Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT3G26540.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr3:9744542-9746644 REVERSE LENGTH=2103 \| 201606
Sequence	ATGGCAGTGACCGGAGTTTCTTCTGCTTTTGGCCGTCTTTTCAAACAAGATAAAACCCAC AAGCGTGTTATCGGCACCGGAACCAAACTTACAGTGACCCGTCAGATTCTTGAGCATCTC GAAGGCGGTAATGTCTCGAAAGCCGTCTCTGTTCTCTTTGCTTCTCCAGAGCCAGTTAGT TATTGGCTATACGAGCGTCTTTTCCGTTCTTGTTCCTCGAAAGCTCTTGTTGTGCAAGCC CGTAAAGTCCAATCTCACTTAGTAACTTTCTCTCCGTTGCCTCCGATTTTCCTCTTGAAC AGAGCCATTGAGGCTTATGGTAAATGTGGGTGTGTTGATGATGCACGAGAGCTGTTCGAG GAAATGCCTGAACGAGATGGTGGGTCTTGGAACGCTGTGATTACTGCTTGTGCGCAAAAC GGTGTCTCTGATGAGGTGTTTCGTATGTTTCGTAGAATGAATAGAGATGGCGTACGAGCT ACGGAGACTTCTTTTGCTGGTGTTTTAAAGTCATGTGGTTTAATCTTGGACTTGAGATTA TTGAGGCAGCTGCATTGTGCTGTGGTGAAGTATGGGTATTCGGGGAATGTAGATTTGGAG ACTTCGATTGTTGATGTTTATGGGAAGTGTCGGGTGATGAGTGATGCGAGAAGAGTGTTT GATGAGATTGTAAACCCTAGTGATGTATCTTGGAATGTGATTGTGCGGCGGTATCTTGAG ATGGGGTTTAATGATGAGGCAGTGGTGATGTTTTTCAAGATGCTGGAGTTGAATGTTCGA CCTTTGAATCACACGGTTTCTAGTGTAATGTTAGCTTGTTCGAGATCCTTGGCCCTTGAG GTGGGAAAGGTAATCCATGCCATTGCTGTGAAACTTAGTGTTGTGGCAGATACAGTTGTT TCTACTTCTGTATTTGATATGTATGTAAAATGTGACAGATTGGAGAGTGCTCGCAGAGTA TTTGACCAAACTAGATCTAAAGATTTGAAATCTTGGACTTCGGCGATGTCGGGATATGCA ATGAGTGGTTTAACTAGAGAGGCAAGGGAGCTCTTTGATTTGATGCCTGAACGGAATATA GTCTCATGGAACGCAATGTTGGGCGGATATGTACATGCCCATGAATGGGATGAGGCACTG GATTTTCTCACTTTGATGCGCCAGGAGATTGAAAATATTGATAATGTCACTCTTGTGTGG ATCCTAAATGTCTGCTCTGGTATATCAGATGTTCAAATGGGGAAGCAAGCTCATGGTTTT ATCTACCGACATGGATATGATACGAATGTAATTGTAGCCAATGCACTTCTTGATATGTAT GGAAAATGCGGGACCTTGCAGAGTGCCAATATTTGGTTCCGCCAAATGAGTGAACTAAGG GATGAGGTTTCATGGAATGCTTTATTGACTGGTGTAGCTCGAGTTGGCAGGAGTGAACAA GCCTTATCTTTCTTTGAAGGGATGCAAGTGGAGGCCAAACCAAGCAAATACACACTGGCA ACGCTCTTAGCAGGTTGTGCGAACATTCCTGCTTTAAATTTAGGCAAAGCAATCCACGGA TTCCTGATCAGAGATGGCTATAAAATTGATGTTGTTATACGGGGTGCAATGGTTGACATG TATTCCAAATGCCGATGTTTCGACTATGCTATCGAAGTATTCAAAGAGGCAGCTACACGG GACTTGATTCTATGGAACTCTATTATCCGTGGATGTTGTCGTAATGGAAGAAGCAAGGAG GTCTTTGAGTTGTTCATGCTTTTGGAAAATGAAGGAGTTAAGCCTGACCATGTCACCTTT TTGGGAATCTTACAAGCTTGCATACGTGAAGGTCATGTCGAACTCGGTTTTCAGTATTTC AGTTCTATGAGCACCAAATATCATATATCACCACAGGTTGAGCATTATGATTGTATGATT GAACTCTACTGCAAGTATGGATGCTTGCATCAGCTTGAAGAATTTCTCCTCTTGATGCCT TTTGATCCACCTATGCAAATGTTGACAAGGATAAATGATGCTTGCCAAAGATACCGCTGG TCAAAGTTAGGAGCATGGGCTGCTAAACGGCTTATGAATGATCATTACCTTCAGCCACCA TGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT3G26540.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr3:9744542-9746644 REVERSE LENGTH=700 \| 201606
