Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT2G17370.1
CDS Infomation	\| 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase 2 \| Chr2:7550007-7551981 FORWARD LENGTH=1689 \| 201606
Sequence	ATGGAGGATCTCCGTCGTAGATTTCCGACTAAAAAGAACGGAGAAGAAATCTCTAATGTC GCCGTCGATCCTCCTCTTCGTAAAGCCTCTGACGCGCTTCCTCTTCCGTTATACCTAACC AACACTTTTTTCCTCTCGCTCTTCTTCGCTACTGTTTATTTTCTTCTTAGCCGATGGCGT GAGAAGATCCGTAACTCGACGCCTCTTCACGTCGTTGACTTATCTGAGATCTGTGCTCTA ATCGGTTTCGTTGCTTCGTTTATCTACCTCCTTGGTTTCTGTGGTATTGATCTCATTTTC CGATCTTCTTCCGATGATGATGTTTGGGTTAACGATGGGATGATTCCATGTAATCAATCC CTAGATTGTCGTGAGGTTCTTCCGATTAAACCTAATTCCGTCGATCCTCCTCGGGAATCG GAGCTTGATTCGGTGGAAGATGAAGAAATCGTTAAATTAGTGATCGACGGAACCATCCCT TCGTACTCATTGGAGACGAAACTCGGAGATTGTAAAAGAGCAGCAGCGATTAGAAGAGAA GCGGTTCAGAGGATAACCGGTAAATCCTTAACCGGTCTTCCATTGGAAGGTTTCGATTAC AATTCAATTTTGGGGCAATGCTGTGAGATGCCAGTTGGGTATGTTCAGATCCCAGTGGGG ATTGCAGGACCTTTGTTGCTTGATGGGGTTGAGTATTCAGTGCCAATGGCTACAACAGAA GGTTGTTTGGTTGCTAGTACCAATAGAGGTTTTAAAGCTATACACTTGTCTGGTGGTGCT TTTAGTGTTCTTGTGAAAGATGCCATGACTAGAGCTCCAGTTGTTAGATTCCCTTCTGCA AGAAGAGCTGCTCTTGTCATGTTTTATCTTCAAGATCCTTCTAATTTCGAGAGATTGTCT CTCATTTTCAACAAATCGAGTAGATTTGCTAGGCTTCAGAGTATTACATGCACGATTGCT GGGAGGAATCTGTATCCGAGGTTTGCGTGTAGTACTGGTGATGCTATGGGGATGAACATG GTCTCAAAAGGTGTTCAGAATGTCTTGGACTTTGTAAAGAGCGAGTTTCCTGACATGGAT GTTATTGGCATCTCTGGGAACTACTGTTCGGACAAGAAGGCTTCGGCTGTAAACTGGATC GAAGGACGTGGTAAGCATGTTGTATGTGAAGCTTTTATTAAGGCTGAGATTGTGGAGAAA GTGTTGAAGACTAGCGTTGAGGCTCTTGTAGAGCTTAACACGCTCAAGAATCTTGTTGGT TCAGCCATGGCGGGTTCTCTTGGTGGGTTCAATGCTCATTCAAGCAATATTGTCAGCGCT GTGTTCATCGCCACTGGCCAAGACCCAGCTCAAAACGTGGAGAGCTCACACTGTATGACC ATGATTCTTCCCGATGGTGACGACCTTCACATCTCTGTTTCAATGCCTTGCATTGAGGTT GGTACTGTTGGAGGTGGGACACAACTTGCATCACAAGCAGCTTGTTTGAATCTACTCGGT GTGAAAGGATCAAACAACGAGAAACCTGGCTCGAACGCACAGCAATTGGCAAGAATAGTG GCTGGTTCGGTTCTTGCAGGAGAGCTTTCACTAATGTCTGCTATTGCAGCTGGACAGCTT GTGAAGAGTCACATGAAATACAACAGATCCAGCAGAGACATTGGCCCTTCGTCTCAAGTC AACAGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT2G17370.1
PEP Infomation	\| 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase 2 \| Chr2:7550007-7551981 FORWARD LENGTH=562 \| 201606
Sequence	MEDLRRRFPTKKNGEEISNVAVDPPLRKASDALPLPLYLTNTFFLSLFFATVYFLLSRWR EKIRNSTPLHVVDLSEICALIGFVASFIYLLGFCGIDLIFRSSSDDDVWVNDGMIPCNQS LDCREVLPIKPNSVDPPRESELDSVEDEEIVKLVIDGTIPSYSLETKLGDCKRAAAIRRE AVQRITGKSLTGLPLEGFDYNSILGQCCEMPVGYVQIPVGIAGPLLLDGVEYSVPMATTE GCLVASTNRGFKAIHLSGGAFSVLVKDAMTRAPVVRFPSARRAALVMFYLQDPSNFERLS LIFNKSSRFARLQSITCTIAGRNLYPRFACSTGDAMGMNMVSKGVQNVLDFVKSEFPDMD VIGISGNYCSDKKASAVNWIEGRGKHVVCEAFIKAEIVEKVLKTSVEALVELNTLKNLVG SAMAGSLGGFNAHSSNIVSAVFIATGQDPAQNVESSHCMTMILPDGDDLHISVSMPCIEV GTVGGGTQLASQAACLNLLGVKGSNNEKPGSNAQQLARIVAGSVLAGELSLMSAIAAGQL VKSHMKYNRSSRDIGPSSQVNR

