Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G71210.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:26838850-26841489 REVERSE LENGTH=2640 \| 201606
Sequence	ATGCTTCGGTGTTGGTCAGTCACCGTCGAGAGATCATGCGAAGGAATGCTCCTCAGGCGG AGGATACTATCGCTCTCTGCGTCGTCGTTCAGAAACTTTACTTCCGGTAACAACGGCGAC GCTATTCCGTTCTCTACCTTCACGAAACCTTCTTCTTCAATCGCTCCCGGAGATTTCCTC GTCCGTGAATGGAAAGACTGGTTTAAGCATCGAGATGTGAAACAGAGCCACCAATTAATC GATCGAATCTTTGACATCCTTCGAGCTCCTTCTAACGATGGAGACGATAGAGCTTTTTAT CTCCACCTCTCCAATCTCCGACTTCGTCTCACTGAGAAATTCGTCCTCGACGTGCTTTCA CACACTCGTTACGATATCCTCTGTTGTCTCAAATTCTTCGATTGGGCTGCTCGTCAGCCT GGGTTTCATCACACGCGTGCTACTTTTCATGCTATCTTCAAGATCCTTCGTGGTGCGAAG CTTGTGACTCTTATGATTGACTTTTTGGATCGAAGTGTTGGTTTTGAAAGTTGCCGTCAT TCTCTTCGTCTCTGTGATGCTCTTGTTGTTGGTTATGCTGTAGCTGGTCGTACTGATATA GCTCTTCAGCATTTTGGTAATATGAGATTTCGAGGTTTGGATTTGGATTCTTTTGGGTAT CATGTGCTTTTGAATGCACTTGTTGAGGAGAAGTGTTTTGATAGTTTTGATGTCATCTTC GACCAGATCTCCGTGCGTGGCTTCGTATGTGCTGTTACGCATTCGATTTTGGTGAAGAAG TTTTGCAAGCAAGGGAAGCTTGATGAGGCTGAAGATTATCTTCGAGCCTTGCTGCCTAAT GATCCTGCTGGATGTGGTTCTGGCTTAGGTATATTGGTTGATGCTCTATGTTCCAAACGA AAGTTTCAGGAAGCTACTAAGTTGTTAGACGAGATCAAACTGGTGGGAACAGTGAATATG GACCGTGCTTATAACATTTGGATTAGGGCGCTTATTAAAGCTGGATTCTTGAATAACCCT GCGGATTTCTTGCAGAAGATTAGTCCTTTGGAAGGTTGTGAACTCGAAGTTTTCAGGTAT AACTCTATGGTCTTTCAACTTTTGAAGGAGAACAATCTTGATGGTGTGTATGATATTCTT ACGGAGATGATGGTACGTGGAGTTTCGCCGAATAAGAAAACGATGAATGCTGCTTTATGC TTCTTTTGCAAAGCTGGATTTGTAGATGAAGCCCTCGAGTTATACCGGTCGAGGTCAGAA ATTGGGTTTGCTCCTACCGCCATGTCTTACAACTATCTGATTCATACCCTTTGTGCCAAT GAAAGTGTTGAACAAGCTTATGATGTCTTGAAAGGGGCAATTGACCGAGGGCATTTTCTT GGTGGAAAGACATTTAGTACACTAACCAATGCCTTGTGCTGGAAGGGGAAGCCTGACATG GCAAGGGAGCTGGTTATTGCTGCCGCTGAACGGGACTTATTGCCTAAACGTATAGCTGGT TGCAAGATTATATCAGCTCTTTGCGATGTTGGGAAAGTGGAGGACGCTCTTATGATTAAT GAGCTATTCAATAAAAGTGGTGTAGACACCTCCTTTAAAATGTTCACCAGTTTGATATAT GGCTCAATCACACTAATGAGGGGAGACATAGCTGCTAAACTTATCATCAGGATGCAGGAA AAGGGCTACACCCCGACCCGTAGTCTCTATCGAAATGTTATTCAATGTGTTTGTGAGATG GAAAGTGGTGAAAAAAACTTCTTTACTACTTTGCTAAAGTTTCAGTTGTCTCTTTGGGAA CACAAGGTTCAGGCCTACAACTTATTCATTGAAGGAGCTGGGTTTGCAGGAAAACCAAAA CTTGCAAGACTAGTGTATGATATGATGGATAGAGATGGTATCACGCCCACAGTAGCTTCA AACATTCTCATGCTTCAGAGTTATCTAAAAAATGAGAAAATCGCCGATGCTCTTCACTTT TTCCATGACCTGCGTGAACAAGGTAAGACCAAAAAAAGACTGTACCAAGTTATGATTGTT GGTCTCTGTAAAGCAAATAAATTGGATGATGCTATGCATTTCTTGGAAGAAATGAAGGGA GAAGGACTACAGCCTAGTATCGAATGTTACGAAGTAAACATACAAAAATTGTGCAACGAA GAAAAGTATGATGAGGCAGTTGGATTAGTCAATGAATTTAGGAAAAGTGGGCGTCGTATT