Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT2G04860.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr2:1706787-1708865 REVERSE LENGTH=2079 \| 201606
Sequence	ATGCGCATTACCAAACCCATAACTCTATATAGAGACCTTTCTTACTTCCATTCTCTACTA AAATCTTGTATCCATGGTGAAATCTCTTCTTCTCCAATCACTATCTTCCGTGACTTACTC CGTTCCTCTCTTACACCAAATCATTTCACTATGTCTATCTTTCTCCAAGCCACTACTACC TCTTTCAATTCCTTCAAGTTACAAGTCGAACAAGTCCAAACCCATCTCACAAAATCAGGT CTTGATCGGTTCGTATACGTGAAAACATCTCTTCTTAATCTCTACTTGAAGAAGGGTTGC GTAACGAGTGCACAAATGTTGTTCGATGAAATGCCTGAGAGAGATACAGTTGTTTGGAAT GCATTGATTTGTGGGTATTCACGAAATGGTTATGAGTGTGATGCGTGGAAGCTTTTTATC GTAATGCTTCAGCAAGGGTTTTCTCCATCTGCTACTACACTTGTGAATTTGTTACCTTTT TGTGGACAATGTGGTTTTGTATCTCAAGGGAGATCTGTTCATGGTGTTGCTGCAAAGTCT GGCCTTGAGTTGGATTCTCAGGTGAAGAATGCGTTGATTTCGTTTTACTCAAAGTGTGCA GAGTTGGGTTCAGCAGAAGTCTTGTTTAGAGAAATGAAAGATAAAAGCACAGTTTCTTGG AATACAATGATTGGTGCCTATAGCCAGAGTGGTTTACAGGAAGAAGCCATCACTGTTTTC AAGAATATGTTTGAGAAGAATGTGGAAATTAGTCCAGTCACTATCATCAATCTTCTTTCT GCTCATGTTAGTCACGAGCCACTACATTGTCTTGTTGTTAAATGTGGAATGGTGAATGAT ATATCTGTGGTTACTTCTTTGGTCTGTGCATATTCAAGGTGTGGGTGTTTGGTTTCAGCA GAGCGTCTTTATGCGTCTGCTAAACAAGATAGTATTGTCGGCTTAACTTCGATTGTTTCA TGCTATGCGGAGAAAGGAGATATGGATATAGCAGTTGTGTATTTTTCTAAAACGCGTCAG TTGTGTATGAAAATTGATGCTGTAGCTTTAGTTGGAATTCTCCATGGATGTAAAAAGTCT TCCCATATTGACATAGGAATGTCGTTACATGGTTATGCGATCAAAAGCGGATTGTGCACA AAAACACTGGTTGTGAATGGACTGATAACTATGTACTCTAAGTTTGATGATGTAGAGACT GTCCTGTTTTTGTTTGAGCAACTGCAGGAGACTCCTTTAATTAGCTGGAACTCAGTGATA TCCGGGTGTGTACAGTCTGGAAGGGCAAGTACAGCTTTTGAGGTGTTCCATCAGATGATG TTAACTGGTGGACTTTTGCCGGATGCCATTACGATAGCCAGTTTGCTTGCTGGCTGTTCC CAGCTTTGTTGCTTGAATTTGGGGAAGGAGCTTCATGGCTATACTCTTAGGAACAATTTT GAAAATGAGAACTTTGTTTGCACTGCTCTGATAGATATGTATGCCAAATGTGGAAACGAA GTACAAGCGGAAAGTGTGTTCAAGAGTATAAAAGCTCCGTGTACAGCAACATGGAACTCA ATGATATCAGGATACAGCTTATCGGGGTTACAACATCGAGCTCTTTCTTGTTACTTGGAA ATGCGAGAGAAGGGGTTGAAACCTGACGAGATCACCTTTTTGGGGGTTCTGTCTGCATGT AACCATGGAGGCTTTGTCGATGAAGGAAAAATATGTTTCAGAGCAATGATCAAAGAGTTT GGAATATCTCCAACTTTACAGCATTATGCACTTATGGTTGGCTTGTTGGGAAGAGCATGT TTATTTACTGAGGCATTGTATTTAATTTGGAAGATGGATATAAAGCCGGATTCTGCAGTA TGGGGTGCTCTACTTAGCGCGTGCATTATTCACAGAGAGTTGGAGGTTGGGGAATATGTA GCTAGGAAAATGTTTATGCTGGATTACAAGAATGGAGGGCTGTATGTATTGATGTCAAAC CTATATGCAACAGAAGCAATGTGGGACGACGTAGTTAGAGTCAGGAATATGATGAAAGAT AATGGATACGATGGTTATTTGGGAGTTAGCCAAATATAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT2G04860.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr2:1706787-1708865 REVERSE LENGTH=692 \| 201606
