Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT4G08810.1
CDS Infomation	\| calcium ion binding protein \| Chr4:5616204-5617862 REVERSE LENGTH=1659 \| 201606
Sequence	ATGAAGGAATCAGATCTAACCACCGAACCAATCGCACAAAATCTAATCAAGCTAATAAGC AATGTCTGTTTCTCAGTCTTCGTTTTCACAGTTCTCATCTTCACAGTAATCGCAGTAACT TACCAACCACCAGATCCATGGCTTGAATCTGCTCCAGCACTCACCAAACTCCTAACCGAA ACCGAAAACGCAACTTTCAAAATCGACGGTTCGATTCTCAAAACCGGCGAAGATCTCGCT TCATCTCCGTCATCATCACCTCCGTCGAACTCCACAGAGCAAGTCACGGAGGCGACGATT GAGAAATCCGAGGCGAAAATCGGTAATATGACTGTGAAGAACTCTATAGATTGTGATGAG GATTTGAAGATTGTGAATTGTTCTGATCCGAGAGTTTTAGTTGCTGTTGAGAGGTTTAAT TTGAAGGTTTTTAAATCTATTGTGTTCTTAGAGTACGAAACTCCGGTTAACGGATCGAAA CTAGACGAATGCGATGTTTCTTGGAGGTTTAGGAATAAGAAGGAGAAGTCATGGAGGAGA TACAGAGATTTCAGGAGGTTTAGGTTTGGATTTGGTGAGAATTGTACTTATAAAGTGTTT CATACTAGTGGTTGGCATTCTGGTGTTAATGCTCGTAGGCCTAGGATTAGTAGACCGAGC TCGAGTCGAGGAGCTCGCGGTGGTGATTCGGAGATTAATGATACGATTCCGACTCTTGGT TCGCAGACGAGTTTCCGGAGAGGGAAGTATTTGTATTATTCGCGGGGTGGTGATTATTGT AAGGGTATGAATCAGTATATGTGGAGTTTCTTGTGTGGTTTAGGTGAAGCAATGTATTTG AATAGGACTTTTGTGATGGATTTGAGTTTGTGTTTGTCTTCGAGTTATAGTTCTAAGGGG AAAGATGAGGAAGGTAAGGATTTTCGGTATTATTTTGATTTCGAGCATCTTAAGGAGACG GCTTCGATTGTTGAAGAGGGTGAGTTCTTGAGAGATTGGAAGAAATGGAATCGGTTGCAT AAACGGAAAGTTCCTGTTAGGAAGGTTAAGACGCATAGAGTGTCGCCTTTGCAGCTTAGT AAAGATAAGAGTACGATTATATGGAGGCAGTTTGATACTCCTGAGCCTGAAAACTATTGG TATAGAGTTTGTGAAGGGCAAGCATCGAAGTATGTTGAGAGGCCGTGGCATGCGTTGTGG AAGTCGAAGAGGTTGATGAATATTGTCTCTGAGATTAGTGGGAAAATGGACTGGGATTTT GATGCTGTTCATGTGGTTAGAGGCGAGAAAGCGAAGAACAAGAAGCTATGGCCACATTTG GATGCAGACACATGGCCTGATGCGATATTGACCAAACTTAAAGGATTGGTTCAGGTGTGG AGGAATTTGTACGTTGCAACTAATGAACCGTTTTATAATTACTTTGACAAGTTGAGGTCT CAGTACAAGGTTCACTTGCTTGATGACTATAGCTACTTGTGGGGAAATAAGAGTGAATGG TACAATGAGACTAGTCTCTTGAACAATGGGAAACCAGTTGAGTTTGATGGGTACATGAGA GTAGCTGTTGATACAGAGGTGTTTTATAGAGGAAAGACTCGCGTCGAGACGTTCTATAAC CTTACCACGGACTGCAAAGACGGGATCAATACATGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT4G08810.1
PEP Infomation	\| calcium ion binding protein \| Chr4:5616204-5617862 REVERSE LENGTH=552 \| 201606
Sequence	MKESDLTTEPIAQNLIKLISNVCFSVFVFTVLIFTVIAVTYQPPDPWLESAPALTKLLTE TENATFKIDGSILKTGEDLASSPSSSPPSNSTEQVTEATIEKSEAKIGNMTVKNSIDCDE DLKIVNCSDPRVLVAVERFNLKVFKSIVFLEYETPVNGSKLDECDVSWRFRNKKEKSWRR YRDFRRFRFGFGENCTYKVFHTSGWHSGVNARRPRISRPSSSRGARGGDSEINDTIPTLG SQTSFRRGKYLYYSRGGDYCKGMNQYMWSFLCGLGEAMYLNRTFVMDLSLCLSSSYSSKG KDEEGKDFRYYFDFEHLKETASIVEEGEFLRDWKKWNRLHKRKVPVRKVKTHRVSPLQLS KDKSTIIWRQFDTPEPENYWYRVCEGQASKYVERPWHALWKSKRLMNIVSEISGKMDWDF DAVHVVRGEKAKNKKLWPHLDADTWPDAILTKLKGLVQVWRNLYVATNEPFYNYFDKLRS QYKVHLLDDYSYLWGNKSEWYNETSLLNNGKPVEFDGYMRVAVDTEVFYRGKTRVETFYN LTTDCKDGINTC

