Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G77010.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:28942710-28944797 FORWARD LENGTH=2088 \| 201606
Sequence	ATGATTTTGAAGTACAATAGTAGTTACAGGTTTTATCTTTCAAGTAGTTTTCTCCAAGCT ATGGAAGTAGATTGTCGGCGTTATTACGTACGTCTTCTTCAATCATGCAGCAGCAGAAAT CGCGAAACTTTATGGAGACAAACCAATGGATTGCTCTTGAAGAAGGGTTTTCTTAGTTCA ATTGTCATTGTTGCTAACCATCTCCTCCAAATGTACTCCCGGTCTGGTAAAATGGGAATT GCGCGGAACTTGTTCGACGAAATGCCTGATAGAAACTATTTCTCGTGGAACACTATGATT GAAGGGTACATGAATTCTGGGGAAAAGGGAACGTCTTTGAGGTTTTTTGATATGATGCCA GAAAGAGATGGGTACTCTTGGAACGTGGTTGTTTCCGGGTTTGCTAAAGCTGGTGAGCTA AGTGTCGCTAGGAGGTTATTCAATGCCATGCCGGAAAAAGATGTTGTGACGTTGAACTCT CTGCTTCATGGATATATTTTAAACGGTTATGCAGAGGAAGCTCTGAGGTTGTTTAAAGAA TTGAATTTTAGCGCTGATGCGATCACATTGACGACAGTTCTTAAAGCTTGTGCTGAGTTA GAAGCTTTGAAATGTGGGAAGCAGATACATGCTCAGATTCTGATCGGTGGTGTTGAATGT GACTCGAAAATGAATAGTTCTTTAGTTAATGTGTATGCAAAGTGTGGTGATTTGAGAATG GCAAGCTATATGCTGGAGCAGATTAGGGAACCTGATGACCATTCTCTATCTGCCTTAATT TCAGGTTATGCAAATTGTGGGAGAGTGAATGAGTCTAGAGGACTTTTCGATAGGAAAAGT AACAGATGTGTAATTCTATGGAACTCTATGATTTCAGGCTATATTGCTAACAATATGAAA ATGGAGGCATTGGTTCTTTTCAATGAGATGAGGAATGAAACCCGGGAAGATTCTCGTACG CTGGCAGCGGTTATAAATGCTTGCATCGGTTTGGGCTTCCTAGAGACTGGTAAACAAATG CATTGTCATGCTTGTAAATTTGGGTTAATTGATGACATTGTTGTAGCTAGCACTTTGCTT GACATGTACTCCAAGTGTGGAAGCCCAATGGAAGCTTGCAAACTTTTCAGTGAGGTCGAA TCCTATGACACTATCTTACTTAACAGTATGATCAAGGTATATTTCAGCTGCGGAAGAATC GATGATGCAAAACGGGTATTTGAGAGAATTGAAAATAAGAGCTTGATTTCTTGGAACTCA ATGACTAACGGATTCAGTCAAAATGGTTGTACTGTTGAAACTTTAGAGTATTTCCATCAG ATGCATAAGCTGGATTTGCCTACAGATGAGGTTAGCCTCTCTAGTGTCATTAGTGCGTGT GCAAGTATATCTTCTCTCGAACTCGGTGAGCAAGTTTTTGCGAGGGCAACTATTGTTGGT CTTGACTCTGATCAAGTAGTATCATCTTCTCTCATTGATCTCTACTGCAAGTGTGGATTC GTTGAGCATGGCAGGAGAGTATTCGATACAATGGTTAAATCAGATGAAGTACCATGGAAC TCAATGATATCAGGTTATGCTACGAATGGTCAAGGATTTGAAGCGATTGACTTGTTCAAG AAAATGAGTGTTGCTGGTATAAGACCTACTCAGATCACTTTTATGGTTGTTCTAACAGCA TGCAATTACTGTGGTTTAGTCGAAGAGGGACGAAAATTGTTTGAGTCAATGAAGGTTGAT CATGGTTTTGTTCCAGATAAAGAGCATTTTTCATGTATGGTTGATCTTTTGGCTCGTGCT GGTTATGTGGAAGAAGCTATAAATCTTGTAGAAGAGATGCCTTTCGATGTGGATGGAAGC ATGTGGTCATCTATTCTAAGAGGATGTGTAGCAAATGGATATAAAGCCATGGGAAAGAAA GCTGCTGAGAAGATTATAGAGCTTGAACCTGAGAACTCAGTTGCTTATGTGCAGTTGTCC GCTATATTCGCAACCTCGGGAGATTGGGAAAGCTCGGCGCTTGTAAGAAAACTGATGAGG GAGAACAATGTGACAAAGAATCCAGGTTCTAGTTGGACTGATTGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G77010.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:28942710-28944797 FORWARD LENGTH=695 \| 201606
