Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT3G01580.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr3:223529-225511 REVERSE LENGTH=1983 \| 201606
Sequence	ATGGGTTTTTGCCGGAAGTTCTCTTCTTCCGTGGATGCACGCCAAATGTTCGGCGAAATG ACGAAGAGAAGCTTGTACCAGTGGAATACTCTTCTTAAGAGTTTATCCAGAGAGAAACAA TGGGAAGAAGTCTTGTATCACTTTAGTCATATGTTTCGCGATGAAGAAAAGCCTGATAAT TTCACGCTTCCAGTTGCTCTCAAGGCCTGCGGGGAGCTGCGGGAAGTTAATTATGGTGAA ATGATTCATGGGTTCGTGAAGAAGGATGTCACTCTTGGGTCTGACCTTTATGTTGGATCT TCTCTGATATATATGTATATCAAATGTGGAAGAATGATCGAAGCTTTGAGGATGTTCGAT GAATTGGAGAAGCCTGATATAGTGACATGGTCTTCTATGGTTTCTGGGTTTGAGAAAAAC GGGTCTCCCTATCAGGCCGTAGAGTTTTTCAGGAGAATGGTGATGGCTTCCGATGTTACT CCTGATCGGGTAACTTTAATCACACTAGTTTCTGCTTGTACAAAGCTTTCGAATTCAAGG CTTGGAAGATGTGTGCATGGTTTTGTGATTAGGAGAGGATTTTCAAATGACTTGTCTTTG GTAAATTCGCTATTGAATTGTTATGCAAAGTCAAGAGCTTTCAAGGAAGCGGTTAATTTG TTCAAGATGATAGCAGAGAAAGATGTTATATCTTGGAGCACAGTGATTGCTTGCTACGTT CAAAATGGAGCTGCCGCTGAAGCGTTGCTTGTCTTCAATGATATGATGGATGATGGAACA GAACCTAATGTAGCTACCGTGCTCTGTGTTTTACAAGCTTGTGCAGCTGCTCATGATTTA GAGCAAGGTAGGAAGACTCATGAATTGGCCATTAGGAAAGGTTTAGAGACAGAAGTGAAA GTCTCTACTGCTCTAGTTGATATGTATATGAAGTGTTTCTCCCCTGAAGAAGCTTATGCT GTATTCTCCAGGATACCAAGAAAAGATGTAGTCTCTTGGGTTGCGCTGATAAGTGGCTTT ACATTAAATGGAATGGCTCACAGATCAATTGAGGAATTTTCCATCATGTTGCTGGAAAAT AATACCAGGCCTGATGCTATTCTTATGGTGAAGGTTCTTGGGTCATGTTCGGAGTTAGGC TTTCTCGAACAAGCTAAATGCTTTCATAGTTATGTTATCAAATATGGATTTGACAGTAAC CCATTCATCGGAGCTTCTCTTGTAGAGCTTTACTCGAGGTGTGGGAGTCTAGGCAATGCT TCTAAAGTATTCAATGGGATTGCTTTAAAGGACACTGTGGTTTGGACATCTTTGATCACT GGTTATGGCATCCATGGAAAGGGCACTAAAGCACTGGAAACATTTAATCACATGGTCAAG AGCTCAGAAGTTAAGCCTAATGAAGTGACATTTCTCTCAATATTATCTGCTTGTAGTCAC GCAGGTTTGATACATGAGGGGTTGAGAATATTTAAATTGATGGTGAATGACTATAGACTT GCTCCCAACTTAGAACACTATGCTGTATTAGTTGATCTTCTTGGTCGTGTAGGAGATCTA GATACTGCCATTGAAATCACAAAGCGGATGCCTTTTTCACCGACACCTCAAATCTTGGGT ACTCTTTTAGGCGCGTGTAGGATTCATCAGAATGGTGAGATGGCAGAAACTGTTGCAAAG