Sequence	MRITKPITLYRDLSYFHSLLKSCIHGEISSSPITIFRDLLRSSLTPNHFTMSIFLQATTT SFNSFKLQVEQVQTHLTKSGLDRFVYVKTSLLNLYLKKGCVTSAQMLFDEMPERDTVVWN ALICGYSRNGYECDAWKLFIVMLQQGFSPSATTLVNLLPFCGQCGFVSQGRSVHGVAAKS GLELDSQVKNALISFYSKCAELGSAEVLFREMKDKSTVSWNTMIGAYSQSGLQEEAITVF KNMFEKNVEISPVTIINLLSAHVSHEPLHCLVVKCGMVNDISVVTSLVCAYSRCGCLVSA ERLYASAKQDSIVGLTSIVSCYAEKGDMDIAVVYFSKTRQLCMKIDAVALVGILHGCKKS SHIDIGMSLHGYAIKSGLCTKTLVVNGLITMYSKFDDVETVLFLFEQLQETPLISWNSVI SGCVQSGRASTAFEVFHQMMLTGGLLPDAITIASLLAGCSQLCCLNLGKELHGYTLRNNF ENENFVCTALIDMYAKCGNEVQAESVFKSIKAPCTATWNSMISGYSLSGLQHRALSCYLE MREKGLKPDEITFLGVLSACNHGGFVDEGKICFRAMIKEFGISPTLQHYALMVGLLGRAC LFTEALYLIWKMDIKPDSAVWGALLSACIIHRELEVGEYVARKMFMLDYKNGGLYVLMSN LYATEAMWDDVVRVRNMMKDNGYDGYLGVSQI

Transcript Sequence

Transcript ID	AT2G04860.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr2:1706787-1708926 REVERSE LENGTH=2140 \| 201606
Sequence	CACAAGTTCTAATAATTCCGACACAAGGAAATAAAGCTAGAGGAGACAGAACAGAGATAG TATGCGCATTACCAAACCCATAACTCTATATAGAGACCTTTCTTACTTCCATTCTCTACT AAAATCTTGTATCCATGGTGAAATCTCTTCTTCTCCAATCACTATCTTCCGTGACTTACT CCGTTCCTCTCTTACACCAAATCATTTCACTATGTCTATCTTTCTCCAAGCCACTACTAC CTCTTTCAATTCCTTCAAGTTACAAGTCGAACAAGTCCAAACCCATCTCACAAAATCAGG TCTTGATCGGTTCGTATACGTGAAAACATCTCTTCTTAATCTCTACTTGAAGAAGGGTTG CGTAACGAGTGCACAAATGTTGTTCGATGAAATGCCTGAGAGAGATACAGTTGTTTGGAA TGCATTGATTTGTGGGTATTCACGAAATGGTTATGAGTGTGATGCGTGGAAGCTTTTTAT CGTAATGCTTCAGCAAGGGTTTTCTCCATCTGCTACTACACTTGTGAATTTGTTACCTTT TTGTGGACAATGTGGTTTTGTATCTCAAGGGAGATCTGTTCATGGTGTTGCTGCAAAGTC TGGCCTTGAGTTGGATTCTCAGGTGAAGAATGCGTTGATTTCGTTTTACTCAAAGTGTGC AGAGTTGGGTTCAGCAGAAGTCTTGTTTAGAGAAATGAAAGATAAAAGCACAGTTTCTTG GAATACAATGATTGGTGCCTATAGCCAGAGTGGTTTACAGGAAGAAGCCATCACTGTTTT CAAGAATATGTTTGAGAAGAATGTGGAAATTAGTCCAGTCACTATCATCAATCTTCTTTC TGCTCATGTTAGTCACGAGCCACTACATTGTCTTGTTGTTAAATGTGGAATGGTGAATGA TATATCTGTGGTTACTTCTTTGGTCTGTGCATATTCAAGGTGTGGGTGTTTGGTTTCAGC AGAGCGTCTTTATGCGTCTGCTAAACAAGATAGTATTGTCGGCTTAACTTCGATTGTTTC ATGCTATGCGGAGAAAGGAGATATGGATATAGCAGTTGTGTATTTTTCTAAAACGCGTCA GTTGTGTATGAAAATTGATGCTGTAGCTTTAGTTGGAATTCTCCATGGATGTAAAAAGTC TTCCCATATTGACATAGGAATGTCGTTACATGGTTATGCGATCAAAAGCGGATTGTGCAC AAAAACACTGGTTGTGAATGGACTGATAACTATGTACTCTAAGTTTGATGATGTAGAGAC TGTCCTGTTTTTGTTTGAGCAACTGCAGGAGACTCCTTTAATTAGCTGGAACTCAGTGAT ATCCGGGTGTGTACAGTCTGGAAGGGCAAGTACAGCTTTTGAGGTGTTCCATCAGATGAT GTTAACTGGTGGACTTTTGCCGGATGCCATTACGATAGCCAGTTTGCTTGCTGGCTGTTC CCAGCTTTGTTGCTTGAATTTGGGGAAGGAGCTTCATGGCTATACTCTTAGGAACAATTT TGAAAATGAGAACTTTGTTTGCACTGCTCTGATAGATATGTATGCCAAATGTGGAAACGA AGTACAAGCGGAAAGTGTGTTCAAGAGTATAAAAGCTCCGTGTACAGCAACATGGAACTC AATGATATCAGGATACAGCTTATCGGGGTTACAACATCGAGCTCTTTCTTGTTACTTGGA AATGCGAGAGAAGGGGTTGAAACCTGACGAGATCACCTTTTTGGGGGTTCTGTCTGCATG TAACCATGGAGGCTTTGTCGATGAAGGAAAAATATGTTTCAGAGCAATGATCAAAGAGTT TGGAATATCTCCAACTTTACAGCATTATGCACTTATGGTTGGCTTGTTGGGAAGAGCATG TTTATTTACTGAGGCATTGTATTTAATTTGGAAGATGGATATAAAGCCGGATTCTGCAGT ATGGGGTGCTCTACTTAGCGCGTGCATTATTCACAGAGAGTTGGAGGTTGGGGAATATGT AGCTAGGAAAATGTTTATGCTGGATTACAAGAATGGAGGGCTGTATGTATTGATGTCAAA CCTATATGCAACAGAAGCAATGTGGGACGACGTAGTTAGAGTCAGGAATATGATGAAAGA TAATGGATACGATGGTTATTTGGGAGTTAGCCAAATATAA