Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT2G13600.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:5671493-5673586 FORWARD LENGTH=2094 \| 201606
Sequence	ATGGCAACAAAATCATTTCTCAAACTCGCTGCTGATCTCTCTTCTTTCACCGATTCTTCA CCATTCGCAAAGCTTCTTGATTCATGCATCAAATCCAAGTTATCAGCAATCTACGTCCGT TATGTCCATGCTTCTGTCATCAAATCAGGTTTCTCCAATGAAATATTTATACAGAATCGG CTCATCGACGCTTATTCGAAATGTGGGTCACTCGAGGATGGTCGCCAAGTGTTCGACAAA ATGCCTCAACGAAATATCTACACTTGGAACTCTGTTGTGACGGGTTTGACAAAGTTAGGA TTTTTAGATGAAGCTGATTCTTTATTCAGGTCAATGCCTGAACGTGATCAATGTACTTGG AATTCTATGGTTTCGGGTTTTGCGCAACATGATAGGTGTGAAGAGGCTTTGTGTTATTTT GCTATGATGCATAAGGAAGGGTTTGTGCTTAATGAATATAGTTTTGCTAGTGTTCTTAGT GCTTGTTCTGGTTTGAATGATATGAATAAGGGTGTACAAGTACATTCTTTGATTGCGAAA TCGCCTTTTTTGTCAGATGTGTATATAGGTTCTGCTCTTGTTGACATGTATTCCAAATGC GGTAATGTAAATGATGCTCAGAGGGTTTTTGATGAGATGGGTGATAGAAATGTTGTTTCT TGGAATAGTTTGATTACATGTTTTGAACAAAATGGTCCTGCGGTGGAAGCTCTCGATGTT TTTCAAATGATGTTAGAATCTAGGGTTGAGCCAGATGAGGTTACTTTAGCTAGTGTGATT AGTGCCTGTGCAAGCTTGTCGGCGATTAAGGTTGGTCAGGAAGTTCATGGCCGTGTTGTT AAAAACGATAAGTTGAGGAATGATATAATTCTAAGCAATGCGTTTGTGGATATGTATGCA AAGTGCAGCAGGATAAAAGAAGCTAGGTTTATATTTGATAGCATGCCTATCAGAAATGTT ATTGCAGAAACCTCCATGATCAGTGGGTACGCAATGGCTGCAAGCACTAAGGCGGCTAGA CTCATGTTTACCAAAATGGCGGAGAGGAATGTTGTTTCATGGAATGCGCTTATTGCTGGC TATACGCAGAACGGAGAAAACGAAGAAGCACTTAGTCTCTTTTGTCTCTTGAAGAGGGAA TCAGTATGCCCAACTCACTATTCCTTTGCTAATATCCTCAAGGCATGTGCAGATCTTGCA GAGTTACATCTCGGTATGCAGGCTCACGTGCATGTCTTGAAGCATGGCTTTAAGTTTCAA TCTGGTGAAGAAGATGATATATTTGTTGGCAATTCCTTGATAGATATGTATGTGAAATGT GGTTGTGTAGAAGAGGGTTATCTTGTATTCAGGAAGATGATGGAAAGAGATTGTGTTTCC TGGAACGCGATGATTATTGGATTTGCACAAAATGGTTATGGAAATGAGGCTCTTGAGTTG TTCAGAGAAATGCTTGAGTCTGGAGAAAAACCAGATCACATTACCATGATTGGTGTTCTT TCTGCATGCGGGCATGCTGGATTTGTTGAAGAAGGGCGGCACTACTTTTCTTCTATGACC AGAGATTTTGGTGTGGCTCCGCTTAGGGATCACTATACTTGCATGGTCGATTTGCTTGGT CGAGCTGGATTTCTCGAAGAAGCAAAGAGCATGATTGAGGAGATGCCTATGCAACCAGAT TCTGTTATATGGGGTTCTTTGCTTGCTGCTTGTAAAGTACATAGGAACATTACGTTAGGT AAATACGTTGCAGAGAAGCTTTTAGAAGTAGAGCCGTCAAATTCAGGACCATATGTTCTT CTTTCTAACATGTACGCTGAGCTCGGAAAATGGGAGGATGTGATGAATGTACGAAAGTCG ATGAGGAAAGAGGGAGTCACAAAGCAGCCAGGGTGTAGTTGGATAAAGATACAAGGACAT GATCATGTTTTCATGGTTAAAGATAAAAGCCATCCTCGAAAAAAGCAGATACACTCGCTT CTTGATATTTTAATAGCCGAGATGAGACCGGAACAAGATCATACTGAAATAGGATCACTC TCGTCCGAGGAAATGGATTATTCATCTAATCTTCTTTGGGACAACGCCATGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT2G13600.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:5671493-5673586 FORWARD LENGTH=697 \| 201606
