Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT4G11550.1
CDS Infomation	\| Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein \| Chr4:6996823-6998829 REVERSE LENGTH=2007 \| 201606
Sequence	ATGGAATATGAGGAATATGAGGAAGTGTCACTACCGTTGATCCACGAGCATCTTATGATG CCGTGTAATTATCTAACTAGGGCTGATTGCTGTGGACGCTTCGGTTTTACCAGTGGTGGT TATTACTGCGAAAGCTGTAGCTTCTTGGTTCATAGGAAATGTGTTGAAGATTCCTCTGAA TATATTGAACACCCGTCTCACTCTGTTCACCCTCTTAAGCTTCAAAGTAAACCAGACCAT ATATGTGATATATGTGATAAGAGGATCGTGGATCTATGCTATCATTGTGAGATCTGTGAC TTCAATGTGGATCTATACTGTGCAAAGTACCCACCACCAAAAGTTATTGATATTTCCGAG ACGCATCACCACAAGCTCACCCTTCTCAAGAAAGGGATCAAGTTCGACTGTGGTGCTAGC AAATGTGGGGAGGTTATGTATGGGTTTCCTTACAAATGCCATGAATGTGATTTAGCCTTC CATGTGGATTGCGTATGGAATCCGCCGGAGGCAAAAAACCCGTCAGAGGTAAACCACTCT CACCACCCTTTACACCCTCTTAAGCTCCACATAGGTCAACCACCGGACTATTCTGATGGT AAATGTCGTCTTTGCGCACAAAAGATTTGTGATAGATTGTTTTATCATTGTTCTGCCTGT AACTTCAGCTTGGATATGTGTTGTCTTTTAAACCCACCATCACAATATGTTATGGATTTG AAAGTTCATGCTCACGAACTCACCTTTCGCCCAAGACTTGATTCTTTTACATGTAATGCT TGCGGGTTGAGTGGAGACAGAAACCCTTACATATGTGTGCAATGTGATTTCATGATACAT CAAGAGTGTCTTGACCTTCCACGCCTCATAAACATCAATCGGCATGATCACCGTGTTTCT CGCACTTCCGTTCTTGGTGTTGTGAATTCGGTATGTGGAGTTTGTCGCCGGAAGGTGGAT TGGACTTGGGGCGGGTATTCTTGTCAGCGGTGTCCTCACTATGTCGTTCATTCGAAATGT GCTACTAGAGAGGATGTGTGGAACGGAAAAGAGCTCGAAGGAGTGCCTGAAGAGATAGAA GATGTAGAGCCATATGTGGTGATAGATGAAAACACAATACAACATTTCAGCCACAAAGAG CATTACCTAAGATTCCATGTTAGTGCTCTTCTTTGGGAGGAAAACAAGCGTTGCAATGCT TGCACCCAGCCCATTGGTCTCCAATCTTTCTATGGTTGTGTTGTTTGTGATTTCATTCTT CACCAAAACTGCGCTGAATCTCCTAGAAAGAAATGGCATTTTCTACATAATGAACGTCTT ACTTTAGTTACAAGCAAGGATGATTACTTTCACTGCACTGCGTGTGATAGACTCTCCAAT GGTTTCATGTACCAGTGTGGGGATATGAAGTTAGATGTACTGTGCGGTTCAATTTCTGAA CCGTTTGTCCATCCAAGCCACCCCCATCATCCCTTATATTACATTCCACCAGAGGAAGAA AAACAATGCAATGGTTGCGACAATTGGTCATCTCTTGTGCTTACGTGCATTGAAAGTGGC TGTAGATATTTCTTATGCTTCGATTGTGCTAGGCTACCACAAGTGGTAAAGCATAGAGTA GACGCTCATCCTCTCTCACTATGCTATGGAGAAAAGGCAAGTGGCAAATACTGGTGTGAC ATTTGTGAGAAAGAAACGAATCCGAGTACATGGTTCTACACGTGTAAAGATCACCGAGCT AGTTTGCATACAAAGTGCGTGATGGGAGACTTTGCAAGGCTCATGCCAGGAAGTACATTA ACGTATTCCCACATATCATATGAGGTGGTGCGCAATAATAGTATGTCTCGTCCATTTTGC AGAGCGTGTGAGTCACATTGCATGTACCCTATCATCTTGAAGGTGCTTGGATCCTCAGCT CTTTACATCTGCTCTTTAAACTGCGTAGATGGTTTTTGGTATCCGAAGATCGTTTCTGGT ATCAAAAAACGTCAACCAGCAAAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT4G11550.1
