Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID

AT2G06000.1

CDS Infomation

| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | Chr2:2328000-2329610 REVERSE LENGTH=1611 | 201606

Sequence

ATGATTCGAACAACATTCGCGACCGCCATCGCTCATTTCCACACGCATTCTCATGGAGGA
GCTCAAGCTCGTCCTCTACAGAACAACACACGAGAAGTAATCCATTGTCCTGAAGCTTGG
TTAGTCAAAATCGTATCTACTTTGTTCGTGTACAGAGTTCCAGATTCAGATCTCTGTTTC
TGTTACTTAAGCAAGAATCTAAATCCGTTTATCTCCTTTGAGGTTGTGAAGAAATTGGAT
AACAATCCTCACATAGGGTTTCGATTTTGGGAGTTTAGTAGATTCAAATTGAACATTCGT
CATTCGTTTTGGACTTATAATTTGCTAACGAGATCTCTTTGTAAAGCCGGTTTGCACGAT
TTAGCCGGTCAGATGTTTGAGTGTATGAAGAGCGATGGGGTTTCTCCGAATAATCGGTTA
TTAGGGTTCTTAGTGTCTTCGTTTGCTGAGAAAGGTAAGCTCCATTTCGCTACTGCGTTG
CTTCTTCAGTCTTTTGAGGTTGAAGGATGTTGTATGGTGGTGAATAGTTTGTTGAATACT
TTGGTGAAGTTGGATCGTGTGGAAGATGCGATGAAGCTTTTTGATGAACATTTGAGATTT
CAGTCTTGTAATGATACAAAGACGTTTAACATTTTGATTCGAGGTTTGTGCGGCGTAGGG
AAAGCGGAGAAAGCGTTAGAGCTTTTGGGTGTGATGAGTGGTTTTGGTTGTGAGCCTGAC
ATTGTTACGTATAATACTCTTATTCAGGGGTTTTGCAAGAGTAATGAGTTGAACAAAGCG
AGTGAGATGTTTAAAGATGTTAAGTCGGGTAGTGTTTGCTCTCCTGATGTTGTTACATAT
ACTTCGATGATCTCAGGGTACTGCAAAGCTGGGAAGATGCGTGAAGCGTCGAGTTTGTTA
GATGATATGCTTCGTTTGGGGATATATCCAACTAATGTGACTTTTAATGTCCTCGTTGAT
GGTTATGCGAAAGCTGGTGAGATGCTTACTGCTGAAGAAATTCGTGGGAAAATGATTTCT
TTTGGCTGTTTCCCGGATGTAGTGACGTTTACTTCCTTAATTGATGGATATTGTAGAGTA
GGACAAGTGAGCCAAGGTTTTAGGCTTTGGGAAGAAATGAATGCCAGAGGAATGTTTCCT
AATGCATTTACCTATTCTATTCTTATCAATGCGCTCTGTAACGAGAATAGGCTGCTCAAG
GCTCGTGAACTTCTGGGGCAGTTAGCTAGTAAGGACATTATTCCACAACCATTTATGTAC
AACCCTGTCATTGATGGGTTTTGTAAAGCTGGAAAGGTCAATGAGGCAAATGTTATTGTG
GAAGAGATGGAGAAGAAGAAATGCAAACCAGATAAGATCACATTTACGATTCTTATAATC
GGGCATTGCATGAAAGGAAGGATGTTTGAAGCAGTTAGCATTTTCCACAAAATGGTTGCG
ATAGGTTGTTCACCGGATAAGATTACTGTGAGTTCTTTGTTATCTTGTCTTCTTAAGGCT
GGTATGGCTAAGGAGGCCTATCACTTAAACCAGATAGCACGTAAAGGCCAAAGTAATAAC
GTGGTACCTCTAGAGACGAAAACCGCAAATGCGACTCTGGCTGCCTGCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

AT2G06000.1

PEP Infomation

| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | Chr2:2328000-2329610 REVERSE LENGTH=536 | 201606

Sequence

MIRTTFATAIAHFHTHSHGGAQARPLQNNTREVIHCPEAWLVKIVSTLFVYRVPDSDLCF
CYLSKNLNPFISFEVVKKLDNNPHIGFRFWEFSRFKLNIRHSFWTYNLLTRSLCKAGLHD
LAGQMFECMKSDGVSPNNRLLGFLVSSFAEKGKLHFATALLLQSFEVEGCCMVVNSLLNT
LVKLDRVEDAMKLFDEHLRFQSCNDTKTFNILIRGLCGVGKAEKALELLGVMSGFGCEPD
IVTYNTLIQGFCKSNELNKASEMFKDVKSGSVCSPDVVTYTSMISGYCKAGKMREASSLL
DDMLRLGIYPTNVTFNVLVDGYAKAGEMLTAEEIRGKMISFGCFPDVVTFTSLIDGYCRV
GQVSQGFRLWEEMNARGMFPNAFTYSILINALCNENRLLKARELLGQLASKDIIPQPFMY
NPVIDGFCKAGKVNEANVIVEEMEKKKCKPDKITFTILIIGHCMKGRMFEAVSIFHKMVA
IGCSPDKITVSSLLSCLLKAGMAKEAYHLNQIARKGQSNNVVPLETKTANATLAAC

Transcript Sequence

Transcript ID

AT2G06000.1

Transcript Infomation

| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | Chr2:2327323-2329835 REVERSE LENGTH=2513 | 201606

