Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT2G45350.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:18694816-18696657 REVERSE LENGTH=1842 \| 201606
Sequence	ATGCTTGTCTTCAAGTCAACCATGGAGTGTTCGATTTCATCCACCATTCATGTCCTTGGA AGCTGCAAAACTTCAGATGACGTGAACCAAATCCACGGGCGATTGATTAAGACGGGAATC ATCAAAAACTCAAATCTCACTACGAGGATTGTTCTGGCTTTTGCCTCTTCTCGACGTCCG TATCTCGCCGATTTCGCGCGTTGTGTCTTCCACGAGTATCACGTATGTTCGTTTTCATTT GGAGAGGTGGAGGATCCATTTTTATGGAACGCCGTGATCAAGTCTCACTCTCATGGAAAG GATCCGAGACAAGCTCTGCTCTTGCTCTGTTTGATGCTCGAGAATGGGGTTTCCGTGGAC AAATTCTCACTGTCACTTGTTCTTAAAGCGTGTTCGAGGTTAGGTTTTGTAAAAGGAGGA ATGCAGATTCATGGGTTTTTGAAAAAAACTGGACTTTGGTCGGATTTGTTTCTACAGAAT TGTTTGATTGGCTTGTATCTGAAATGTGGTTGTTTAGGTTTATCACGCCAGATGTTTGAT AGAATGCCGAAGAGAGACTCTGTTTCTTATAATTCCATGATTGATGGGTATGTCAAATGT GGATTGATTGTATCCGCGCGTGAATTGTTCGATTTGATGCCTATGGAGATGAAGAATTTG ATATCTTGGAACTCTATGATAAGTGGTTATGCTCAGACATCAGATGGAGTTGACATAGCG TCTAAACTGTTTGCTGATATGCCTGAGAAGGACTTGATTTCGTGGAACTCAATGATAGAT GGATATGTAAAACACGGAAGAATCGAAGATGCTAAGGGTTTATTCGATGTGATGCCGAGA AGAGATGTAGTTACTTGGGCTACCATGATTGATGGGTATGCAAAGTTAGGTTTTGTTCAT CACGCTAAGACTCTGTTTGACCAAATGCCTCATAGAGATGTTGTGGCATATAATTCTATG ATGGCTGGTTATGTTCAAAACAAGTATCACATGGAAGCTCTTGAAATATTTAGTGACATG GAAAAGGAGAGTCACTTGTTACCCGATGATACGACTTTGGTAATAGTTCTGCCTGCAATT GCTCAGCTTGGCCGATTATCCAAAGCCATAGATATGCATTTGTACATCGTGGAGAAACAA TTCTATCTAGGTGGAAAACTCGGTGTTGCTCTCATTGATATGTATTCGAAATGCGGAAGC ATACAACACGCCATGTTGGTTTTCGAGGGAATCGAAAACAAAAGCATTGATCACTGGAAT GCTATGATTGGTGGGCTCGCTATTCATGGTCTAGGGGAATCTGCATTCGATATGCTCTTG CAGATTGAGAGACTCTCTTTAAAACCAGACGATATCACCTTTGTTGGCGTTTTAAATGCT TGCAGCCACTCTGGGTTAGTAAAGGAAGGCCTTCTCTGCTTTGAGCTCATGAGGAGAAAA CACAAGATAGAACCAAGATTGCAACACTATGGTTGTATGGTAGACATACTATCGAGATCC GGAAGTATAGAGCTAGCCAAAAACTTAATAGAGGAAATGCCTGTTGAGCCAAATGATGTC ATATGGAGAACGTTTCTCACCGCTTGTAGTCACCACAAGGAGTTTGAAACGGGAGAGCTT GTCGCAAAACACCTTATTTTGCAGGCTGGATATAACCCGAGCTCATATGTGCTACTCTCT AACATGTATGCTAGTTTTGGAATGTGGAAGGATGTTCGTAGAGTTAGAACGATGATGAAG GAAAGAAAGATAGAGAAAATTCCTGGTTGTAGTTGGATTGAGCTCGATGGAAGAGTCCAT GAGTTCTTTGTAGATAGCATTGAAGTTTCCAGTACATTGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	AT2G45350.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:18694816-18696657 REVERSE LENGTH=613 \| 201606
Sequence	MLVFKSTMECSISSTIHVLGSCKTSDDVNQIHGRLIKTGIIKNSNLTTRIVLAFASSRRP YLADFARCVFHEYHVCSFSFGEVEDPFLWNAVIKSHSHGKDPRQALLLLCLMLENGVSVD KFSLSLVLKACSRLGFVKGGMQIHGFLKKTGLWSDLFLQNCLIGLYLKCGCLGLSRQMFD RMPKRDSVSYNSMIDGYVKCGLIVSARELFDLMPMEMKNLISWNSMISGYAQTSDGVDIA SKLFADMPEKDLISWNSMIDGYVKHGRIEDAKGLFDVMPRRDVVTWATMIDGYAKLGFVH HAKTLFDQMPHRDVVAYNSMMAGYVQNKYHMEALEIFSDMEKESHLLPDDTTLVIVLPAI AQLGRLSKAIDMHLYIVEKQFYLGGKLGVALIDMYSKCGSIQHAMLVFEGIENKSIDHWN AMIGGLAIHGLGESAFDMLLQIERLSLKPDDITFVGVLNACSHSGLVKEGLLCFELMRRK HKIEPRLQHYGCMVDILSRSGSIELAKNLIEEMPVEPNDVIWRTFLTACSHHKEFETGEL VAKHLILQAGYNPSSYVLLSNMYASFGMWKDVRRVRTMMKERKIEKIPGCSWIELDGRVH EFFVDSIEVSSTL

