Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT3G13750.1
CDS Infomation	\| beta galactosidase 1 \| Chr3:4511192-4515756 FORWARD LENGTH=2544 \| 201606
Sequence	ATGGGTTCGAAACCTAATGCCATGAAGAATGTGGTGGCTATGGCGGCAGTTTCTGCTCTG TTCCTTCTAGGGTTTCTTGTTTGCTCTGTTTCTGGTTCTGTCTCTTACGATAGCAGAGCC ATTACCATCAATGGCAAAAGAAGAATCCTTATCTCTGGATCTATTCACTACCCCAGAAGT ACTCCTGAGATGTGGCCAGATCTAATTCGGAAAGCAAAGGAAGGAGGCTTAGATGTGATT CAGACTTATGTGTTCTGGAATGGGCATGAGCCATCTCCTGGAAAATATTATTTCGAGGGC AACTATGATTTGGTTAAGTTTGTCAAGTTGGTCCAACAATCTGGACTCTATCTTCATCTA AGGATTGGTCCTTATGTCTGTGCTGAATGGAACTTCGGAGGATTTCCTGTTTGGCTTAAG TACATTCCAGGGATTAGCTTCAGAACAGATAACGGTCCTTTCAAGGCTCAAATGCAAAGA TTCACCACGAAGATTGTTAACATGATGAAAGCTGAGAGGCTTTTTGAATCTCAAGGCGGT CCTATAATTCTCTCTCAGATTGAAAATGAATATGGACCAATGGAGTATGAGCTTGGTGCA CCGGGCCGGTCATACACCAACTGGGCAGCTAAGATGGCGGTGGGGCTAGGCACTGGTGTC CCTTGGGTCATGTGCAAACAAGACGATGCTCCCGACCCCATTATCAATGCTTGCAATGGC TTCTACTGTGATTACTTCTCCCCAAACAAGGCTTACAAGCCTAAAATGTGGACCGAAGCC TGGACTGGATGGTTTACAAAGTTTGGAGGCCCAGTTCCTTACCGCCCAGCTGAAGATATG GCCTTTTCCGTTGCAAGGTTTATCCAAAAGGGTGGATCTTTCATCAACTACTATATGTAT CATGGTGGAACAAACTTTGGTCGAACTGCTGGTGGTCCGTTTATCGCAACTAGCTATGAT TATGATGCTCCTCTTGACGAATATGGACTTGAAAGGCAGCCTAAGTGGGGGCACTTGAAA GATTTGCATAGAGCAATTAAGCTGTGTGAACCAGCTTTAGTATCAGGAGAGCCCACAAGA ATGCCTCTCGGAAACTATCAAGAGGCTCATGTGTACAAATCAAAATCTGGAGCTTGTTCT GCATTCTTAGCAAATTATAATCCAAAATCTTACGCCAAAGTTTCTTTCGGGAACAATCAC TACAATCTCCCTCCGTGGTCTATAAGTATTCTCCCAGACTGCAAAAACACAGTTTACAAC ACAGCCAGGGTTGGTGCTCAAACTTCTAGGATGAAAATGGTTCGGGTTCCTGTTCATGGT GGTTTATCTTGGCAAGCATACAATGAAGACCCATCAACTTACATCGATGAGTCATTCACA ATGGTCGGATTAGTGGAGCAGATAAACACTACACGAGACACTTCGGATTACCTGTGGTAC ATGACTGATGTTAAAGTTGATGCCAATGAAGGATTTTTGAGGAATGGAGATTTGCCGACT CTTACTGTTCTATCAGCTGGCCATGCTATGCATGTGTTTATCAATGGTCAATTATCTGGA TCTGCATATGGTAGTTTAGACTCTCCTAAGCTAACTTTTCGGAAAGGTGTGAATCTAAGA GCTGGTTTCAACAAAATTGCGATACTAAGCATTGCTGTTGGTCTCCCGAATGTGGGTCCA