AAGCTTTTCGAATTGGAATCTAATCATGCTGGCTATTACATGTTAATGTCGAATGTGTAT GGGGTTAAGGGAGAATGGGAGAATGTGGAGAAGTTGAGAAATTCGGTGAAGCAGAGAGGA ATTAAGAAAGGACTGGCAGAGAGTTTGATTGAGATTAGAAGAAAAGTACATAGATTTGTG GCGGATGATGAATTGCATCCTGAGAAAGAGCCGGTTTATGGATTGCTGAAAGAGCTGGAC TTGCATATGAAAGAAGATTTGGAAAACTGTGTGTACTTTGAATATGAGGGAGACAGCTTG TGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT3G01580.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr3:223529-225511 REVERSE LENGTH=660 \| 201606
Sequence	MGFCRKFSSSVDARQMFGEMTKRSLYQWNTLLKSLSREKQWEEVLYHFSHMFRDEEKPDN FTLPVALKACGELREVNYGEMIHGFVKKDVTLGSDLYVGSSLIYMYIKCGRMIEALRMFD ELEKPDIVTWSSMVSGFEKNGSPYQAVEFFRRMVMASDVTPDRVTLITLVSACTKLSNSR LGRCVHGFVIRRGFSNDLSLVNSLLNCYAKSRAFKEAVNLFKMIAEKDVISWSTVIACYV QNGAAAEALLVFNDMMDDGTEPNVATVLCVLQACAAAHDLEQGRKTHELAIRKGLETEVK VSTALVDMYMKCFSPEEAYAVFSRIPRKDVVSWVALISGFTLNGMAHRSIEEFSIMLLEN NTRPDAILMVKVLGSCSELGFLEQAKCFHSYVIKYGFDSNPFIGASLVELYSRCGSLGNA SKVFNGIALKDTVVWTSLITGYGIHGKGTKALETFNHMVKSSEVKPNEVTFLSILSACSH AGLIHEGLRIFKLMVNDYRLAPNLEHYAVLVDLLGRVGDLDTAIEITKRMPFSPTPQILG TLLGACRIHQNGEMAETVAKKLFELESNHAGYYMLMSNVYGVKGEWENVEKLRNSVKQRG IKKGLAESLIEIRRKVHRFVADDELHPEKEPVYGLLKELDLHMKEDLENCVYFEYEGDSL

Transcript Sequence

Transcript ID	AT3G01580.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr3:223332-225682 REVERSE LENGTH=2351 \| 201606
Sequence	TTTGCTTTGAAGTTGAATCCATCCTTCTCTTCTCTTCTCTCCCTCGCAAAGTTTACTGCA AGAAGGAAATTTGGGTTGCTCAAGCAATGTAGAAGCGAGAAAATTTTGATGGAAGTTTTT CGGAAACAGAAGGTTTGAATGTGAGATAATTTTCAATTTCAGGGGATTTGGATGGGTTTT TGCCGGAAGTTCTCTTCTTCCGTGGATGCACGCCAAATGTTCGGCGAAATGACGAAGAGA AGCTTGTACCAGTGGAATACTCTTCTTAAGAGTTTATCCAGAGAGAAACAATGGGAAGAA GTCTTGTATCACTTTAGTCATATGTTTCGCGATGAAGAAAAGCCTGATAATTTCACGCTT CCAGTTGCTCTCAAGGCCTGCGGGGAGCTGCGGGAAGTTAATTATGGTGAAATGATTCAT GGGTTCGTGAAGAAGGATGTCACTCTTGGGTCTGACCTTTATGTTGGATCTTCTCTGATA TATATGTATATCAAATGTGGAAGAATGATCGAAGCTTTGAGGATGTTCGATGAATTGGAG