Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT4G01030.1
CDS Infomation	\| pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein \| Chr4:448336-450642 REVERSE LENGTH=2307 \| 201606
Sequence	ATGTATCGGTTTCTGGGTTTAACTATCCATGGTGGTTTGATCAAGAGAGGGCTTGATAAT TCAGACACACGAGTGGTTTCTGCGTCGATGGGTTTTTATGGAAGATGTGTGAGTTTGGGT TTTGCTAACAAGTTATTCGATGAAATGCCTAAAAGAGATGATCTTGCATGGAACGAGATC GTAATGGTAAACTTGCGGAGTGGGAATTGGGAAAAGGCTGTGGAACTTTTCAGAGAGATG CAGTTTTCTGGTGCTAAAGCTTATGATAGCACAATGGTTAAGCTTTTGCAAGTTTGTAGC AATAAGGAAGGTTTTGCAGAAGGGAGACAGATTCATGGGTATGTTCTGAGACTCGGGCTT GAATCAAATGTGTCTATGTGTAACTCTTTGATTGTCATGTATTCGAGGAATGGCAAGCTT GAATTATCCAGGAAAGTTTTTAACTCGATGAAAGACCGGAATTTGTCTTCGTGGAACTCG ATTTTATCGAGTTATACGAAACTTGGTTATGTAGATGATGCTATCGGTCTCCTGGACGAG ATGGAGATATGTGGTCTGAAGCCAGATATAGTGACATGGAACTCTCTTTTGTCAGGTTAT GCTTCTAAAGGCTTATCCAAAGATGCCATTGCTGTATTGAAGAGAATGCAAATTGCTGGT CTGAAGCCAAGCACGAGCTCAATTAGTAGTCTTCTTCAAGCTGTAGCTGAACCGGGGCAT CTTAAACTTGGGAAAGCGATCCACGGATACATATTAAGAAATCAGCTTTGGTACGATGTG TATGTAGAAACCACCTTGATCGACATGTATATTAAAACTGGCTACTTGCCTTACGCCCGG ATGGTTTTTGATATGATGGATGCGAAGAACATTGTTGCTTGGAATTCACTCGTCTCGGGA CTTTCGTACGCTTGTCTTCTAAAGGATGCTGAAGCTTTGATGATTAGAATGGAGAAGGAA GGGATCAAACCTGATGCTATTACATGGAACAGTCTTGCTTCTGGGTATGCGACTTTGGGG AAACCTGAGAAGGCATTAGATGTGATAGGGAAGATGAAGGAGAAAGGTGTGGCCCCTAAC GTGGTTTCATGGACAGCCATTTTTTCAGGATGTTCCAAAAATGGAAACTTCAGGAATGCT CTCAAAGTTTTCATTAAAATGCAGGAAGAAGGTGTTGGTCCGAACGCAGCAACTATGTCC ACCTTGCTTAAGATATTAGGTTGCTTAAGTCTACTACACAGTGGCAAAGAGGTTCACGGT TTCTGTTTGAGGAAAAATTTGATCTGCGATGCATATGTTGCAACTGCACTAGTAGATATG TATGGAAAATCAGGGGATCTGCAAAGTGCGATTGAGATTTTCTGGGGCATTAAGAACAAA TCGCTAGCTTCTTGGAACTGTATGCTCATGGGTTATGCCATGTTTGGGCGAGGCGAAGAA GGGATCGCGGCTTTCAGTGTGATGCTTGAAGCGGGCATGGAACCAGATGCTATAACGTTT ACCTCTGTCTTGTCTGTCTGTAAGAACTCAGGTCTTGTCCAAGAAGGGTGGAAATACTTT GATCTTATGAGGTCTCGTTATGGTATAATCCCGACCATCGAACACTGCTCTTGCATGGTA GATCTGCTCGGGAGATCGGGTTATCTTGATGAAGCCTGGGACTTCATTCAAACAATGTCA TTAAAACCCGATGCAACTATTTGGGGTGCTTTTCTTTCATCTTGTAAGATTCATAGAGAC CTAGAACTCGCGGAAATCGCTTGGAAGAGGCTTCAAGTACTAGAACCACACAATTCAGCT AACTACATGATGATGATAAACTTGTACAGTAATTTGAACAGATGGGAAGATGTTGAACGT ATACGGAACTTAATGAGGAATAACAGGGTGAGAGTCCAGGATCTGTGGAGCTGGATTCAG