CATTTTGAGACATGGAATGCTGGAGTTTTGGGTCCAGTTTCATTGAACGGTCTCAATGGG GGACGGAGAGATCTATCATGGCAGAAATGGACTTATAAGGTTGGTCTTAAAGGAGAGTCT CTGAGTCTTCATTCACTTAGTGGTAGCTCATCGGTTGAGTGGGCAGAAGGTGCATTTGTT GCACAGAAGCAACCACTTACTTGGTACAAGACGACTTTCTCTGCTCCAGCTGGAGATTCG CCATTGGCTGTAGACATGGGAAGCATGGGAAAAGGTCAAATATGGATAAATGGGCAGAGC CTGGGACGTCACTGGCCTGCATATAAAGCAGTTGGTTCTTGCAGCGAGTGTTCTTATACC GGAACATTCAGAGAGGACAAGTGCTTAAGAAACTGTGGAGAGGCTTCTCAAAGATGGTAC CATGTCCCAAGGTCGTGGCTAAAACCAAGTGGCAATCTATTGGTTGTCTTTGAGGAATGG GGAGGAGACCCGAACGGAATCACGTTGGTCAGAAGAGAAGTGGACAGTGTATGTGCAGAT ATCTATGAATGGCAATCAACGCTGGTGAACTACCAATTGCATGCTTCTGGAAAAGTTAAT AAACCATTGCATCCCAAAGCACATTTACAATGCGGGCCCGGACAAAAGATCACCACCGTG AAGTTTGCTAGTTTCGGGACACCTGAAGGGACTTGTGGTAGTTACCGTCAAGGAAGCTGT CACGCCCATCACTCCTATGACGCTTTCAACAAACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTCT GTAACTGTAGCACCGGAGATGTTTGGTGGAGATCCGTGTCCAAATGTGATGAAGAAACTC GCGGTGGAAGCCGTTTGTGCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT3G13750.1
PEP Infomation	\| beta galactosidase 1 \| Chr3:4511192-4515756 FORWARD LENGTH=847 \| 201606
Sequence	MGSKPNAMKNVVAMAAVSALFLLGFLVCSVSGSVSYDSRAITINGKRRILISGSIHYPRS TPEMWPDLIRKAKEGGLDVIQTYVFWNGHEPSPGKYYFEGNYDLVKFVKLVQQSGLYLHL RIGPYVCAEWNFGGFPVWLKYIPGISFRTDNGPFKAQMQRFTTKIVNMMKAERLFESQGG PIILSQIENEYGPMEYELGAPGRSYTNWAAKMAVGLGTGVPWVMCKQDDAPDPIINACNG FYCDYFSPNKAYKPKMWTEAWTGWFTKFGGPVPYRPAEDMAFSVARFIQKGGSFINYYMY HGGTNFGRTAGGPFIATSYDYDAPLDEYGLERQPKWGHLKDLHRAIKLCEPALVSGEPTR MPLGNYQEAHVYKSKSGACSAFLANYNPKSYAKVSFGNNHYNLPPWSISILPDCKNTVYN TARVGAQTSRMKMVRVPVHGGLSWQAYNEDPSTYIDESFTMVGLVEQINTTRDTSDYLWY MTDVKVDANEGFLRNGDLPTLTVLSAGHAMHVFINGQLSGSAYGSLDSPKLTFRKGVNLR AGFNKIAILSIAVGLPNVGPHFETWNAGVLGPVSLNGLNGGRRDLSWQKWTYKVGLKGES LSLHSLSGSSSVEWAEGAFVAQKQPLTWYKTTFSAPAGDSPLAVDMGSMGKGQIWINGQS LGRHWPAYKAVGSCSECSYTGTFREDKCLRNCGEASQRWYHVPRSWLKPSGNLLVVFEEW GGDPNGITLVRREVDSVCADIYEWQSTLVNYQLHASGKVNKPLHPKAHLQCGPGQKITTV KFASFGTPEGTCGSYRQGSCHAHHSYDAFNKLCVGQNWCSVTVAPEMFGGDPCPNVMKKL AVEAVCA

