGGATCATTACATC TGTATAGTTGATTGTCTTGGAAGAGCTGGCCGGCTTGAAGATGCAGAGAAGCTTGCAGAA GCTACACCATACAAAAGTAGCTCTGTTCTATGGGAGATTCTACTAAGTTCATGTAGAGTC CATGGAGATGTGAGCTTGGCTAGACGAGTTGCAGAAAAACTAATGCGTCTGGATCCTCAG AGCTCAGCAGCATATGTGCTGCTAAGCAACACATATAGTTCTTTGAGACAGTGGGATGAT TCTGCAGCTCTTCAAGGATTAATGAACAAGAACAGAGTTCATAAAACTCCAGGTCAAAGC TGGACCACATATGGCAATGATTTGGACTCAGGGTTTCGAAAATAG

Peptide Sequence

PEP ID	AT4G20770.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr4:11130762-11133086 REVERSE LENGTH=774 \| 201606
Sequence	MRSGGNKYLASLLRCYRDERCKLSGKVIHGFIVRMGMKSDTYLCNRLLDLYIECGDGDYA RKVFDEMSVRDVYSWNAFLTFRCKVGDLGEACEVFDGMPERDVVSWNNMISVLVRKGFEE KALVVYKRMVCDGFLPSRFTLASVLSACSKVLDGVFGMRCHGVAVKTGLDKNIFVGNALL SMYAKCGFIVDYGVRVFESLSQPNEVSYTAVIGGLARENKVLEAVQMFRLMCEKGVQVDS VCLSNILSISAPREGCDSLSEIYGNELGKQIHCLALRLGFGGDLHLNNSLLEIYAKNKDM NGAELIFAEMPEVNVVSWNIMIVGFGQEYRSDKSVEFLTRMRDSGFQPNEVTCISVLGAC FRSGDVETGRRIFSSIPQPSVSAWNAMLSGYSNYEHYEEAISNFRQMQFQNLKPDKTTLS VILSSCARLRFLEGGKQIHGVVIRTEISKNSHIVSGLIAVYSECEKMEISECIFDDCINE LDIACWNSMISGFRHNMLDTKALILFRRMHQTAVLCPNETSFATVLSSCSRLCSLLHGRQ FHGLVVKSGYVSDSFVETALTDMYCKCGEIDSARQFFDAVLRKNTVIWNEMIHGYGHNGR GDEAVGLYRKMISSGEKPDGITFVSVLTACSHSGLVETGLEILSSMQRIHGIEPELDHYI CIVDCLGRAGRLEDAEKLAEATPYKSSSVLWEILLSSCRVHGDVSLARRVAEKLMRLDPQ SSAAYVLLSNTYSSLRQWDDSAALQGLMNKNRVHKTPGQSWTTYGNDLDSGFRK