ATAGATCAAACGGTTCACATCTTCTATGCGGAGGGAAAAACACATCCTGATGAAGGAGAT ATATACTTTGAGCTGTACAAATTAGTCTCTGAGATGAAGAAATCAGGTTATGTGCCAGAC ACAAGCTGTATACACCAAGACATAAGTGATTCAGAGAAAGAGAAGCTGCTTATGGGACAT ACAGAGAAGTTAGCAATGACGTATGGCCTTATCAAGAAGAAAGGCTTAGCTCCTATAAGA GTGGTCAAAAACACGAATATATGTTCTGATAGCCACACCGTAGCCAAATACATGTCGGTT TTGAGAAACCGTGAGATTGTTTTACAAGAAGGGGCAAGGGTTCATCATTTCAGAGACGGA AAATGTTCCTGCAACGACTCTTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT4G01030.1
PEP Infomation	\| pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein \| Chr4:448336-450642 REVERSE LENGTH=768 \| 201606
Sequence	MYRFLGLTIHGGLIKRGLDNSDTRVVSASMGFYGRCVSLGFANKLFDEMPKRDDLAWNEI VMVNLRSGNWEKAVELFREMQFSGAKAYDSTMVKLLQVCSNKEGFAEGRQIHGYVLRLGL ESNVSMCNSLIVMYSRNGKLELSRKVFNSMKDRNLSSWNSILSSYTKLGYVDDAIGLLDE MEICGLKPDIVTWNSLLSGYASKGLSKDAIAVLKRMQIAGLKPSTSSISSLLQAVAEPGH LKLGKAIHGYILRNQLWYDVYVETTLIDMYIKTGYLPYARMVFDMMDAKNIVAWNSLVSG LSYACLLKDAEALMIRMEKEGIKPDAITWNSLASGYATLGKPEKALDVIGKMKEKGVAPN VVSWTAIFSGCSKNGNFRNALKVFIKMQEEGVGPNAATMSTLLKILGCLSLLHSGKEVHG FCLRKNLICDAYVATALVDMYGKSGDLQSAIEIFWGIKNKSLASWNCMLMGYAMFGRGEE GIAAFSVMLEAGMEPDAITFTSVLSVCKNSGLVQEGWKYFDLMRSRYGIIPTIEHCSCMV DLLGRSGYLDEAWDFIQTMSLKPDATIWGAFLSSCKIHRDLELAEIAWKRLQVLEPHNSA NYMMMINLYSNLNRWEDVERIRNLMRNNRVRVQDLWSWIQIDQTVHIFYAEGKTHPDEGD IYFELYKLVSEMKKSGYVPDTSCIHQDISDSEKEKLLMGHTEKLAMTYGLIKKKGLAPIR VVKNTNICSDSHTVAKYMSVLRNREIVLQEGARVHHFRDGKCSCNDSW

Transcript Sequence

Transcript ID	AT4G01030.1
Transcript Infomation	\| pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein \| Chr4:447941-450642 REVERSE LENGTH=2702 \| 201606
Sequence	ATGTATCGGTTTCTGGGTTTAACTATCCATGGTGGTTTGATCAAGAGAGGGCTTGATAAT TCAGACACACGAGTGGTTTCTGCGTCGATGGGTTTTTATGGAAGATGTGTGAGTTTGGGT TTTGCTAACAAGTTATTCGATGAAATGCCTAAAAGAGATGATCTTGCATGGAACGAGATC GTAATGGTAAACTTGCGGAGTGGGAATTGGGAAAAGGCTGTGGAACTTTTCAGAGAGATG CAGTTTTCTGGTGCTAAAGCTTATGATAGCACAATGGTTAAGCTTTTGCAAGTTTGTAGC AATAAGGAAGGTTTTGCAGAAGGGAGACAGATTCATGGGTATGTTCTGAGACTCGGGCTT GAATCAAATGTGTCTATGTGTAACTCTTTGATTGTCATGTATTCGAGGAATGGCAAGCTT GAATTATCCAGGAAAGTTTTTAACTCGATGAAAGACCGGAATTTGTCTTCGTGGAACTCG ATTTTATCGAGTTATACGAAACTTGGTTATGTAGATGATGCTATCGGTCTCCTGGACGAG ATGGAGATATGTGGTCTGAAGCCAGATATAGTGACATGGAACTCTCTTTTGTCAGGTTAT