Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID

AT3G01580.1

CDS Infomation

| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr3:223529-225511 REVERSE LENGTH=1983 | 201606

Sequence

ATGGGTTTTTGCCGGAAGTTCTCTTCTTCCGTGGATGCACGCCAAATGTTCGGCGAAATG
ACGAAGAGAAGCTTGTACCAGTGGAATACTCTTCTTAAGAGTTTATCCAGAGAGAAACAA
TGGGAAGAAGTCTTGTATCACTTTAGTCATATGTTTCGCGATGAAGAAAAGCCTGATAAT
TTCACGCTTCCAGTTGCTCTCAAGGCCTGCGGGGAGCTGCGGGAAGTTAATTATGGTGAA
ATGATTCATGGGTTCGTGAAGAAGGATGTCACTCTTGGGTCTGACCTTTATGTTGGATCT
TCTCTGATATATATGTATATCAAATGTGGAAGAATGATCGAAGCTTTGAGGATGTTCGAT
GAATTGGAGAAGCCTGATATAGTGACATGGTCTTCTATGGTTTCTGGGTTTGAGAAAAAC
GGGTCTCCCTATCAGGCCGTAGAGTTTTTCAGGAGAATGGTGATGGCTTCCGATGTTACT
CCTGATCGGGTAACTTTAATCACACTAGTTTCTGCTTGTACAAAGCTTTCGAATTCAAGG
CTTGGAAGATGTGTGCATGGTTTTGTGATTAGGAGAGGATTTTCAAATGACTTGTCTTTG
GTAAATTCGCTATTGAATTGTTATGCAAAGTCAAGAGCTTTCAAGGAAGCGGTTAATTTG
TTCAAGATGATAGCAGAGAAAGATGTTATATCTTGGAGCACAGTGATTGCTTGCTACGTT
CAAAATGGAGCTGCCGCTGAAGCGTTGCTTGTCTTCAATGATATGATGGATGATGGAACA
GAACCTAATGTAGCTACCGTGCTCTGTGTTTTACAAGCTTGTGCAGCTGCTCATGATTTA
GAGCAAGGTAGGAAGACTCATGAATTGGCCATTAGGAAAGGTTTAGAGACAGAAGTGAAA
GTCTCTACTGCTCTAGTTGATATGTATATGAAGTGTTTCTCCCCTGAAGAAGCTTATGCT
GTATTCTCCAGGATACCAAGAAAAGATGTAGTCTCTTGGGTTGCGCTGATAAGTGGCTTT
ACATTAAATGGAATGGCTCACAGATCAATTGAGGAATTTTCCATCATGTTGCTGGAAAAT
AATACCAGGCCTGATGCTATTCTTATGGTGAAGGTTCTTGGGTCATGTTCGGAGTTAGGC
TTTCTCGAACAAGCTAAATGCTTTCATAGTTATGTTATCAAATATGGATTTGACAGTAAC
CCATTCATCGGAGCTTCTCTTGTAGAGCTTTACTCGAGGTGTGGGAGTCTAGGCAATGCT
TCTAAAGTATTCAATGGGATTGCTTTAAAGGACACTGTGGTTTGGACATCTTTGATCACT
GGTTATGGCATCCATGGAAAGGGCACTAAAGCACTGGAAACATTTAATCACATGGTCAAG
AGCTCAGAAGTTAAGCCTAATGAAGTGACATTTCTCTCAATATTATCTGCTTGTAGTCAC
GCAGGTTTGATACATGAGGGGTTGAGAATATTTAAATTGATGGTGAATGACTATAGACTT
GCTCCCAACTTAGAACACTATGCTGTATTAGTTGATCTTCTTGGTCGTGTAGGAGATCTA
GATACTGCCATTGAAATCACAAAGCGGATGCCTTTTTCACCGACACCTCAAATCTTGGGT
ACTCTTTTAGGCGCGTGTAGGATTCATCAGAATGGTGAGATGGCAGAAACTGTTGCAAAG
AAGCTTTTCGAATTGGAATCTAATCATGCTGGCTATTACATGTTAATGTCGAATGTGTAT
GGGGTTAAGGGAGAATGGGAGAATGTGGAGAAGTTGAGAAATTCGGTGAAGCAGAGAGGA
ATTAAGAAAGGACTGGCAGAGAGTTTGATTGAGATTAGAAGAAAAGTACATAGATTTGTG
GCGGATGATGAATTGCATCCTGAGAAAGAGCCGGTTTATGGATTGCTGAAAGAGCTGGAC
TTGCATATGAAAGAAGATTTGGAAAACTGTGTGTACTTTGAATATGAGGGAGACAGCTTG
TGA

