Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT3G03110.1
CDS Infomation	\| exportin 1B \| Chr3:708966-716879 FORWARD LENGTH=3231 \| 201606
Sequence	ATGGCTGCCGAGAAGTTAAGAGACTTGAGTCAGCCGATTGACGTCGTTTTACTCGATGCC ACTGTTGAGGCCTTTTACTCTACCGGATCTAAGGAAGAAAGAGCTTCTGCGGATAATATC TTGCGGGATTTGAAAGCTAATCCTGATACTTGGCTTCAAGTTGTTCACATTCTACAGAAC ACCAGTAGTACGCATACCAAATTTTTTGCCCTTCAGGTGCTGGAAGGTGTTATAAAATAT AGGTGGAATGCATTACCCGTTGAACAACGTGATGGAATGAAAAATTACATCTCTGATGTC ATTGTGCAGCTGTCAAGGGATGAAGCATCTTTCAGAACGGAAAGGCTTTATGTCAACAAG TTAAATATCATCCTGGTTCAGATCGTGAAACAGGAGTGGCCGGCAAAGTGGAAAAGCTTT ATTCCTGATTTAGTTATAGCTGCTAAGACTAGTGAAACTATCTGTGAGAATTGCATGGCT ATTTTGAAACTCCTAAGTGAAGAGGTCTTTGATTTCTCAAAAGGAGAGATGACTCAGCAA AAGATAAAAGAACTGAAACAGTCTCTAAACAGCGAGTTTCAACTCATTCACGAGTTATGC CTATATGTCCTCTCAGCTTCCCAAAGACAAGAGCTTATACGTGCTACACTCTCTGCATTG CATGCCTATCTTTCTTGGATTCCGTTGGGATACATATTTGAGTCCCCTTTGCTGGAGATC CTACTTAAATTCTTCCCTGTTCCAGCATATAGGAATCTCACACTTCAATGTTTGTCAGAG GTTGCATCTCTTAATTTTGGGGACTTCTACGATATGCAATATGTCAAGATGTACAGCATT TTCATGAATCAGTTGCAGGCAATTCTCCCTTTAAATTTAAATATCCCTGAGGCATATTCA ACTGGAAGTAGTGAAGAACAGGCTTTTATCCAGAACTTGGCACTGTTTTTCACTTCGTTT TTCAAGTTACATATAAAAATCCTAGAATCTGCACCCGAAAATATTTCTCTATTACTTGCG GGTCTGGGATATCTCATTAGCATATCGTATGTTGATGACACTGAAGTATTCAAGGTTTGT TTGGACTATTGGAATTCATTAGTGTTGGAGTTGTTTGGGACGCGACATCATGCGTGTCAC CCTGCACTAACTCCAAGTCTGTTTGGATTGCAAATGGCTTTCCTTCCTAGTACAGTTGAT GGTGTTAAATCTGAAGTCACTGAGCGGCAAAAACTTTATTCAGATCCAATGTCAAAATTA AGGGGACTCATGATTAGTCGCACGGCTAAGCCTGAAGAAGTGTTAATTGTTGAGGACGAA AATGGGAACATTGTTCGTGAAACTATGAAGGATAATGATGTTCTTGTCCAGTATAAGATA ATGCGGGAGACATTAATCTACCTCTCACACCTTGATCATGAAGATACCGAAAAACAGATG TTGAGTAAGCTAAGCAAACAGTTGAGCGGGGAGGAATGGGCATGGAACAATCTAAACACT TTATGCTGGGCTATTGGGTCTATTTCTGGGTCCATGGTAGTAGAACAGGAAAACAGATTT CTCGTGATGGTTATCCGTGATTTGTTAAGTTTATGTGAAGTCGTCAAGGGAAAAGACAAT AAAGCTGTTATTGCGAGCAACATCATGTACGTTGTTGGACAATATTCAAGATTCTTAAGA GCCCATTGGAAGTTTTTGAAGACAGTTGTCCATAAGCTGTTTGAATTTATGCATGAGACG CATCCTGGTGTTCAGGACATGGCTTGCGACACATTCTTAAAAATTGTTCAGAAGTGTAAG CGAAAATTTGTTATTGTTCAGGTTGGAGAAAGTGAGCCATTTGTGTCTGAACTTCTATCA GGCCTTGCTACAATCGTCGGAGATCTTCAACCTCATCAGATTCATACATTTTATGAATCT GTTGGTAGTATGATCCAGGCAGAATCAGATCCTCAGAAGAGGGGGGAATACCTCCAGAGG