Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT4G14170.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr4:8176709-8178142 REVERSE LENGTH=1434 \| 201606
Sequence	ATGCACTTACCATCTTCCTCTTCCTTGTACTCGTCTCCTACGAAGAGTCTATTCGCAATG TTCTTGAAAGCTCGAGCTTTATCAGTAACTACACAGAATCCTCCTGATCTCTTCTCGCTT CTACATCATTCTCCAAACGCTAAACATCTACGCCATCTCCACGCTCACCTTCTTCGTACA TTTCTCTATTCCAACGTTGTGCTCAGCTCCAAGCTCGTCCTCGCTTATTCCAAGCTGAAC CATCTCTTTCCTACTTCGCTTTCTGTCTTCTGGCACATGCCTTATCGCAACATTTTCTCT TGGAATATAATCATCGGTGAGTTCTCTAGATCGGGTTTTGCTTCCAAGTCAATTGATTTG TTTCTTCGTATGTGGCGAGAGTCTTGTGTTAGACCGGATGATTTTACGCTTCCTCTTATT CTACGAGCTTGCTCTGCGTCTAGGGAAGCGAAATCTGGAGATTTGATTCATGTTCTGTGT TTGAAACTTGGGTTTAGCTCAAGTTTGTTTGTTAGTTCGGCTTTAGTGATAATGTATGTA GATATGGGGAAACTTTTACATGCACGTAAGTTGTTCGACGATATGCCTGTGAGAGACTCT GTTCTTTATACAGCTATGTTTGGTGGGTATGTTCAGCAAGGAGAAGCTATGTTGGGTTTA GCCATGTTCAGAGAAATGGGGTATTCTGGATTTGCGCTGGATTCAGTGGTGATGGTGAGT TTACTTATGGCTTGTGGACAACTTGGAGCGTTGAAGCACGGGAAGAGCGTCCATGGATGG TGTATCAGGAGATGCTCCTGCTTGGGCTTGAATCTCGGCAATGCTATAACAGATATGTAT GTAAAGTGCTCGATACTGGACTATGCGCACACTGTATTTGTAAATATGTCGAGACGAGAT GTGATCTCTTGGAGCTCGCTTATTTTGGGGTATGGTTTGGATGGAGACGTGGTAATGTCT TTTAAACTCTTTGATGAGATGCTTAAGGAAGGAATTGAACCCAATGCTGTCACTTTTCTT GGTGTCTTATCAGCCTGTGCCCATGGCGGTCTTGTGGAAAAATCTTGGCTGTATTTCAGA CTAATGCAGGAATATAATATAGTTCCTGAACTGAAACACTATGCTAGTGTGGCGGATTGT ATGTCTCGAGCAGGTCTTCTGGAGGAAGCAGAGAAGTTTCTGGAAGATATGCCCGTGAAA CCTGATGAGGCTGTTATGGGTGCGGTGTTGAGTGGGTGCAAGGTGTATGGAAATGTAGAA GTTGGGGAAAGAGTGGCGAGGGAGCTGATTCAACTTAAGCCGAGAAAAGCTAGCTACTAT GTAACGTTGGCCGGTCTATATTCAGCTGCAGGTCGGTTTGATGAAGCTGAGAGTCTGAGG CAGTGGATGAAGGAGAAACAGATTTCTAAGGTTCCCGGGTGTAGCTCAATATGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT4G14170.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr4:8176709-8178142 REVERSE LENGTH=477 \| 201606
Sequence	MHLPSSSSLYSSPTKSLFAMFLKARALSVTTQNPPDLFSLLHHSPNAKHLRHLHAHLLRT FLYSNVVLSSKLVLAYSKLNHLFPTSLSVFWHMPYRNIFSWNIIIGEFSRSGFASKSIDL FLRMWRESCVRPDDFTLPLILRACSASREAKSGDLIHVLCLKLGFSSSLFVSSALVIMYV DMGKLLHARKLFDDMPVRDSVLYTAMFGGYVQQGEAMLGLAMFREMGYSGFALDSVVMVS LLMACGQLGALKHGKSVHGWCIRRCSCLGLNLGNAITDMYVKCSILDYAHTVFVNMSRRD VISWSSLILGYGLDGDVVMSFKLFDEMLKEGIEPNAVTFLGVLSACAHGGLVEKSWLYFR LMQEYNIVPELKHYASVADCMSRAGLLEEAEKFLEDMPVKPDEAVMGAVLSGCKVYGNVE VGERVARELIQLKPRKASYYVTLAGLYSAAGRFDEAESLRQWMKEKQISKVPGCSSI

