Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT2G03380.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:1028292-1030361 FORWARD LENGTH=2070 \| 201606
Sequence	ATGCTACGCTCTATCACTCTTTCTCCGACTAGAAGATTCGGGTTTCCACCGAGATGCGTC TCTTTTACGACTATCAAAGAATTGATTTTGACTGAAGAGAATGATGGGTCTTCTCTGCAT TACGCCGCTTCGAGCCCGTGCTTTCTCCTTCTAAGTAAGTGCACGAACATTGATTCTCTA AGGCAATCTCACGGAGTTTTAACGGGAAATGGACTCATGGGTGATATCTCGATTGCCACC AAGCTCGTTAGTCTATATGGTTTCTTTGGGTATACTAAAGATGCACGCTTGGTGTTCGAT CAAATTCCTGAACCAGATTTTTATTTATGGAAAGTCATGCTCAGATGTTATTGCTTGAAT AAAGAGAGTGTAGAAGTCGTAAAGTTGTATGATTTATTGATGAAGCATGGATTCAGATAT GATGATATTGTTTTCTCGAAAGCTTTGAAAGCGTGTACTGAGCTTCAGGATTTAGACAAT GGGAAGAAGATACATTGCCAGCTCGTTAAGGTGCCGAGTTTCGATAATGTTGTGTTGACA GGTCTTCTAGATATGTATGCTAAGTGTGGAGAAATCAAGAGTGCTCATAAGGTGTTTAAC GATATTACTTTGAGGAATGTGGTTTGTTGGACTTCGATGATTGCTGGGTATGTTAAGAAC GACTTGTGCGAAGAAGGGTTGGTTCTGTTTAATCGGATGAGGGAAAACAATGTTTTGGGT AATGAATATACTTACGGTACTCTAATAATGGCTTGTACAAAGCTTAGTGCTTTACATCAA GGAAAGTGGTTTCATGGTTGTTTGGTTAAGAGTGGTATAGAGCTCAGCTCATGTTTGGTG ACATCTCTTCTCGATATGTATGTTAAGTGTGGTGACATAAGCAATGCACGTCGGGTGTTT AATGAGCATTCTCATGTGGATCTTGTCATGTGGACAGCTATGATTGTGGGGTATACCCAT AACGGAAGTGTGAATGAGGCGCTGAGCTTGTTTCAGAAAATGAAGGGGGTTGAAATCAAG CCTAATTGTGTTACCATTGCAAGTGTCTTATCGGGTTGCGGTCTGATTGAGAATCTTGAA CTGGGAAGATCAGTTCATGGCCTCTCCATCAAAGTTGGTATTTGGGATACAAATGTTGCA AATGCTCTGGTTCACATGTACGCCAAGTGTTACCAGAATAGAGATGCTAAATATGTGTTT GAAATGGAGTCAGAGAAAGATATAGTTGCTTGGAATTCTATAATTTCCGGGTTTTCACAA AACGGCTCTATCCATGAAGCTTTGTTTCTTTTCCATCGCATGAATTCAGAATCTGTGACG CCTAATGGTGTAACAGTTGCGAGTCTTTTTTCAGCCTGTGCTTCCCTTGGGTCTCTAGCT GTAGGTTCATCACTTCATGCCTATTCCGTGAAATTGGGTTTCCTGGCATCATCCAGTGTT CATGTTGGTACTGCACTCCTGGACTTCTATGCCAAATGTGGGGATCCCCAATCTGCCCGT CTCATCTTCGATACTATAGAGGAGAAAAACACAATCACATGGAGTGCTATGATCGGAGGC TATGGAAAGCAAGGGGATACAATAGGGTCCCTTGAGCTATTTGAGGAGATGCTGAAAAAG CAACAAAAACCCAACGAATCAACCTTCACATCTATTTTATCAGCTTGTGGCCACACAGGG ATGGTTAATGAAGGGAAGAAGTACTTCAGCTCAATGTACAAAGATTATAACTTCACGCCT TCAACAAAACACTACACATGTATGGTTGATATGTTAGCTCGAGCAGGTGAGCTTGAGCAA GCCTTAGATATCATCGAAAAGATGCCAATCCAACCAGACGTGAGATGTTTCGGGGCATTT CTACACGGATGTGGAATGCATTCAAGATTTGATCTTGGGGAGATTGTGATTAAGAAGATG CTTGATTTACATCCTGATGATGCCTCTTATTATGTTCTCGTCTCTAATTTGTATGCATCG GATGGACGGTGGAATCAGGCTAAAGAAGTGAGAAATCTGATGAAGCAAAGAGGTCTGAGC AAGATTGCAGGCCATAGCACAATGGAATAG

Peptide Sequence

PEP ID	AT2G03380.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:1028292-1030361 FORWARD LENGTH=689 \| 201606
Sequence	MLRSITLSPTRRFGFPPRCVSFTTIKELILTEENDGSSLHYAASSPCFLLLSKCTNIDSL RQSHGVLTGNGLMGDISIATKLVSLYGFFGYTKDARLVFDQIPEPDFYLWKVMLRCYCLN KESVEVVKLYDLLMKHGFRYDDIVFSKALKACTELQDLDNGKKIHCQLVKVPSFDNVVLT GLLDMYAKCGEIKSAHKVFNDITLRNVVCWTSMIAGYVKNDLCEEGLVLFNRMRENNVLG NEYTYGTLIMACTKLSALHQGKWFHGCLVKSGIELSSCLVTSLLDMYVKCGDISNARRVF NEHSHVDLVMWTAMIVGYTHNGSVNEALSLFQKMKGVEIKPNCVTIASVLSGCGLIENLE LGRSVHGLSIKVGIWDTNVANALVHMYAKCYQNRDAKYVFEMESEKDIVAWNSIISGFSQ NGSIHEALFLFHRMNSESVTPNGVTVASLFSACASLGSLAVGSSLHAYSVKLGFLASSSV HVGTALLDFYAKCGDPQSARLIFDTIEEKNTITWSAMIGGYGKQGDTIGSLELFEEMLKK QQKPNESTFTSILSACGHTGMVNEGKKYFSSMYKDYNFTPSTKHYTCMVDMLARAGELEQ ALDIIEKMPIQPDVRCFGAFLHGCGMHSRFDLGEIVIKKMLDLHPDDASYYVLVSNLYAS DGRWNQAKEVRNLMKQRGLSKIAGHSTME

