Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT3G21470.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein \| Chr3:7563503-7565074 FORWARD LENGTH=1572 \| 201606
Sequence	ATGAATTTGGAGGAACATTTATCGTTAGGTGAGTTTCATGTGTCGAATCTTATAAAGAAT CATATATCTAGAGGATCACCAATACAAGCTCTGGTTTTGTACGGAGGAATCCGCCGCAGA GGAGTGTATTTTCCGGGATGGGTTCCTTTGATTTTAAGGGCATGTGCTTGCGTTGTTCCA CGTGTTGTTCTTGGGAAGCTGTTGCATTCTGAATCAATCAAGTTCGGTGTTTGTTCTGAT GTTATGGTGGGAAGCTCTCTGATCAGTATGTATGGGAAATGTGGATGTGTAGTTTCTGCA CGTAAGGTGTTTGACGAAATGCCTGAGAGAAACGTGGCTACTTGGAACGCTATGATTGGT GGGTATATGAGCAATGGTGATGCAGTTTTGGCTAGTGGATTGTTTGAAGAGATATCGGTT TGTAGAAATACGGTGACTTGGATCGAGATGATTAAAGGGTATGGGAAGAGAATAGAGATT GAGAAAGCTAGAGAATTGTTTGAGAGAATGCCTTTCGAGTTAAAGAATGTGAAGGCTTGG TCTGTGATGCTTGGAGTTTACGTTAATAATCGAAAAATGGAGGATGCAAGGAAGTTTTTC GAGGATATACCGGAGAAGAACGCCTTTGTATGGTCATTGATGATGTCTGGGTATTTTAGG ATAGGTGATGTGCATGAAGCTAGAGCTATTTTTTATCGAGTTTTTGCTCGTGATTTGGTG ATTTGGAACACTTTGATTGCTGGTTATGCACAGAATGGGTATTCTGATGATGCTATTGAT GCTTTCTTTAATATGCAAGGAGAAGGGTATGAACCGGATGCGGTAACGGTTTCTAGTATT TTATCTGCTTGTGCTCAATCTGGTCGTCTTGATGTTGGCAGAGAAGTTCACTCTCTGATT AATCATAGAGGAATTGAGCTTAACCAGTTTGTTTCAAATGCTTTGATTGATATGTATGCG AAATGTGGGGATCTAGAGAATGCGACATCCGTGTTTGAGTCGATAAGTGTGAGAAGTGTA GCATGTTGTAACTCTATGATCTCGTGTCTAGCCATACATGGGAAAGGCAAAGAAGCTTTA GAGATGTTCAGCACGATGGAGAGCTTAGATTTAAAGCCTGACGAGATCACTTTTATAGCG GTTCTCACTGCTTGTGTCCATGGAGGCTTTCTAATGGAAGGTCTAAAGATATTCTCGGAG ATGAAAACTCAAGACGTGAAACCGAATGTAAAGCATTTTGGATGTTTGATACATCTCTTG GGACGCTCCGGGAAATTGAAAGAAGCTTACAGATTGGTAAAAGAAATGCATGTGAAACCG AACGATACAGTATTGGGAGCTTTGCTTGGTGCATGTAAGGTTCATATGGATACAGAAATG GCTGAACAAGTGATGAAGATCATCGAGACTGCTGGAAGCATCACTAACAGTTACAGCGAG AACCATCTTGCATCGATATCGAACTTGTATGCACACACCGAAAGATGGCAAACAGCTGAA GCGTTGAGAGTAGAAATGGAGAAAAGAGGTCTTGAGAAATCCCCAGGGCTTAGCTCACTA GTTTTGACCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT3G21470.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein \| Chr3:7563503-7565074 FORWARD LENGTH=523 \| 201606
