Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G73710.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:27721190-27724165 FORWARD LENGTH=2976 \| 201606
Sequence	ATGCTTCAGCCAAGTCCTCCTCACTACTCTTCCTCTAGAGATGTCAGACATCATCATCAT CATCATCATCATCATCATCATCTAGCTCTGAGTTCTAAAGCTAGGGTTTTTCCACTTTCA CTTCCCTGTAACTTCTCCTCTAGGGTTTCTTTTAAGCTTCAACTTCACTGCGCCGCTTCT TCCTCTTCTTCAGTTTCTCCACCTCGATGCTCTAAACCTAACCCAAGCTCTCGAAAACGC AAATATGGCGGCGTAATCCCTTCCATTTTGCGTTCTCTTGACTCTTCCACTGATATTGAA ACAACTCTAGCTTCTCTTTGTCTCAATTTAAGCCCTAAAGAACAAACTGTTCTTCTTAAA GAGCAGACTCGTTGGGAAAGAGTTCTTCGTGTGTTTCGATTTTTCCAGTCTCACCAAAGT TATGTTCCTAATGTGATTCATTACAACATTGTGTTAAGAGCTTTAGGGAGAGCGGGGAAA TGGGATGAATTGAGGCTTTGTTGGATTGAGATGGCTCATAATGGTGTTTTGCCTACTAAC AATACTTATGGTATGCTTGTTGATGTTTATGGTAAAGCTGGTCTTGTTAAGGAAGCTCTT CTTTGGATTAAGCATATGGGACAGAGAATGCATTTCCCTGATGAAGTCACTATGGCTACT GTTGTTAGAGTTTTCAAGAACTCCGGTGAGTTTGATCGTGCTGATAGGTTCTTTAAAGGT TGGTGCGCTGGAAAAGTTGATCTTGATTTGGATTCTATTGATGATTTTCCTAAGAATGGT TCAGCTCAATCTCCTGTGAACTTGAAGCAGTTCTTGTCGATGGAGCTTTTTAAGGTTGGT GCAAGGAATCCTATTGAGAAAAGTCTGCATTTTGCATCTGGTTCAGACTCTTCTCCGAGG AAGCCAAGGTTAACTTCCACCTTCAACACTCTGATTGATTTGTATGGAAAGGCAGGTCGT TTAAACGATGCTGCTAATCTCTTCTCGGAGATGTTGAAATCTGGAGTACCTATAGATACT GTAACGTTTAACACGATGATACATACTTGTGGAACTCATGGGCATTTGTCAGAGGCTGAA TCCTTGTTGAAGAAGATGGAAGAGAAAGGGATATCCCCTGATACTAAGACATATAATATC CTTTTGTCTCTTCATGCTGATGCTGGGGACATTGAGGCAGCTCTTGAGTACTATAGGAAA ATTAGGAAAGTAGGACTTTTTCCTGATACTGTAACTCATCGAGCTGTTCTTCATATCTTG TGTCAGCGGAAAATGGTTGCAGAAGTTGAAGCTGTGATAGCTGAGATGGACAGAAATAGC ATTCGCATTGATGAGCACTCTGTTCCTGTTATTATGCAGATGTATGTCAATGAAGGTTTA GTCGTACAGGCAAAAGCTCTGTTTGAGAGGTTCCAGTTGGATTGTGTGCTTTCGTCAACG ACACTTGCAGCAGTTATTGATGTCTATGCTGAAAAGGGACTGTGGGTTGAAGCGGAGACT GTGTTCTATGGGAAAAGAAACATGTCAGGCCAGAGGAATGATGTTTTGGAGTACAATGTC ATGATCAAGGCTTATGGTAAGGCCAAACTTCATGAGAAAGCACTTTCTCTCTTCAAAGGG ATGAAGAACCAAGGGACTTGGCCTGATGAGTGCACTTACAATTCCCTATTCCAGATGCTT GCTGGGGTTGATTTAGTGGACGAAGCCCAGCGGATCTTGGCTGAAATGCTGGATTCGGGC TGTAAACCTGGATGCAAGACCTATGCTGCTATGATAGCTAGCTATGTGCGGCTTGGCCTG TTGTCTGATGCAGTTGACCTGTACGAGGCAATGGAAAAAACAGGGGTGAAACCGAATGAA