Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT3G20730.1
CDS Infomation	\| PPR superfamily protein \| Chr3:7247092-7248878 FORWARD LENGTH=1698 \| 201606
Sequence	ATGATGCTGGTTGTTTCGGAAAACTACTTATTAAGCCCTTCTTTGTACCTTAAAGCTCTT AAATTATGCAGCTACCAAAACGTCAAGAAACAACTATTGTTGATCCATGGGAATTCGATT ACAAATGGGTTCTGCTCCAATCTCCAGTTGAAGGACATGTTGATAGATTTGTACTTAAAA CAGGGAGATGTGAAACATGCACGTAAACTGTTCGATAGAATTTCTAAGAGAGATGTGGTT TCTTGGACAGCTATGATCTCGAGGTTTTCTCGATGTGGATATCACCCGGACGCGTTGTTG TTGTTTAAAGAGATGCACCGGGAAGATGTTAAGGCTAATCAGTTCACTTATGGGAGTGTT TTGAAGTCGTGTAAAGATTTGGGGTGTCTGAAAGAAGGGATGCAGATACATGGTAGTGTG GAGAAAGGGAATTGTGCAGGGAACTTAATTGTGAGAAGTGCATTGCTTTCTCTTTATGCC AGGTGTGGAAAGATGGAGGAAGCTCGTCTTCAGTTTGATTCAATGAAAGAAAGGGATTTG GTTTCTTGGAATGCTATGATCGATGGATACACCGCCAATGCTTGTGCAGATACTTCGTTT AGTCTGTTTCAGTTGATGCTCACGGAAGGGAAGAAGCCAGACTGCTTCACCTTTGGAAGC CTCTTGAGAGCTTCTATTGTCGTTAAGTGTCTTGAAATAGTCAGTGAATTACATGGATTA GCGATCAAGCTGGGTTTTGGGAGATCAAGTGCACTAATTAGGTCTCTGGTTAATGCATAT GTGAAGTGTGGTAGCCTTGCCAATGCTTGGAAACTGCACGAGGGCACAAAGAAAAGAGAC TTACTATCTTGCACTGCTCTAATTACAGGTTTTTCACAGCAGAACAACTGCACAAGTGAT GCCTTTGATATCTTCAAAGATATGATACGGATGAAAACAAAGATGGACGAAGTTGTAGTA TCCTCGATGCTTAAAATATGCACCACCATTGCATCTGTAACCATTGGAAGACAGATCCAT GGTTTTGCCTTAAAATCTTCCCAAATCAGATTCGATGTTGCTTTGGGGAATTCGCTGATA GATATGTATGCAAAGTCTGGGGAAATCGAGGATGCAGTCCTGGCTTTCGAAGAGATGAAA GAGAAAGATGTGAGATCATGGACCTCTTTGATTGCAGGATATGGAAGACATGGGAATTTT GAGAAAGCAATTGATCTTTATAACAGAATGGAGCATGAAAGGATCAAACCGAATGACGTT ACATTTCTTTCTCTCCTCTCTGCTTGTAGTCATACAGGACAAACCGAACTAGGCTGGAAG ATTTACGACACAATGATCAACAAGCACGGAATCGAAGCTCGAGAAGAGCACTTATCTTGC ATCATAGATATGCTTGCGCGCAGTGGCTACTTGGAAGAAGCTTATGCACTGATAAGAAGT AAAGAGGGTATTGTAAGTCTTAGCTCATCAACATGGGGAGCTTTTCTTGATGCATGCAGG CGCCATGGGAATGTGCAGCTCAGTAAAGTAGCAGCCACGCAGCTTCTGAGTATGGAACCG AGGAAACCAGTCAATTACATCAATTTGGCCAGTGTGTATGCAGCTAATGGAGCATGGGAC AATGCTTTGAATACTAGAAAGCTTATGAAAGAGAGTGGTTCCTGCAATAAAGCTCCAGGA TACAGCCTTGTGTATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT3G20730.1
PEP Infomation	\| PPR superfamily protein \| Chr3:7247092-7248878 FORWARD LENGTH=565 \| 201606
Sequence	MMLVVSENYLLSPSLYLKALKLCSYQNVKKQLLLIHGNSITNGFCSNLQLKDMLIDLYLK QGDVKHARKLFDRISKRDVVSWTAMISRFSRCGYHPDALLLFKEMHREDVKANQFTYGSV LKSCKDLGCLKEGMQIHGSVEKGNCAGNLIVRSALLSLYARCGKMEEARLQFDSMKERDL VSWNAMIDGYTANACADTSFSLFQLMLTEGKKPDCFTFGSLLRASIVVKCLEIVSELHGL AIKLGFGRSSALIRSLVNAYVKCGSLANAWKLHEGTKKRDLLSCTALITGFSQQNNCTSD AFDIFKDMIRMKTKMDEVVVSSMLKICTTIASVTIGRQIHGFALKSSQIRFDVALGNSLI DMYAKSGEIEDAVLAFEEMKEKDVRSWTSLIAGYGRHGNFEKAIDLYNRMEHERIKPNDV TFLSLLSACSHTGQTELGWKIYDTMINKHGIEAREEHLSCIIDMLARSGYLEEAYALIRS KEGIVSLSSSTWGAFLDACRRHGNVQLSKVAATQLLSMEPRKPVNYINLASVYAANGAWD NALNTRKLMKESGSCNKAPGYSLVY