TTGATGGCTCTCCCGAATCAGAAATGGGCAGAAATTATAGGACAAGCACGTCAAAGTGCA GATATCCTCAAGGAACCAGATGTGATACGTACTGTGCTTAATATCCTCCAGACAAATACG CGCGTTGCAACTTCACTAGGAACATTCTTCCTGTCTCAAATTTCGTTGATCTTCTTGGAT ATGCTGAATGTTTACAGAATGTATAGTGAACTCGTTTCAAGCAGCATTGCTAATGGTGGC CCATACGCTTCGAGAACATCTCTTGTTAAACTTTTAAGGTCTGTTAAGAGGGAAATTCTT AAGCTGATAGAGACGTTTTTAGATAAAGCTGAAAACCAGCCACACATTGGAAAACAGTTT GTTCCACCAATGATGGATCAAGTACTTGGCGACTATGCAAGAAATGTTCCTGATGCAAGA GAATCAGAAGTCTTGTCACTCTTTGCGACAATAATCAACAAATACAAGGTTGTAATGCGA GATGAAGTTCCCCTCATATTTGAAGCTGTTTTCCAGTGCACATTGGAGATGATTACTAAG AATTTTGAAGATTACCCAGAGCACCGTCTCAAGTTTTTCTCGTTACTTCGTGCTATTGCT ACATTTTGTTTCCGTGCGTTGATACAGTTGTCAAGTGAGCAACTGAAGCTAGTGATGGAT TCAGTTATCTGGGCATTTAGGCATACTGAAAGAAATATCGCTGAAACTGGGCTCAATCTC TTGCTCGAGATGCTGAAAAACTTTCAGAAATCTGACTTTTGTAACAAATTCTACCAAACA TACTTTCTGCAAATTGAGCAAGAAGTATTTGCTGTCTTGACCGATACCTTCCACAAGCCT GGGTTCAAGTTGCATGTGTTGGTGTTGCAGCACTTATTTAGCCTGGTTGAGAGCGGATCA TTGGCAGAACCATTGTGGGATGCTGCAACGGTACCGCATCCTTATTCAAATAATGTCGCC TTTGTGCTTGAGTACACCACCAAGCTTCTAAGCTCATCATTCCCCAACATGACTACAACA GAGGTGACACAGTTTGTGAATGGACTTTACGAGTCGAGAAACGATGTTGGCAGATTTAAG GATAACATACGCGACTTCCTTATACAGTCCAAGGAATTTTCTGCTCAGGATAACAAAGAT TTATATGCTGAGGAAGCTGCTGCCCAAATGGAGAGAGAGAGACAAAGAATGCTTTCGATT CCTGGACTTATAGCTCCCAGCGAAATTCAAGACGACATGGCCGATTCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT3G03110.1
PEP Infomation	\| exportin 1B \| Chr3:708966-716879 FORWARD LENGTH=1076 \| 201606
Sequence	MAAEKLRDLSQPIDVVLLDATVEAFYSTGSKEERASADNILRDLKANPDTWLQVVHILQN TSSTHTKFFALQVLEGVIKYRWNALPVEQRDGMKNYISDVIVQLSRDEASFRTERLYVNK LNIILVQIVKQEWPAKWKSFIPDLVIAAKTSETICENCMAILKLLSEEVFDFSKGEMTQQ KIKELKQSLNSEFQLIHELCLYVLSASQRQELIRATLSALHAYLSWIPLGYIFESPLLEI LLKFFPVPAYRNLTLQCLSEVASLNFGDFYDMQYVKMYSIFMNQLQAILPLNLNIPEAYS TGSSEEQAFIQNLALFFTSFFKLHIKILESAPENISLLLAGLGYLISISYVDDTEVFKVC LDYWNSLVLELFGTRHHACHPALTPSLFGLQMAFLPSTVDGVKSEVTERQKLYSDPMSKL RGLMISRTAKPEEVLIVEDENGNIVRETMKDNDVLVQYKIMRETLIYLSHLDHEDTEKQM LSKLSKQLSGEEWAWNNLNTLCWAIGSISGSMVVEQENRFLVMVIRDLLSLCEVVKGKDN KAVIASNIMYVVGQYSRFLRAHWKFLKTVVHKLFEFMHETHPGVQDMACDTFLKIVQKCK RKFVIVQVGESEPFVSELLSGLATIVGDLQPHQIHTFYESVGSMIQAESDPQKRGEYLQR LMALPNQKWAEIIGQARQSADILKEPDVIRTVLNILQTNTRVATSLGTFFLSQISLIFLD