GTTGTTTATGGTTCCTTAATTAATGGGTTTGCTGAGAGTGGAATGGTCGAAGAAGCGATT CAATACTTTAGAATGATGGAAGAACATGGCGTTCAGTCCAATCATATCGTTCTGACTTCC CTTATCAAGGCTTATAGCAAAGTGGGGTGTCTTGAAGAAGCTAGGAGAGTGTATGACAAA ATGAAGGATTCAGAAGGTGGCCCAGATGTTGCTGCATCAAACAGCATGCTAAGTCTGTGT GCAGATCTTGGCATAGTTTCTGAAGCAGAATCCATTTTCAATGCTCTCAGAGAAAAAGGC ACATGTGATGTTATTTCGTTTGCAACAATGATGTACTTGTACAAGGGCATGGGCATGCTC GACGAGGCTATTGAAGTGGCTGAAGAAATGAGAGAGTCTGGTCTACTAAGTGACTGCACT TCATTTAATCAGGTTATGGCTTGCTACGCTGCTGATGGGCAGTTAAGTGAATGCTGTGAA CTGTTTCATGAGATGTTAGTTGAAAGAAAGCTCTTGCTGGATTGGGGAACATTTAAAACG CTCTTCACGCTCTTGAAGAAAGGTGGGGTGCCAAGTGAAGCTGTGTCGCAGCTACAAACC GCATACAATGAAGCTAAACCACTGGCAACACCAGCAATCACTGCAACTCTGTTCTCAGCC ATGGGTTTGTATGCATATGCGCTGGAATCATGCCAAGAGCTCACAAGTGGTGAAATTCCT CGCGAGCATTTTGCATACAACGCAGTGATATACACTTATAGTGCATCAGGAGACATTGAC ATGGCCCTAAAGGCATACATGAGAATGCAGGAAAAAGGTCTAGAACCAGATATTGTCACG CAAGCCTACCTTGTTGGGATATACGGGAAAGCGGGAATGGTGGAAGGTGTGAAGAGGGTA CATAGCCGGCTGACGTTTGGGGAGCTTGAACCAAGCCAATCGTTGTTTAAAGCAGTTAGA GATGCTTATGTGAGTGCAAACAGACAGGACTTGGCTGATGTGGTGAAGAAAGAGATGAGC ATTGCTTTTGAAGCTGAAAGGGAGTGTAGTTCAAGATCTGGAGAAGAAGAAGAAGACGAT GAAGAGGAAAATTCTGAAGAAGACGAGGCATTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G73710.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:27721190-27724165 FORWARD LENGTH=991 \| 201606
Sequence	MLQPSPPHYSSSRDVRHHHHHHHHHHHLALSSKARVFPLSLPCNFSSRVSFKLQLHCAAS SSSSVSPPRCSKPNPSSRKRKYGGVIPSILRSLDSSTDIETTLASLCLNLSPKEQTVLLK EQTRWERVLRVFRFFQSHQSYVPNVIHYNIVLRALGRAGKWDELRLCWIEMAHNGVLPTN NTYGMLVDVYGKAGLVKEALLWIKHMGQRMHFPDEVTMATVVRVFKNSGEFDRADRFFKG WCAGKVDLDLDSIDDFPKNGSAQSPVNLKQFLSMELFKVGARNPIEKSLHFASGSDSSPR KPRLTSTFNTLIDLYGKAGRLNDAANLFSEMLKSGVPIDTVTFNTMIHTCGTHGHLSEAE SLLKKMEEKGISPDTKTYNILLSLHADAGDIEAALEYYRKIRKVGLFPDTVTHRAVLHIL CQRKMVAEVEAVIAEMDRNSIRIDEHSVPVIMQMYVNEGLVVQAKALFERFQLDCVLSST TLAAVIDVYAEKGLWVEAETVFYGKRNMSGQRNDVLEYNVMIKAYGKAKLHEKALSLFKG MKNQGTWPDECTYNSLFQMLAGVDLVDEAQRILAEMLDSGCKPGCKTYAAMIASYVRLGL LSDAVDLYEAMEKTGVKPNEVVYGSLINGFAESGMVEEAIQYFRMMEEHGVQSNHIVLTS LIKAYSKVGCLEEARRVYDKMKDSEGGPDVAASNSMLSLCADLGIVSEAESIFNALREKG TCDVISFATMMYLYKGMGMLDEAIEVAEEMRESGLLSDCTSFNQVMACYAADGQLSECCE LFHEMLVERKLLLDWGTFKTLFTLLKKGGVPSEAVSQLQTAYNEAKPLATPAITATLFSA MGLYAYALESCQELTSGEIPREHFAYNAVIYTYSASGDIDMALKAYMRMQEKGLEPDIVT QAYLVGIYGKAGMVEGVKRVHSRLTFGELEPSQSLFKAVRDAYVSANRQDLADVVKKEMS IAFEAERECSSRSGEEEEDDEEENSEEDEAF