Transcript Sequence

Transcript ID	AT4G14170.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr4:8176146-8178196 REVERSE LENGTH=2051 \| 201606
Sequence	GTTTTGGATTAAATCATAAAGCATCTTCCACTATTCTCTGGATTTTGTGATGCGATGCAC TTACCATCTTCCTCTTCCTTGTACTCGTCTCCTACGAAGAGTCTATTCGCAATGTTCTTG AAAGCTCGAGCTTTATCAGTAACTACACAGAATCCTCCTGATCTCTTCTCGCTTCTACAT CATTCTCCAAACGCTAAACATCTACGCCATCTCCACGCTCACCTTCTTCGTACATTTCTC TATTCCAACGTTGTGCTCAGCTCCAAGCTCGTCCTCGCTTATTCCAAGCTGAACCATCTC TTTCCTACTTCGCTTTCTGTCTTCTGGCACATGCCTTATCGCAACATTTTCTCTTGGAAT ATAATCATCGGTGAGTTCTCTAGATCGGGTTTTGCTTCCAAGTCAATTGATTTGTTTCTT CGTATGTGGCGAGAGTCTTGTGTTAGACCGGATGATTTTACGCTTCCTCTTATTCTACGA GCTTGCTCTGCGTCTAGGGAAGCGAAATCTGGAGATTTGATTCATGTTCTGTGTTTGAAA CTTGGGTTTAGCTCAAGTTTGTTTGTTAGTTCGGCTTTAGTGATAATGTATGTAGATATG GGGAAACTTTTACATGCACGTAAGTTGTTCGACGATATGCCTGTGAGAGACTCTGTTCTT TATACAGCTATGTTTGGTGGGTATGTTCAGCAAGGAGAAGCTATGTTGGGTTTAGCCATG TTCAGAGAAATGGGGTATTCTGGATTTGCGCTGGATTCAGTGGTGATGGTGAGTTTACTT ATGGCTTGTGGACAACTTGGAGCGTTGAAGCACGGGAAGAGCGTCCATGGATGGTGTATC AGGAGATGCTCCTGCTTGGGCTTGAATCTCGGCAATGCTATAACAGATATGTATGTAAAG TGCTCGATACTGGACTATGCGCACACTGTATTTGTAAATATGTCGAGACGAGATGTGATC TCTTGGAGCTCGCTTATTTTGGGGTATGGTTTGGATGGAGACGTGGTAATGTCTTTTAAA CTCTTTGATGAGATGCTTAAGGAAGGAATTGAACCCAATGCTGTCACTTTTCTTGGTGTC TTATCAGCCTGTGCCCATGGCGGTCTTGTGGAAAAATCTTGGCTGTATTTCAGACTAATG CAGGAATATAATATAGTTCCTGAACTGAAACACTATGCTAGTGTGGCGGATTGTATGTCT CGAGCAGGTCTTCTGGAGGAAGCAGAGAAGTTTCTGGAAGATATGCCCGTGAAACCTGAT GAGGCTGTTATGGGTGCGGTGTTGAGTGGGTGCAAGGTGTATGGAAATGTAGAAGTTGGG GAAAGAGTGGCGAGGGAGCTGATTCAACTTAAGCCGAGAAAAGCTAGCTACTATGTAACG TTGGCCGGTCTATATTCAGCTGCAGGTCGGTTTGATGAAGCTGAGAGTCTGAGGCAGTGG ATGAAGGAGAAACAGATTTCTAAGGTTCCCGGGTGTAGCTCAATATGAAAGATGGGATGG AGATTTCAGCGTCTTCTGGTTGTACATGTGAAAGATTACCAGAATGGTAAAGATCAAAAC CGCACCAAAAGCTCTTGAAACTTACATCTAGATTTTGGTAATGAGGCTCAGACCACAGCT AATTGTGTACATGGAAAAGTTGTGGTGTCTGGTCCGACTTTGAAAACAGTCTTTAGCTAC TACGGCATGTTTCACCTCGCTGTTAGTGGAAAGCAAGGGACTTTTGATTGCCTCAGCAAA TAAGACATTTAAACATGGCCTGGAGACTACAGTCTCAGCTGTCTGCAGAGGGTCATCATC CAAAAGAGTAGCTGGGTGGTCAAAAGGGTTACAAAGTTTCAATTGTTATGGATAAGTTAA AAATGTCTTGTGCTTATACACAAACTGATATGCTTAAGTAAGCTTTTGATGTAGAATATA CTTGGTGTTTAATAGGATAAAGATAAGCTCTTTTCAAAGTTAACTTTTTGTTATTAGGGT TGTAGATCATGGGATTTGATATACCGGAAGGAACATTTTTTTGAATTATTTCAGAATAAT CTTTTATTGCG