Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT4G02750.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr4:1221116-1223461 REVERSE LENGTH=2346 \| 201606
Sequence	ATGGAAATAAACAAGTTTCGTGCTCTTTCGCGGCGAGCTCAGCAGCTACATTACACATCC TTGAATGGACTTAAACGAAGATGCAACAACGCACACGGTGCAGCTAATTTTCACTCGTTG AAGAGAGCTACACAAACCCAAATCCAGAAATCGCAGACCAAACCTCTCCTTAAATGTGGA GACTCGGATATAAAAGAGTGGAACGTTGCTATAAGCAGCTACATGCGTACTGGAAGATGC AACGAAGCGCTTCGTGTCTTCAAACGCATGCCTAGGTGGAGTTCCGTTTCTTATAACGGT ATGATTTCTGGTTATTTGAGAAACGGTGAGTTTGAACTCGCCCGGAAGTTGTTCGATGAA ATGCCTGAACGAGATTTAGTTTCCTGGAATGTGATGATTAAAGGGTATGTACGGAACAGG AATCTTGGGAAAGCGAGGGAATTGTTTGAGATAATGCCTGAGAGAGATGTTTGTTCGTGG AATACCATGTTGTCGGGTTACGCTCAGAATGGTTGTGTTGATGATGCAAGGAGTGTTTTT GATCGAATGCCTGAGAAGAACGATGTATCGTGGAATGCATTGCTCTCTGCTTATGTTCAG AATAGTAAGATGGAGGAGGCTTGTATGTTGTTTAAGTCAAGAGAGAATTGGGCGTTGGTT TCGTGGAACTGCTTGCTTGGTGGGTTTGTTAAGAAGAAAAAGATTGTTGAGGCAAGGCAG TTTTTTGATAGTATGAATGTGAGGGATGTGGTCTCATGGAATACGATCATCACTGGTTAT GCACAGAGCGGGAAAATCGATGAGGCGCGGCAGCTATTTGATGAGTCTCCTGTTCAAGAT GTCTTTACATGGACAGCAATGGTGTCAGGATATATACAAAACCGGATGGTGGAAGAAGCG AGAGAATTATTCGACAAAATGCCAGAGAGAAACGAAGTGTCATGGAATGCCATGCTTGCA GGATATGTGCAGGGCGAGAGAATGGAGATGGCAAAGGAATTGTTTGATGTTATGCCTTGT AGAAATGTTAGTACATGGAACACGATGATAACTGGATATGCTCAGTGTGGGAAAATTTCT GAAGCTAAGAACCTTTTTGATAAAATGCCAAAGAGAGATCCGGTCTCTTGGGCAGCTATG ATTGCAGGGTATTCGCAAAGCGGACACAGCTTTGAAGCTCTTCGTTTGTTTGTACAAATG GAGAGGGAGGGAGGTAGATTGAATCGGTCTTCGTTTTCATCTGCTCTAAGCACATGTGCA GACGTTGTTGCTCTCGAGCTCGGGAAGCAATTGCATGGACGATTAGTTAAAGGTGGGTAT GAGACTGGGTGCTTTGTTGGGAATGCGCTTTTGTTGATGTATTGCAAATGTGGAAGCATA GAAGAAGCTAATGACTTGTTTAAGGAGATGGCTGGGAAGGACATTGTCTCTTGGAACACA ATGATTGCAGGTTACTCAAGGCACGGGTTCGGAGAAGTGGCTTTAAGGTTCTTCGAGTCG ATGAAGAGAGAAGGACTGAAGCCAGATGATGCTACCATGGTTGCGGTATTATCTGCATGC AGTCACACAGGACTTGTTGACAAAGGCAGGCAATATTTCTATACGATGACTCAAGACTAT GGCGTAATGCCTAACTCACAGCACTATGCTTGCATGGTTGATCTTCTTGGTCGAGCTGGG CTTCTAGAAGATGCTCACAATCTAATGAAGAACATGCCCTTTGAGCCAGACGCTGCAATT TGGGGAACTTTACTTGGTGCAAGCAGAGTTCATGGAAACACAGAGCTAGCCGAAACAGCT GCAGATAAGATATTTGCAATGGAGCCTGAAAATTCCGGTATGTATGTTCTTCTCTCTAAT CTATACGCTTCTTCGGGTCGATGGGGAGATGTTGGTAAACTACGAGTGAGAATGCGGGAT