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G73710.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:27721190-27724954 FORWARD LENGTH=3765 \| 201606
Sequence	ATGCTTCAGCCAAGTCCTCCTCACTACTCTTCCTCTAGAGATGTCAGACATCATCATCAT CATCATCATCATCATCATCATCTAGCTCTGAGTTCTAAAGCTAGGGTTTTTCCACTTTCA CTTCCCTGTAACTTCTCCTCTAGGGTTTCTTTTAAGCTTCAACTTCACTGCGCCGCTTCT TCCTCTTCTTCAGTTTCTCCACCTCGATGCTCTAAACCTAACCCAAGCTCTCGAAAACGC AAATATGGCGGCGTAATCCCTTCCATTTTGCGTTCTCTTGACTCTTCCACTGATATTGAA ACAACTCTAGCTTCTCTTTGTCTCAATTTAAGCCCTAAAGAACAAACTGTTCTTCTTAAA GAGCAGACTCGTTGGGAAAGAGTTCTTCGTGTGTTTCGATTTTTCCAGTCTCACCAAAGT TATGTTCCTAATGTGATTCATTACAACATTGTGTTAAGAGCTTTAGGGAGAGCGGGGAAA TGGGATGAATTGAGGCTTTGTTGGATTGAGATGGCTCATAATGGTGTTTTGCCTACTAAC AATACTTATGGTATGCTTGTTGATGTTTATGGTAAAGCTGGTCTTGTTAAGGAAGCTCTT CTTTGGATTAAGCATATGGGACAGAGAATGCATTTCCCTGATGAAGTCACTATGGCTACT GTTGTTAGAGTTTTCAAGAACTCCGGTGAGTTTGATCGTGCTGATAGGTTCTTTAAAGGT TGGTGCGCTGGAAAAGTTGATCTTGATTTGGATTCTATTGATGATTTTCCTAAGAATGGT TCAGCTCAATCTCCTGTGAACTTGAAGCAGTTCTTGTCGATGGAGCTTTTTAAGGTTGGT GCAAGGAATCCTATTGAGAAAAGTCTGCATTTTGCATCTGGTTCAGACTCTTCTCCGAGG AAGCCAAGGTTAACTTCCACCTTCAACACTCTGATTGATTTGTATGGAAAGGCAGGTCGT TTAAACGATGCTGCTAATCTCTTCTCGGAGATGTTGAAATCTGGAGTACCTATAGATACT GTAACGTTTAACACGATGATACATACTTGTGGAACTCATGGGCATTTGTCAGAGGCTGAA TCCTTGTTGAAGAAGATGGAAGAGAAAGGGATATCCCCTGATACTAAGACATATAATATC CTTTTGTCTCTTCATGCTGATGCTGGGGACATTGAGGCAGCTCTTGAGTACTATAGGAAA ATTAGGAAAGTAGGACTTTTTCCTGATACTGTAACTCATCGAGCTGTTCTTCATATCTTG TGTCAGCGGAAAATGGTTGCAGAAGTTGAAGCTGTGATAGCTGAGATGGACAGAAATAGC ATTCGCATTGATGAGCACTCTGTTCCTGTTATTATGCAGATGTATGTCAATGAAGGTTTA GTCGTACAGGCAAAAGCTCTGTTTGAGAGGTTCCAGTTGGATTGTGTGCTTTCGTCAACG ACACTTGCAGCAGTTATTGATGTCTATGCTGAAAAGGGACTGTGGGTTGAAGCGGAGACT GTGTTCTATGGGAAAAGAAACATGTCAGGCCAGAGGAATGATGTTTTGGAGTACAATGTC ATGATCAAGGCTTATGGTAAGGCCAAACTTCATGAGAAAGCACTTTCTCTCTTCAAAGGG ATGAAGAACCAAGGGACTTGGCCTGATGAGTGCACTTACAATTCCCTATTCCAGATGCTT