ACAGCTTTCATAGGTAATGTCCTTTTGCATAACGCAATGAAGAGCAAAGGGGTGTATGAA GCATGGACACGGATGAGAAATATAGAAGATAAGATCCCTGAGATGAAGTCACTTGGTGAG TTGATAGGATTATTCTCAGGACGAATAGATATGGAAGTAGAACTGAAGCGGTTAGATGAA GTTATAGAGAAATGCTATCCTCTTGATATGTACACGTACAATATGCTGTTGAGAATGATT GTAATGAACCAGGCGGAAGATGCATATGAGATGGTTGAAAGAATAGCTCGGAGAGGATAT GTGCCTAATGAACGGACTGACATGATCCTTGAACGGGCTAACCGCATACTAGAGGAACGG AATTCAAGGTCAAACTTAGGGAGGAATGGTTGGAATAGTAGACAGAGGCAACTTGAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G71210.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:26838850-26841489 REVERSE LENGTH=879 \| 201606
Sequence	MLRCWSVTVERSCEGMLLRRRILSLSASSFRNFTSGNNGDAIPFSTFTKPSSSIAPGDFL VREWKDWFKHRDVKQSHQLIDRIFDILRAPSNDGDDRAFYLHLSNLRLRLTEKFVLDVLS HTRYDILCCLKFFDWAARQPGFHHTRATFHAIFKILRGAKLVTLMIDFLDRSVGFESCRH SLRLCDALVVGYAVAGRTDIALQHFGNMRFRGLDLDSFGYHVLLNALVEEKCFDSFDVIF DQISVRGFVCAVTHSILVKKFCKQGKLDEAEDYLRALLPNDPAGCGSGLGILVDALCSKR KFQEATKLLDEIKLVGTVNMDRAYNIWIRALIKAGFLNNPADFLQKISPLEGCELEVFRY NSMVFQLLKENNLDGVYDILTEMMVRGVSPNKKTMNAALCFFCKAGFVDEALELYRSRSE IGFAPTAMSYNYLIHTLCANESVEQAYDVLKGAIDRGHFLGGKTFSTLTNALCWKGKPDM ARELVIAAAERDLLPKRIAGCKIISALCDVGKVEDALMINELFNKSGVDTSFKMFTSLIY GSITLMRGDIAAKLIIRMQEKGYTPTRSLYRNVIQCVCEMESGEKNFFTTLLKFQLSLWE HKVQAYNLFIEGAGFAGKPKLARLVYDMMDRDGITPTVASNILMLQSYLKNEKIADALHF FHDLREQGKTKKRLYQVMIVGLCKANKLDDAMHFLEEMKGEGLQPSIECYEVNIQKLCNE EKYDEAVGLVNEFRKSGRRITAFIGNVLLHNAMKSKGVYEAWTRMRNIEDKIPEMKSLGE LIGLFSGRIDMEVELKRLDEVIEKCYPLDMYTYNMLLRMIVMNQAEDAYEMVERIARRGY VPNERTDMILERANRILEERNSRSNLGRNGWNSRQRQLE

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G71210.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:26838289-26841507 REVERSE LENGTH=3219 \| 201606
Sequence	GGTTTTTCGAGTTTTTGGATGCTTCGGTGTTGGTCAGTCACCGTCGAGAGATCATGCGAA GGAATGCTCCTCAGGCGGAGGATACTATCGCTCTCTGCGTCGTCGTTCAGAAACTTTACT TCCGGTAACAACGGCGACGCTATTCCGTTCTCTACCTTCACGAAACCTTCTTCTTCAATC GCTCCCGGAGATTTCCTCGTCCGTGAATGGAAAGACTGGTTTAAGCATCGAGATGTGAAA CAGAGCCACCAATTAATCGATCGAATCTTTGACATCCTTCGAGCTCCTTCTAACGATGGA GACGATAGAGCTTTTTATCTCCACCTCTCCAATCTCCGACTTCGTCTCACTGAGAAATTC GTCCTCGACGTGCTTTCACACACTCGTTACGATATCCTCTGTTGTCTCAAATTCTTCGAT TGGGCTGCTCGTCAGCCTGGGTTTCATCACACGCGTGCTACTTTTCATGCTATCTTCAAG ATCCTTCGTGGTGCGAAGCTTGTGACTCTTATGATTGACTTTTTGGATCGAAGTGTTGGT TTTGAAAGTTGCCGTCATTCTCTTCGTCTCTGTGATGCTCTTGTTGTTGGTTATGCTGTA GCTGGTCGTACTGATATAGCTCTTCAGCATTTTGGTAATATGAGATTTCGAGGTTTGGAT TTGGATTCTTTTGGGTATCATGTGCTTTTGAATGCACTTGTTGAGGAGAAGTGTTTTGAT AGTTTTGATGTCATCTTCGACCAGATCTCCGTGCGTGGCTTCGTATGTGCTGTTACGCAT