AAGCCTGATATAGTGACATGGTCTTCTATGGTTTCTGGGTTTGAGAAAAACGGGTCTCCC TATCAGGCCGTAGAGTTTTTCAGGAGAATGGTGATGGCTTCCGATGTTACTCCTGATCGG GTAACTTTAATCACACTAGTTTCTGCTTGTACAAAGCTTTCGAATTCAAGGCTTGGAAGA TGTGTGCATGGTTTTGTGATTAGGAGAGGATTTTCAAATGACTTGTCTTTGGTAAATTCG CTATTGAATTGTTATGCAAAGTCAAGAGCTTTCAAGGAAGCGGTTAATTTGTTCAAGATG ATAGCAGAGAAAGATGTTATATCTTGGAGCACAGTGATTGCTTGCTACGTTCAAAATGGA GCTGCCGCTGAAGCGTTGCTTGTCTTCAATGATATGATGGATGATGGAACAGAACCTAAT GTAGCTACCGTGCTCTGTGTTTTACAAGCTTGTGCAGCTGCTCATGATTTAGAGCAAGGT AGGAAGACTCATGAATTGGCCATTAGGAAAGGTTTAGAGACAGAAGTGAAAGTCTCTACT GCTCTAGTTGATATGTATATGAAGTGTTTCTCCCCTGAAGAAGCTTATGCTGTATTCTCC AGGATACCAAGAAAAGATGTAGTCTCTTGGGTTGCGCTGATAAGTGGCTTTACATTAAAT GGAATGGCTCACAGATCAATTGAGGAATTTTCCATCATGTTGCTGGAAAATAATACCAGG CCTGATGCTATTCTTATGGTGAAGGTTCTTGGGTCATGTTCGGAGTTAGGCTTTCTCGAA CAAGCTAAATGCTTTCATAGTTATGTTATCAAATATGGATTTGACAGTAACCCATTCATC GGAGCTTCTCTTGTAGAGCTTTACTCGAGGTGTGGGAGTCTAGGCAATGCTTCTAAAGTA TTCAATGGGATTGCTTTAAAGGACACTGTGGTTTGGACATCTTTGATCACTGGTTATGGC ATCCATGGAAAGGGCACTAAAGCACTGGAAACATTTAATCACATGGTCAAGAGCTCAGAA GTTAAGCCTAATGAAGTGACATTTCTCTCAATATTATCTGCTTGTAGTCACGCAGGTTTG ATACATGAGGGGTTGAGAATATTTAAATTGATGGTGAATGACTATAGACTTGCTCCCAAC TTAGAACACTATGCTGTATTAGTTGATCTTCTTGGTCGTGTAGGAGATCTAGATACTGCC ATTGAAATCACAAAGCGGATGCCTTTTTCACCGACACCTCAAATCTTGGGTACTCTTTTA GGCGCGTGTAGGATTCATCAGAATGGTGAGATGGCAGAAACTGTTGCAAAGAAGCTTTTC GAATTGGAATCTAATCATGCTGGCTATTACATGTTAATGTCGAATGTGTATGGGGTTAAG GGAGAATGGGAGAATGTGGAGAAGTTGAGAAATTCGGTGAAGCAGAGAGGAATTAAGAAA GGACTGGCAGAGAGTTTGATTGAGATTAGAAGAAAAGTACATAGATTTGTGGCGGATGAT GAATTGCATCCTGAGAAAGAGCCGGTTTATGGATTGCTGAAAGAGCTGGACTTGCATATG AAAGAAGATTTGGAAAACTGTGTGTACTTTGAATATGAGGGAGACAGCTTGTGATACTGG TATGCTTAAGGTTGAAGCCAAGATCTCTGTCTTACCCAAGTAACCACTTTCTATTAGAAG GGATCAACACTAAGAATATGGAGATTTAAGCCTAAGGGCTAAGGCGGTTCTCAACAATAC ATGATGTGAATACAATCACAGACGATTTACTGAGGTTTGTTGATAAGATCTTGATCAGTC TCTGCATCATC