Transcript Sequence

Transcript ID	AT4G20770.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr4:11130762-11133086 REVERSE LENGTH=2325 \| 201606
Sequence	ATGCGTAGCGGAGGGAATAAGTATTTAGCGAGTCTCTTGCGTTGTTATAGAGATGAAAGG TGTAAACTTTCTGGGAAAGTTATACATGGGTTCATTGTTAGGATGGGAATGAAGAGTGAT ACTTATCTATGTAATCGTTTACTTGATTTGTATATTGAGTGTGGTGATGGGGATTATGCA CGGAAGGTGTTTGATGAAATGTCTGTAAGAGATGTTTATTCTTGGAATGCTTTTTTGACG TTTAGATGTAAAGTTGGGGATTTGGGGGAAGCGTGTGAGGTGTTTGATGGAATGCCTGAG AGAGATGTTGTGTCGTGGAATAATATGATTAGTGTTTTGGTGAGGAAAGGGTTTGAAGAG AAGGCTTTGGTTGTCTATAAGAGGATGGTTTGTGATGGGTTTTTGCCTTCTCGGTTCACG TTAGCTAGTGTTTTAAGTGCGTGTAGCAAGGTTTTGGATGGTGTTTTTGGTATGAGGTGT CATGGGGTTGCTGTTAAAACGGGTCTTGATAAGAATATTTTTGTTGGGAATGCGTTGTTG TCTATGTATGCAAAGTGTGGGTTTATTGTTGATTATGGTGTTCGAGTCTTTGAATCTCTC TCTCAGCCTAATGAAGTCTCTTATACAGCGGTGATTGGCGGGTTAGCTCGGGAAAATAAA GTGTTGGAGGCAGTTCAGATGTTCAGATTGATGTGCGAGAAAGGCGTGCAGGTGGATTCT GTTTGCTTATCTAATATTCTTAGCATCTCTGCTCCAAGAGAAGGATGTGATAGCCTGAGT GAAATCTATGGCAATGAGCTTGGGAAACAGATTCATTGTCTTGCTTTGAGACTTGGGTTT GGAGGAGATCTTCATCTGAACAATTCGTTGCTTGAAATATATGCAAAGAATAAAGACATG AATGGTGCAGAGCTAATTTTTGCTGAGATGCCTGAAGTGAATGTTGTCTCTTGGAACATA ATGATAGTTGGGTTTGGTCAGGAGTATCGAAGTGACAAATCTGTTGAATTCCTAACGAGA ATGAGAGATTCTGGTTTTCAACCAAATGAAGTTACTTGCATTAGTGTTCTTGGAGCGTGC TTTCGTTCAGGGGATGTCGAAACCGGAAGGAGAATATTCAGTAGCATTCCCCAGCCAAGT GTTAGCGCTTGGAATGCTATGCTTTCTGGTTATTCCAACTATGAACACTATGAGGAAGCA ATAAGCAATTTCAGACAAATGCAGTTTCAGAACCTGAAACCTGATAAAACCACTTTGAGT GTGATATTAAGTTCGTGTGCGAGATTGAGATTTCTGGAAGGAGGGAAGCAGATCCATGGG GTAGTGATAAGGACCGAGATTTCGAAGAACAGTCACATAGTTAGTGGTCTTATTGCAGTG TACTCCGAATGCGAGAAGATGGAGATATCTGAATGTATCTTTGATGATTGTATAAACGAA TTGGATATCGCTTGTTGGAACTCGATGATCTCAGGTTTTAGACACAACATGCTGGACACA AAAGCTCTAATACTCTTTAGAAGGATGCATCAGACTGCCGTGTTGTGTCCTAATGAAACT TCATTCGCTACTGTACTAAGTAGCTGTTCAAGGTTATGTAGTTTGCTCCATGGAAGACAG TTTCATGGACTGGTAGTGAAGAGTGGATATGTAAGTGATTCCTTTGTTGAAACCGCTCTT ACCGACATGTACTGCAAGTGTGGGGAAATAGATTCAGCTCGACAGTTCTTCGATGCTGTT TTGAGGAAAAACACGGTTATTTGGAATGAGATGATACATGGGTATGGTCATAATGGACGA GGTGATGAAGCTGTTGGTCTCTACAGAAAGATGATTTCATCAGGAGAGAAGCCTGATGGG ATAACCTTCGTTTCTGTCTTGACTGCTTGTAGCCACTCAGGACTGGTGGAAACCGGGCTT GAGATACTTAGTTCGATGCAGAGAATTCATGGAATTGAGCCGGAGCTGGATCATTACATC TGTATAGTTGATTGTCTTGGAAGAGCTGGCCGGCTTGAAGATGCAGAGAAGCTTGCAGAA GCTACACCATACAAAAGTAGCTCTGTTCTATGGGAGATTCTACTAAGTTCATGTAGAGTC CATGGAGATGTGAGCTTGGCTAGACGAGTTGCAGAAAAACTAATGCGTCTGGATCCTCAG AGCTCAGCAGCATATGTGCTGCTAAGCAACACATATAGTTCTTTGAGACAGTGGGATGAT TCTGCAGCTCTTCAAGGATTAATGAACAAGAACAGAGTTCATAAAACTCCAGGTCAAAGC TGGACCACATATGGCAATGATTTGGACTCAGGGTTTCGAAAATAG