Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT3G13770.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr3:4519647-4521533 FORWARD LENGTH=1887 \| 201606
Sequence	ATGTTTAACTTGATGAGACTAATTCATCGATCTTTCTCGTCGTCTCCAACAAACTATGTT CTTCAAACCATTCTTCCAATCTCTCAATTATGCTCCAACGGTCGTCTTCAAGAAGCTTTA CTGGAGATGGCGATGTTAGGTCCCGAGATGGGGTTCCATGGTTACGATGCTTTGTTGAAT GCGTGTTTGGACAAAAGGGCTCTTAGAGATGGTCAAAGAGTTCATGCCCACATGATCAAA ACCCGTTATTTACCCGCCACTTACCTCCGAACTCGTCTGCTTATCTTCTATGGTAAATGT GATTGTTTAGAGGATGCACGGAAAGTGCTCGACGAAATGCCTGAGAAGAATGTCGTTTCC TGGACTGCTATGATCTCGCGTTATTCTCAAACTGGGCATTCTTCTGAGGCTCTCACTGTT TTTGCAGAGATGATGAGATCAGATGGGAAACCGAATGAGTTCACTTTCGCTACTGTTCTT ACTTCTTGTATACGTGCTTCTGGGTTAGGTCTTGGTAAGCAAATCCATGGACTCATAGTT AAGTGGAATTACGATTCTCATATTTTTGTTGGAAGCTCTCTTCTTGACATGTATGCTAAA GCTGGTCAAATTAAAGAAGCTCGTGAGATTTTCGAGTGTTTGCCTGAGAGAGATGTTGTC TCATGTACTGCTATTATTGCTGGTTATGCCCAACTAGGTCTTGATGAAGAGGCGTTAGAG ATGTTTCATAGACTGCATAGTGAAGGAATGAGTCCCAATTATGTTACCTATGCTAGTCTT TTGACAGCATTATCTGGACTTGCTTTGCTAGATCATGGCAAGCAAGCTCATTGCCATGTC TTGAGACGTGAACTTCCGTTTTACGCGGTCCTTCAGAATTCTCTTATTGATATGTACTCA AAATGTGGGAATCTTTCTTACGCTAGAAGGCTTTTTGATAACATGCCTGAGAGGACAGCG ATTTCATGGAATGCGATGCTTGTGGGATATAGTAAACATGGGTTAGGAAGAGAAGTTCTT GAACTTTTTAGATTGATGAGAGATGAGAAGAGAGTAAAGCCTGATGCAGTTACCCTTTTG GCTGTTTTGTCTGGTTGCAGCCATGGGAGAATGGAAGACACAGGGTTGAATATATTTGAT GGCATGGTAGCGGGAGAATACGGGACTAAGCCTGGCACTGAGCATTATGGTTGCATCGTT GATATGCTTGGCCGTGCGGGTAGGATTGATGAGGCATTTGAATTCATCAAAAGAATGCCA TCTAAACCAACTGCTGGTGTCTTGGGTTCCCTTTTAGGAGCATGTAGGGTTCACTTATCT GTGGATATTGGCGAATCTGTAGGTCGCAGACTCATTGAGATTGAACCAGAGAATGCAGGG AACTATGTCATCCTCTCTAATTTGTATGCTTCGGCTGGAAGATGGGCAGATGTAAACAAT GTAAGAGCTATGATGATGCAGAAAGCTGTTACAAAAGAACCAGGAAGAAGCTGGATTCAA CACGAGCAAACCTTACATTACTTCCACGCCAATGATCGTACCCATCCAAGAAGGGAAGAA GTGTTAGCTAAAATGAAAGAAATATCGATAAAAATGAAGCAAGCTGGTTATGTTCCTGAT CTTAGCTGTGTGCTATATGATGTGGATGAAGAGCAGAAGGAGAAAATGCTACTTGGCCAC AGTGAGAAACTAGCCTTGACTTTTGGTTTGATTGCTACTGGTGAAGGGATTCCAATTAGA GTTTTCAAGAATCTACGTATATGCGTTGATTGTCATAACTTCGCCAAGATCTTCTCAAAG GTTTTTGAAAGAGAAGTGTCATTAAGGGATAAAAACAGGTTTCATCAAATTGTCGATGGA ATATGTTCATGCGGAGATTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT3G13770.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr3:4519647-4521533 FORWARD LENGTH=628 \| 201606