GCTTCTAAAGGCTTATCCAAAGATGCCATTGCTGTATTGAAGAGAATGCAAATTGCTGGT CTGAAGCCAAGCACGAGCTCAATTAGTAGTCTTCTTCAAGCTGTAGCTGAACCGGGGCAT CTTAAACTTGGGAAAGCGATCCACGGATACATATTAAGAAATCAGCTTTGGTACGATGTG TATGTAGAAACCACCTTGATCGACATGTATATTAAAACTGGCTACTTGCCTTACGCCCGG ATGGTTTTTGATATGATGGATGCGAAGAACATTGTTGCTTGGAATTCACTCGTCTCGGGA CTTTCGTACGCTTGTCTTCTAAAGGATGCTGAAGCTTTGATGATTAGAATGGAGAAGGAA GGGATCAAACCTGATGCTATTACATGGAACAGTCTTGCTTCTGGGTATGCGACTTTGGGG AAACCTGAGAAGGCATTAGATGTGATAGGGAAGATGAAGGAGAAAGGTGTGGCCCCTAAC GTGGTTTCATGGACAGCCATTTTTTCAGGATGTTCCAAAAATGGAAACTTCAGGAATGCT CTCAAAGTTTTCATTAAAATGCAGGAAGAAGGTGTTGGTCCGAACGCAGCAACTATGTCC ACCTTGCTTAAGATATTAGGTTGCTTAAGTCTACTACACAGTGGCAAAGAGGTTCACGGT TTCTGTTTGAGGAAAAATTTGATCTGCGATGCATATGTTGCAACTGCACTAGTAGATATG TATGGAAAATCAGGGGATCTGCAAAGTGCGATTGAGATTTTCTGGGGCATTAAGAACAAA TCGCTAGCTTCTTGGAACTGTATGCTCATGGGTTATGCCATGTTTGGGCGAGGCGAAGAA GGGATCGCGGCTTTCAGTGTGATGCTTGAAGCGGGCATGGAACCAGATGCTATAACGTTT ACCTCTGTCTTGTCTGTCTGTAAGAACTCAGGTCTTGTCCAAGAAGGGTGGAAATACTTT GATCTTATGAGGTCTCGTTATGGTATAATCCCGACCATCGAACACTGCTCTTGCATGGTA GATCTGCTCGGGAGATCGGGTTATCTTGATGAAGCCTGGGACTTCATTCAAACAATGTCA TTAAAACCCGATGCAACTATTTGGGGTGCTTTTCTTTCATCTTGTAAGATTCATAGAGAC CTAGAACTCGCGGAAATCGCTTGGAAGAGGCTTCAAGTACTAGAACCACACAATTCAGCT AACTACATGATGATGATAAACTTGTACAGTAATTTGAACAGATGGGAAGATGTTGAACGT ATACGGAACTTAATGAGGAATAACAGGGTGAGAGTCCAGGATCTGTGGAGCTGGATTCAG ATAGATCAAACGGTTCACATCTTCTATGCGGAGGGAAAAACACATCCTGATGAAGGAGAT ATATACTTTGAGCTGTACAAATTAGTCTCTGAGATGAAGAAATCAGGTTATGTGCCAGAC ACAAGCTGTATACACCAAGACATAAGTGATTCAGAGAAAGAGAAGCTGCTTATGGGACAT ACAGAGAAGTTAGCAATGACGTATGGCCTTATCAAGAAGAAAGGCTTAGCTCCTATAAGA GTGGTCAAAAACACGAATATATGTTCTGATAGCCACACCGTAGCCAAATACATGTCGGTT TTGAGAAACCGTGAGATTGTTTTACAAGAAGGGGCAAGGGTTCATCATTTCAGAGACGGA AAATGTTCCTGCAACGACTCTTGGTGATAATATAGATACTACCTAGCTCTGTTTTTTCTA ACAATGGTGCGTAAATACAGACACTGTCCAACAAACACCAGAAAACAAATTACATCAAAA CTTTGACTGCATGCTCGAAAATGGCCCATGGAGCTGATCTGAGTAAAGCAGCAGAGAAGC ATGATCACACGTGCTTCTATGAATCTAAATTTCCTTCACTGAGTTTGTTCGTGGGACTAA TCTAGCCAAATCTTCAAAGGTTGGTTTCTGTATGATTCTTCTCTCTGTATCCATTGGAAG CGTTACAGAAAGTTGCGATGGAATTGGTAATGTCTTGAGCAGCCAATCTTTCAGAGACAC AAGCCAAGGATTTGAGGTTACACTTTATGAGTGATTCCACGAAGTAACATGTATCATCTT TG