Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT2G05920.1
CDS Infomation	\| Subtilase family protein \| Chr2:2269831-2272207 REVERSE LENGTH=2265 \| 201606
Sequence	ATGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCATCACAATCATCACCACCTTCCTCTTCCTT CTCCTCCACACAACCGCCAAAAAAACCTACATCATCCGCGTCAATCACTCCGATAAACCG GAATCATTCCTCACTCACCACGATTGGTACACATCTCAACTCAATTCAGAATCATCTCTT CTCTACACTTACACAACCTCCTTCCATGGCTTCTCCGCTTACCTCGACTCCACCGAAGCC GATTCTCTCCTCTCCTCCTCAAACTCAATCCTCGATATCTTCGAAGATCCTCTCTACACA CTTCACACTACGCGTACTCCTGAGTTTCTCGGTCTCAATTCCGAATTCGGTGTTCACGAT CTCGGTTCTTCTTCTAACGGCGTTATCATCGGAGTTTTAGATACTGGCGTTTGGCCTGAA TCTAGAAGCTTCGATGATACTGATATGCCTGAGATTCCTTCTAAATGGAAAGGAGAATGT GAATCTGGTTCCGATTTCGATTCCAAGTTGTGTAACAAGAAGCTTATCGGAGCTAGAAGC TTCTCCAAAGGATTTCAAATGGCTTCTGGTGGTGGTTTTTCGAGTAAGCGTGAATCTGTT TCTCCTCGTGATGTTGACGGACATGGAACACATACTTCAACTACCGCCGCGGGATCCGCC GTTAGAAACGCTAGCTTCCTCGGTTACGCCGCCGGTACGGCCAGAGGTATGGCCACTCGT GCTCGTGTTGCTACTTATAAAGTTTGTTGGAGTACTGGTTGTTTTGGATCTGATATACTA GCTGCTATGGATCGAGCTATACTTGATGGTGTTGATGTGCTTTCGTTATCTCTTGGTGGT GGTTCTGCTCCGTATTATCGCGATACGATTGCGATTGGAGCGTTTTCGGCTATGGAGAGA GGTGTTTTTGTGTCTTGTTCTGCTGGTAATAGTGGTCCTACTAGAGCTTCTGTTGCCAAT GTTGCTCCTTGGGTTATGACTGTTGGTGCTGGTACTTTAGATAGAGATTTTCCGGCTTTT GCGAATCTCGGTAACGGGAAACGACTTACCGGTGTTTCGCTGTATAGCGGTGTAGGAATG GGGACGAAGCCGCTTGAATTGGTTTATAATAAAGGGAATAGTAGTTCGAGTAATCTTTGT TTACCTGGTTCGCTTGATTCGAGTATTGTTCGTGGGAAGATTGTTGTTTGTGATAGAGGT GTTAATGCTAGAGTTGAGAAAGGAGCTGTGGTTAGAGATGCTGGTGGTTTAGGGATGATA ATGGCGAATACTGCTGCGAGTGGAGAGGAGCTTGTGGCGGATAGTCATTTGCTTCCCGCG ATCGCTGTAGGGAAGAAGACTGGTGATTTACTTAGGGAGTATGTTAAGTCAGATTCTAAA CCAACCGCTCTTCTTGTTTTTAAAGGAACGGTTCTTGACGTTAAGCCGTCTCCTGTGGTT GCTGCTTTTAGCTCGAGAGGTCCTAATACTGTTACTCCTGAAATCTTGAAGCCTGATGTT ATTGGTCCTGGAGTTAATATTTTGGCTGGTTGGTCTGACGCTATTGGTCCTACTGGTCTT GACAAGGACTCTAGGAGGACTCAGTTCAACATCATGTCAGGTACGTCAATGTCATGCCCA CACATCAGTGGTTTAGCGGGTCTTTTGAAAGCAGCTCACCCTGAGTGGAGTCCGAGTGCT ATCAAATCAGCTCTCATGACTACAGCTTACGTTCTTGACAACACCAACGCTCCTCTCCAT GATGCTGCAGACAACAGCCTATCTAACCCATATGCTCACGGCTCGGGCCATGTAGATCCC CAAAAGGCTCTCTCACCAGGTCTTGTCTACGACATCTCAACCGAGGAATACATCAGGTTT TTGTGCTCTCTAGACTACACAGTCGATCACATTGTTGCGATTGTGAAGCGACCTAGCGTT AACTGCTCGAAGAAGTTCTCAGATCCTGGTCAGCTCAACTACCCAAGTTTCTCGGTTTTG TTTGGGGGTAAAAGAGTTGTGCGGTACACTCGGGAAGTAACAAATGTTGGTGCAGCAAGC TCGGTTTACAAAGTGACGGTTAATGGAGCTCCTAGTGTCGGAATCTCTGTTAAACCATCG AAACTTTCGTTTAAAAGCGTGGGAGAGAAGAAGAGGTACACAGTCACGTTTGTTAGCAAG AAAGGAGTGAGTATGACGAACAAGGCTGAGTTTGGTTCCATCACTTGGAGCAATCCGCAG CACGAAGTGAGAAGTCCCGTTGCATTCTCTTGGAACCGGTTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT2G05920.1