MLNVYRMYSELVSSSIANGGPYASRTSLVKLLRSVKREILKLIETFLDKAENQPHIGKQF VPPMMDQVLGDYARNVPDARESEVLSLFATIINKYKVVMRDEVPLIFEAVFQCTLEMITK NFEDYPEHRLKFFSLLRAIATFCFRALIQLSSEQLKLVMDSVIWAFRHTERNIAETGLNL LLEMLKNFQKSDFCNKFYQTYFLQIEQEVFAVLTDTFHKPGFKLHVLVLQHLFSLVESGS LAEPLWDAATVPHPYSNNVAFVLEYTTKLLSSSFPNMTTTEVTQFVNGLYESRNDVGRFK DNIRDFLIQSKEFSAQDNKDLYAEEAAAQMERERQRMLSIPGLIAPSEIQDDMADS

Transcript Sequence

Transcript ID	AT3G03110.1
Transcript Infomation	\| exportin 1B \| Chr3:708698-717093 FORWARD LENGTH=3713 \| 201606
Sequence	CTGTAGAGTATACAAATTCAAACCCTGAGGCGGTCAACGAAAAAAAAAGAAGAGAAAACA AAATTAGAAGTCAGGCCTTTTTCTCAGCGTCGCCTGCGTCAATCTTAAGCTGTCTTTCAA AAACCTCTCTCAATATTTAAACTGCCTCTCCTCCGTACCGCTCTACCCAAAAAAAAACTC TCTCCCTCTCTCTCGAACTTTGTCTCCCTCCATTGATTTCACTCTCGTATCGAGTCTCTT CTTCTAGAATTTGCGCATCCTCTCCGCCATGGCTGCCGAGAAGTTAAGAGACTTGAGTCA GCCGATTGACGTCGTTTTACTCGATGCCACTGTTGAGGCCTTTTACTCTACCGGATCTAA GGAAGAAAGAGCTTCTGCGGATAATATCTTGCGGGATTTGAAAGCTAATCCTGATACTTG GCTTCAAGTTGTTCACATTCTACAGAACACCAGTAGTACGCATACCAAATTTTTTGCCCT TCAGGTGCTGGAAGGTGTTATAAAATATAGGTGGAATGCATTACCCGTTGAACAACGTGA TGGAATGAAAAATTACATCTCTGATGTCATTGTGCAGCTGTCAAGGGATGAAGCATCTTT CAGAACGGAAAGGCTTTATGTCAACAAGTTAAATATCATCCTGGTTCAGATCGTGAAACA GGAGTGGCCGGCAAAGTGGAAAAGCTTTATTCCTGATTTAGTTATAGCTGCTAAGACTAG TGAAACTATCTGTGAGAATTGCATGGCTATTTTGAAACTCCTAAGTGAAGAGGTCTTTGA TTTCTCAAAAGGAGAGATGACTCAGCAAAAGATAAAAGAACTGAAACAGTCTCTAAACAG CGAGTTTCAACTCATTCACGAGTTATGCCTATATGTCCTCTCAGCTTCCCAAAGACAAGA GCTTATACGTGCTACACTCTCTGCATTGCATGCCTATCTTTCTTGGATTCCGTTGGGATA CATATTTGAGTCCCCTTTGCTGGAGATCCTACTTAAATTCTTCCCTGTTCCAGCATATAG GAATCTCACACTTCAATGTTTGTCAGAGGTTGCATCTCTTAATTTTGGGGACTTCTACGA TATGCAATATGTCAAGATGTACAGCATTTTCATGAATCAGTTGCAGGCAATTCTCCCTTT AAATTTAAATATCCCTGAGGCATATTCAACTGGAAGTAGTGAAGAACAGGCTTTTATCCA GAACTTGGCACTGTTTTTCACTTCGTTTTTCAAGTTACATATAAAAATCCTAGAATCTGC ACCCGAAAATATTTCTCTATTACTTGCGGGTCTGGGATATCTCATTAGCATATCGTATGT TGATGACACTGAAGTATTCAAGGTTTGTTTGGACTATTGGAATTCATTAGTGTTGGAGTT GTTTGGGACGCGACATCATGCGTGTCACCCTGCACTAACTCCAAGTCTGTTTGGATTGCA AATGGCTTTCCTTCCTAGTACAGTTGATGGTGTTAAATCTGAAGTCACTGAGCGGCAAAA ACTTTATTCAGATCCAATGTCAAAATTAAGGGGACTCATGATTAGTCGCACGGCTAAGCC TGAAGAAGTGTTAATTGTTGAGGACGAAAATGGGAACATTGTTCGTGAAACTATGAAGGA