Sequence	MATKSFLKLAADLSSFTDSSPFAKLLDSCIKSKLSAIYVRYVHASVIKSGFSNEIFIQNR LIDAYSKCGSLEDGRQVFDKMPQRNIYTWNSVVTGLTKLGFLDEADSLFRSMPERDQCTW NSMVSGFAQHDRCEEALCYFAMMHKEGFVLNEYSFASVLSACSGLNDMNKGVQVHSLIAK SPFLSDVYIGSALVDMYSKCGNVNDAQRVFDEMGDRNVVSWNSLITCFEQNGPAVEALDV FQMMLESRVEPDEVTLASVISACASLSAIKVGQEVHGRVVKNDKLRNDIILSNAFVDMYA KCSRIKEARFIFDSMPIRNVIAETSMISGYAMAASTKAARLMFTKMAERNVVSWNALIAG YTQNGENEEALSLFCLLKRESVCPTHYSFANILKACADLAELHLGMQAHVHVLKHGFKFQ SGEEDDIFVGNSLIDMYVKCGCVEEGYLVFRKMMERDCVSWNAMIIGFAQNGYGNEALEL FREMLESGEKPDHITMIGVLSACGHAGFVEEGRHYFSSMTRDFGVAPLRDHYTCMVDLLG RAGFLEEAKSMIEEMPMQPDSVIWGSLLAACKVHRNITLGKYVAEKLLEVEPSNSGPYVL LSNMYAELGKWEDVMNVRKSMRKEGVTKQPGCSWIKIQGHDHVFMVKDKSHPRKKQIHSL LDILIAEMRPEQDHTEIGSLSSEEMDYSSNLLWDNAM

Transcript Sequence

Transcript ID	AT2G13600.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:5671396-5673622 FORWARD LENGTH=2227 \| 201606
Sequence	CTTCTGTCTGTCTGTCTACACACAAAGATGCGTAGCTTTGATTGCTCGAGAAAACTAGAC TCATGTTCAATGTTCTTCTGCAAACGACGATAATGGAATGGCAACAAAATCATTTCTCAA ACTCGCTGCTGATCTCTCTTCTTTCACCGATTCTTCACCATTCGCAAAGCTTCTTGATTC ATGCATCAAATCCAAGTTATCAGCAATCTACGTCCGTTATGTCCATGCTTCTGTCATCAA ATCAGGTTTCTCCAATGAAATATTTATACAGAATCGGCTCATCGACGCTTATTCGAAATG TGGGTCACTCGAGGATGGTCGCCAAGTGTTCGACAAAATGCCTCAACGAAATATCTACAC TTGGAACTCTGTTGTGACGGGTTTGACAAAGTTAGGATTTTTAGATGAAGCTGATTCTTT ATTCAGGTCAATGCCTGAACGTGATCAATGTACTTGGAATTCTATGGTTTCGGGTTTTGC GCAACATGATAGGTGTGAAGAGGCTTTGTGTTATTTTGCTATGATGCATAAGGAAGGGTT TGTGCTTAATGAATATAGTTTTGCTAGTGTTCTTAGTGCTTGTTCTGGTTTGAATGATAT GAATAAGGGTGTACAAGTACATTCTTTGATTGCGAAATCGCCTTTTTTGTCAGATGTGTA TATAGGTTCTGCTCTTGTTGACATGTATTCCAAATGCGGTAATGTAAATGATGCTCAGAG GGTTTTTGATGAGATGGGTGATAGAAATGTTGTTTCTTGGAATAGTTTGATTACATGTTT TGAACAAAATGGTCCTGCGGTGGAAGCTCTCGATGTTTTTCAAATGATGTTAGAATCTAG GGTTGAGCCAGATGAGGTTACTTTAGCTAGTGTGATTAGTGCCTGTGCAAGCTTGTCGGC GATTAAGGTTGGTCAGGAAGTTCATGGCCGTGTTGTTAAAAACGATAAGTTGAGGAATGA TATAATTCTAAGCAATGCGTTTGTGGATATGTATGCAAAGTGCAGCAGGATAAAAGAAGC TAGGTTTATATTTGATAGCATGCCTATCAGAAATGTTATTGCAGAAACCTCCATGATCAG TGGGTACGCAATGGCTGCAAGCACTAAGGCGGCTAGACTCATGTTTACCAAAATGGCGGA GAGGAATGTTGTTTCATGGAATGCGCTTATTGCTGGCTATACGCAGAACGGAGAAAACGA AGAAGCACTTAGTCTCTTTTGTCTCTTGAAGAGGGAATCAGTATGCCCAACTCACTATTC CTTTGCTAATATCCTCAAGGCATGTGCAGATCTTGCAGAGTTACATCTCGGTATGCAGGC TCACGTGCATGTCTTGAAGCATGGCTTTAAGTTTCAATCTGGTGAAGAAGATGATATATT TGTTGGCAATTCCTTGATAGATATGTATGTGAAATGTGGTTGTGTAGAAGAGGGTTATCT TGTATTCAGGAAGATGATGGAAAGAGATTGTGTTTCCTGGAACGCGATGATTATTGGATT TGCACAAAATGGTTATGGAAATGAGGCTCTTGAGTTGTTCAGAGAAATGCTTGAGTCTGG AGAAAAACCAGATCACATTACCATGATTGGTGTTCTTTCTGCATGCGGGCATGCTGGATT TGTTGAAGAAGGGCGGCACTACTTTTCTTCTATGACCAGAGATTTTGGTGTGGCTCCGCT TAGGGATCACTATACTTGCATGGTCGATTTGCTTGGTCGAGCTGGATTTCTCGAAGAAGC AAAGAGCATGATTGAGGAGATGCCTATGCAACCAGATTCTGTTATATGGGGTTCTTTGCT TGCTGCTTGTAAAGTACATAGGAACATTACGTTAGGTAAATACGTTGCAGAGAAGCTTTT AGAAGTAGAGCCGTCAAATTCAGGACCATATGTTCTTCTTTCTAACATGTACGCTGAGCT CGGAAAATGGGAGGATGTGATGAATGTACGAAAGTCGATGAGGAAAGAGGGAGTCACAAA GCAGCCAGGGTGTAGTTGGATAAAGATACAAGGACATGATCATGTTTTCATGGTTAAAGA TAAAAGCCATCCTCGAAAAAAGCAGATACACTCGCTTCTTGATATTTTAATAGCCGAGAT GAGACCGGAACAAGATCATACTGAAATAGGATCACTCTCGTCCGAGGAAATGGATTATTC ATCTAATCTTCTTTGGGACAACGCCATGTAATGTAAGTAACTTTGCTGGAATTGTTTTTT GCTGTTC