Sequence	MFNLMRLIHRSFSSSPTNYVLQTILPISQLCSNGRLQEALLEMAMLGPEMGFHGYDALLN ACLDKRALRDGQRVHAHMIKTRYLPATYLRTRLLIFYGKCDCLEDARKVLDEMPEKNVVS WTAMISRYSQTGHSSEALTVFAEMMRSDGKPNEFTFATVLTSCIRASGLGLGKQIHGLIV KWNYDSHIFVGSSLLDMYAKAGQIKEAREIFECLPERDVVSCTAIIAGYAQLGLDEEALE MFHRLHSEGMSPNYVTYASLLTALSGLALLDHGKQAHCHVLRRELPFYAVLQNSLIDMYS KCGNLSYARRLFDNMPERTAISWNAMLVGYSKHGLGREVLELFRLMRDEKRVKPDAVTLL AVLSGCSHGRMEDTGLNIFDGMVAGEYGTKPGTEHYGCIVDMLGRAGRIDEAFEFIKRMP SKPTAGVLGSLLGACRVHLSVDIGESVGRRLIEIEPENAGNYVILSNLYASAGRWADVNN VRAMMMQKAVTKEPGRSWIQHEQTLHYFHANDRTHPRREEVLAKMKEISIKMKQAGYVPD LSCVLYDVDEEQKEKMLLGHSEKLALTFGLIATGEGIPIRVFKNLRICVDCHNFAKIFSK VFEREVSLRDKNRFHQIVDGICSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	AT3G13770.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr3:4519647-4521533 FORWARD LENGTH=1887 \| 201606
Sequence	ATGTTTAACTTGATGAGACTAATTCATCGATCTTTCTCGTCGTCTCCAACAAACTATGTT CTTCAAACCATTCTTCCAATCTCTCAATTATGCTCCAACGGTCGTCTTCAAGAAGCTTTA CTGGAGATGGCGATGTTAGGTCCCGAGATGGGGTTCCATGGTTACGATGCTTTGTTGAAT GCGTGTTTGGACAAAAGGGCTCTTAGAGATGGTCAAAGAGTTCATGCCCACATGATCAAA ACCCGTTATTTACCCGCCACTTACCTCCGAACTCGTCTGCTTATCTTCTATGGTAAATGT GATTGTTTAGAGGATGCACGGAAAGTGCTCGACGAAATGCCTGAGAAGAATGTCGTTTCC TGGACTGCTATGATCTCGCGTTATTCTCAAACTGGGCATTCTTCTGAGGCTCTCACTGTT TTTGCAGAGATGATGAGATCAGATGGGAAACCGAATGAGTTCACTTTCGCTACTGTTCTT ACTTCTTGTATACGTGCTTCTGGGTTAGGTCTTGGTAAGCAAATCCATGGACTCATAGTT AAGTGGAATTACGATTCTCATATTTTTGTTGGAAGCTCTCTTCTTGACATGTATGCTAAA GCTGGTCAAATTAAAGAAGCTCGTGAGATTTTCGAGTGTTTGCCTGAGAGAGATGTTGTC TCATGTACTGCTATTATTGCTGGTTATGCCCAACTAGGTCTTGATGAAGAGGCGTTAGAG ATGTTTCATAGACTGCATAGTGAAGGAATGAGTCCCAATTATGTTACCTATGCTAGTCTT TTGACAGCATTATCTGGACTTGCTTTGCTAGATCATGGCAAGCAAGCTCATTGCCATGTC TTGAGACGTGAACTTCCGTTTTACGCGGTCCTTCAGAATTCTCTTATTGATATGTACTCA AAATGTGGGAATCTTTCTTACGCTAGAAGGCTTTTTGATAACATGCCTGAGAGGACAGCG ATTTCATGGAATGCGATGCTTGTGGGATATAGTAAACATGGGTTAGGAAGAGAAGTTCTT GAACTTTTTAGATTGATGAGAGATGAGAAGAGAGTAAAGCCTGATGCAGTTACCCTTTTG GCTGTTTTGTCTGGTTGCAGCCATGGGAGAATGGAAGACACAGGGTTGAATATATTTGAT GGCATGGTAGCGGGAGAATACGGGACTAAGCCTGGCACTGAGCATTATGGTTGCATCGTT GATATGCTTGGCCGTGCGGGTAGGATTGATGAGGCATTTGAATTCATCAAAAGAATGCCA TCTAAACCAACTGCTGGTGTCTTGGGTTCCCTTTTAGGAGCATGTAGGGTTCACTTATCT GTGGATATTGGCGAATCTGTAGGTCGCAGACTCATTGAGATTGAACCAGAGAATGCAGGG AACTATGTCATCCTCTCTAATTTGTATGCTTCGGCTGGAAGATGGGCAGATGTAAACAAT GTAAGAGCTATGATGATGCAGAAAGCTGTTACAAAAGAACCAGGAAGAAGCTGGATTCAA CACGAGCAAACCTTACATTACTTCCACGCCAATGATCGTACCCATCCAAGAAGGGAAGAA GTGTTAGCTAAAATGAAAGAAATATCGATAAAAATGAAGCAAGCTGGTTATGTTCCTGAT CTTAGCTGTGTGCTATATGATGTGGATGAAGAGCAGAAGGAGAAAATGCTACTTGGCCAC AGTGAGAAACTAGCCTTGACTTTTGGTTTGATTGCTACTGGTGAAGGGATTCCAATTAGA GTTTTCAAGAATCTACGTATATGCGTTGATTGTCATAACTTCGCCAAGATCTTCTCAAAG GTTTTTGAAAGAGAAGTGTCATTAAGGGATAAAAACAGGTTTCATCAAATTGTCGATGGA ATATGTTCATGCGGAGATTACTGGTGA