Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT2G39620.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:16518968-16521478 REVERSE LENGTH=2511 \| 201606
Sequence	ATGCCAATTAACTACACTAACCTCCTCCTTATGCTCCGGGAATGTAAGAACTTCCGGTGT CTTCTTCAAGTTCACGGCAGCTTGATAGTCTCAGGTCTTAAACCTCATAACCAGCTCATA AACGCTTATTCTCTCTTTCAAAGACAGGACCTTTCTCGCGTCATCTTTGATTCAGTTCGA GATCCAGGTGTTGTCTTGTGGAATTCAATGATCAGAGGATACACGAGAGCCGGTTTGCAC AGAGAAGCTCTCGGATTCTTCGGGTATATGTCGGAGGAGAAAGGTATTGATCCAGACAAG TACAGTTTCACTTTTGCTTTGAAGGCTTGTGCCGGATCTATGGACTTTAAGAAGGGTTTA CGGATACATGATTTGATTGCTGAGATGGGTCTTGAGTCTGATGTTTATATAGGAACTGCG TTAGTTGAAATGTATTGTAAAGCTCGTGACTTGGTTTCTGCAAGACAAGTGTTCGATAAA ATGCATGTGAAGGATGTTGTTACTTGGAACACTATGGTTTCCGGGTTGGCTCAAAATGGA TGTTCTAGTGCAGCTTTGCTGTTGTTTCATGATATGCGTTCGTGTTGTGTTGACATTGAT CATGTTAGTTTATATAATCTGATCCCTGCGGTTTCGAAGCTAGAGAAGAGTGATGTCTGT AGATGTCTTCACGGACTTGTGATTAAGAAAGGTTTTATCTTTGCTTTCTCTAGTGGGCTG ATTGACATGTATTGCAACTGCGCGGATTTATATGCTGCTGAATCTGTTTTTGAAGAAGTG TGGAGGAAGGATGAGTCTTCATGGGGTACAATGATGGCAGCTTATGCACATAATGGGTTC TTTGAGGAGGTATTGGAGTTGTTTGACCTTATGAGAAACTATGATGTTAGAATGAATAAG GTAGCTGCAGCAAGTGCTCTTCAAGCTGCTGCATATGTAGGGGATTTAGTGAAGGGGATT GCAATTCATGATTACGCAGTGCAACAAGGATTGATCGGTGATGTCTCAGTTGCTACTTCT CTTATGAGTATGTATTCCAAATGTGGTGAGTTGGAGATAGCCGAACAACTGTTCATTAAT ATTGAAGATAGAGATGTTGTTTCTTGGTCTGCCATGATTGCGTCGTATGAGCAAGCAGGG CAACACGATGAGGCTATCTCTTTGTTTAGAGATATGATGAGAATACATATCAAGCCTAAT GCTGTAACTTTGACTAGTGTGCTACAAGGGTGTGCAGGAGTAGCCGCCTCTAGATTGGGT AAGAGCATACATTGTTATGCTATAAAGGCTGATATTGAGTCTGAGTTGGAAACTGCCACA GCTGTTATTTCAATGTACGCTAAATGTGGTCGATTTTCTCCCGCGCTCAAAGCCTTTGAA AGACTGCCAATTAAAGATGCTGTGGCATTCAACGCTCTAGCGCAAGGGTATACTCAGATT GGTGATGCCAATAAAGCATTTGATGTGTACAAGAACATGAAGTTACATGGTGTATGCCCA GACTCAAGAACTATGGTTGGTATGCTTCAAACTTGTGCCTTCTGTAGTGACTATGCTCGA GGTTCTTGTGTTTATGGACAAATTATAAAGCATGGGTTCGATTCAGAATGTCACGTGGCA CATGCTCTTATCAATATGTTCACCAAATGTGATGCCCTCGCTGCAGCGATAGTTTTGTTT GACAAGTGTGGATTCGAGAAAAGTACTGTATCTTGGAATATAATGATGAACGGGTACTTA CTCCATGGCCAGGCTGAAGAAGCTGTTGCCACTTTTCGTCAGATGAAGGTTGAGAAATTT CAGCCAAATGCAGTCACTTTTGTTAACATAGTACGCGCAGCAGCAGAATTATCAGCCTTG AGAGTAGGAATGTCGGTTCATTCCAGTCTCATTCAGTGTGGATTTTGTTCCCAAACACCA GTAGGAAACAGCCTTGTTGACATGTATGCGAAATGTGGAATGATAGAATCTTCCGAGAAA