Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT2G40720.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr2:16987269-16989851 FORWARD LENGTH=2583 \| 201606
Sequence	ATGCGTTTCAAGCTTCACGACGTTCACATTCGTCGGGGACTTTGTTGTGTAGCTGATTCT TACATTTCTCCGGCATCGATTAATTCAGGAATCAGAGCTCTAATTCAGAAAGGAGAGTAT CTACAAGCTCTGCATTTATACTCTAAGCATGATGGTTCTTCTCCTTTCTGGACTTCCGTT TTCACGTTTCCTTCTCTACTTAAAGCTTGCTCGGCTCTTACGAATCTCAGTTATGGGAAA ACCATTCATGGTTCGGTCGTCGTGTTGGGATGGCGATATGATCCTTTCATTGCAACCTCG CTTGTTAATATGTATGTAAAATGTGGGTTTTTAGATTATGCCGTCCAAGTGTTCGACGGT TGGTCTCAGAGTCAGAGTGGAGTTTCTGCTCGGGATGTTACTGTTTGGAACTCTATGATT GATGGGTACTTCAAATTTCGAAGATTTAAGGAAGGGGTTGGTTGTTTTCGTCGGATGCTG GTGTTTGGTGTAAGACCTGATGCTTTTTCCTTATCCATTGTTGTTAGTGTTATGTGTAAA GAAGGAAACTTTAGGCGGGAAGAAGGGAAACAGATTCATGGATTTATGTTAAGGAATTCG TTAGATACTGATTCGTTCTTGAAAACTGCTTTGATTGATATGTATTTCAAGTTTGGTTTA TCGATAGATGCGTGGAGAGTTTTTGTGGAGATTGAGGATAAATCGAATGTTGTACTATGG AATGTGATGATTGTAGGGTTTGGCGGTAGTGGGATCTGTGAATCTAGCTTGGATTTGTAT ATGCTTGCAAAGAATAACAGTGTCAAGCTTGTTTCCACTTCATTCACTGGAGCTCTTGGT GCGTGTAGTCAAAGTGAGAATTCTGGTTTCGGTAGGCAGATCCATTGCGACGTGGTGAAG ATGGGACTTCACAATGACCCGTATGTTTGTACTTCTCTACTGTCAATGTATTCAAAATGT GGTATGGTTGGTGAGGCAGAAACTGTCTTCAGTTGCGTTGTGGATAAAAGACTTGAGATA TGGAATGCTATGGTTGCAGCTTATGCAGAGAATGATTATGGGTACTCTGCTTTGGATTTG TTCGGTTTCATGAGGCAGAAAAGTGTCTTGCCTGATTCTTTTACCTTGTCGAATGTTATA TCCTGTTGCAGCGTATTGGGATTGTATAACTATGGCAAATCAGTCCACGCAGAACTGTTT AAGAGACCGATACAAAGTACGTCTACAATAGAGAGTGCTTTACTCACTCTGTATTCCAAG TGTGGATGTGATCCTGATGCTTACTTAGTCTTCAAATCAATGGAAGAAAAAGATATGGTT GCGTGGGGCTCCCTGATCTCAGGACTTTGCAAGAATGGGAAATTCAAAGAGGCTCTAAAA GTTTTTGGGGACATGAAAGATGATGATGATAGCTTGAAACCTGATTCTGATATTATGACG AGCGTTACAAACGCATGTGCTGGATTAGAGGCTCTCAGGTTTGGCCTTCAGGTTCATGGC AGCATGATTAAAACTGGGCTAGTGCTGAATGTTTTTGTTGGCAGCTCCCTTATTGATCTG TATTCTAAGTGTGGCTTACCAGAAATGGCTCTCAAAGTTTTCACTAGCATGAGCACGGAA AACATGGTTGCCTGGAATTCAATGATATCTTGCTACAGCCGAAACAACCTTCCAGAACTG TCGATTGACCTTTTCAATCTGATGCTCAGTCAAGGTATCTTCCCTGATTCAGTATCCATC ACAAGTGTCCTTGTAGCAATCTCATCGACTGCAAGCTTGCTAAAAGGGAAAAGTCTACAT GGTTATACATTAAGACTCGGCATTCCTTCGGATACTCACCTGAAAAACGCTTTGATTGAT ATGTATGTAAAATGCGGGTTTTCGAAGTATGCAGAGAACATCTTCAAGAAAATGCAGCAT AAGAGCTTGATCACTTGGAACCTAATGATATATGGGTATGGATCCCATGGAGATTGTATT