Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT3G16610.1
CDS Infomation	\| pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein \| Chr3:5656371-5658335 REVERSE LENGTH=1965 \| 201606
Sequence	ATGTTTCTAAGTCTTCTTGAAACCTGTATTCGCTCAAGGAATCTGGTCTTAGGTCAGGTC ATTCATCAGCATCTTCTTAAACGCTCTCTTACGTTAAGTTCCTCTACAGTGCTCGTCAAT TTAACACGTCTTTACGCATCATGCAATGAAGTGGAACTTGCACGCCATGTGTTCGATGAA ATTCCTCATCCAAGGATCAATCCTATTGCTTGGGATTTGATGATCAGAGCCTATGCTTCG AATGATTTCGCGGAAAAAGCTTTGGATTTGTACTACAAGATGCTGAATTCTGGTGTTAGA CCCACGAAATATACGTACCCGTTTGTTTTGAAAGCATGTGCTGGTCTTCGAGCAATTGAC GATGGTAAGCTGATACATAGTCATGTGAATTGTAGCGACTTTGCAACTGATATGTATGTA TGTACTGCTCTGGTTGATTTCTATGCTAAGTGTGGGGAACTTGAGATGGCTATAAAGGTG TTCGACGAAATGCCTAAGAGAGATATGGTTGCTTGGAATGCTATGATTTCTGGGTTTTCT TTACATTGCTGTTTAACTGATGTCATTGGATTGTTTTTGGATATGCGTAGAATCGATGGT CTGAGTCCTAATCTATCCACCATCGTTGGGATGTTTCCTGCACTAGGAAGGGCTGGTGCA TTGAGGGAAGGGAAAGCTGTTCATGGGTATTGCACAAGAATGGGTTTTAGCAATGATTTA GTTGTTAAGACTGGGATCTTGGATGTATATGCCAAGAGCAAGTGCATTATCTATGCGAGA AGAGTTTTCGATTTAGACTTTAAGAAGAATGAGGTAACCTGGAGTGCTATGATTGGAGGC TACGTAGAAAACGAAATGATAAAGGAAGCTGGAGAAGTGTTTTTTCAGATGTTGGTTAAT GATAATGTGGCAATGGTGACGCCAGTTGCCATTGGGCTTATTCTGATGGGTTGTGCAAGG TTTGGAGATCTAAGTGGAGGGCGATGTGTACATTGTTACGCGGTTAAAGCAGGCTTCATC TTAGACTTAACTGTTCAAAACACCATAATTTCATTTTATGCTAAGTATGGAAGCTTATGT GATGCTTTTAGGCAGTTTAGTGAGATTGGCTTGAAAGATGTTATTTCATATAATTCTCTC ATCACTGGGTGTGTAGTGAACTGTCGCCCAGAAGAGAGTTTTCGTCTATTTCATGAGATG AGAACATCTGGAATTCGTCCTGATATTACAACATTGCTTGGTGTCTTAACCGCTTGCTCT CACTTGGCTGCTTTGGGACACGGTTCTAGTTGCCACGGGTATTGTGTTGTTCATGGCTAT GCAGTTAACACAAGCATTTGTAATGCACTGATGGATATGTACACAAAGTGTGGAAAACTT GATGTAGCCAAGAGAGTTTTCGACACAATGCATAAGCGGGATATAGTTTCGTGGAACACA ATGCTGTTCGGATTCGGAATTCATGGTCTTGGCAAAGAAGCTCTTTCTCTGTTCAACAGT ATGCAGGAAACAGGTGTGAACCCAGACGAGGTGACTCTTCTTGCTATTTTGTCTGCTTGT AGCCATTCAGGACTAGTGGATGAAGGGAAACAACTGTTCAACTCCATGTCTCGAGGAGAT TTCAACGTCATCCCAAGAATAGACCATTACAATTGCATGACTGATCTTCTAGCCCGTGCC GGATACTTGGATGAAGCTTATGATTTTGTAAACAAGATGCCATTTGAGCCCGATATTCGC GTGTTGGGTACACTTCTCTCTGCTTGTTGGACGTACAAGAATGCGGAACTTGGGAATGAA GTGTCGAAAAAGATGCAGAGTCTTGGTGAAACAACAGAAAGCTTAGTTCTTCTATCCAAC ACCTACTCAGCTGCTGAGAGATGGGAAGATGCAGCTAGAATTAGAATGATACAGAAGAAA AGAGGGCTTCTCAAGACTCCGGGTTATAGCTGGGTCGATGTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT3G16610.1
PEP Infomation	\| pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein \| Chr3:5656371-5658335 REVERSE LENGTH=654 \| 201606