Peptide Sequence

PEP ID

AT3G01580.1

PEP Infomation

| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr3:223529-225511 REVERSE LENGTH=660 | 201606

Sequence

MGFCRKFSSSVDARQMFGEMTKRSLYQWNTLLKSLSREKQWEEVLYHFSHMFRDEEKPDN
FTLPVALKACGELREVNYGEMIHGFVKKDVTLGSDLYVGSSLIYMYIKCGRMIEALRMFD
ELEKPDIVTWSSMVSGFEKNGSPYQAVEFFRRMVMASDVTPDRVTLITLVSACTKLSNSR
LGRCVHGFVIRRGFSNDLSLVNSLLNCYAKSRAFKEAVNLFKMIAEKDVISWSTVIACYV
QNGAAAEALLVFNDMMDDGTEPNVATVLCVLQACAAAHDLEQGRKTHELAIRKGLETEVK
VSTALVDMYMKCFSPEEAYAVFSRIPRKDVVSWVALISGFTLNGMAHRSIEEFSIMLLEN
NTRPDAILMVKVLGSCSELGFLEQAKCFHSYVIKYGFDSNPFIGASLVELYSRCGSLGNA
SKVFNGIALKDTVVWTSLITGYGIHGKGTKALETFNHMVKSSEVKPNEVTFLSILSACSH
AGLIHEGLRIFKLMVNDYRLAPNLEHYAVLVDLLGRVGDLDTAIEITKRMPFSPTPQILG
TLLGACRIHQNGEMAETVAKKLFELESNHAGYYMLMSNVYGVKGEWENVEKLRNSVKQRG
IKKGLAESLIEIRRKVHRFVADDELHPEKEPVYGLLKELDLHMKEDLENCVYFEYEGDSL

Transcript Sequence

Transcript ID

AT3G01580.1

Transcript Infomation

| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | Chr3:223332-225682 REVERSE LENGTH=2351 | 201606