Sequence

GTCTTGTATAGACTCTGAAATCGTGAAATGGTACAAAGACTCTTAATCATTTAGCGGGTT
TAACTATTAAAAGCCTCTAGCTCCTCTAGAAGGTTCTATTGTTCCTTCCTTGGTAAACGT
TTCAGTTTCACACACTCTCATCTGAAAAAAAAAAATACAGATGAGATTGACCAAAACAAG
CCCTAGCTTAAGCTCAATCTCCGCCGCCGATATTCTCACGCCGGTATGATTCGAACAACA
TTCGCGACCGCCATCGCTCATTTCCACACGCATTCTCATGGAGGAGCTCAAGCTCGTCCT
CTACAGAACAACACACGAGAAGTAATCCATTGTCCTGAAGCTTGGTTAGTCAAAATCGTA
TCTACTTTGTTCGTGTACAGAGTTCCAGATTCAGATCTCTGTTTCTGTTACTTAAGCAAG
AATCTAAATCCGTTTATCTCCTTTGAGGTTGTGAAGAAATTGGATAACAATCCTCACATA
GGGTTTCGATTTTGGGAGTTTAGTAGATTCAAATTGAACATTCGTCATTCGTTTTGGACT
TATAATTTGCTAACGAGATCTCTTTGTAAAGCCGGTTTGCACGATTTAGCCGGTCAGATG
TTTGAGTGTATGAAGAGCGATGGGGTTTCTCCGAATAATCGGTTATTAGGGTTCTTAGTG
TCTTCGTTTGCTGAGAAAGGTAAGCTCCATTTCGCTACTGCGTTGCTTCTTCAGTCTTTT
GAGGTTGAAGGATGTTGTATGGTGGTGAATAGTTTGTTGAATACTTTGGTGAAGTTGGAT
CGTGTGGAAGATGCGATGAAGCTTTTTGATGAACATTTGAGATTTCAGTCTTGTAATGAT
ACAAAGACGTTTAACATTTTGATTCGAGGTTTGTGCGGCGTAGGGAAAGCGGAGAAAGCG
TTAGAGCTTTTGGGTGTGATGAGTGGTTTTGGTTGTGAGCCTGACATTGTTACGTATAAT
ACTCTTATTCAGGGGTTTTGCAAGAGTAATGAGTTGAACAAAGCGAGTGAGATGTTTAAA
GATGTTAAGTCGGGTAGTGTTTGCTCTCCTGATGTTGTTACATATACTTCGATGATCTCA
GGGTACTGCAAAGCTGGGAAGATGCGTGAAGCGTCGAGTTTGTTAGATGATATGCTTCGT
TTGGGGATATATCCAACTAATGTGACTTTTAATGTCCTCGTTGATGGTTATGCGAAAGCT
GGTGAGATGCTTACTGCTGAAGAAATTCGTGGGAAAATGATTTCTTTTGGCTGTTTCCCG
GATGTAGTGACGTTTACTTCCTTAATTGATGGATATTGTAGAGTAGGACAAGTGAGCCAA
GGTTTTAGGCTTTGGGAAGAAATGAATGCCAGAGGAATGTTTCCTAATGCATTTACCTAT
TCTATTCTTATCAATGCGCTCTGTAACGAGAATAGGCTGCTCAAGGCTCGTGAACTTCTG
GGGCAGTTAGCTAGTAAGGACATTATTCCACAACCATTTATGTACAACCCTGTCATTGAT
GGGTTTTGTAAAGCTGGAAAGGTCAATGAGGCAAATGTTATTGTGGAAGAGATGGAGAAG
AAGAAATGCAAACCAGATAAGATCACATTTACGATTCTTATAATCGGGCATTGCATGAAA
GGAAGGATGTTTGAAGCAGTTAGCATTTTCCACAAAATGGTTGCGATAGGTTGTTCACCG
GATAAGATTACTGTGAGTTCTTTGTTATCTTGTCTTCTTAAGGCTGGTATGGCTAAGGAG
GCCTATCACTTAAACCAGATAGCACGTAAAGGCCAAAGTAATAACGTGGTACCTCTAGAG
ACGAAAACCGCAAATGCGACTCTGGCTGCCTGCTAGGCTTTCTATATAATATATCTGTGC
ATCGGCCTTTCAACCACCGTACATTCTCTACACATTGCTAGGCGTAGCTGGAAGCAGAGC
AGACAAAAACAGTCAAAAACTCACAGTAAGCAACTGTTCACATTACACTTTCAATTGCTC
TGGTAGATTCATTAGATCCTAATTCTCTTTTGAAGATTGAAATAAAGATGTAATTGCATA
AATATAAGTTTGTGAAATGATAGAATATGTTTATATCACTCTTAGTTAGCTAGTTCGCAG
GCTTCTGATGCTTGTTGTGTCAATTTTGACTCTCTTGTTCAGGCTATTCTACTTCCAGAG
ATCACAATTCAGTGTAAACTCTGCTGAGAGAATGAAACCAAAATAGCTCATCTGCAAGAA
CAGGGATATTCAGTTGCTTAAAAGCTTAGAAAAAAATATGTAGAAATAGATTATAGGTCT
TAAGTTCATTGCCTAAGGATAAGAAGAACTGGTTAATCCGAGTGTTTTTTTGAGGGAACC
AGATTGGTTTCATGAGTCTTGTAAATCCGTCTGTGAGTCTTCTGTTTGAGCTTTTGGCAA
GGCTGGACATATAGTGTTTCTTCTTATGGTGGCAATTCATTTCCATGTTGAATACTAGTC
GACATCAACCTTTCGATCAAAATCCTTTAAGATGGAGGAAAAAAATGTCGCTA