Transcript Sequence

Transcript ID	AT3G20730.1
Transcript Infomation	\| PPR superfamily protein \| Chr3:7246896-7248878 FORWARD LENGTH=1894 \| 201606
Sequence	ATGAGTTATGAGCAATGCTTGTACTTGCTATCACCCAAAAAGGAACTGTCTTTTTGGATT CATAAGTTTCGAGAAATTTTTGCAAAAAGCTATGTTTTTTTTACGTTCTTCATGGTTGAT TTCGATTAAAAGAGATCGCTTTTTGTAGCTCAGGTCTCATCAAATCTGAATCCAATTTTC AGTTGGTGGATATTGGATGATGCTGGTTGTTTCGGAAAACTACTTATTAAGCCCTTCTTT GTACCTTAAAGCTCTTAAATTATGCAGCTACCAAAACGTCAAGAAACAACTATTGTTGAT CCATGGGAATTCGATTACAAATGGGTTCTGCTCCAATCTCCAGTTGAAGGACATGTTGAT AGATTTGTACTTAAAACAGGGAGATGTGAAACATGCACGTAAACTGTTCGATAGAATTTC TAAGAGAGATGTGGTTTCTTGGACAGCTATGATCTCGAGGTTTTCTCGATGTGGATATCA CCCGGACGCGTTGTTGTTGTTTAAAGAGATGCACCGGGAAGATGTTAAGGCTAATCAGTT CACTTATGGGAGTGTTTTGAAGTCGTGTAAAGATTTGGGGTGTCTGAAAGAAGGGATGCA GATACATGGTAGTGTGGAGAAAGGGAATTGTGCAGGGAACTTAATTGTGAGAAGTGCATT GCTTTCTCTTTATGCCAGGTGTGGAAAGATGGAGGAAGCTCGTCTTCAGTTTGATTCAAT GAAAGAAAGGGATTTGGTTTCTTGGAATGCTATGATCGATGGATACACCGCCAATGCTTG TGCAGATACTTCGTTTAGTCTGTTTCAGTTGATGCTCACGGAAGGGAAGAAGCCAGACTG CTTCACCTTTGGAAGCCTCTTGAGAGCTTCTATTGTCGTTAAGTGTCTTGAAATAGTCAG TGAATTACATGGATTAGCGATCAAGCTGGGTTTTGGGAGATCAAGTGCACTAATTAGGTC TCTGGTTAATGCATATGTGAAGTGTGGTAGCCTTGCCAATGCTTGGAAACTGCACGAGGG CACAAAGAAAAGAGACTTACTATCTTGCACTGCTCTAATTACAGGTTTTTCACAGCAGAA CAACTGCACAAGTGATGCCTTTGATATCTTCAAAGATATGATACGGATGAAAACAAAGAT GGACGAAGTTGTAGTATCCTCGATGCTTAAAATATGCACCACCATTGCATCTGTAACCAT TGGAAGACAGATCCATGGTTTTGCCTTAAAATCTTCCCAAATCAGATTCGATGTTGCTTT GGGGAATTCGCTGATAGATATGTATGCAAAGTCTGGGGAAATCGAGGATGCAGTCCTGGC TTTCGAAGAGATGAAAGAGAAAGATGTGAGATCATGGACCTCTTTGATTGCAGGATATGG AAGACATGGGAATTTTGAGAAAGCAATTGATCTTTATAACAGAATGGAGCATGAAAGGAT CAAACCGAATGACGTTACATTTCTTTCTCTCCTCTCTGCTTGTAGTCATACAGGACAAAC CGAACTAGGCTGGAAGATTTACGACACAATGATCAACAAGCACGGAATCGAAGCTCGAGA AGAGCACTTATCTTGCATCATAGATATGCTTGCGCGCAGTGGCTACTTGGAAGAAGCTTA TGCACTGATAAGAAGTAAAGAGGGTATTGTAAGTCTTAGCTCATCAACATGGGGAGCTTT TCTTGATGCATGCAGGCGCCATGGGAATGTGCAGCTCAGTAAAGTAGCAGCCACGCAGCT TCTGAGTATGGAACCGAGGAAACCAGTCAATTACATCAATTTGGCCAGTGTGTATGCAGC TAATGGAGCATGGGACAATGCTTTGAATACTAGAAAGCTTATGAAAGAGAGTGGTTCCTG CAATAAAGCTCCAGGATACAGCCTTGTGTATTGA