Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT2G27660.1
CDS Infomation	\| Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein \| Chr2:11798694-11800850 REVERSE LENGTH=2157 \| 201606
Sequence	ATGGGGAAGCCAACGACTCAAAACAATAGCTTTATTAACCATTTCAGCCACCCCCACCGC CTTCAACTAACCCCGGCGACGTCATCACCACCGTGCTCCGCCTGCAAACTCACCGGAGGT AACGGCCGGGTTTACTCATGTAGGCCATGCAACTTCTCTCTCCATGAGTCGTGTAGCAAG ATGAAGCAGGTAATAACACATCCCTCTCACCCTTCGCATACGCTTAGCCTGCTCGTGGCT CCTGTCTACGATGGTGGATACTTCAACTGTGACGGTTGTGGCATCCACGGGACGGGTTTT AGTTACCAATGCTCTGTATGCGACTTCGACATCCACGCGCTTTGTGCTTACAAGCCGCTC TCAATCATCCACAAGTCTCATCCGCAACACAATCTTAAACTCGCGTTTCAATCTCCATAT GGCGCTAATAAAGGTTTCTCTTGCGACATCTGTCGTAAGATTGGGAAGAACCAGTGGCTT TACCGGTGCATCCCCTGCGAATTCGATGCTCATGTCGGTTGTATCACTGGTCCTAATCCT CACCTCCTTCAACATAGTACTTCCGCACCTAATCCTCATACTCATCATGCCGGTCACCCT CAACATCAAAACTCGCTTCCTGTGCCTAATCAAGGCAGTAACAGGGTCAGGCCCATGCCT ATGACAAGGCCCAATAGGACCATTAATCCTAATAGGCCTATAGCTCAAAACGCGGCTGTC AATGGACCAAGAAGACAGAACAACAACTTGGGTTATAATGCTCAGGTTGGGCCTAATGGA CCAAATGAACTTACTGGTCAAGGATCAATGGATGGGAGTGGTTACAATGGTAGTGCAAGT GCAACGAATAAAGAGTTTGATGTTGATGTCGATGTTGATGTTGATGTTGATGTTGATGTC GATGTCGATGTCGAGGTTGAATATGAAGGTGATGTGTATGTTGAAGAGGCTAATGACGAG GGAGAAGACGTTGATGGTAACGACGAGGGAGAAGATGTTGATGGTAACGGGCTTGAAATT GTGGCTTGTGTCGATAATTTAAGTGTTGCTTATAGTGAGAGTGATTTTGGAAGCAGTAGT GATGCTCGTAGCCAATGTAATGATTTGTCTGATGCTGATCTATATCCACTGTCTCTGGAT AACACACAAGGACCAAGACCGGTTCGTATGAACCAAGGCTCGGGTGGCGGAAGGAAGAAA AACACGAACCAGAATGGTCAGGCTTCTCGGTCTAAGAAAATAGTTGGTAATGGCCCACGT GGTGGGCTTCAAGGATCCAACAGTCCAATACAAAGCCCTAGAGGACCTCAAACTAGAAGG GTACAAAATGTTCGTAATAATCCAACAAGAGGTCGTGGTGGGGCTGTGAGTGTAAGAGTT AATAGACCTCGTGACCCATCTGCATTTATTGCACCTCAAGGATTTAATGGGCCGAGTGGT GGACCCTCCAATGCAATAGATAGTGGTGCCAACAATGATAACTACAACGAAGTCGAAGGC ACTGATGTCTATGTTGGTGAAGATAATGTTGGTTACGAGGAGAGTTATGGTGGTGGTGAT GGTGATTGTGACTTTGAAGTTGGAGGTGACTTCGGTGATGAGGGCTATGATCAGTCTTAT GATGACAATTATGGTGAAAATGATTTCGAAAGCTATAGCGACATCACTGGAGGAAGTGAG TCTATGTATGAAGATGGTGAATCTTACGGGACTATGAATGATTCACAATATAGTGGTTTC AATGAAGAGCCCAATAACCAGTATGCACCCATGGTTGGGCCGGTTGGTGGACCAGGAATG