GCTGGGGTTGATTTAGTGGACGAAGCCCAGCGGATCTTGGCTGAAATGCTGGATTCGGGC TGTAAACCTGGATGCAAGACCTATGCTGCTATGATAGCTAGCTATGTGCGGCTTGGCCTG TTGTCTGATGCAGTTGACCTGTACGAGGCAATGGAAAAAACAGGGGTGAAACCGAATGAA GTTGTTTATGGTTCCTTAATTAATGGGTTTGCTGAGAGTGGAATGGTCGAAGAAGCGATT CAATACTTTAGAATGATGGAAGAACATGGCGTTCAGTCCAATCATATCGTTCTGACTTCC CTTATCAAGGCTTATAGCAAAGTGGGGTGTCTTGAAGAAGCTAGGAGAGTGTATGACAAA ATGAAGGATTCAGAAGGTGGCCCAGATGTTGCTGCATCAAACAGCATGCTAAGTCTGTGT GCAGATCTTGGCATAGTTTCTGAAGCAGAATCCATTTTCAATGCTCTCAGAGAAAAAGGC ACATGTGATGTTATTTCGTTTGCAACAATGATGTACTTGTACAAGGGCATGGGCATGCTC GACGAGGCTATTGAAGTGGCTGAAGAAATGAGAGAGTCTGGTCTACTAAGTGACTGCACT TCATTTAATCAGGTTATGGCTTGCTACGCTGCTGATGGGCAGTTAAGTGAATGCTGTGAA CTGTTTCATGAGATGTTAGTTGAAAGAAAGCTCTTGCTGGATTGGGGAACATTTAAAACG CTCTTCACGCTCTTGAAGAAAGGTGGGGTGCCAAGTGAAGCTGTGTCGCAGCTACAAACC GCATACAATGAAGCTAAACCACTGGCAACACCAGCAATCACTGCAACTCTGTTCTCAGCC ATGGGTTTGTATGCATATGCGCTGGAATCATGCCAAGAGCTCACAAGTGGTGAAATTCCT CGCGAGCATTTTGCATACAACGCAGTGATATACACTTATAGTGCATCAGGAGACATTGAC ATGGCCCTAAAGGCATACATGAGAATGCAGGAAAAAGGTCTAGAACCAGATATTGTCACG CAAGCCTACCTTGTTGGGATATACGGGAAAGCGGGAATGGTGGAAGGTGTGAAGAGGGTA CATAGCCGGCTGACGTTTGGGGAGCTTGAACCAAGCCAATCGTTGTTTAAAGCAGTTAGA GATGCTTATGTGAGTGCAAACAGACAGGACTTGGCTGATGTGGTGAAGAAAGAGATGAGC ATTGCTTTTGAAGCTGAAAGGGAGTGTAGTTCAAGATCTGGAGAAGAAGAAGAAGACGAT GAAGAGGAAAATTCTGAAGAAGACGAGGCATTTTGAAGTGTAGCCACAGATGTATGTAAG AAATATTGTAGAATATAGGATTTAGTGGAAATGGACTGTACAGTTTCACAGAAGCCAAAG GAAATATGCATACTTAAGCCTCAGATTGATCTCTGGTAAAGAAATGTGTATCTTAAAACT GTTATAGAAAGAAAAAAAAAGGTTCCACAGGGTCAAATCTATAAAAGCGAGCACCTTTGG CTATGGTTTTGGTAGAGGAATTAGCATACGCTCCTTACAACAATAGATTGATTTGCATCA TCGGGTTGGTCTTCTGTTGGTTTTGGTCTCTGGATTGAACATCTTTCTCCTGTCTTGCTT GCTCTTATTTTCAATTGTATAGCATCAAAGCCCATGAAAAGAGCCAGATGTTCTGGAATT GATTCCAATTTGGAATCTTGTCAGTTACTGGTGATGAATATCAACATGGAAGATATGAAA CAGAGTAGCCAGCAAATTCCTTCCATTCGGAACAAAGAGTCTCTCAGCTTCAGTCAAAGT ATATCAGTTATTGATCTCAAGAAAGTAATAGTAGTGAGCAATGAAGATGATGATGGAGCT CTAGAGTTGAAGAACAGAGGAGTGGAACGAACCAGTGGAGAACTCTTGAAGACCACAGTG TCAATGTGTTTATTGTTGTCTTTGTCTTTCTCTAAAAGTTGTAAAAAAAAAGGGTGTGAA GCTAAAGCTAAATGGTATGTAAGCAATGTTTTGCAATTTTAAATTTACAAAATAACACTC GGAGTTTCTGAAAGTTTAATTTTGACCCATAATATTTGATATTTG