Transcript Sequence

Transcript ID	AT2G03380.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr2:1028228-1030361 FORWARD LENGTH=2134 \| 201606
Sequence	CTGAGACCAACAACCTGGCGGGAAAGCCACGCCGCCGGTAAGTTGTGAACGGCGAAGAAG ATCAATGCTACGCTCTATCACTCTTTCTCCGACTAGAAGATTCGGGTTTCCACCGAGATG CGTCTCTTTTACGACTATCAAAGAATTGATTTTGACTGAAGAGAATGATGGGTCTTCTCT GCATTACGCCGCTTCGAGCCCGTGCTTTCTCCTTCTAAGTAAGTGCACGAACATTGATTC TCTAAGGCAATCTCACGGAGTTTTAACGGGAAATGGACTCATGGGTGATATCTCGATTGC CACCAAGCTCGTTAGTCTATATGGTTTCTTTGGGTATACTAAAGATGCACGCTTGGTGTT CGATCAAATTCCTGAACCAGATTTTTATTTATGGAAAGTCATGCTCAGATGTTATTGCTT GAATAAAGAGAGTGTAGAAGTCGTAAAGTTGTATGATTTATTGATGAAGCATGGATTCAG ATATGATGATATTGTTTTCTCGAAAGCTTTGAAAGCGTGTACTGAGCTTCAGGATTTAGA CAATGGGAAGAAGATACATTGCCAGCTCGTTAAGGTGCCGAGTTTCGATAATGTTGTGTT GACAGGTCTTCTAGATATGTATGCTAAGTGTGGAGAAATCAAGAGTGCTCATAAGGTGTT TAACGATATTACTTTGAGGAATGTGGTTTGTTGGACTTCGATGATTGCTGGGTATGTTAA GAACGACTTGTGCGAAGAAGGGTTGGTTCTGTTTAATCGGATGAGGGAAAACAATGTTTT GGGTAATGAATATACTTACGGTACTCTAATAATGGCTTGTACAAAGCTTAGTGCTTTACA TCAAGGAAAGTGGTTTCATGGTTGTTTGGTTAAGAGTGGTATAGAGCTCAGCTCATGTTT GGTGACATCTCTTCTCGATATGTATGTTAAGTGTGGTGACATAAGCAATGCACGTCGGGT GTTTAATGAGCATTCTCATGTGGATCTTGTCATGTGGACAGCTATGATTGTGGGGTATAC CCATAACGGAAGTGTGAATGAGGCGCTGAGCTTGTTTCAGAAAATGAAGGGGGTTGAAAT CAAGCCTAATTGTGTTACCATTGCAAGTGTCTTATCGGGTTGCGGTCTGATTGAGAATCT TGAACTGGGAAGATCAGTTCATGGCCTCTCCATCAAAGTTGGTATTTGGGATACAAATGT TGCAAATGCTCTGGTTCACATGTACGCCAAGTGTTACCAGAATAGAGATGCTAAATATGT GTTTGAAATGGAGTCAGAGAAAGATATAGTTGCTTGGAATTCTATAATTTCCGGGTTTTC ACAAAACGGCTCTATCCATGAAGCTTTGTTTCTTTTCCATCGCATGAATTCAGAATCTGT GACGCCTAATGGTGTAACAGTTGCGAGTCTTTTTTCAGCCTGTGCTTCCCTTGGGTCTCT AGCTGTAGGTTCATCACTTCATGCCTATTCCGTGAAATTGGGTTTCCTGGCATCATCCAG TGTTCATGTTGGTACTGCACTCCTGGACTTCTATGCCAAATGTGGGGATCCCCAATCTGC CCGTCTCATCTTCGATACTATAGAGGAGAAAAACACAATCACATGGAGTGCTATGATCGG AGGCTATGGAAAGCAAGGGGATACAATAGGGTCCCTTGAGCTATTTGAGGAGATGCTGAA AAAGCAACAAAAACCCAACGAATCAACCTTCACATCTATTTTATCAGCTTGTGGCCACAC AGGGATGGTTAATGAAGGGAAGAAGTACTTCAGCTCAATGTACAAAGATTATAACTTCAC GCCTTCAACAAAACACTACACATGTATGGTTGATATGTTAGCTCGAGCAGGTGAGCTTGA GCAAGCCTTAGATATCATCGAAAAGATGCCAATCCAACCAGACGTGAGATGTTTCGGGGC ATTTCTACACGGATGTGGAATGCATTCAAGATTTGATCTTGGGGAGATTGTGATTAAGAA GATGCTTGATTTACATCCTGATGATGCCTCTTATTATGTTCTCGTCTCTAATTTGTATGC ATCGGATGGACGGTGGAATCAGGCTAAAGAAGTGAGAAATCTGATGAAGCAAAGAGGTCT GAGCAAGATTGCAGGCCATAGCACAATGGAATAG