AATAACCAGAACCAATACGGTCAAAATGGTAGGCCGAGGAATGTGGGCATGTATGGAAGA GGTGGTACAAACATGAACAGATATGGGAACGTGAACCAAGGTGCAAATAGGATGCAACCG AGAACTATGGGTGGTCGACCTCTCCAATATAGGCCCAATGGAAGACCTAACATGGCAAAT GGAGGAGTACCCAATGGACCTCTAGGACTTGGCACTCCAATGTTGATGAATACAATGGTG CAAGGTTTATGCCAAAGCTTTGGGATGAACATGCTCATTGGTGGTGGCGGTGATGCTAAT GGTGGAGCGGGTGATGGTGGTGGAGGAGGCTTTTTTGGTGGTGAAACAGAATTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT2G27660.1
PEP Infomation	\| Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein \| Chr2:11798694-11800850 REVERSE LENGTH=718 \| 201606
Sequence	MGKPTTQNNSFINHFSHPHRLQLTPATSSPPCSACKLTGGNGRVYSCRPCNFSLHESCSK MKQVITHPSHPSHTLSLLVAPVYDGGYFNCDGCGIHGTGFSYQCSVCDFDIHALCAYKPL SIIHKSHPQHNLKLAFQSPYGANKGFSCDICRKIGKNQWLYRCIPCEFDAHVGCITGPNP HLLQHSTSAPNPHTHHAGHPQHQNSLPVPNQGSNRVRPMPMTRPNRTINPNRPIAQNAAV NGPRRQNNNLGYNAQVGPNGPNELTGQGSMDGSGYNGSASATNKEFDVDVDVDVDVDVDV DVDVEVEYEGDVYVEEANDEGEDVDGNDEGEDVDGNGLEIVACVDNLSVAYSESDFGSSS DARSQCNDLSDADLYPLSLDNTQGPRPVRMNQGSGGGRKKNTNQNGQASRSKKIVGNGPR GGLQGSNSPIQSPRGPQTRRVQNVRNNPTRGRGGAVSVRVNRPRDPSAFIAPQGFNGPSG GPSNAIDSGANNDNYNEVEGTDVYVGEDNVGYEESYGGGDGDCDFEVGGDFGDEGYDQSY DDNYGENDFESYSDITGGSESMYEDGESYGTMNDSQYSGFNEEPNNQYAPMVGPVGGPGM NNQNQYGQNGRPRNVGMYGRGGTNMNRYGNVNQGANRMQPRTMGGRPLQYRPNGRPNMAN GGVPNGPLGLGTPMLMNTMVQGLCQSFGMNMLIGGGGDANGGAGDGGGGGFFGGETEF

Transcript Sequence

Transcript ID	AT2G27660.1
Transcript Infomation	\| Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein \| Chr2:11798417-11800928 REVERSE LENGTH=2512 \| 201606
Sequence	ATTAACTCTTGAGTTGTGTTTCTGATCACAAGAACAATCTCATTTCTAAGACAAAAACCA AAGAAAAAAATACAAAAAATGGGGAAGCCAACGACTCAAAACAATAGCTTTATTAACCAT TTCAGCCACCCCCACCGCCTTCAACTAACCCCGGCGACGTCATCACCACCGTGCTCCGCC TGCAAACTCACCGGAGGTAACGGCCGGGTTTACTCATGTAGGCCATGCAACTTCTCTCTC CATGAGTCGTGTAGCAAGATGAAGCAGGTAATAACACATCCCTCTCACCCTTCGCATACG CTTAGCCTGCTCGTGGCTCCTGTCTACGATGGTGGATACTTCAACTGTGACGGTTGTGGC ATCCACGGGACGGGTTTTAGTTACCAATGCTCTGTATGCGACTTCGACATCCACGCGCTT TGTGCTTACAAGCCGCTCTCAATCATCCACAAGTCTCATCCGCAACACAATCTTAAACTC GCGTTTCAATCTCCATATGGCGCTAATAAAGGTTTCTCTTGCGACATCTGTCGTAAGATT