Sequence	MNLEEHLSLGEFHVSNLIKNHISRGSPIQALVLYGGIRRRGVYFPGWVPLILRACACVVP RVVLGKLLHSESIKFGVCSDVMVGSSLISMYGKCGCVVSARKVFDEMPERNVATWNAMIG GYMSNGDAVLASGLFEEISVCRNTVTWIEMIKGYGKRIEIEKARELFERMPFELKNVKAW SVMLGVYVNNRKMEDARKFFEDIPEKNAFVWSLMMSGYFRIGDVHEARAIFYRVFARDLV IWNTLIAGYAQNGYSDDAIDAFFNMQGEGYEPDAVTVSSILSACAQSGRLDVGREVHSLI NHRGIELNQFVSNALIDMYAKCGDLENATSVFESISVRSVACCNSMISCLAIHGKGKEAL EMFSTMESLDLKPDEITFIAVLTACVHGGFLMEGLKIFSEMKTQDVKPNVKHFGCLIHLL GRSGKLKEAYRLVKEMHVKPNDTVLGALLGACKVHMDTEMAEQVMKIIETAGSITNSYSE NHLASISNLYAHTERWQTAEALRVEMEKRGLEKSPGLSSLVLT

Transcript Sequence

Transcript ID	AT3G21470.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein \| Chr3:7563503-7565160 FORWARD LENGTH=1658 \| 201606
Sequence	ATGAATTTGGAGGAACATTTATCGTTAGGTGAGTTTCATGTGTCGAATCTTATAAAGAAT CATATATCTAGAGGATCACCAATACAAGCTCTGGTTTTGTACGGAGGAATCCGCCGCAGA GGAGTGTATTTTCCGGGATGGGTTCCTTTGATTTTAAGGGCATGTGCTTGCGTTGTTCCA CGTGTTGTTCTTGGGAAGCTGTTGCATTCTGAATCAATCAAGTTCGGTGTTTGTTCTGAT GTTATGGTGGGAAGCTCTCTGATCAGTATGTATGGGAAATGTGGATGTGTAGTTTCTGCA CGTAAGGTGTTTGACGAAATGCCTGAGAGAAACGTGGCTACTTGGAACGCTATGATTGGT GGGTATATGAGCAATGGTGATGCAGTTTTGGCTAGTGGATTGTTTGAAGAGATATCGGTT TGTAGAAATACGGTGACTTGGATCGAGATGATTAAAGGGTATGGGAAGAGAATAGAGATT GAGAAAGCTAGAGAATTGTTTGAGAGAATGCCTTTCGAGTTAAAGAATGTGAAGGCTTGG TCTGTGATGCTTGGAGTTTACGTTAATAATCGAAAAATGGAGGATGCAAGGAAGTTTTTC GAGGATATACCGGAGAAGAACGCCTTTGTATGGTCATTGATGATGTCTGGGTATTTTAGG ATAGGTGATGTGCATGAAGCTAGAGCTATTTTTTATCGAGTTTTTGCTCGTGATTTGGTG ATTTGGAACACTTTGATTGCTGGTTATGCACAGAATGGGTATTCTGATGATGCTATTGAT GCTTTCTTTAATATGCAAGGAGAAGGGTATGAACCGGATGCGGTAACGGTTTCTAGTATT TTATCTGCTTGTGCTCAATCTGGTCGTCTTGATGTTGGCAGAGAAGTTCACTCTCTGATT AATCATAGAGGAATTGAGCTTAACCAGTTTGTTTCAAATGCTTTGATTGATATGTATGCG AAATGTGGGGATCTAGAGAATGCGACATCCGTGTTTGAGTCGATAAGTGTGAGAAGTGTA GCATGTTGTAACTCTATGATCTCGTGTCTAGCCATACATGGGAAAGGCAAAGAAGCTTTA GAGATGTTCAGCACGATGGAGAGCTTAGATTTAAAGCCTGACGAGATCACTTTTATAGCG GTTCTCACTGCTTGTGTCCATGGAGGCTTTCTAATGGAAGGTCTAAAGATATTCTCGGAG ATGAAAACTCAAGACGTGAAACCGAATGTAAAGCATTTTGGATGTTTGATACATCTCTTG GGACGCTCCGGGAAATTGAAAGAAGCTTACAGATTGGTAAAAGAAATGCATGTGAAACCG AACGATACAGTATTGGGAGCTTTGCTTGGTGCATGTAAGGTTCATATGGATACAGAAATG GCTGAACAAGTGATGAAGATCATCGAGACTGCTGGAAGCATCACTAACAGTTACAGCGAG AACCATCTTGCATCGATATCGAACTTGTATGCACACACCGAAAGATGGCAAACAGCTGAA GCGTTGAGAGTAGAAATGGAGAAAAGAGGTCTTGAGAAATCCCCAGGGCTTAGCTCACTA GTTTTGACCTGAGTCTATACCACTTAGCTTTATTTGAAGAAGTAAAATACTTAGTGATTA TGAAATTGCCTTTATAAACAGTGTTTATACAAAAAATC