PEP Infomation	\| Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein \| Chr4:6996823-6998829 REVERSE LENGTH=668 \| 201606
Sequence	MEYEEYEEVSLPLIHEHLMMPCNYLTRADCCGRFGFTSGGYYCESCSFLVHRKCVEDSSE YIEHPSHSVHPLKLQSKPDHICDICDKRIVDLCYHCEICDFNVDLYCAKYPPPKVIDISE THHHKLTLLKKGIKFDCGASKCGEVMYGFPYKCHECDLAFHVDCVWNPPEAKNPSEVNHS HHPLHPLKLHIGQPPDYSDGKCRLCAQKICDRLFYHCSACNFSLDMCCLLNPPSQYVMDL KVHAHELTFRPRLDSFTCNACGLSGDRNPYICVQCDFMIHQECLDLPRLININRHDHRVS RTSVLGVVNSVCGVCRRKVDWTWGGYSCQRCPHYVVHSKCATREDVWNGKELEGVPEEIE DVEPYVVIDENTIQHFSHKEHYLRFHVSALLWEENKRCNACTQPIGLQSFYGCVVCDFIL HQNCAESPRKKWHFLHNERLTLVTSKDDYFHCTACDRLSNGFMYQCGDMKLDVLCGSISE PFVHPSHPHHPLYYIPPEEEKQCNGCDNWSSLVLTCIESGCRYFLCFDCARLPQVVKHRV DAHPLSLCYGEKASGKYWCDICEKETNPSTWFYTCKDHRASLHTKCVMGDFARLMPGSTL TYSHISYEVVRNNSMSRPFCRACESHCMYPIILKVLGSSALYICSLNCVDGFWYPKIVSG IKKRQPAK

Transcript Sequence

Transcript ID	AT4G11550.1
Transcript Infomation	\| Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein \| Chr4:6996747-6999693 REVERSE LENGTH=2947 \| 201606
Sequence	CTCCACCAGAATATGCCCATTTCCAAATTTTCTACCTTTTGAGAGACTTGAGATTTGGAT ATTTGTGTGCCATTATCTCATCTTGTAAGATGGAAATTACACGGCCAGTATGTGTGTGCC CCCCAAGCTGTTTTGCTTTCCATTAATGGTGTCCGTATCATGAGGACACTTGATGGTATT AGACTCCATTGGTGGCCAATCTATAACTGGGTTTCAAGATTGTCTTACTACTCAATTCTT CATTGTCTAAACAGGAGATGACATTACCCCTGATCTTTAACTCCACTTCATCTTGTTCAG ATGATTTTGCAGTGAAGAGCGAGGTTGTTGAAATCATCGAAGAACACAAGGTTGTTCTTG ATCAAAGCTTCATCAAACAAATTAGTTAATGTTCTTGGATTGTCTCGTATACATCAATGC GTTTATGCGCTAACAAAACCTTCTATTGGTTCCTGTTTTGAATATTGATTTGCTTTCATT GTTTACATTAGATGATACAATGCTTTATGTCATTATGCTGCAATGAAAAGGTACAAGTTC ATCAAAGTTATTGCTTGAGGAATTATTTATCTTGATAAAAAATATGCTAATTAAGACAAC AAAACTGAGACTTCGATTATAGGATTTTATATCAATGGAACTTTTTCAATGTACAATTAT TATTGTGGGTCCTGTCTCTTTGTTTATAATTATATCAACGGCTAGTGACTTTTAAAATCG TTTTTCTCCTGACTAAGAGCATCTGTGAGAGTAAACATTGACTTTTAATTAGAGAGAGAA ATAGACTTGAAAGGAGCATAGCTTTGTGATCTCAGATTCAACTTTTTCTTCTTCCTTTTC TGCTCAATCTTGTTGTAGACGACCATGGAATATGAGGAATATGAGGAAGTGTCACTACCG