Transcript Sequence

Transcript ID	AT3G13750.1
Transcript Infomation	\| beta galactosidase 1 \| Chr3:4510965-4516478 FORWARD LENGTH=3493 \| 201606
Sequence	GCATCCGAACAAAAAAAAAAACAAGTTTTCTTCTTTTTACACTCAAGAATATAAATTCCC TGTTCTCCAGATCTTTTCTCAAGAAAATTTAAAGCTTTAACTTAAGAAAGCTTGAACCTT TCTCTTCCAACCACATCTTCCTTCTTTTTATCCTCTAGCTCAACTTAGAAAGAATAGAAT AAAGTGGCAAAACCGAAAGTGAACCAACTTGTAGTAAATTAATAGTTATGGGTTCGAAAC CTAATGCCATGAAGAATGTGGTGGCTATGGCGGCAGTTTCTGCTCTGTTCCTTCTAGGGT TTCTTGTTTGCTCTGTTTCTGGTTCTGTCTCTTACGATAGCAGAGCCATTACCATCAATG GCAAAAGAAGAATCCTTATCTCTGGATCTATTCACTACCCCAGAAGTACTCCTGAGATGT GGCCAGATCTAATTCGGAAAGCAAAGGAAGGAGGCTTAGATGTGATTCAGACTTATGTGT TCTGGAATGGGCATGAGCCATCTCCTGGAAAATATTATTTCGAGGGCAACTATGATTTGG TTAAGTTTGTCAAGTTGGTCCAACAATCTGGACTCTATCTTCATCTAAGGATTGGTCCTT ATGTCTGTGCTGAATGGAACTTCGGAGGATTTCCTGTTTGGCTTAAGTACATTCCAGGGA TTAGCTTCAGAACAGATAACGGTCCTTTCAAGGCTCAAATGCAAAGATTCACCACGAAGA TTGTTAACATGATGAAAGCTGAGAGGCTTTTTGAATCTCAAGGCGGTCCTATAATTCTCT CTCAGATTGAAAATGAATATGGACCAATGGAGTATGAGCTTGGTGCACCGGGCCGGTCAT ACACCAACTGGGCAGCTAAGATGGCGGTGGGGCTAGGCACTGGTGTCCCTTGGGTCATGT GCAAACAAGACGATGCTCCCGACCCCATTATCAATGCTTGCAATGGCTTCTACTGTGATT ACTTCTCCCCAAACAAGGCTTACAAGCCTAAAATGTGGACCGAAGCCTGGACTGGATGGT TTACAAAGTTTGGAGGCCCAGTTCCTTACCGCCCAGCTGAAGATATGGCCTTTTCCGTTG CAAGGTTTATCCAAAAGGGTGGATCTTTCATCAACTACTATATGTATCATGGTGGAACAA ACTTTGGTCGAACTGCTGGTGGTCCGTTTATCGCAACTAGCTATGATTATGATGCTCCTC TTGACGAATATGGACTTGAAAGGCAGCCTAAGTGGGGGCACTTGAAAGATTTGCATAGAG CAATTAAGCTGTGTGAACCAGCTTTAGTATCAGGAGAGCCCACAAGAATGCCTCTCGGAA ACTATCAAGAGGCTCATGTGTACAAATCAAAATCTGGAGCTTGTTCTGCATTCTTAGCAA ATTATAATCCAAAATCTTACGCCAAAGTTTCTTTCGGGAACAATCACTACAATCTCCCTC CGTGGTCTATAAGTATTCTCCCAGACTGCAAAAACACAGTTTACAACACAGCCAGGGTTG GTGCTCAAACTTCTAGGATGAAAATGGTTCGGGTTCCTGTTCATGGTGGTTTATCTTGGC AAGCATACAATGAAGACCCATCAACTTACATCGATGAGTCATTCACAATGGTCGGATTAG TGGAGCAGATAAACACTACACGAGACACTTCGGATTACCTGTGGTACATGACTGATGTTA