PEP Infomation	\| Subtilase family protein \| Chr2:2269831-2272207 REVERSE LENGTH=754 \| 201606
Sequence	MASSSSSSSSITIITTFLFLLLHTTAKKTYIIRVNHSDKPESFLTHHDWYTSQLNSESSL LYTYTTSFHGFSAYLDSTEADSLLSSSNSILDIFEDPLYTLHTTRTPEFLGLNSEFGVHD LGSSSNGVIIGVLDTGVWPESRSFDDTDMPEIPSKWKGECESGSDFDSKLCNKKLIGARS FSKGFQMASGGGFSSKRESVSPRDVDGHGTHTSTTAAGSAVRNASFLGYAAGTARGMATR ARVATYKVCWSTGCFGSDILAAMDRAILDGVDVLSLSLGGGSAPYYRDTIAIGAFSAMER GVFVSCSAGNSGPTRASVANVAPWVMTVGAGTLDRDFPAFANLGNGKRLTGVSLYSGVGM GTKPLELVYNKGNSSSSNLCLPGSLDSSIVRGKIVVCDRGVNARVEKGAVVRDAGGLGMI MANTAASGEELVADSHLLPAIAVGKKTGDLLREYVKSDSKPTALLVFKGTVLDVKPSPVV AAFSSRGPNTVTPEILKPDVIGPGVNILAGWSDAIGPTGLDKDSRRTQFNIMSGTSMSCP HISGLAGLLKAAHPEWSPSAIKSALMTTAYVLDNTNAPLHDAADNSLSNPYAHGSGHVDP QKALSPGLVYDISTEEYIRFLCSLDYTVDHIVAIVKRPSVNCSKKFSDPGQLNYPSFSVL FGGKRVVRYTREVTNVGAASSVYKVTVNGAPSVGISVKPSKLSFKSVGEKKRYTVTFVSK KGVSMTNKAEFGSITWSNPQHEVRSPVAFSWNRF

Transcript Sequence

Transcript ID	AT2G05920.1
Transcript Infomation	\| Subtilase family protein \| Chr2:2269315-2272452 REVERSE LENGTH=3026 \| 201606
Sequence	TTTATCACGTATCGTGTCTCCAGCTGTATATATATTTCCCACACACACTCTTTTTCAAAA CCCCACCGACGATGGCATTTCCGTTATTATTCTAACGGTCACACGTCCCTTACGTGTCCA CCACTTTTTTTTATTATTATTTTAATCCCATCACTCTTTCTCTCTCTCTCCCTATCTTCT TCTTCTTCTTCTTCTTATTCCCCACACTCTCTTCTTCTCTACTTCACCATCATTCACACA CACTCATGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCATCACAATCATCACCACCTTCCTCT TCCTTCTCCTCCACACAACCGCCAAAAAAACCTACATCATCCGCGTCAATCACTCCGATA AACCGGAATCATTCCTCACTCACCACGATTGGTACACATCTCAACTCAATTCAGAATCAT CTCTTCTCTACACTTACACAACCTCCTTCCATGGCTTCTCCGCTTACCTCGACTCCACCG AAGCCGATTCTCTCCTCTCCTCCTCAAACTCAATCCTCGATATCTTCGAAGATCCTCTCT ACACACTTCACACTACGCGTACTCCTGAGTTTCTCGGTCTCAATTCCGAATTCGGTGTTC ACGATCTCGGTTCTTCTTCTAACGGCGTTATCATCGGAGTTTTAGATACTGGCGTTTGGC CTGAATCTAGAAGCTTCGATGATACTGATATGCCTGAGATTCCTTCTAAATGGAAAGGAG AATGTGAATCTGGTTCCGATTTCGATTCCAAGTTGTGTAACAAGAAGCTTATCGGAGCTA GAAGCTTCTCCAAAGGATTTCAAATGGCTTCTGGTGGTGGTTTTTCGAGTAAGCGTGAAT