Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT2G17200.1
CDS Infomation	\| ubiquitin family protein \| Chr2:7482133-7485090 REVERSE LENGTH=1656 \| 201606
Sequence	ATGGGTGGAGAGGGAGATTCAAGTCAGCCGCAGAGTGGTGAAGGAGAAGCTGTGGCTGTG AACATCAGGTGCTCTAATGGCACGAAATTTAGTGTGAAGACGAGTCTCGATTCAACGGTG GAGTCTTTCAAAGAGTTGGTGGCTCAGAGCAGCGATGTTCCAGCTAATCAGCAGCGCTTG ATTTACAAGGGTCGTATCCTCAAGGACGATCAAACTCTCCTCAGCTATGGTTTGCAGGCT GATCACACCATTCATATGGTTAGAGGCTCTGCACCTTCTTCAGCACCACCTCCTGCTCCG GCCGCAAGCCAAACCACTGCACCTAGTGTTACTCGAGGGGTTGGTTCAGATAATAGCTCG AATCTAGGAGGAGCGAGTCCTGGGGAATCTTTGTTCCCTGGGCTTGGATTTAATCCTCTG GGTGGTGGAAATGCTATGTCTGGGTTATTTGGAGCTGGTCTTCCGGATCTTGTGCAGACA CAGCAACAACTAGCTCAAAACCCTAACATGATTAGAGATATGATGAATACTCCAGCCATC CAGAACCTTATGAACAACCCAGAGTTTATGAGGAGTATGATTATGAATAACCCTCAAATG CGTGAGCTTGTAGATCGCAATCCTGAGCTTGGTCATGTGCTCAATGACCCAAGCATCCTT CGTCAAACTCTAGAAGCGGCAAGAAACCCAGAGCTTATGCGTGAAATGATGCGGAATACT GATAGGGCTATGAGTAATATTGAGTCTATGCCTGAGGGATTTAACATGCTTAGGCGTATG TATGAAAATGTCCAGGAACCGTTAATGAATGCTACCACTATGTCCGGGAATGCTGGAAAC AATACAGGCTCCAATCCATTTGCTGCTCTGTTGGGAAACCAGGGGGTCACTACGCAAGGA AGTGATGCTTCTAATAATTCTTCGACACCAAATGCTGGAACGGGGACTATTCCGAATGCA AATCCACTTCCTAATCCTTGGGGTGCTACAGGTGGTCAGACAACTGCCCCTGGAAGGACA AATGTTGGTGGGGATGCGAGGAGCCCTGGACTTGGTGGCCTTGGTGGTCTTGGAAGCCTT GGAGGCCTTGGTGGACTCGGTATGCTTGGAGCGGATTCACCTCTTGGTGCGACTCCAGAT GCTTCTCAATTGAGCCAGTTATTGCAAAACCCAGCCATATCGCAGATGATGCAAAGCGTA TTTTCCAATCCACAATACATGAATCAGCTTATGAGTCTTAACCCACAACTCCGAAGCATG CTAGATTCGAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGAACCCAGATTTCCTTCGTCAGTTT AGTTCTCCGGAGATGATGCAGCAAATGATGACTCTACAGCAATCACTATCTCAGAATAGA AATACAGCCAGCCAGGATGCGGGGCAAACTGGTGCTGCCACAGGAAATAACGGGGGGCTG GATTTATTGATGAATATGTTTGGCAGTCTTGGTGCTGGCGGCCTGAGTGGCACGAACCAA TCCAATGTTCCTCCTGAAGAGCGGTACGCTACTCAATTGCAACAGTTGCAGGAAATGGGA TTCTATGACAGAGCAGAGAACATTAGGGCGTTGCTTGCAACCAATGGTAACGTTAACGCT GCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATCGGACAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	AT2G17200.1
PEP Infomation	\| ubiquitin family protein \| Chr2:7482133-7485090 REVERSE LENGTH=551 \| 201606
Sequence	MGGEGDSSQPQSGEGEAVAVNIRCSNGTKFSVKTSLDSTVESFKELVAQSSDVPANQQRL IYKGRILKDDQTLLSYGLQADHTIHMVRGSAPSSAPPPAPAASQTTAPSVTRGVGSDNSS NLGGASPGESLFPGLGFNPLGGGNAMSGLFGAGLPDLVQTQQQLAQNPNMIRDMMNTPAI QNLMNNPEFMRSMIMNNPQMRELVDRNPELGHVLNDPSILRQTLEAARNPELMREMMRNT DRAMSNIESMPEGFNMLRRMYENVQEPLMNATTMSGNAGNNTGSNPFAALLGNQGVTTQG SDASNNSSTPNAGTGTIPNANPLPNPWGATGGQTTAPGRTNVGGDARSPGLGGLGGLGSL GGLGGLGMLGADSPLGATPDASQLSQLLQNPAISQMMQSVFSNPQYMNQLMSLNPQLRSM LDSNPQLREMMQNPDFLRQFSSPEMMQQMMTLQQSLSQNRNTASQDAGQTGAATGNNGGL DLLMNMFGSLGAGGLSGTNQSNVPPEERYATQLQQLQEMGFYDRAENIRALLATNGNVNA AVERLLGSIGQ