Transcript Sequence

Transcript ID	AT4G08810.1
Transcript Infomation	\| calcium ion binding protein \| Chr4:5615921-5618066 REVERSE LENGTH=2146 \| 201606
Sequence	CAAATTTAAAAGTTGGCACATTTTTCCCAAATTAAAAATCAAAGTAAGAAAAAAAGAAGA CTTGTCCAAAAAAAAAAAAGACTAAAAAAAGTTCACTAGAGTCCATTTTCTTCTTCTTCC TCACACCAAAAAGCTTCCATTGATTTCGCATCAGATCTTGCTCTCTCTTCTATCTCTGCG ATTCTTCTGGATCTTCTCAAATCCATGAAGGAATCAGATCTAACCACCGAACCAATCGCA CAAAATCTAATCAAGCTAATAAGCAATGTCTGTTTCTCAGTCTTCGTTTTCACAGTTCTC ATCTTCACAGTAATCGCAGTAACTTACCAACCACCAGATCCATGGCTTGAATCTGCTCCA GCACTCACCAAACTCCTAACCGAAACCGAAAACGCAACTTTCAAAATCGACGGTTCGATT CTCAAAACCGGCGAAGATCTCGCTTCATCTCCGTCATCATCACCTCCGTCGAACTCCACA GAGCAAGTCACGGAGGCGACGATTGAGAAATCCGAGGCGAAAATCGGTAATATGACTGTG AAGAACTCTATAGATTGTGATGAGGATTTGAAGATTGTGAATTGTTCTGATCCGAGAGTT TTAGTTGCTGTTGAGAGGTTTAATTTGAAGGTTTTTAAATCTATTGTGTTCTTAGAGTAC GAAACTCCGGTTAACGGATCGAAACTAGACGAATGCGATGTTTCTTGGAGGTTTAGGAAT AAGAAGGAGAAGTCATGGAGGAGATACAGAGATTTCAGGAGGTTTAGGTTTGGATTTGGT GAGAATTGTACTTATAAAGTGTTTCATACTAGTGGTTGGCATTCTGGTGTTAATGCTCGT AGGCCTAGGATTAGTAGACCGAGCTCGAGTCGAGGAGCTCGCGGTGGTGATTCGGAGATT AATGATACGATTCCGACTCTTGGTTCGCAGACGAGTTTCCGGAGAGGGAAGTATTTGTAT TATTCGCGGGGTGGTGATTATTGTAAGGGTATGAATCAGTATATGTGGAGTTTCTTGTGT GGTTTAGGTGAAGCAATGTATTTGAATAGGACTTTTGTGATGGATTTGAGTTTGTGTTTG TCTTCGAGTTATAGTTCTAAGGGGAAAGATGAGGAAGGTAAGGATTTTCGGTATTATTTT GATTTCGAGCATCTTAAGGAGACGGCTTCGATTGTTGAAGAGGGTGAGTTCTTGAGAGAT TGGAAGAAATGGAATCGGTTGCATAAACGGAAAGTTCCTGTTAGGAAGGTTAAGACGCAT AGAGTGTCGCCTTTGCAGCTTAGTAAAGATAAGAGTACGATTATATGGAGGCAGTTTGAT ACTCCTGAGCCTGAAAACTATTGGTATAGAGTTTGTGAAGGGCAAGCATCGAAGTATGTT GAGAGGCCGTGGCATGCGTTGTGGAAGTCGAAGAGGTTGATGAATATTGTCTCTGAGATT AGTGGGAAAATGGACTGGGATTTTGATGCTGTTCATGTGGTTAGAGGCGAGAAAGCGAAG AACAAGAAGCTATGGCCACATTTGGATGCAGACACATGGCCTGATGCGATATTGACCAAA CTTAAAGGATTGGTTCAGGTGTGGAGGAATTTGTACGTTGCAACTAATGAACCGTTTTAT AATTACTTTGACAAGTTGAGGTCTCAGTACAAGGTTCACTTGCTTGATGACTATAGCTAC TTGTGGGGAAATAAGAGTGAATGGTACAATGAGACTAGTCTCTTGAACAATGGGAAACCA GTTGAGTTTGATGGGTACATGAGAGTAGCTGTTGATACAGAGGTGTTTTATAGAGGAAAG ACTCGCGTCGAGACGTTCTATAACCTTACCACGGACTGCAAAGACGGGATCAATACATGC TAAATTGATCATTCAGGTTGTGATATGTTTTCATTGTTTTATTTGTTTGTGTATCAAATT CAGTTATGCTTGTGTTGTTTACCTTGTGTTCTACTAGCTATTGAAGAGTGTACGTAACGT TTACATTTTTTGATTCATATCCTTAATTCTGTAAGAAGGCAACACCAAAGTGACATAGCT GATACATATCGATTCAGGAATATATTGTTTATGATTATGCTTTTAACTAGAACTCTTTTA TCGATCAAAACAATCTTGTATTGTTCATCTGTGTATCATGAACGGG