Sequence

TTTGCTTTGAAGTTGAATCCATCCTTCTCTTCTCTTCTCTCCCTCGCAAAGTTTACTGCA
AGAAGGAAATTTGGGTTGCTCAAGCAATGTAGAAGCGAGAAAATTTTGATGGAAGTTTTT
CGGAAACAGAAGGTTTGAATGTGAGATAATTTTCAATTTCAGGGGATTTGGATGGGTTTT
TGCCGGAAGTTCTCTTCTTCCGTGGATGCACGCCAAATGTTCGGCGAAATGACGAAGAGA
AGCTTGTACCAGTGGAATACTCTTCTTAAGAGTTTATCCAGAGAGAAACAATGGGAAGAA
GTCTTGTATCACTTTAGTCATATGTTTCGCGATGAAGAAAAGCCTGATAATTTCACGCTT
CCAGTTGCTCTCAAGGCCTGCGGGGAGCTGCGGGAAGTTAATTATGGTGAAATGATTCAT
GGGTTCGTGAAGAAGGATGTCACTCTTGGGTCTGACCTTTATGTTGGATCTTCTCTGATA
TATATGTATATCAAATGTGGAAGAATGATCGAAGCTTTGAGGATGTTCGATGAATTGGAG
AAGCCTGATATAGTGACATGGTCTTCTATGGTTTCTGGGTTTGAGAAAAACGGGTCTCCC
TATCAGGCCGTAGAGTTTTTCAGGAGAATGGTGATGGCTTCCGATGTTACTCCTGATCGG
GTAACTTTAATCACACTAGTTTCTGCTTGTACAAAGCTTTCGAATTCAAGGCTTGGAAGA
TGTGTGCATGGTTTTGTGATTAGGAGAGGATTTTCAAATGACTTGTCTTTGGTAAATTCG
CTATTGAATTGTTATGCAAAGTCAAGAGCTTTCAAGGAAGCGGTTAATTTGTTCAAGATG
ATAGCAGAGAAAGATGTTATATCTTGGAGCACAGTGATTGCTTGCTACGTTCAAAATGGA
GCTGCCGCTGAAGCGTTGCTTGTCTTCAATGATATGATGGATGATGGAACAGAACCTAAT
GTAGCTACCGTGCTCTGTGTTTTACAAGCTTGTGCAGCTGCTCATGATTTAGAGCAAGGT
AGGAAGACTCATGAATTGGCCATTAGGAAAGGTTTAGAGACAGAAGTGAAAGTCTCTACT
GCTCTAGTTGATATGTATATGAAGTGTTTCTCCCCTGAAGAAGCTTATGCTGTATTCTCC
AGGATACCAAGAAAAGATGTAGTCTCTTGGGTTGCGCTGATAAGTGGCTTTACATTAAAT
GGAATGGCTCACAGATCAATTGAGGAATTTTCCATCATGTTGCTGGAAAATAATACCAGG
CCTGATGCTATTCTTATGGTGAAGGTTCTTGGGTCATGTTCGGAGTTAGGCTTTCTCGAA
CAAGCTAAATGCTTTCATAGTTATGTTATCAAATATGGATTTGACAGTAACCCATTCATC
GGAGCTTCTCTTGTAGAGCTTTACTCGAGGTGTGGGAGTCTAGGCAATGCTTCTAAAGTA
TTCAATGGGATTGCTTTAAAGGACACTGTGGTTTGGACATCTTTGATCACTGGTTATGGC
ATCCATGGAAAGGGCACTAAAGCACTGGAAACATTTAATCACATGGTCAAGAGCTCAGAA
GTTAAGCCTAATGAAGTGACATTTCTCTCAATATTATCTGCTTGTAGTCACGCAGGTTTG
ATACATGAGGGGTTGAGAATATTTAAATTGATGGTGAATGACTATAGACTTGCTCCCAAC
TTAGAACACTATGCTGTATTAGTTGATCTTCTTGGTCGTGTAGGAGATCTAGATACTGCC
ATTGAAATCACAAAGCGGATGCCTTTTTCACCGACACCTCAAATCTTGGGTACTCTTTTA
GGCGCGTGTAGGATTCATCAGAATGGTGAGATGGCAGAAACTGTTGCAAAGAAGCTTTTC
GAATTGGAATCTAATCATGCTGGCTATTACATGTTAATGTCGAATGTGTATGGGGTTAAG
GGAGAATGGGAGAATGTGGAGAAGTTGAGAAATTCGGTGAAGCAGAGAGGAATTAAGAAA
GGACTGGCAGAGAGTTTGATTGAGATTAGAAGAAAAGTACATAGATTTGTGGCGGATGAT
GAATTGCATCCTGAGAAAGAGCCGGTTTATGGATTGCTGAAAGAGCTGGACTTGCATATG
AAAGAAGATTTGGAAAACTGTGTGTACTTTGAATATGAGGGAGACAGCTTGTGATACTGG
TATGCTTAAGGTTGAAGCCAAGATCTCTGTCTTACCCAAGTAACCACTTTCTATTAGAAG
GGATCAACACTAAGAATATGGAGATTTAAGCCTAAGGGCTAAGGCGGTTCTCAACAATAC
ATGATGTGAATACAATCACAGACGATTTACTGAGGTTTGTTGATAAGATCTTGATCAGTC
TCTGCATCATC