AAGTTGATGCCAATGAAGGATTTTTGAGGAATGGAGATTTGCCGACTCTTACTGTTCTAT CAGCTGGCCATGCTATGCATGTGTTTATCAATGGTCAATTATCTGGATCTGCATATGGTA GTTTAGACTCTCCTAAGCTAACTTTTCGGAAAGGTGTGAATCTAAGAGCTGGTTTCAACA AAATTGCGATACTAAGCATTGCTGTTGGTCTCCCGAATGTGGGTCCACATTTTGAGACAT GGAATGCTGGAGTTTTGGGTCCAGTTTCATTGAACGGTCTCAATGGGGGACGGAGAGATC TATCATGGCAGAAATGGACTTATAAGGTTGGTCTTAAAGGAGAGTCTCTGAGTCTTCATT CACTTAGTGGTAGCTCATCGGTTGAGTGGGCAGAAGGTGCATTTGTTGCACAGAAGCAAC CACTTACTTGGTACAAGACGACTTTCTCTGCTCCAGCTGGAGATTCGCCATTGGCTGTAG ACATGGGAAGCATGGGAAAAGGTCAAATATGGATAAATGGGCAGAGCCTGGGACGTCACT GGCCTGCATATAAAGCAGTTGGTTCTTGCAGCGAGTGTTCTTATACCGGAACATTCAGAG AGGACAAGTGCTTAAGAAACTGTGGAGAGGCTTCTCAAAGATGGTACCATGTCCCAAGGT CGTGGCTAAAACCAAGTGGCAATCTATTGGTTGTCTTTGAGGAATGGGGAGGAGACCCGA ACGGAATCACGTTGGTCAGAAGAGAAGTGGACAGTGTATGTGCAGATATCTATGAATGGC AATCAACGCTGGTGAACTACCAATTGCATGCTTCTGGAAAAGTTAATAAACCATTGCATC CCAAAGCACATTTACAATGCGGGCCCGGACAAAAGATCACCACCGTGAAGTTTGCTAGTT TCGGGACACCTGAAGGGACTTGTGGTAGTTACCGTCAAGGAAGCTGTCACGCCCATCACT CCTATGACGCTTTCAACAAACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTCTGTAACTGTAGCAC CGGAGATGTTTGGTGGAGATCCGTGTCCAAATGTGATGAAGAAACTCGCGGTGGAAGCCG TTTGTGCTTAAATGAAAGCAGACGCAACAGCAATCAAAAGACTGTAAAGGTGGTTACTTA CGCATTCTTACAGGTTTCTGATGGTATTAGTATGTTTTATGAAGACAACAGAAGAAGTTG GTATTTTTCTAGCTCCTTATTTTATCACGGTGGAAGTTGTACAAAGGGACGCAGCACGCC GTTCAACAATTTGCAGAGTTGTGATTTATATGTAAATAAGCTTGGGAAGGGTTTGTTATT GTAACCCAAGAAAGAAGATGAAGAAGAAGAAGAAGCACATTGAGACTGGAGAATCTAAGT CCATGTGTAGATTCTTTTGGTAGGAGCAAAACTGGGATTAGTTTATTCTCTGAGTTTTGC TTTGAACGTGTTTGTTGTTGCTGTTGTTGTAGTCGATACTATTAGATGAGACATTCTCTG CAATTATCTCATTGCTAAATTTATGTAATGGTTTTTCTTTCTTTCTATGGAATGAAGCAT ATCAGTCTTGAAGTAAACCAATGTGTGAATCACCCCTCCAAATATTGAGCTTTTGAAATT TATTCATTCTACCATTTTCGTGTTTTACGTTTTGTGGATTTACCACTTTCACAAAGTAAC AGAAAGTAGAAACTGCCATTGCTGATCCTTTTACACTGTTTTTTGGGTTGACCATTTTTT TTTATTCATCAGGAAACCTTGGTGCTGTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTCAGACTAATAAT GTAATATCAATGT