Transcript Sequence

Transcript ID	AT2G17370.1
Transcript Infomation	\| 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase 2 \| Chr2:7549702-7552260 FORWARD LENGTH=2273 \| 201606
Sequence	AATGTGTTGAAAAAAAGAATCAAAAGTAACAAAAACCATAACCCTAAATAATCATCCCAA AAGTGGAAATAATAAAAGAAGCAGTTAGATTGTGACGGAGGAGACAAAATCATCATCTCT GTTCTTCTTCTTCTCCTCTCTCACATACGATGATGACCCAACAACCTTGACGTTGATTTC GATGTCACACACAACACTATAAATAACACTCTTCACCTATTTTTGTCATCTCACACTTTG GACTTTGGAGCCCAAAATAATCTCATAACCATTAAAAACAAATCTCCTCCTTCTCTCCGG CGTCAATGGAGGATCTCCGTCGTAGATTTCCGACTAAAAAGAACGGAGAAGAAATCTCTA ATGTCGCCGTCGATCCTCCTCTTCGTAAAGCCTCTGACGCGCTTCCTCTTCCGTTATACC TAACCAACACTTTTTTCCTCTCGCTCTTCTTCGCTACTGTTTATTTTCTTCTTAGCCGAT GGCGTGAGAAGATCCGTAACTCGACGCCTCTTCACGTCGTTGACTTATCTGAGATCTGTG CTCTAATCGGTTTCGTTGCTTCGTTTATCTACCTCCTTGGTTTCTGTGGTATTGATCTCA TTTTCCGATCTTCTTCCGATGATGATGTTTGGGTTAACGATGGGATGATTCCATGTAATC AATCCCTAGATTGTCGTGAGGTTCTTCCGATTAAACCTAATTCCGTCGATCCTCCTCGGG AATCGGAGCTTGATTCGGTGGAAGATGAAGAAATCGTTAAATTAGTGATCGACGGAACCA TCCCTTCGTACTCATTGGAGACGAAACTCGGAGATTGTAAAAGAGCAGCAGCGATTAGAA GAGAAGCGGTTCAGAGGATAACCGGTAAATCCTTAACCGGTCTTCCATTGGAAGGTTTCG ATTACAATTCAATTTTGGGGCAATGCTGTGAGATGCCAGTTGGGTATGTTCAGATCCCAG TGGGGATTGCAGGACCTTTGTTGCTTGATGGGGTTGAGTATTCAGTGCCAATGGCTACAA CAGAAGGTTGTTTGGTTGCTAGTACCAATAGAGGTTTTAAAGCTATACACTTGTCTGGTG GTGCTTTTAGTGTTCTTGTGAAAGATGCCATGACTAGAGCTCCAGTTGTTAGATTCCCTT CTGCAAGAAGAGCTGCTCTTGTCATGTTTTATCTTCAAGATCCTTCTAATTTCGAGAGAT TGTCTCTCATTTTCAACAAATCGAGTAGATTTGCTAGGCTTCAGAGTATTACATGCACGA TTGCTGGGAGGAATCTGTATCCGAGGTTTGCGTGTAGTACTGGTGATGCTATGGGGATGA ACATGGTCTCAAAAGGTGTTCAGAATGTCTTGGACTTTGTAAAGAGCGAGTTTCCTGACA TGGATGTTATTGGCATCTCTGGGAACTACTGTTCGGACAAGAAGGCTTCGGCTGTAAACT GGATCGAAGGACGTGGTAAGCATGTTGTATGTGAAGCTTTTATTAAGGCTGAGATTGTGG AGAAAGTGTTGAAGACTAGCGTTGAGGCTCTTGTAGAGCTTAACACGCTCAAGAATCTTG TTGGTTCAGCCATGGCGGGTTCTCTTGGTGGGTTCAATGCTCATTCAAGCAATATTGTCA GCGCTGTGTTCATCGCCACTGGCCAAGACCCAGCTCAAAACGTGGAGAGCTCACACTGTA TGACCATGATTCTTCCCGATGGTGACGACCTTCACATCTCTGTTTCAATGCCTTGCATTG AGGTTGGTACTGTTGGAGGTGGGACACAACTTGCATCACAAGCAGCTTGTTTGAATCTAC TCGGTGTGAAAGGATCAAACAACGAGAAACCTGGCTCGAACGCACAGCAATTGGCAAGAA TAGTGGCTGGTTCGGTTCTTGCAGGAGAGCTTTCACTAATGTCTGCTATTGCAGCTGGAC AGCTTGTGAAGAGTCACATGAAATACAACAGATCCAGCAGAGACATTGGCCCTTCGTCTC AAGTCAACAGGTGATGTTTGGAGCACGATGAGACGGATAATAATAAAACAACAAAAACCC ATAATTAGATTTGATGTAATTCTAACTTCATTTGATTTCTTCTTCATCGATCTCTTTTCT TTTCTATCTATTTTGTACTAAGTCTCCAAATTTTCTTAATTTATGTAAAGTCTTTTGTCC TTCCATCTTTATGGCTTATATTAATATCATAGCTTAGCATCAAAATGTGTAATTAAATTG CGGTTTAAGCTTTAAAGCCATGATTTTTTTTTCTAACATTGAATAGATTATTG