AAAGGGGTGAAGAAAGTTCCAGGGTACAGTTGGATTGAAATTCAGAACAAGACTCATACT TTCTCGGTTGGGGATGAGTTTCATCCTGAGAAAGACGAGATCTTTGCATTTTTGGAGGAG CTGGATTTGAGAATGAAGAAAGCAGGGTATGTTTCAAAGACGAGTGTGGTTCTTCATGAT GTGGAGGAAGAAGAGAAGGAGCGTATGGTTCGGTACCATAGCGAGAGACTGGCTGTAGCT TATGGGATAATGCGTGTGTCTTCAGGGAGACCGATCCGTGTGATAAAGAATCTGCGTGTA TGTGAGGATTGTCACAACGCCATCAAGTATATGGCCAGAATCACAGGGAGACTGATTATC TTGAGGGATAATAACAGGTTTCACCATTTTAAGGATGGTTCATGTTCTTGTGGAGACTAC TGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT4G02750.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr4:1221116-1223461 REVERSE LENGTH=781 \| 201606
Sequence	MEINKFRALSRRAQQLHYTSLNGLKRRCNNAHGAANFHSLKRATQTQIQKSQTKPLLKCG DSDIKEWNVAISSYMRTGRCNEALRVFKRMPRWSSVSYNGMISGYLRNGEFELARKLFDE MPERDLVSWNVMIKGYVRNRNLGKARELFEIMPERDVCSWNTMLSGYAQNGCVDDARSVF DRMPEKNDVSWNALLSAYVQNSKMEEACMLFKSRENWALVSWNCLLGGFVKKKKIVEARQ FFDSMNVRDVVSWNTIITGYAQSGKIDEARQLFDESPVQDVFTWTAMVSGYIQNRMVEEA RELFDKMPERNEVSWNAMLAGYVQGERMEMAKELFDVMPCRNVSTWNTMITGYAQCGKIS EAKNLFDKMPKRDPVSWAAMIAGYSQSGHSFEALRLFVQMEREGGRLNRSSFSSALSTCA DVVALELGKQLHGRLVKGGYETGCFVGNALLLMYCKCGSIEEANDLFKEMAGKDIVSWNT MIAGYSRHGFGEVALRFFESMKREGLKPDDATMVAVLSACSHTGLVDKGRQYFYTMTQDY GVMPNSQHYACMVDLLGRAGLLEDAHNLMKNMPFEPDAAIWGTLLGASRVHGNTELAETA ADKIFAMEPENSGMYVLLSNLYASSGRWGDVGKLRVRMRDKGVKKVPGYSWIEIQNKTHT FSVGDEFHPEKDEIFAFLEELDLRMKKAGYVSKTSVVLHDVEEEEKERMVRYHSERLAVA YGIMRVSSGRPIRVIKNLRVCEDCHNAIKYMARITGRLIILRDNNRFHHFKDGSCSCGDY W

Transcript Sequence

Transcript ID	AT4G02750.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr4:1221017-1223617 REVERSE LENGTH=2601 \| 201606
Sequence	ATCTTTATTATGCCTTACAGTCGAGATATTGACTGAATGATCATTGAGAAATTGATACGA CCTTGAGAAAATCTCAGATTATGCATTGTTTGTTTGTGATAAAACTTTCTGTGAAATCCA CGGAGACGATCCTTTGACAATGTTTTCATTTCAGTAATGGAAATAAACAAGTTTCGTGCT CTTTCGCGGCGAGCTCAGCAGCTACATTACACATCCTTGAATGGACTTAAACGAAGATGC AACAACGCACACGGTGCAGCTAATTTTCACTCGTTGAAGAGAGCTACACAAACCCAAATC CAGAAATCGCAGACCAAACCTCTCCTTAAATGTGGAGACTCGGATATAAAAGAGTGGAAC GTTGCTATAAGCAGCTACATGCGTACTGGAAGATGCAACGAAGCGCTTCGTGTCTTCAAA CGCATGCCTAGGTGGAGTTCCGTTTCTTATAACGGTATGATTTCTGGTTATTTGAGAAAC GGTGAGTTTGAACTCGCCCGGAAGTTGTTCGATGAAATGCCTGAACGAGATTTAGTTTCC