TGCTTTATTGAGATAAGCAACAAATACATAGTTTCATGGAACACTATGCTATCCGCTTAC GCAGCCCACGGTCTAGCAAGCTGTGCGGTCTCACTTTTCTTGTCCATGCAAGAAAACGAA CTCAAACCAGACTCTGTTTCCTTTCTCAGTGTTCTTTCAGCTTGTAGACACGCAGGGTTA GTCGAAGAAGGAAAACGAATTTTCGAGGAAATGGGAGAGAGACACAAGATCGAAGCAGAA GTTGAACATTACGCGTGTATGGTAGATCTATTAGGGAAGGCTGGTTTGTTTGGTGAAGCT GTGGAAATGATGAGAAGAATGAGAGTGAAAACAAGTGTAGGAGTATGGGGAGCTTTATTA AATTCTTCAAGAATGCATTGTAATTTGTGGTTAAGCAATGCTGCATTGTGTCAGCTTGTT AAACTTGAGCCACTAAATCCTTCTCATTATAGTCAAGATCGGAGATTAGGAGAGGTCAAT AATGTATCAAGAATTAAGAAAGTTCCTGCTTGTAGTTGGATAGAAGTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT2G39620.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:16518968-16521478 REVERSE LENGTH=836 \| 201606
Sequence	MPINYTNLLLMLRECKNFRCLLQVHGSLIVSGLKPHNQLINAYSLFQRQDLSRVIFDSVR DPGVVLWNSMIRGYTRAGLHREALGFFGYMSEEKGIDPDKYSFTFALKACAGSMDFKKGL RIHDLIAEMGLESDVYIGTALVEMYCKARDLVSARQVFDKMHVKDVVTWNTMVSGLAQNG CSSAALLLFHDMRSCCVDIDHVSLYNLIPAVSKLEKSDVCRCLHGLVIKKGFIFAFSSGL IDMYCNCADLYAAESVFEEVWRKDESSWGTMMAAYAHNGFFEEVLELFDLMRNYDVRMNK VAAASALQAAAYVGDLVKGIAIHDYAVQQGLIGDVSVATSLMSMYSKCGELEIAEQLFIN IEDRDVVSWSAMIASYEQAGQHDEAISLFRDMMRIHIKPNAVTLTSVLQGCAGVAASRLG KSIHCYAIKADIESELETATAVISMYAKCGRFSPALKAFERLPIKDAVAFNALAQGYTQI GDANKAFDVYKNMKLHGVCPDSRTMVGMLQTCAFCSDYARGSCVYGQIIKHGFDSECHVA HALINMFTKCDALAAAIVLFDKCGFEKSTVSWNIMMNGYLLHGQAEEAVATFRQMKVEKF QPNAVTFVNIVRAAAELSALRVGMSVHSSLIQCGFCSQTPVGNSLVDMYAKCGMIESSEK CFIEISNKYIVSWNTMLSAYAAHGLASCAVSLFLSMQENELKPDSVSFLSVLSACRHAGL VEEGKRIFEEMGERHKIEAEVEHYACMVDLLGKAGLFGEAVEMMRRMRVKTSVGVWGALL NSSRMHCNLWLSNAALCQLVKLEPLNPSHYSQDRRLGEVNNVSRIKKVPACSWIEV

Transcript Sequence

Transcript ID	AT2G39620.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:16518890-16521544 REVERSE LENGTH=2655 \| 201606
Sequence	TTCAAATTTAACGGTTTTTCCTATAAACCGCCAAAAAACTGCAAATGCATCCTCGTCGCC GGTGAAATGCCAATTAACTACACTAACCTCCTCCTTATGCTCCGGGAATGTAAGAACTTC CGGTGTCTTCTTCAAGTTCACGGCAGCTTGATAGTCTCAGGTCTTAAACCTCATAACCAG CTCATAAACGCTTATTCTCTCTTTCAAAGACAGGACCTTTCTCGCGTCATCTTTGATTCA GTTCGAGATCCAGGTGTTGTCTTGTGGAATTCAATGATCAGAGGATACACGAGAGCCGGT TTGCACAGAGAAGCTCTCGGATTCTTCGGGTATATGTCGGAGGAGAAAGGTATTGATCCA GACAAGTACAGTTTCACTTTTGCTTTGAAGGCTTGTGCCGGATCTATGGACTTTAAGAAG GGTTTACGGATACATGATTTGATTGCTGAGATGGGTCTTGAGTCTGATGTTTATATAGGA