GGGAAGAACCAGTGGCTTTACCGGTGCATCCCCTGCGAATTCGATGCTCATGTCGGTTGT ATCACTGGTCCTAATCCTCACCTCCTTCAACATAGTACTTCCGCACCTAATCCTCATACT CATCATGCCGGTCACCCTCAACATCAAAACTCGCTTCCTGTGCCTAATCAAGGCAGTAAC AGGGTCAGGCCCATGCCTATGACAAGGCCCAATAGGACCATTAATCCTAATAGGCCTATA GCTCAAAACGCGGCTGTCAATGGACCAAGAAGACAGAACAACAACTTGGGTTATAATGCT CAGGTTGGGCCTAATGGACCAAATGAACTTACTGGTCAAGGATCAATGGATGGGAGTGGT TACAATGGTAGTGCAAGTGCAACGAATAAAGAGTTTGATGTTGATGTCGATGTTGATGTT GATGTTGATGTTGATGTCGATGTCGATGTCGAGGTTGAATATGAAGGTGATGTGTATGTT GAAGAGGCTAATGACGAGGGAGAAGACGTTGATGGTAACGACGAGGGAGAAGATGTTGAT GGTAACGGGCTTGAAATTGTGGCTTGTGTCGATAATTTAAGTGTTGCTTATAGTGAGAGT GATTTTGGAAGCAGTAGTGATGCTCGTAGCCAATGTAATGATTTGTCTGATGCTGATCTA TATCCACTGTCTCTGGATAACACACAAGGACCAAGACCGGTTCGTATGAACCAAGGCTCG GGTGGCGGAAGGAAGAAAAACACGAACCAGAATGGTCAGGCTTCTCGGTCTAAGAAAATA GTTGGTAATGGCCCACGTGGTGGGCTTCAAGGATCCAACAGTCCAATACAAAGCCCTAGA GGACCTCAAACTAGAAGGGTACAAAATGTTCGTAATAATCCAACAAGAGGTCGTGGTGGG GCTGTGAGTGTAAGAGTTAATAGACCTCGTGACCCATCTGCATTTATTGCACCTCAAGGA TTTAATGGGCCGAGTGGTGGACCCTCCAATGCAATAGATAGTGGTGCCAACAATGATAAC TACAACGAAGTCGAAGGCACTGATGTCTATGTTGGTGAAGATAATGTTGGTTACGAGGAG AGTTATGGTGGTGGTGATGGTGATTGTGACTTTGAAGTTGGAGGTGACTTCGGTGATGAG GGCTATGATCAGTCTTATGATGACAATTATGGTGAAAATGATTTCGAAAGCTATAGCGAC ATCACTGGAGGAAGTGAGTCTATGTATGAAGATGGTGAATCTTACGGGACTATGAATGAT TCACAATATAGTGGTTTCAATGAAGAGCCCAATAACCAGTATGCACCCATGGTTGGGCCG GTTGGTGGACCAGGAATGAATAACCAGAACCAATACGGTCAAAATGGTAGGCCGAGGAAT GTGGGCATGTATGGAAGAGGTGGTACAAACATGAACAGATATGGGAACGTGAACCAAGGT GCAAATAGGATGCAACCGAGAACTATGGGTGGTCGACCTCTCCAATATAGGCCCAATGGA AGACCTAACATGGCAAATGGAGGAGTACCCAATGGACCTCTAGGACTTGGCACTCCAATG TTGATGAATACAATGGTGCAAGGTTTATGCCAAAGCTTTGGGATGAACATGCTCATTGGT GGTGGCGGTGATGCTAATGGTGGAGCGGGTGATGGTGGTGGAGGAGGCTTTTTTGGTGGT GAAACAGAATTCTAAAAGAGATGAAAAATGGATATTACGAAATTTAAATGTTTTTATTTC ATTACGTATTGTTTTTTTATGTAAGCTTGTTTTTCTTATTTATTTTCCTCTTCTTATTTC TTAAATGTAAGAGCAATTTCAGAGGCCACAATCTGGCTGACCTGACCATGCTCACATACC AAATAAGAAAAGTGCAACATATATACTTGTCATGGCTATATTTACAAAATAACTACATCA CCTCATCATATCTATAACCATATTCTTATACCATCACAACATCTCATGCTTA