Transcript Sequence

Transcript ID	AT2G45350.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:18694816-18696691 REVERSE LENGTH=1876 \| 201606
Sequence	CCGGTTCATCTCCAACAGAAGAACGTAATAACTGATGCTTGTCTTCAAGTCAACCATGGA GTGTTCGATTTCATCCACCATTCATGTCCTTGGAAGCTGCAAAACTTCAGATGACGTGAA CCAAATCCACGGGCGATTGATTAAGACGGGAATCATCAAAAACTCAAATCTCACTACGAG GATTGTTCTGGCTTTTGCCTCTTCTCGACGTCCGTATCTCGCCGATTTCGCGCGTTGTGT CTTCCACGAGTATCACGTATGTTCGTTTTCATTTGGAGAGGTGGAGGATCCATTTTTATG GAACGCCGTGATCAAGTCTCACTCTCATGGAAAGGATCCGAGACAAGCTCTGCTCTTGCT CTGTTTGATGCTCGAGAATGGGGTTTCCGTGGACAAATTCTCACTGTCACTTGTTCTTAA AGCGTGTTCGAGGTTAGGTTTTGTAAAAGGAGGAATGCAGATTCATGGGTTTTTGAAAAA AACTGGACTTTGGTCGGATTTGTTTCTACAGAATTGTTTGATTGGCTTGTATCTGAAATG TGGTTGTTTAGGTTTATCACGCCAGATGTTTGATAGAATGCCGAAGAGAGACTCTGTTTC TTATAATTCCATGATTGATGGGTATGTCAAATGTGGATTGATTGTATCCGCGCGTGAATT GTTCGATTTGATGCCTATGGAGATGAAGAATTTGATATCTTGGAACTCTATGATAAGTGG TTATGCTCAGACATCAGATGGAGTTGACATAGCGTCTAAACTGTTTGCTGATATGCCTGA GAAGGACTTGATTTCGTGGAACTCAATGATAGATGGATATGTAAAACACGGAAGAATCGA AGATGCTAAGGGTTTATTCGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTAGTTACTTGGGCTACCAT GATTGATGGGTATGCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCACGCTAAGACTCTGTTTGACCAAAT GCCTCATAGAGATGTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAAAACAAGTA TCACATGGAAGCTCTTGAAATATTTAGTGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTGTTACCCGA TGATACGACTTTGGTAATAGTTCTGCCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATTATCCAAAGC CATAGATATGCATTTGTACATCGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAAACTCGGTGT TGCTCTCATTGATATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTTGGTTTTCGA GGGAATCGAAAACAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCTCGCTATTCA TGGTCTAGGGGAATCTGCATTCGATATGCTCTTGCAGATTGAGAGACTCTCTTTAAAACC AGACGATATCACCTTTGTTGGCGTTTTAAATGCTTGCAGCCACTCTGGGTTAGTAAAGGA AGGCCTTCTCTGCTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAGATTGCAACA CTATGGTTGTATGGTAGACATACTATCGAGATCCGGAAGTATAGAGCTAGCCAAAAACTT AATAGAGGAAATGCCTGTTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACGTTTCTCACCGCTTG TAGTCACCACAAGGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCAAAACACCTTATTTTGCAGGC TGGATATAACCCGAGCTCATATGTGCTACTCTCTAACATGTATGCTAGTTTTGGAATGTG GAAGGATGTTCGTAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAAAATTCCTGG TTGTAGTTGGATTGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAGCATTGAAGT TTCCAGTACATTGTAG