ACTGCGTTAGTTGAAATGTATTGTAAAGCTCGTGACTTGGTTTCTGCAAGACAAGTGTTC GATAAAATGCATGTGAAGGATGTTGTTACTTGGAACACTATGGTTTCCGGGTTGGCTCAA AATGGATGTTCTAGTGCAGCTTTGCTGTTGTTTCATGATATGCGTTCGTGTTGTGTTGAC ATTGATCATGTTAGTTTATATAATCTGATCCCTGCGGTTTCGAAGCTAGAGAAGAGTGAT GTCTGTAGATGTCTTCACGGACTTGTGATTAAGAAAGGTTTTATCTTTGCTTTCTCTAGT GGGCTGATTGACATGTATTGCAACTGCGCGGATTTATATGCTGCTGAATCTGTTTTTGAA GAAGTGTGGAGGAAGGATGAGTCTTCATGGGGTACAATGATGGCAGCTTATGCACATAAT GGGTTCTTTGAGGAGGTATTGGAGTTGTTTGACCTTATGAGAAACTATGATGTTAGAATG AATAAGGTAGCTGCAGCAAGTGCTCTTCAAGCTGCTGCATATGTAGGGGATTTAGTGAAG GGGATTGCAATTCATGATTACGCAGTGCAACAAGGATTGATCGGTGATGTCTCAGTTGCT ACTTCTCTTATGAGTATGTATTCCAAATGTGGTGAGTTGGAGATAGCCGAACAACTGTTC ATTAATATTGAAGATAGAGATGTTGTTTCTTGGTCTGCCATGATTGCGTCGTATGAGCAA GCAGGGCAACACGATGAGGCTATCTCTTTGTTTAGAGATATGATGAGAATACATATCAAG CCTAATGCTGTAACTTTGACTAGTGTGCTACAAGGGTGTGCAGGAGTAGCCGCCTCTAGA TTGGGTAAGAGCATACATTGTTATGCTATAAAGGCTGATATTGAGTCTGAGTTGGAAACT GCCACAGCTGTTATTTCAATGTACGCTAAATGTGGTCGATTTTCTCCCGCGCTCAAAGCC TTTGAAAGACTGCCAATTAAAGATGCTGTGGCATTCAACGCTCTAGCGCAAGGGTATACT CAGATTGGTGATGCCAATAAAGCATTTGATGTGTACAAGAACATGAAGTTACATGGTGTA TGCCCAGACTCAAGAACTATGGTTGGTATGCTTCAAACTTGTGCCTTCTGTAGTGACTAT GCTCGAGGTTCTTGTGTTTATGGACAAATTATAAAGCATGGGTTCGATTCAGAATGTCAC GTGGCACATGCTCTTATCAATATGTTCACCAAATGTGATGCCCTCGCTGCAGCGATAGTT TTGTTTGACAAGTGTGGATTCGAGAAAAGTACTGTATCTTGGAATATAATGATGAACGGG TACTTACTCCATGGCCAGGCTGAAGAAGCTGTTGCCACTTTTCGTCAGATGAAGGTTGAG AAATTTCAGCCAAATGCAGTCACTTTTGTTAACATAGTACGCGCAGCAGCAGAATTATCA GCCTTGAGAGTAGGAATGTCGGTTCATTCCAGTCTCATTCAGTGTGGATTTTGTTCCCAA ACACCAGTAGGAAACAGCCTTGTTGACATGTATGCGAAATGTGGAATGATAGAATCTTCC GAGAAATGCTTTATTGAGATAAGCAACAAATACATAGTTTCATGGAACACTATGCTATCC GCTTACGCAGCCCACGGTCTAGCAAGCTGTGCGGTCTCACTTTTCTTGTCCATGCAAGAA AACGAACTCAAACCAGACTCTGTTTCCTTTCTCAGTGTTCTTTCAGCTTGTAGACACGCA GGGTTAGTCGAAGAAGGAAAACGAATTTTCGAGGAAATGGGAGAGAGACACAAGATCGAA GCAGAAGTTGAACATTACGCGTGTATGGTAGATCTATTAGGGAAGGCTGGTTTGTTTGGT GAAGCTGTGGAAATGATGAGAAGAATGAGAGTGAAAACAAGTGTAGGAGTATGGGGAGCT TTATTAAATTCTTCAAGAATGCATTGTAATTTGTGGTTAAGCAATGCTGCATTGTGTCAG CTTGTTAAACTTGAGCCACTAAATCCTTCTCATTATAGTCAAGATCGGAGATTAGGAGAG GTCAATAATGTATCAAGAATTAAGAAAGTTCCTGCTTGTAGTTGGATAGAAGTCTGAGAA TACTCAATTCTTTTGATTCTTCTTCTCTATCTTTTACTGTATCAAAAAATCTTTCTAAGT ATAATTGAAATTGTG