TTGATCCACGAGCATCTTATGATGCCGTGTAATTATCTAACTAGGGCTGATTGCTGTGGA CGCTTCGGTTTTACCAGTGGTGGTTATTACTGCGAAAGCTGTAGCTTCTTGGTTCATAGG AAATGTGTTGAAGATTCCTCTGAATATATTGAACACCCGTCTCACTCTGTTCACCCTCTT AAGCTTCAAAGTAAACCAGACCATATATGTGATATATGTGATAAGAGGATCGTGGATCTA TGCTATCATTGTGAGATCTGTGACTTCAATGTGGATCTATACTGTGCAAAGTACCCACCA CCAAAAGTTATTGATATTTCCGAGACGCATCACCACAAGCTCACCCTTCTCAAGAAAGGG ATCAAGTTCGACTGTGGTGCTAGCAAATGTGGGGAGGTTATGTATGGGTTTCCTTACAAA TGCCATGAATGTGATTTAGCCTTCCATGTGGATTGCGTATGGAATCCGCCGGAGGCAAAA AACCCGTCAGAGGTAAACCACTCTCACCACCCTTTACACCCTCTTAAGCTCCACATAGGT CAACCACCGGACTATTCTGATGGTAAATGTCGTCTTTGCGCACAAAAGATTTGTGATAGA TTGTTTTATCATTGTTCTGCCTGTAACTTCAGCTTGGATATGTGTTGTCTTTTAAACCCA CCATCACAATATGTTATGGATTTGAAAGTTCATGCTCACGAACTCACCTTTCGCCCAAGA CTTGATTCTTTTACATGTAATGCTTGCGGGTTGAGTGGAGACAGAAACCCTTACATATGT GTGCAATGTGATTTCATGATACATCAAGAGTGTCTTGACCTTCCACGCCTCATAAACATC AATCGGCATGATCACCGTGTTTCTCGCACTTCCGTTCTTGGTGTTGTGAATTCGGTATGT GGAGTTTGTCGCCGGAAGGTGGATTGGACTTGGGGCGGGTATTCTTGTCAGCGGTGTCCT CACTATGTCGTTCATTCGAAATGTGCTACTAGAGAGGATGTGTGGAACGGAAAAGAGCTC GAAGGAGTGCCTGAAGAGATAGAAGATGTAGAGCCATATGTGGTGATAGATGAAAACACA ATACAACATTTCAGCCACAAAGAGCATTACCTAAGATTCCATGTTAGTGCTCTTCTTTGG GAGGAAAACAAGCGTTGCAATGCTTGCACCCAGCCCATTGGTCTCCAATCTTTCTATGGT TGTGTTGTTTGTGATTTCATTCTTCACCAAAACTGCGCTGAATCTCCTAGAAAGAAATGG CATTTTCTACATAATGAACGTCTTACTTTAGTTACAAGCAAGGATGATTACTTTCACTGC ACTGCGTGTGATAGACTCTCCAATGGTTTCATGTACCAGTGTGGGGATATGAAGTTAGAT GTACTGTGCGGTTCAATTTCTGAACCGTTTGTCCATCCAAGCCACCCCCATCATCCCTTA TATTACATTCCACCAGAGGAAGAAAAACAATGCAATGGTTGCGACAATTGGTCATCTCTT GTGCTTACGTGCATTGAAAGTGGCTGTAGATATTTCTTATGCTTCGATTGTGCTAGGCTA CCACAAGTGGTAAAGCATAGAGTAGACGCTCATCCTCTCTCACTATGCTATGGAGAAAAG GCAAGTGGCAAATACTGGTGTGACATTTGTGAGAAAGAAACGAATCCGAGTACATGGTTC TACACGTGTAAAGATCACCGAGCTAGTTTGCATACAAAGTGCGTGATGGGAGACTTTGCA AGGCTCATGCCAGGAAGTACATTAACGTATTCCCACATATCATATGAGGTGGTGCGCAAT AATAGTATGTCTCGTCCATTTTGCAGAGCGTGTGAGTCACATTGCATGTACCCTATCATC TTGAAGGTGCTTGGATCCTCAGCTCTTTACATCTGCTCTTTAAACTGCGTAGATGGTTTT TGGTATCCGAAGATCGTTTCTGGTATCAAAAAACGTCAACCAGCAAAGTGAAGATTGCTC GTTAAAATCCAAAAGTTATGTTTGTGATGTTGTATGTACTTCCAGTAATTCTGTTCATTA AAACCCC