Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT2G03880.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:1181560-1183452 FORWARD LENGTH=1893 \| 201606
Sequence	ATGAAGTCAGTAATGTCAAAGATCAAACTTTTTAGACCAGTCGTCACGTTACGTTGTTCT TACAGCTCCACAGATCAAACTCTTCTTCTTAGCGAATTTACCAGACTCTGTTACCAGAGA GACCTTCCCAGAGCTATGAAAGCAATGGATTCATTGCAAAGTCATGGTCTTTGGGCAGAC TCTGCAACTTATTCTGAGCTTATCAAGTGTTGTATATCTAATAGAGCTGTTCATGAAGGG AATCTCATTTGTCGTCATTTATACTTCAATGGTCATCGACCAATGATGTTTCTGGTTAAT GTTCTGATCAATATGTATGTAAAATTCAATCTTTTGAATGATGCTCACCAACTGTTCGAT CAAATGCCTCAAAGGAATGTTATTTCTTGGACTACGATGATTTCTGCTTATTCTAAGTGT AAGATTCATCAAAAGGCTTTGGAGCTTTTGGTTTTGATGTTGAGAGATAATGTGAGGCCT AATGTGTATACTTACTCTTCTGTTTTGAGATCTTGCAATGGTATGTCTGATGTTAGAATG CTTCATTGTGGGATTATTAAGGAGGGGTTGGAGTCTGATGTTTTTGTTAGGAGTGCTTTG ATTGATGTGTTTGCTAAACTGGGTGAGCCGGAGGATGCTCTTTCGGTTTTCGATGAAATG GTTACAGGTGATGCGATTGTTTGGAACTCGATCATTGGTGGGTTTGCTCAGAATAGTAGA AGCGATGTAGCTTTGGAGCTTTTTAAGAGGATGAAGAGAGCTGGTTTCATTGCGGAGCAG GCTACGTTGACTAGCGTATTGAGGGCTTGTACTGGTTTGGCTCTGTTGGAGCTTGGGATG CAAGCTCATGTTCATATCGTGAAATATGACCAAGACTTGATACTCAACAACGCACTCGTG GACATGTATTGCAAGTGTGGGAGTTTGGAGGATGCTCTCCGTGTGTTCAACCAGATGAAG GAGAGAGATGTGATTACATGGAGCACTATGATTTCAGGGTTGGCACAGAATGGTTATAGC CAGGAGGCACTGAAGTTGTTTGAGCGTATGAAATCTTCTGGGACGAAGCCAAACTACATT ACGATTGTCGGGGTTCTCTTTGCTTGCAGCCACGCAGGGCTCCTGGAAGATGGTTGGTAC TACTTCAGATCAATGAAGAAACTTTATGGAATCGATCCAGTGAGGGAACATTATGGTTGC ATGATTGATCTGCTTGGAAAAGCTGGAAAGCTCGACGATGCAGTGAAGCTGTTAAATGAA ATGGAGTGTGAGCCAGATGCTGTGACATGGAGAACTTTGCTTGGTGCTTGTAGGGTTCAA AGAAACATGGTGCTAGCGGAGTATGCAGCTAAAAAGGTCATAGCACTCGATCCCGAGGAT GCAGGAACTTACACACTATTGTCTAACATATACGCAAACTCTCAGAAATGGGACAGTGTT GAAGAAATTCGGACACGAATGAGAGACAGAGGAATCAAGAAAGAACCTGGATGCAGCTGG ATCGAAGTAAACAAACAGATTCATGCTTTTATAATTGGAGACAATTCTCACCCACAGATA GTTGAAGTCAGTAAGAAGCTGAACCAATTGATCCATAGACTCACTGGTATTGGCTATGTT CCTGAAACAAACTTTGTGCTACAAGATCTTGAAGGTGAACAAATGGAAGATTCACTTAGA CATCACAGTGAGAAACTGGCTTTAGCCTTTGGCTTGATGACATTACCTATTGAGAAAGTC ATTAGGATAAGAAAGAATCTGAGAATATGTGGGGATTGTCATGTGTTTTGCAAGCTCGCA TCGAAGCTTGAAATCCGCAGTATCGTTATACGAGATCCGATCCGTTACCATCATTTCCAG GATGGCAAATGTTCTTGTGGTGACTACTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT2G03880.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:1181560-1183452 FORWARD LENGTH=630 \| 201606