TAATGATGTTCTTGTCCAGTATAAGATAATGCGGGAGACATTAATCTACCTCTCACACCT TGATCATGAAGATACCGAAAAACAGATGTTGAGTAAGCTAAGCAAACAGTTGAGCGGGGA GGAATGGGCATGGAACAATCTAAACACTTTATGCTGGGCTATTGGGTCTATTTCTGGGTC CATGGTAGTAGAACAGGAAAACAGATTTCTCGTGATGGTTATCCGTGATTTGTTAAGTTT ATGTGAAGTCGTCAAGGGAAAAGACAATAAAGCTGTTATTGCGAGCAACATCATGTACGT TGTTGGACAATATTCAAGATTCTTAAGAGCCCATTGGAAGTTTTTGAAGACAGTTGTCCA TAAGCTGTTTGAATTTATGCATGAGACGCATCCTGGTGTTCAGGACATGGCTTGCGACAC ATTCTTAAAAATTGTTCAGAAGTGTAAGCGAAAATTTGTTATTGTTCAGGTTGGAGAAAG TGAGCCATTTGTGTCTGAACTTCTATCAGGCCTTGCTACAATCGTCGGAGATCTTCAACC TCATCAGATTCATACATTTTATGAATCTGTTGGTAGTATGATCCAGGCAGAATCAGATCC TCAGAAGAGGGGGGAATACCTCCAGAGGTTGATGGCTCTCCCGAATCAGAAATGGGCAGA AATTATAGGACAAGCACGTCAAAGTGCAGATATCCTCAAGGAACCAGATGTGATACGTAC TGTGCTTAATATCCTCCAGACAAATACGCGCGTTGCAACTTCACTAGGAACATTCTTCCT GTCTCAAATTTCGTTGATCTTCTTGGATATGCTGAATGTTTACAGAATGTATAGTGAACT CGTTTCAAGCAGCATTGCTAATGGTGGCCCATACGCTTCGAGAACATCTCTTGTTAAACT TTTAAGGTCTGTTAAGAGGGAAATTCTTAAGCTGATAGAGACGTTTTTAGATAAAGCTGA AAACCAGCCACACATTGGAAAACAGTTTGTTCCACCAATGATGGATCAAGTACTTGGCGA CTATGCAAGAAATGTTCCTGATGCAAGAGAATCAGAAGTCTTGTCACTCTTTGCGACAAT AATCAACAAATACAAGGTTGTAATGCGAGATGAAGTTCCCCTCATATTTGAAGCTGTTTT CCAGTGCACATTGGAGATGATTACTAAGAATTTTGAAGATTACCCAGAGCACCGTCTCAA GTTTTTCTCGTTACTTCGTGCTATTGCTACATTTTGTTTCCGTGCGTTGATACAGTTGTC AAGTGAGCAACTGAAGCTAGTGATGGATTCAGTTATCTGGGCATTTAGGCATACTGAAAG AAATATCGCTGAAACTGGGCTCAATCTCTTGCTCGAGATGCTGAAAAACTTTCAGAAATC TGACTTTTGTAACAAATTCTACCAAACATACTTTCTGCAAATTGAGCAAGAAGTATTTGC TGTCTTGACCGATACCTTCCACAAGCCTGGGTTCAAGTTGCATGTGTTGGTGTTGCAGCA CTTATTTAGCCTGGTTGAGAGCGGATCATTGGCAGAACCATTGTGGGATGCTGCAACGGT ACCGCATCCTTATTCAAATAATGTCGCCTTTGTGCTTGAGTACACCACCAAGCTTCTAAG CTCATCATTCCCCAACATGACTACAACAGAGGTGACACAGTTTGTGAATGGACTTTACGA GTCGAGAAACGATGTTGGCAGATTTAAGGATAACATACGCGACTTCCTTATACAGTCCAA GGAATTTTCTGCTCAGGATAACAAAGATTTATATGCTGAGGAAGCTGCTGCCCAAATGGA GAGAGAGAGACAAAGAATGCTTTCGATTCCTGGACTTATAGCTCCCAGCGAAATTCAAGA CGACATGGCCGATTCTTAAGTCTTGTTTTTATATTTTATAAGAAGAAGGCTCTCGAAAAG AGAAATGGAATTTTTTTTGTAGAGATCTTGAGAAATGGAAAGCTTAGAAAAGACAAGTGT TAGGTTTTCTAAATTACAATCTTTTTTGTTGGATTTGTTACTATTAAATGAAAAATGTTT AGGATCTCAAAATTAATCGAACCTCAAACCGGTTATAAACCGGTCTTAATTTC