TCGATTTTGGTGAAGAAGTTTTGCAAGCAAGGGAAGCTTGATGAGGCTGAAGATTATCTT CGAGCCTTGCTGCCTAATGATCCTGCTGGATGTGGTTCTGGCTTAGGTATATTGGTTGAT GCTCTATGTTCCAAACGAAAGTTTCAGGAAGCTACTAAGTTGTTAGACGAGATCAAACTG GTGGGAACAGTGAATATGGACCGTGCTTATAACATTTGGATTAGGGCGCTTATTAAAGCT GGATTCTTGAATAACCCTGCGGATTTCTTGCAGAAGATTAGTCCTTTGGAAGGTTGTGAA CTCGAAGTTTTCAGGTATAACTCTATGGTCTTTCAACTTTTGAAGGAGAACAATCTTGAT GGTGTGTATGATATTCTTACGGAGATGATGGTACGTGGAGTTTCGCCGAATAAGAAAACG ATGAATGCTGCTTTATGCTTCTTTTGCAAAGCTGGATTTGTAGATGAAGCCCTCGAGTTA TACCGGTCGAGGTCAGAAATTGGGTTTGCTCCTACCGCCATGTCTTACAACTATCTGATT CATACCCTTTGTGCCAATGAAAGTGTTGAACAAGCTTATGATGTCTTGAAAGGGGCAATT GACCGAGGGCATTTTCTTGGTGGAAAGACATTTAGTACACTAACCAATGCCTTGTGCTGG AAGGGGAAGCCTGACATGGCAAGGGAGCTGGTTATTGCTGCCGCTGAACGGGACTTATTG CCTAAACGTATAGCTGGTTGCAAGATTATATCAGCTCTTTGCGATGTTGGGAAAGTGGAG GACGCTCTTATGATTAATGAGCTATTCAATAAAAGTGGTGTAGACACCTCCTTTAAAATG TTCACCAGTTTGATATATGGCTCAATCACACTAATGAGGGGAGACATAGCTGCTAAACTT ATCATCAGGATGCAGGAAAAGGGCTACACCCCGACCCGTAGTCTCTATCGAAATGTTATT CAATGTGTTTGTGAGATGGAAAGTGGTGAAAAAAACTTCTTTACTACTTTGCTAAAGTTT CAGTTGTCTCTTTGGGAACACAAGGTTCAGGCCTACAACTTATTCATTGAAGGAGCTGGG TTTGCAGGAAAACCAAAACTTGCAAGACTAGTGTATGATATGATGGATAGAGATGGTATC ACGCCCACAGTAGCTTCAAACATTCTCATGCTTCAGAGTTATCTAAAAAATGAGAAAATC GCCGATGCTCTTCACTTTTTCCATGACCTGCGTGAACAAGGTAAGACCAAAAAAAGACTG TACCAAGTTATGATTGTTGGTCTCTGTAAAGCAAATAAATTGGATGATGCTATGCATTTC TTGGAAGAAATGAAGGGAGAAGGACTACAGCCTAGTATCGAATGTTACGAAGTAAACATA CAAAAATTGTGCAACGAAGAAAAGTATGATGAGGCAGTTGGATTAGTCAATGAATTTAGG AAAAGTGGGCGTCGTATTACAGCTTTCATAGGTAATGTCCTTTTGCATAACGCAATGAAG AGCAAAGGGGTGTATGAAGCATGGACACGGATGAGAAATATAGAAGATAAGATCCCTGAG ATGAAGTCACTTGGTGAGTTGATAGGATTATTCTCAGGACGAATAGATATGGAAGTAGAA CTGAAGCGGTTAGATGAAGTTATAGAGAAATGCTATCCTCTTGATATGTACACGTACAAT ATGCTGTTGAGAATGATTGTAATGAACCAGGCGGAAGATGCATATGAGATGGTTGAAAGA ATAGCTCGGAGAGGATATGTGCCTAATGAACGGACTGACATGATCCTTGAACGGGCTAAC CGCATACTAGAGGAACGGAATTCAAGGTCAAACTTAGGGAGGAATGGTTGGAATAGTAGA CAGAGGCAACTTGAATGATGAAAAGTATGTCACAGAGAGGTCAGAATTGTTGAATAGAGA GAACAAGGGAGTTGATTTGGATTCAGTATCTGTTTTGGGATTTGGATCATGGACAACAGA TGAATGAGAAAAGCCAGATTCTTCTTCTTGAGGCTTTATATGTCCTGGACGTTGTAACTT GCAGGAGCTTTTTTATCTCTGGATTGCAAAAGATCGATGGTATTTTCCCAGAAGCTTTTT GTTTTTTTTTAAGTAAAGATCGATGTGTCACTAAAGACACTTACAGAATTGGGTAGTATC CATTATGTACACAATTGTTTGTAGTCTTTCCTAGAAACACACAAGAATTGGGTAGTATCC ATTATGTACACAATTGTTTGTAGTCTTTCCTAGAAACACACAAGTTTTGTTGTGCGACAC AACTACTCAGAGAGAGATTTCAACAATTTTTTGTCATATTCTTTATGTGTTGCCTGTTGG TAAGGAAAATCAATGGTGGTCGCCCACCTTGTTTCGAAAATTGGTGTTTGTAATTACATT TGTTTACTAGTTCTAGTAATGATGAATCTTCTTATTTTG