Sequence	MAVTGVSSAFGRLFKQDKTHKRVIGTGTKLTVTRQILEHLEGGNVSKAVSVLFASPEPVS YWLYERLFRSCSSKALVVQARKVQSHLVTFSPLPPIFLLNRAIEAYGKCGCVDDARELFE EMPERDGGSWNAVITACAQNGVSDEVFRMFRRMNRDGVRATETSFAGVLKSCGLILDLRL LRQLHCAVVKYGYSGNVDLETSIVDVYGKCRVMSDARRVFDEIVNPSDVSWNVIVRRYLE MGFNDEAVVMFFKMLELNVRPLNHTVSSVMLACSRSLALEVGKVIHAIAVKLSVVADTVV STSVFDMYVKCDRLESARRVFDQTRSKDLKSWTSAMSGYAMSGLTREARELFDLMPERNI VSWNAMLGGYVHAHEWDEALDFLTLMRQEIENIDNVTLVWILNVCSGISDVQMGKQAHGF IYRHGYDTNVIVANALLDMYGKCGTLQSANIWFRQMSELRDEVSWNALLTGVARVGRSEQ ALSFFEGMQVEAKPSKYTLATLLAGCANIPALNLGKAIHGFLIRDGYKIDVVIRGAMVDM YSKCRCFDYAIEVFKEAATRDLILWNSIIRGCCRNGRSKEVFELFMLLENEGVKPDHVTF LGILQACIREGHVELGFQYFSSMSTKYHISPQVEHYDCMIELYCKYGCLHQLEEFLLLMP FDPPMQMLTRINDACQRYRWSKLGAWAAKRLMNDHYLQPP

Transcript Sequence

Transcript ID	AT3G26540.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr3:9744542-9746652 REVERSE LENGTH=2111 \| 201606
Sequence	CATGAACCATGGCAGTGACCGGAGTTTCTTCTGCTTTTGGCCGTCTTTTCAAACAAGATA AAACCCACAAGCGTGTTATCGGCACCGGAACCAAACTTACAGTGACCCGTCAGATTCTTG AGCATCTCGAAGGCGGTAATGTCTCGAAAGCCGTCTCTGTTCTCTTTGCTTCTCCAGAGC CAGTTAGTTATTGGCTATACGAGCGTCTTTTCCGTTCTTGTTCCTCGAAAGCTCTTGTTG TGCAAGCCCGTAAAGTCCAATCTCACTTAGTAACTTTCTCTCCGTTGCCTCCGATTTTCC TCTTGAACAGAGCCATTGAGGCTTATGGTAAATGTGGGTGTGTTGATGATGCACGAGAGC TGTTCGAGGAAATGCCTGAACGAGATGGTGGGTCTTGGAACGCTGTGATTACTGCTTGTG CGCAAAACGGTGTCTCTGATGAGGTGTTTCGTATGTTTCGTAGAATGAATAGAGATGGCG TACGAGCTACGGAGACTTCTTTTGCTGGTGTTTTAAAGTCATGTGGTTTAATCTTGGACT TGAGATTATTGAGGCAGCTGCATTGTGCTGTGGTGAAGTATGGGTATTCGGGGAATGTAG ATTTGGAGACTTCGATTGTTGATGTTTATGGGAAGTGTCGGGTGATGAGTGATGCGAGAA GAGTGTTTGATGAGATTGTAAACCCTAGTGATGTATCTTGGAATGTGATTGTGCGGCGGT ATCTTGAGATGGGGTTTAATGATGAGGCAGTGGTGATGTTTTTCAAGATGCTGGAGTTGA ATGTTCGACCTTTGAATCACACGGTTTCTAGTGTAATGTTAGCTTGTTCGAGATCCTTGG CCCTTGAGGTGGGAAAGGTAATCCATGCCATTGCTGTGAAACTTAGTGTTGTGGCAGATA CAGTTGTTTCTACTTCTGTATTTGATATGTATGTAAAATGTGACAGATTGGAGAGTGCTC GCAGAGTATTTGACCAAACTAGATCTAAAGATTTGAAATCTTGGACTTCGGCGATGTCGG GATATGCAATGAGTGGTTTAACTAGAGAGGCAAGGGAGCTCTTTGATTTGATGCCTGAAC GGAATATAGTCTCATGGAACGCAATGTTGGGCGGATATGTACATGCCCATGAATGGGATG AGGCACTGGATTTTCTCACTTTGATGCGCCAGGAGATTGAAAATATTGATAATGTCACTC TTGTGTGGATCCTAAATGTCTGCTCTGGTATATCAGATGTTCAAATGGGGAAGCAAGCTC ATGGTTTTATCTACCGACATGGATATGATACGAATGTAATTGTAGCCAATGCACTTCTTG ATATGTATGGAAAATGCGGGACCTTGCAGAGTGCCAATATTTGGTTCCGCCAAATGAGTG AACTAAGGGATGAGGTTTCATGGAATGCTTTATTGACTGGTGTAGCTCGAGTTGGCAGGA GTGAACAAGCCTTATCTTTCTTTGAAGGGATGCAAGTGGAGGCCAAACCAAGCAAATACA CACTGGCAACGCTCTTAGCAGGTTGTGCGAACATTCCTGCTTTAAATTTAGGCAAAGCAA TCCACGGATTCCTGATCAGAGATGGCTATAAAATTGATGTTGTTATACGGGGTGCAATGG TTGACATGTATTCCAAATGCCGATGTTTCGACTATGCTATCGAAGTATTCAAAGAGGCAG CTACACGGGACTTGATTCTATGGAACTCTATTATCCGTGGATGTTGTCGTAATGGAAGAA GCAAGGAGGTCTTTGAGTTGTTCATGCTTTTGGAAAATGAAGGAGTTAAGCCTGACCATG TCACCTTTTTGGGAATCTTACAAGCTTGCATACGTGAAGGTCATGTCGAACTCGGTTTTC AGTATTTCAGTTCTATGAGCACCAAATATCATATATCACCACAGGTTGAGCATTATGATT GTATGATTGAACTCTACTGCAAGTATGGATGCTTGCATCAGCTTGAAGAATTTCTCCTCT TGATGCCTTTTGATCCACCTATGCAAATGTTGACAAGGATAAATGATGCTTGCCAAAGAT ACCGCTGGTCAAAGTTAGGAGCATGGGCTGCTAAACGGCTTATGAATGATCATTACCTTC AGCCACCATGA