Sequence	MFLSLLETCIRSRNLVLGQVIHQHLLKRSLTLSSSTVLVNLTRLYASCNEVELARHVFDE IPHPRINPIAWDLMIRAYASNDFAEKALDLYYKMLNSGVRPTKYTYPFVLKACAGLRAID DGKLIHSHVNCSDFATDMYVCTALVDFYAKCGELEMAIKVFDEMPKRDMVAWNAMISGFS LHCCLTDVIGLFLDMRRIDGLSPNLSTIVGMFPALGRAGALREGKAVHGYCTRMGFSNDL VVKTGILDVYAKSKCIIYARRVFDLDFKKNEVTWSAMIGGYVENEMIKEAGEVFFQMLVN DNVAMVTPVAIGLILMGCARFGDLSGGRCVHCYAVKAGFILDLTVQNTIISFYAKYGSLC DAFRQFSEIGLKDVISYNSLITGCVVNCRPEESFRLFHEMRTSGIRPDITTLLGVLTACS HLAALGHGSSCHGYCVVHGYAVNTSICNALMDMYTKCGKLDVAKRVFDTMHKRDIVSWNT MLFGFGIHGLGKEALSLFNSMQETGVNPDEVTLLAILSACSHSGLVDEGKQLFNSMSRGD FNVIPRIDHYNCMTDLLARAGYLDEAYDFVNKMPFEPDIRVLGTLLSACWTYKNAELGNE VSKKMQSLGETTESLVLLSNTYSAAERWEDAARIRMIQKKRGLLKTPGYSWVDV

Transcript Sequence

Transcript ID	AT3G16610.1
Transcript Infomation	\| pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein \| Chr3:5656215-5658335 REVERSE LENGTH=2121 \| 201606
Sequence	ATGTTTCTAAGTCTTCTTGAAACCTGTATTCGCTCAAGGAATCTGGTCTTAGGTCAGGTC ATTCATCAGCATCTTCTTAAACGCTCTCTTACGTTAAGTTCCTCTACAGTGCTCGTCAAT TTAACACGTCTTTACGCATCATGCAATGAAGTGGAACTTGCACGCCATGTGTTCGATGAA ATTCCTCATCCAAGGATCAATCCTATTGCTTGGGATTTGATGATCAGAGCCTATGCTTCG AATGATTTCGCGGAAAAAGCTTTGGATTTGTACTACAAGATGCTGAATTCTGGTGTTAGA CCCACGAAATATACGTACCCGTTTGTTTTGAAAGCATGTGCTGGTCTTCGAGCAATTGAC GATGGTAAGCTGATACATAGTCATGTGAATTGTAGCGACTTTGCAACTGATATGTATGTA TGTACTGCTCTGGTTGATTTCTATGCTAAGTGTGGGGAACTTGAGATGGCTATAAAGGTG TTCGACGAAATGCCTAAGAGAGATATGGTTGCTTGGAATGCTATGATTTCTGGGTTTTCT TTACATTGCTGTTTAACTGATGTCATTGGATTGTTTTTGGATATGCGTAGAATCGATGGT CTGAGTCCTAATCTATCCACCATCGTTGGGATGTTTCCTGCACTAGGAAGGGCTGGTGCA TTGAGGGAAGGGAAAGCTGTTCATGGGTATTGCACAAGAATGGGTTTTAGCAATGATTTA GTTGTTAAGACTGGGATCTTGGATGTATATGCCAAGAGCAAGTGCATTATCTATGCGAGA AGAGTTTTCGATTTAGACTTTAAGAAGAATGAGGTAACCTGGAGTGCTATGATTGGAGGC TACGTAGAAAACGAAATGATAAAGGAAGCTGGAGAAGTGTTTTTTCAGATGTTGGTTAAT GATAATGTGGCAATGGTGACGCCAGTTGCCATTGGGCTTATTCTGATGGGTTGTGCAAGG TTTGGAGATCTAAGTGGAGGGCGATGTGTACATTGTTACGCGGTTAAAGCAGGCTTCATC TTAGACTTAACTGTTCAAAACACCATAATTTCATTTTATGCTAAGTATGGAAGCTTATGT GATGCTTTTAGGCAGTTTAGTGAGATTGGCTTGAAAGATGTTATTTCATATAATTCTCTC ATCACTGGGTGTGTAGTGAACTGTCGCCCAGAAGAGAGTTTTCGTCTATTTCATGAGATG AGAACATCTGGAATTCGTCCTGATATTACAACATTGCTTGGTGTCTTAACCGCTTGCTCT CACTTGGCTGCTTTGGGACACGGTTCTAGTTGCCACGGGTATTGTGTTGTTCATGGCTAT GCAGTTAACACAAGCATTTGTAATGCACTGATGGATATGTACACAAAGTGTGGAAAACTT GATGTAGCCAAGAGAGTTTTCGACACAATGCATAAGCGGGATATAGTTTCGTGGAACACA ATGCTGTTCGGATTCGGAATTCATGGTCTTGGCAAAGAAGCTCTTTCTCTGTTCAACAGT ATGCAGGAAACAGGTGTGAACCCAGACGAGGTGACTCTTCTTGCTATTTTGTCTGCTTGT AGCCATTCAGGACTAGTGGATGAAGGGAAACAACTGTTCAACTCCATGTCTCGAGGAGAT TTCAACGTCATCCCAAGAATAGACCATTACAATTGCATGACTGATCTTCTAGCCCGTGCC GGATACTTGGATGAAGCTTATGATTTTGTAAACAAGATGCCATTTGAGCCCGATATTCGC GTGTTGGGTACACTTCTCTCTGCTTGTTGGACGTACAAGAATGCGGAACTTGGGAATGAA GTGTCGAAAAAGATGCAGAGTCTTGGTGAAACAACAGAAAGCTTAGTTCTTCTATCCAAC ACCTACTCAGCTGCTGAGAGATGGGAAGATGCAGCTAGAATTAGAATGATACAGAAGAAA AGAGGGCTTCTCAAGACTCCGGGTTATAGCTGGGTCGATGTTTGATTAATGATATGAAAT TAGGGTTTTGCAGTGGAAGAGAAAAACGTAATCGAGAAGGCAAAGAGAATTGCTTACTCT GTTTTCAGCTTCCTACTTGAAATCACAGCCGTTAAAAACAATTTAACTCCTGAAATCAGA TAAGGACCGTTGGATTAGTAT