CTGTTTCTCCTCGTGATGTTGACGGACATGGAACACATACTTCAACTACCGCCGCGGGAT CCGCCGTTAGAAACGCTAGCTTCCTCGGTTACGCCGCCGGTACGGCCAGAGGTATGGCCA CTCGTGCTCGTGTTGCTACTTATAAAGTTTGTTGGAGTACTGGTTGTTTTGGATCTGATA TACTAGCTGCTATGGATCGAGCTATACTTGATGGTGTTGATGTGCTTTCGTTATCTCTTG GTGGTGGTTCTGCTCCGTATTATCGCGATACGATTGCGATTGGAGCGTTTTCGGCTATGG AGAGAGGTGTTTTTGTGTCTTGTTCTGCTGGTAATAGTGGTCCTACTAGAGCTTCTGTTG CCAATGTTGCTCCTTGGGTTATGACTGTTGGTGCTGGTACTTTAGATAGAGATTTTCCGG CTTTTGCGAATCTCGGTAACGGGAAACGACTTACCGGTGTTTCGCTGTATAGCGGTGTAG GAATGGGGACGAAGCCGCTTGAATTGGTTTATAATAAAGGGAATAGTAGTTCGAGTAATC TTTGTTTACCTGGTTCGCTTGATTCGAGTATTGTTCGTGGGAAGATTGTTGTTTGTGATA GAGGTGTTAATGCTAGAGTTGAGAAAGGAGCTGTGGTTAGAGATGCTGGTGGTTTAGGGA TGATAATGGCGAATACTGCTGCGAGTGGAGAGGAGCTTGTGGCGGATAGTCATTTGCTTC CCGCGATCGCTGTAGGGAAGAAGACTGGTGATTTACTTAGGGAGTATGTTAAGTCAGATT CTAAACCAACCGCTCTTCTTGTTTTTAAAGGAACGGTTCTTGACGTTAAGCCGTCTCCTG TGGTTGCTGCTTTTAGCTCGAGAGGTCCTAATACTGTTACTCCTGAAATCTTGAAGCCTG ATGTTATTGGTCCTGGAGTTAATATTTTGGCTGGTTGGTCTGACGCTATTGGTCCTACTG GTCTTGACAAGGACTCTAGGAGGACTCAGTTCAACATCATGTCAGGTACGTCAATGTCAT GCCCACACATCAGTGGTTTAGCGGGTCTTTTGAAAGCAGCTCACCCTGAGTGGAGTCCGA GTGCTATCAAATCAGCTCTCATGACTACAGCTTACGTTCTTGACAACACCAACGCTCCTC TCCATGATGCTGCAGACAACAGCCTATCTAACCCATATGCTCACGGCTCGGGCCATGTAG ATCCCCAAAAGGCTCTCTCACCAGGTCTTGTCTACGACATCTCAACCGAGGAATACATCA GGTTTTTGTGCTCTCTAGACTACACAGTCGATCACATTGTTGCGATTGTGAAGCGACCTA GCGTTAACTGCTCGAAGAAGTTCTCAGATCCTGGTCAGCTCAACTACCCAAGTTTCTCGG TTTTGTTTGGGGGTAAAAGAGTTGTGCGGTACACTCGGGAAGTAACAAATGTTGGTGCAG CAAGCTCGGTTTACAAAGTGACGGTTAATGGAGCTCCTAGTGTCGGAATCTCTGTTAAAC CATCGAAACTTTCGTTTAAAAGCGTGGGAGAGAAGAAGAGGTACACAGTCACGTTTGTTA GCAAGAAAGGAGTGAGTATGACGAACAAGGCTGAGTTTGGTTCCATCACTTGGAGCAATC CGCAGCACGAAGTGAGAAGTCCCGTTGCATTCTCTTGGAACCGGTTTTGATAAAAAAACT AACATCCCTAGTGATGATGTTTTCTATTTAAGTTATCTTGATTGGGTTTAGGCTAAACCA AAGCCCATCATGAGCCATAAGTAGTGGGAAGTGTTCTTGTGTGGTTTGGTTTGAGTCATT GAGTGTGTAGGTGAAAGCATCCCAAAAAAAGTTAGGGATGATAAAAGAAAATGTTGTCAG GAAAAGAACGTTGATGTCGTCATATGTAGTGCTTCAAGTTTCTTCATTTTAACCATCATA CTGATGTAATAGTATCTTTCAAATAAGCAACAAAAGTAATGTGACATAATGTCATCACTG ACATCACTCAAGTGTCTAGACACAAATTGGAGGACATGCGTTCAATACAAAATCACGTGA AGCTGACGCAATTGGATATTAATTATTTCTAACTGGATTAACTGTTTTTTTTGGGGGGGG GTAAAAATTTGGATTAACTCTTACTTAGGATTTGAAGCTAAGTACGATGAGTAAGAAATT TTCTTTCCCGTAAAAGCGTCCCCAAG