Sequence	MILKYNSSYRFYLSSSFLQAMEVDCRRYYVRLLQSCSSRNRETLWRQTNGLLLKKGFLSS IVIVANHLLQMYSRSGKMGIARNLFDEMPDRNYFSWNTMIEGYMNSGEKGTSLRFFDMMP ERDGYSWNVVVSGFAKAGELSVARRLFNAMPEKDVVTLNSLLHGYILNGYAEEALRLFKE LNFSADAITLTTVLKACAELEALKCGKQIHAQILIGGVECDSKMNSSLVNVYAKCGDLRM ASYMLEQIREPDDHSLSALISGYANCGRVNESRGLFDRKSNRCVILWNSMISGYIANNMK MEALVLFNEMRNETREDSRTLAAVINACIGLGFLETGKQMHCHACKFGLIDDIVVASTLL DMYSKCGSPMEACKLFSEVESYDTILLNSMIKVYFSCGRIDDAKRVFERIENKSLISWNS MTNGFSQNGCTVETLEYFHQMHKLDLPTDEVSLSSVISACASISSLELGEQVFARATIVG LDSDQVVSSSLIDLYCKCGFVEHGRRVFDTMVKSDEVPWNSMISGYATNGQGFEAIDLFK KMSVAGIRPTQITFMVVLTACNYCGLVEEGRKLFESMKVDHGFVPDKEHFSCMVDLLARA GYVEEAINLVEEMPFDVDGSMWSSILRGCVANGYKAMGKKAAEKIIELEPENSVAYVQLS AIFATSGDWESSALVRKLMRENNVTKNPGSSWTDC

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G77010.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:28942710-28944827 FORWARD LENGTH=2118 \| 201606
Sequence	ATGATTTTGAAGTACAATAGTAGTTACAGGTTTTATCTTTCAAGTAGTTTTCTCCAAGCT ATGGAAGTAGATTGTCGGCGTTATTACGTACGTCTTCTTCAATCATGCAGCAGCAGAAAT CGCGAAACTTTATGGAGACAAACCAATGGATTGCTCTTGAAGAAGGGTTTTCTTAGTTCA ATTGTCATTGTTGCTAACCATCTCCTCCAAATGTACTCCCGGTCTGGTAAAATGGGAATT GCGCGGAACTTGTTCGACGAAATGCCTGATAGAAACTATTTCTCGTGGAACACTATGATT GAAGGGTACATGAATTCTGGGGAAAAGGGAACGTCTTTGAGGTTTTTTGATATGATGCCA GAAAGAGATGGGTACTCTTGGAACGTGGTTGTTTCCGGGTTTGCTAAAGCTGGTGAGCTA AGTGTCGCTAGGAGGTTATTCAATGCCATGCCGGAAAAAGATGTTGTGACGTTGAACTCT CTGCTTCATGGATATATTTTAAACGGTTATGCAGAGGAAGCTCTGAGGTTGTTTAAAGAA TTGAATTTTAGCGCTGATGCGATCACATTGACGACAGTTCTTAAAGCTTGTGCTGAGTTA GAAGCTTTGAAATGTGGGAAGCAGATACATGCTCAGATTCTGATCGGTGGTGTTGAATGT GACTCGAAAATGAATAGTTCTTTAGTTAATGTGTATGCAAAGTGTGGTGATTTGAGAATG GCAAGCTATATGCTGGAGCAGATTAGGGAACCTGATGACCATTCTCTATCTGCCTTAATT TCAGGTTATGCAAATTGTGGGAGAGTGAATGAGTCTAGAGGACTTTTCGATAGGAAAAGT AACAGATGTGTAATTCTATGGAACTCTATGATTTCAGGCTATATTGCTAACAATATGAAA ATGGAGGCATTGGTTCTTTTCAATGAGATGAGGAATGAAACCCGGGAAGATTCTCGTACG CTGGCAGCGGTTATAAATGCTTGCATCGGTTTGGGCTTCCTAGAGACTGGTAAACAAATG CATTGTCATGCTTGTAAATTTGGGTTAATTGATGACATTGTTGTAGCTAGCACTTTGCTT GACATGTACTCCAAGTGTGGAAGCCCAATGGAAGCTTGCAAACTTTTCAGTGAGGTCGAA TCCTATGACACTATCTTACTTAACAGTATGATCAAGGTATATTTCAGCTGCGGAAGAATC GATGATGCAAAACGGGTATTTGAGAGAATTGAAAATAAGAGCTTGATTTCTTGGAACTCA ATGACTAACGGATTCAGTCAAAATGGTTGTACTGTTGAAACTTTAGAGTATTTCCATCAG ATGCATAAGCTGGATTTGCCTACAGATGAGGTTAGCCTCTCTAGTGTCATTAGTGCGTGT GCAAGTATATCTTCTCTCGAACTCGGTGAGCAAGTTTTTGCGAGGGCAACTATTGTTGGT CTTGACTCTGATCAAGTAGTATCATCTTCTCTCATTGATCTCTACTGCAAGTGTGGATTC GTTGAGCATGGCAGGAGAGTATTCGATACAATGGTTAAATCAGATGAAGTACCATGGAAC TCAATGATATCAGGTTATGCTACGAATGGTCAAGGATTTGAAGCGATTGACTTGTTCAAG AAAATGAGTGTTGCTGGTATAAGACCTACTCAGATCACTTTTATGGTTGTTCTAACAGCA TGCAATTACTGTGGTTTAGTCGAAGAGGGACGAAAATTGTTTGAGTCAATGAAGGTTGAT CATGGTTTTGTTCCAGATAAAGAGCATTTTTCATGTATGGTTGATCTTTTGGCTCGTGCT GGTTATGTGGAAGAAGCTATAAATCTTGTAGAAGAGATGCCTTTCGATGTGGATGGAAGC ATGTGGTCATCTATTCTAAGAGGATGTGTAGCAAATGGATATAAAGCCATGGGAAAGAAA GCTGCTGAGAAGATTATAGAGCTTGAACCTGAGAACTCAGTTGCTTATGTGCAGTTGTCC GCTATATTCGCAACCTCGGGAGATTGGGAAAGCTCGGCGCTTGTAAGAAAACTGATGAGG GAGAACAATGTGACAAAGAATCCAGGTTCTAGTTGGACTGATTGTTGAATGAATACTCAA TTTGAGTGTATAGCATAA