ACAGCATTGAGTCTGTTCGATGAGATGAAAAAGGCAGGAGAATCGCCCGATGATGTAACA TTCCTGTCTCTGATTTCAGCCTGCAATCATTCCGGTTTTGTGGAGGAAGGGAAAAACATT TTTGAGTTCATGAAACAAGACTATGGAATCGAACCAAATATGGAACATTATGCAAATATG GTGGATCTTCTAGGACGTGCAGGTCTCCTCGAAGAAGCTTACAGTTTTATAAAAGCAATG CCTATTGAAGCAGACAGTAGCATATGGCTCTGCCTCTTATCTGCTTCAAGAACTCATCAT AATGTAGAACTTGGGATATTGTCTGCTGAGAAGTTGTTGAGAATGGAACCGGAAAGAGGC AGTACCTATGTTCAGCTAATCAATCTTTACATGGAAGCAGGATTGAAGAACGAAGCAGCA AAGCTGTTGGGTCTGATGAAGGAGAAAGGCTTGCATAAACAACCTGGTTGCAGTTGGATT GAAGTTAGCGATAGAACTAATGTTTTCTTTTCAGGAGGTTCATCTTCTCCAATGAAGGCT GAGATATTCAACGTATTGAATAGGTTAAAGAGTAATATGGTAGATGAGGACAAGGCAACT TGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT2G40720.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr2:16987269-16989851 FORWARD LENGTH=860 \| 201606
Sequence	MRFKLHDVHIRRGLCCVADSYISPASINSGIRALIQKGEYLQALHLYSKHDGSSPFWTSV FTFPSLLKACSALTNLSYGKTIHGSVVVLGWRYDPFIATSLVNMYVKCGFLDYAVQVFDG WSQSQSGVSARDVTVWNSMIDGYFKFRRFKEGVGCFRRMLVFGVRPDAFSLSIVVSVMCK EGNFRREEGKQIHGFMLRNSLDTDSFLKTALIDMYFKFGLSIDAWRVFVEIEDKSNVVLW NVMIVGFGGSGICESSLDLYMLAKNNSVKLVSTSFTGALGACSQSENSGFGRQIHCDVVK MGLHNDPYVCTSLLSMYSKCGMVGEAETVFSCVVDKRLEIWNAMVAAYAENDYGYSALDL FGFMRQKSVLPDSFTLSNVISCCSVLGLYNYGKSVHAELFKRPIQSTSTIESALLTLYSK CGCDPDAYLVFKSMEEKDMVAWGSLISGLCKNGKFKEALKVFGDMKDDDDSLKPDSDIMT SVTNACAGLEALRFGLQVHGSMIKTGLVLNVFVGSSLIDLYSKCGLPEMALKVFTSMSTE NMVAWNSMISCYSRNNLPELSIDLFNLMLSQGIFPDSVSITSVLVAISSTASLLKGKSLH GYTLRLGIPSDTHLKNALIDMYVKCGFSKYAENIFKKMQHKSLITWNLMIYGYGSHGDCI TALSLFDEMKKAGESPDDVTFLSLISACNHSGFVEEGKNIFEFMKQDYGIEPNMEHYANM VDLLGRAGLLEEAYSFIKAMPIEADSSIWLCLLSASRTHHNVELGILSAEKLLRMEPERG STYVQLINLYMEAGLKNEAAKLLGLMKEKGLHKQPGCSWIEVSDRTNVFFSGGSSSPMKA EIFNVLNRLKSNMVDEDKAT

Transcript Sequence

Transcript ID	AT2G40720.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr2:16987269-16989851 FORWARD LENGTH=2583 \| 201606
Sequence	ATGCGTTTCAAGCTTCACGACGTTCACATTCGTCGGGGACTTTGTTGTGTAGCTGATTCT TACATTTCTCCGGCATCGATTAATTCAGGAATCAGAGCTCTAATTCAGAAAGGAGAGTAT CTACAAGCTCTGCATTTATACTCTAAGCATGATGGTTCTTCTCCTTTCTGGACTTCCGTT TTCACGTTTCCTTCTCTACTTAAAGCTTGCTCGGCTCTTACGAATCTCAGTTATGGGAAA ACCATTCATGGTTCGGTCGTCGTGTTGGGATGGCGATATGATCCTTTCATTGCAACCTCG CTTGTTAATATGTATGTAAAATGTGGGTTTTTAGATTATGCCGTCCAAGTGTTCGACGGT TGGTCTCAGAGTCAGAGTGGAGTTTCTGCTCGGGATGTTACTGTTTGGAACTCTATGATT