TGGAATGTGATGATTAAAGGGTATGTACGGAACAGGAATCTTGGGAAAGCGAGGGAATTG TTTGAGATAATGCCTGAGAGAGATGTTTGTTCGTGGAATACCATGTTGTCGGGTTACGCT CAGAATGGTTGTGTTGATGATGCAAGGAGTGTTTTTGATCGAATGCCTGAGAAGAACGAT GTATCGTGGAATGCATTGCTCTCTGCTTATGTTCAGAATAGTAAGATGGAGGAGGCTTGT ATGTTGTTTAAGTCAAGAGAGAATTGGGCGTTGGTTTCGTGGAACTGCTTGCTTGGTGGG TTTGTTAAGAAGAAAAAGATTGTTGAGGCAAGGCAGTTTTTTGATAGTATGAATGTGAGG GATGTGGTCTCATGGAATACGATCATCACTGGTTATGCACAGAGCGGGAAAATCGATGAG GCGCGGCAGCTATTTGATGAGTCTCCTGTTCAAGATGTCTTTACATGGACAGCAATGGTG TCAGGATATATACAAAACCGGATGGTGGAAGAAGCGAGAGAATTATTCGACAAAATGCCA GAGAGAAACGAAGTGTCATGGAATGCCATGCTTGCAGGATATGTGCAGGGCGAGAGAATG GAGATGGCAAAGGAATTGTTTGATGTTATGCCTTGTAGAAATGTTAGTACATGGAACACG ATGATAACTGGATATGCTCAGTGTGGGAAAATTTCTGAAGCTAAGAACCTTTTTGATAAA ATGCCAAAGAGAGATCCGGTCTCTTGGGCAGCTATGATTGCAGGGTATTCGCAAAGCGGA CACAGCTTTGAAGCTCTTCGTTTGTTTGTACAAATGGAGAGGGAGGGAGGTAGATTGAAT CGGTCTTCGTTTTCATCTGCTCTAAGCACATGTGCAGACGTTGTTGCTCTCGAGCTCGGG AAGCAATTGCATGGACGATTAGTTAAAGGTGGGTATGAGACTGGGTGCTTTGTTGGGAAT GCGCTTTTGTTGATGTATTGCAAATGTGGAAGCATAGAAGAAGCTAATGACTTGTTTAAG GAGATGGCTGGGAAGGACATTGTCTCTTGGAACACAATGATTGCAGGTTACTCAAGGCAC GGGTTCGGAGAAGTGGCTTTAAGGTTCTTCGAGTCGATGAAGAGAGAAGGACTGAAGCCA GATGATGCTACCATGGTTGCGGTATTATCTGCATGCAGTCACACAGGACTTGTTGACAAA GGCAGGCAATATTTCTATACGATGACTCAAGACTATGGCGTAATGCCTAACTCACAGCAC TATGCTTGCATGGTTGATCTTCTTGGTCGAGCTGGGCTTCTAGAAGATGCTCACAATCTA ATGAAGAACATGCCCTTTGAGCCAGACGCTGCAATTTGGGGAACTTTACTTGGTGCAAGC AGAGTTCATGGAAACACAGAGCTAGCCGAAACAGCTGCAGATAAGATATTTGCAATGGAG CCTGAAAATTCCGGTATGTATGTTCTTCTCTCTAATCTATACGCTTCTTCGGGTCGATGG GGAGATGTTGGTAAACTACGAGTGAGAATGCGGGATAAAGGGGTGAAGAAAGTTCCAGGG TACAGTTGGATTGAAATTCAGAACAAGACTCATACTTTCTCGGTTGGGGATGAGTTTCAT CCTGAGAAAGACGAGATCTTTGCATTTTTGGAGGAGCTGGATTTGAGAATGAAGAAAGCA GGGTATGTTTCAAAGACGAGTGTGGTTCTTCATGATGTGGAGGAAGAAGAGAAGGAGCGT ATGGTTCGGTACCATAGCGAGAGACTGGCTGTAGCTTATGGGATAATGCGTGTGTCTTCA GGGAGACCGATCCGTGTGATAAAGAATCTGCGTGTATGTGAGGATTGTCACAACGCCATC AAGTATATGGCCAGAATCACAGGGAGACTGATTATCTTGAGGGATAATAACAGGTTTCAC CATTTTAAGGATGGTTCATGTTCTTGTGGAGACTACTGGTGAATGATGATTCCATTTCAT CTTTGATTCAATCTAACCATTGACCAATTATACGTAATCAACACACATTGGAAGAATTAA TTTGTTAACTTAAACATGCCA