Sequence	MKSVMSKIKLFRPVVTLRCSYSSTDQTLLLSEFTRLCYQRDLPRAMKAMDSLQSHGLWAD SATYSELIKCCISNRAVHEGNLICRHLYFNGHRPMMFLVNVLINMYVKFNLLNDAHQLFD QMPQRNVISWTTMISAYSKCKIHQKALELLVLMLRDNVRPNVYTYSSVLRSCNGMSDVRM LHCGIIKEGLESDVFVRSALIDVFAKLGEPEDALSVFDEMVTGDAIVWNSIIGGFAQNSR SDVALELFKRMKRAGFIAEQATLTSVLRACTGLALLELGMQAHVHIVKYDQDLILNNALV DMYCKCGSLEDALRVFNQMKERDVITWSTMISGLAQNGYSQEALKLFERMKSSGTKPNYI TIVGVLFACSHAGLLEDGWYYFRSMKKLYGIDPVREHYGCMIDLLGKAGKLDDAVKLLNE MECEPDAVTWRTLLGACRVQRNMVLAEYAAKKVIALDPEDAGTYTLLSNIYANSQKWDSV EEIRTRMRDRGIKKEPGCSWIEVNKQIHAFIIGDNSHPQIVEVSKKLNQLIHRLTGIGYV PETNFVLQDLEGEQMEDSLRHHSEKLALAFGLMTLPIEKVIRIRKNLRICGDCHVFCKLA SKLEIRSIVIRDPIRYHHFQDGKCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	AT2G03880.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:1181512-1183703 FORWARD LENGTH=2192 \| 201606
Sequence	GAGTGATTTGAAATTTTTGAAGTTGTTTCCATAGTTTTAGTGGAGACGATGAAGTCAGTA ATGTCAAAGATCAAACTTTTTAGACCAGTCGTCACGTTACGTTGTTCTTACAGCTCCACA GATCAAACTCTTCTTCTTAGCGAATTTACCAGACTCTGTTACCAGAGAGACCTTCCCAGA GCTATGAAAGCAATGGATTCATTGCAAAGTCATGGTCTTTGGGCAGACTCTGCAACTTAT TCTGAGCTTATCAAGTGTTGTATATCTAATAGAGCTGTTCATGAAGGGAATCTCATTTGT CGTCATTTATACTTCAATGGTCATCGACCAATGATGTTTCTGGTTAATGTTCTGATCAAT ATGTATGTAAAATTCAATCTTTTGAATGATGCTCACCAACTGTTCGATCAAATGCCTCAA AGGAATGTTATTTCTTGGACTACGATGATTTCTGCTTATTCTAAGTGTAAGATTCATCAA AAGGCTTTGGAGCTTTTGGTTTTGATGTTGAGAGATAATGTGAGGCCTAATGTGTATACT TACTCTTCTGTTTTGAGATCTTGCAATGGTATGTCTGATGTTAGAATGCTTCATTGTGGG ATTATTAAGGAGGGGTTGGAGTCTGATGTTTTTGTTAGGAGTGCTTTGATTGATGTGTTT GCTAAACTGGGTGAGCCGGAGGATGCTCTTTCGGTTTTCGATGAAATGGTTACAGGTGAT GCGATTGTTTGGAACTCGATCATTGGTGGGTTTGCTCAGAATAGTAGAAGCGATGTAGCT TTGGAGCTTTTTAAGAGGATGAAGAGAGCTGGTTTCATTGCGGAGCAGGCTACGTTGACT AGCGTATTGAGGGCTTGTACTGGTTTGGCTCTGTTGGAGCTTGGGATGCAAGCTCATGTT CATATCGTGAAATATGACCAAGACTTGATACTCAACAACGCACTCGTGGACATGTATTGC AAGTGTGGGAGTTTGGAGGATGCTCTCCGTGTGTTCAACCAGATGAAGGAGAGAGATGTG ATTACATGGAGCACTATGATTTCAGGGTTGGCACAGAATGGTTATAGCCAGGAGGCACTG AAGTTGTTTGAGCGTATGAAATCTTCTGGGACGAAGCCAAACTACATTACGATTGTCGGG GTTCTCTTTGCTTGCAGCCACGCAGGGCTCCTGGAAGATGGTTGGTACTACTTCAGATCA ATGAAGAAACTTTATGGAATCGATCCAGTGAGGGAACATTATGGTTGCATGATTGATCTG CTTGGAAAAGCTGGAAAGCTCGACGATGCAGTGAAGCTGTTAAATGAAATGGAGTGTGAG CCAGATGCTGTGACATGGAGAACTTTGCTTGGTGCTTGTAGGGTTCAAAGAAACATGGTG CTAGCGGAGTATGCAGCTAAAAAGGTCATAGCACTCGATCCCGAGGATGCAGGAACTTAC ACACTATTGTCTAACATATACGCAAACTCTCAGAAATGGGACAGTGTTGAAGAAATTCGG ACACGAATGAGAGACAGAGGAATCAAGAAAGAACCTGGATGCAGCTGGATCGAAGTAAAC AAACAGATTCATGCTTTTATAATTGGAGACAATTCTCACCCACAGATAGTTGAAGTCAGT AAGAAGCTGAACCAATTGATCCATAGACTCACTGGTATTGGCTATGTTCCTGAAACAAAC TTTGTGCTACAAGATCTTGAAGGTGAACAAATGGAAGATTCACTTAGACATCACAGTGAG AAACTGGCTTTAGCCTTTGGCTTGATGACATTACCTATTGAGAAAGTCATTAGGATAAGA AAGAATCTGAGAATATGTGGGGATTGTCATGTGTTTTGCAAGCTCGCATCGAAGCTTGAA ATCCGCAGTATCGTTATACGAGATCCGATCCGTTACCATCATTTCCAGGATGGCAAATGT TCTTGTGGTGACTACTGGTAACAATCAGATGACTTTAGATTACTATGAAACAGAGTATAA GATGGTTTAGAAGATTGTTTCTCTGCAAGTTTTCTTCATCAAATTTTTTGATTAGTGAAT CATTTTTGCTTATGAAGAAGCTCATTGATTTGCCAAATTTTCCTGATAGGATTTTGTAAC ATTTGCAAAATTGAATATGTATGATAAAATTGGTCATTGGAGTATGGAGACTCACTAATT TAGTAATTTGTGATAAAAAAGAGTTTCTTCAG