GATGGGTACTTCAAATTTCGAAGATTTAAGGAAGGGGTTGGTTGTTTTCGTCGGATGCTG GTGTTTGGTGTAAGACCTGATGCTTTTTCCTTATCCATTGTTGTTAGTGTTATGTGTAAA GAAGGAAACTTTAGGCGGGAAGAAGGGAAACAGATTCATGGATTTATGTTAAGGAATTCG TTAGATACTGATTCGTTCTTGAAAACTGCTTTGATTGATATGTATTTCAAGTTTGGTTTA TCGATAGATGCGTGGAGAGTTTTTGTGGAGATTGAGGATAAATCGAATGTTGTACTATGG AATGTGATGATTGTAGGGTTTGGCGGTAGTGGGATCTGTGAATCTAGCTTGGATTTGTAT ATGCTTGCAAAGAATAACAGTGTCAAGCTTGTTTCCACTTCATTCACTGGAGCTCTTGGT GCGTGTAGTCAAAGTGAGAATTCTGGTTTCGGTAGGCAGATCCATTGCGACGTGGTGAAG ATGGGACTTCACAATGACCCGTATGTTTGTACTTCTCTACTGTCAATGTATTCAAAATGT GGTATGGTTGGTGAGGCAGAAACTGTCTTCAGTTGCGTTGTGGATAAAAGACTTGAGATA TGGAATGCTATGGTTGCAGCTTATGCAGAGAATGATTATGGGTACTCTGCTTTGGATTTG TTCGGTTTCATGAGGCAGAAAAGTGTCTTGCCTGATTCTTTTACCTTGTCGAATGTTATA TCCTGTTGCAGCGTATTGGGATTGTATAACTATGGCAAATCAGTCCACGCAGAACTGTTT AAGAGACCGATACAAAGTACGTCTACAATAGAGAGTGCTTTACTCACTCTGTATTCCAAG TGTGGATGTGATCCTGATGCTTACTTAGTCTTCAAATCAATGGAAGAAAAAGATATGGTT GCGTGGGGCTCCCTGATCTCAGGACTTTGCAAGAATGGGAAATTCAAAGAGGCTCTAAAA GTTTTTGGGGACATGAAAGATGATGATGATAGCTTGAAACCTGATTCTGATATTATGACG AGCGTTACAAACGCATGTGCTGGATTAGAGGCTCTCAGGTTTGGCCTTCAGGTTCATGGC AGCATGATTAAAACTGGGCTAGTGCTGAATGTTTTTGTTGGCAGCTCCCTTATTGATCTG TATTCTAAGTGTGGCTTACCAGAAATGGCTCTCAAAGTTTTCACTAGCATGAGCACGGAA AACATGGTTGCCTGGAATTCAATGATATCTTGCTACAGCCGAAACAACCTTCCAGAACTG TCGATTGACCTTTTCAATCTGATGCTCAGTCAAGGTATCTTCCCTGATTCAGTATCCATC ACAAGTGTCCTTGTAGCAATCTCATCGACTGCAAGCTTGCTAAAAGGGAAAAGTCTACAT GGTTATACATTAAGACTCGGCATTCCTTCGGATACTCACCTGAAAAACGCTTTGATTGAT ATGTATGTAAAATGCGGGTTTTCGAAGTATGCAGAGAACATCTTCAAGAAAATGCAGCAT AAGAGCTTGATCACTTGGAACCTAATGATATATGGGTATGGATCCCATGGAGATTGTATT ACAGCATTGAGTCTGTTCGATGAGATGAAAAAGGCAGGAGAATCGCCCGATGATGTAACA TTCCTGTCTCTGATTTCAGCCTGCAATCATTCCGGTTTTGTGGAGGAAGGGAAAAACATT TTTGAGTTCATGAAACAAGACTATGGAATCGAACCAAATATGGAACATTATGCAAATATG GTGGATCTTCTAGGACGTGCAGGTCTCCTCGAAGAAGCTTACAGTTTTATAAAAGCAATG CCTATTGAAGCAGACAGTAGCATATGGCTCTGCCTCTTATCTGCTTCAAGAACTCATCAT AATGTAGAACTTGGGATATTGTCTGCTGAGAAGTTGTTGAGAATGGAACCGGAAAGAGGC AGTACCTATGTTCAGCTAATCAATCTTTACATGGAAGCAGGATTGAAGAACGAAGCAGCA AAGCTGTTGGGTCTGATGAAGGAGAAAGGCTTGCATAAACAACCTGGTTGCAGTTGGATT GAAGTTAGCGATAGAACTAATGTTTTCTTTTCAGGAGGTTCATCTTCTCCAATGAAGGCT GAGATATTCAACGTATTGAATAGGTTAAAGAGTAATATGGTAGATGAGGACAAGGCAACT TGA