Transcript Sequence

Transcript ID	AT2G17200.1
Transcript Infomation	\| ubiquitin family protein \| Chr2:7481881-7485240 REVERSE LENGTH=2058 \| 201606
Sequence	TCTCTTCGATCCATTTCGTCAAGCAATCTACCGAACCGACTCAGAGCTTTTGAGTCTTCT AAATCTCTATCGAATTTTTCTAGGGTTAGGGCTCCTGATCGATTTCGCGAGCTCTGCGAT TATTTTAAGTATTAGGATCCGAAATTAGAAATGGGTGGAGAGGGAGATTCAAGTCAGCCG CAGAGTGGTGAAGGAGAAGCTGTGGCTGTGAACATCAGGTGCTCTAATGGCACGAAATTT AGTGTGAAGACGAGTCTCGATTCAACGGTGGAGTCTTTCAAAGAGTTGGTGGCTCAGAGC AGCGATGTTCCAGCTAATCAGCAGCGCTTGATTTACAAGGGTCGTATCCTCAAGGACGAT CAAACTCTCCTCAGCTATGGTTTGCAGGCTGATCACACCATTCATATGGTTAGAGGCTCT GCACCTTCTTCAGCACCACCTCCTGCTCCGGCCGCAAGCCAAACCACTGCACCTAGTGTT ACTCGAGGGGTTGGTTCAGATAATAGCTCGAATCTAGGAGGAGCGAGTCCTGGGGAATCT TTGTTCCCTGGGCTTGGATTTAATCCTCTGGGTGGTGGAAATGCTATGTCTGGGTTATTT GGAGCTGGTCTTCCGGATCTTGTGCAGACACAGCAACAACTAGCTCAAAACCCTAACATG ATTAGAGATATGATGAATACTCCAGCCATCCAGAACCTTATGAACAACCCAGAGTTTATG AGGAGTATGATTATGAATAACCCTCAAATGCGTGAGCTTGTAGATCGCAATCCTGAGCTT GGTCATGTGCTCAATGACCCAAGCATCCTTCGTCAAACTCTAGAAGCGGCAAGAAACCCA GAGCTTATGCGTGAAATGATGCGGAATACTGATAGGGCTATGAGTAATATTGAGTCTATG CCTGAGGGATTTAACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTCCAGGAACCGTTAATGAAT GCTACCACTATGTCCGGGAATGCTGGAAACAATACAGGCTCCAATCCATTTGCTGCTCTG TTGGGAAACCAGGGGGTCACTACGCAAGGAAGTGATGCTTCTAATAATTCTTCGACACCA AATGCTGGAACGGGGACTATTCCGAATGCAAATCCACTTCCTAATCCTTGGGGTGCTACA GGTGGTCAGACAACTGCCCCTGGAAGGACAAATGTTGGTGGGGATGCGAGGAGCCCTGGA CTTGGTGGCCTTGGTGGTCTTGGAAGCCTTGGAGGCCTTGGTGGACTCGGTATGCTTGGA GCGGATTCACCTCTTGGTGCGACTCCAGATGCTTCTCAATTGAGCCAGTTATTGCAAAAC CCAGCCATATCGCAGATGATGCAAAGCGTATTTTCCAATCCACAATACATGAATCAGCTT ATGAGTCTTAACCCACAACTCCGAAGCATGCTAGATTCGAATCCTCAGTTGAGGGAAATG ATGCAGAACCCAGATTTCCTTCGTCAGTTTAGTTCTCCGGAGATGATGCAGCAAATGATG ACTCTACAGCAATCACTATCTCAGAATAGAAATACAGCCAGCCAGGATGCGGGGCAAACT GGTGCTGCCACAGGAAATAACGGGGGGCTGGATTTATTGATGAATATGTTTGGCAGTCTT GGTGCTGGCGGCCTGAGTGGCACGAACCAATCCAATGTTCCTCCTGAAGAGCGGTACGCT ACTCAATTGCAACAGTTGCAGGAAATGGGATTCTATGACAGAGCAGAGAACATTAGGGCG TTGCTTGCAACCAATGGTAACGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATCGGA CAGTAGCATACAGGTTCATGAACTGATGTCTCTCCATCTGGCTTCTCAGTTATAGAATAA ACAGCTTGAATGTGTGTTTTTCAGTAATGATATATTCATCGAATTCATAAAAATTTATAT ATGATAGGATCGTGAACTTTGTTGATAGAAAAGCCGCATCAATACGGTATTTGTTATCAG TGGTCACTCTTCGTCTTTAACTACCCTTAAACCTATATATCTTGGGTGTTTATCTTTGAT AACTTATTTCAAGTTGTT