Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G61380.1
CDS Infomation	\| S-domain-1 29 \| Chr1:22646277-22649401 REVERSE LENGTH=2418 \| 201606
Sequence	ATGGGTATGGTTTTATTTGCTTGCTTGCTTTTACTAATCATATTCCCAACTTGTGGCTAT GCAGCTATAAACACATCAAGTCCTTTGTCAATAAGACAAACTCTGAGTTCTCCTGGTGGA TTTTATGAGTTAGGCTTCTTCAGTCCTAATAATACTCAGAATCAGTATGTCGGGATCTGG TTCAAGAAGATTGTTCCTCGTGTAGTTGTGTGGGTGGCTAACAGAGATACGCCAGTTACT AGCTCTGCAGCAAATCTCACTATCAGCAGCAATGGGAGCCTGATCTTGCTTGATGGGAAA CAAGATGTTATTTGGTCAACAGGAAAAGCTTTCACATCCAACAAATGTCATGCGGAGCTC TTAGATACCGGAAATTTTGTTGTAATTGATGATGTTTCAGGGAATAAATTATGGCAAAGC TTCGAGCATCTTGGTAATACTATGCTGCCTCAGTCATCATTGATGTATGATACTTCTAAT GGCAAGAAGCGTGTGTTGACTACATGGAAAAGTAACAGCGATCCTTCGCCTGGGGAGTTC TCACTGGAGATTACACCACAAATCCCCACACAAGGCCTTATAAGAAGAGGCTCAGTACCT TACTGGAGATGTGGTCCTTGGGCAAAAACAAGATTCTCTGGGATATCTGGAATTGATGCA TCATATGTAAGTCCATTCAGCGTTGTCCAGGATACAGCAGCCGGCACAGGATCTTTCTCT TATTCCACATTAAGAAACTATAATCTCTCATATGTTACGCTAACACCAGAAGGGAAAATG AAGATCCTCTGGGATGATGGAAATAATTGGAAGCTTCACTTGTCTCTCCCAGAGAACCCA TGTGATCTATATGGTAGATGCGGGCCTTATGGTTTGTGTGTGAGATCTGATCCCCCAAAG TGTGAATGCTTGAAAGGGTTTGTACCAAAGTCTGATGAGGAGTGGGGAAAAGGAAACTGG ACAAGTGGGTGTGTGAGACGTACAAAATTATCTTGCCAAGCAAAATCTTCTATGAAAACA CAAGGCAAAGACACAGACATCTTCTATCGTATGACAGATGTAAAGACTCCGGATCTGCAC CAATTTGCAAGCTTTCTCAATGCCGAACAGTGCTATCAAGGTTGTCTAGGCAACTGTTCT TGCACAGCCTTCGCCTATATTAGTGGAATTGGATGTTTGGTATGGAATGGGGAGCTAGCA GACACCGTTCAATTTTTGTCTAGCGGAGAGTTTCTCTTCATTCGTCTTGCAAGTTCAGAA TTGGCTGGAAGCAGTCGAAGGAAGATTATCGTAGGCACTACTGTCAGCCTTTCCATTTTC TTGATCTTGGTATTTGCTGCAATTATGTTGTGGAGATACAGAGCGAAACAAAATGATGCA TGGAAGAATGGTTTTGAACGACAAGATGTCTCCGGCGTCAATTTCTTTGAGATGCATACA ATACGAACTGCCACCAATAACTTCAGTCCTTCAAATAAACTTGGTCAAGGTGGATTTGGT CCAGTTTACAAGGGAAAGTTGGTAGATGGGAAGGAAATAGGTGTTAAACGCCTTGCTAGT AGTTCCGGTCAGGGTACAGAGGAGTTCATGAATGAAATAACACTGATCTCAAAATTGCAA CACAGAAACTTGGTTCGGCTTTTGGGATACTGCATCGACGGAGAAGAGAAGCTACTGATC TATGAGTTCATGGTGAACAAAAGTCTCGATATTTTTATATTTGATCCATGTCTAAAGTTT GAGCTTGATTGGCCAAAGAGATTTAATATCATTCAAGGTATTGCGCGTGGACTTCTCTAT CTCCACCGTGACTCACGCCTCAGAGTTATTCACCGAGACCTGAAGGTCAGCAATATTCTT CTGGACGACAGAATGAATCCAAAAATATCAGATTTTGGATTGGCTCGGATGTTCCAGGGA ACCCAATATCAAGACAACACTCGCAGAGTTGTAGGAACTCTAGGATATATGTCTCCCGAG TATGCATGGGCAGGATTGTTCTCTGAGAAGTCTGATATCTATAGCTTCGGAGTTCTGATG TTAGAAATCATCAGCGGAAAGAGAATTTCACGGTTCATCTATGGTGATGAAAGCAAAGGC CTTCTTGCTTATACATGGGATTCTTGGTGCGAGACCGGGGGATCAAATCTACTTGACAGA GATCTTACTGATACATGCCAAGCATTCGAAGTTGCGAGATGTGTTCAGATTGGTCTGCTC TGTGTTCAACACGAAGCCGTCGACAGACCCAACACTCTTCAAGTACTATCCATGCTTACT TCAGCAACAGATCTTCCAGTACCAAAACAGCCAATATTTGCAGTGCATACTCTAAACGAT ATGCCAATGTTACAGGCTAATTCTCAAGATTTCTTATCTGTAAATGAGATGACAGAATCT ATGATCCAAGGAAGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G61380.1
PEP Infomation	\| S-domain-1 29 \| Chr1:22646277-22649401 REVERSE LENGTH=805 \| 201606
Sequence	MGMVLFACLLLLIIFPTCGYAAINTSSPLSIRQTLSSPGGFYELGFFSPNNTQNQYVGIW FKKIVPRVVVWVANRDTPVTSSAANLTISSNGSLILLDGKQDVIWSTGKAFTSNKCHAEL LDTGNFVVIDDVSGNKLWQSFEHLGNTMLPQSSLMYDTSNGKKRVLTTWKSNSDPSPGEF SLEITPQIPTQGLIRRGSVPYWRCGPWAKTRFSGISGIDASYVSPFSVVQDTAAGTGSFS YSTLRNYNLSYVTLTPEGKMKILWDDGNNWKLHLSLPENPCDLYGRCGPYGLCVRSDPPK CECLKGFVPKSDEEWGKGNWTSGCVRRTKLSCQAKSSMKTQGKDTDIFYRMTDVKTPDLH QFASFLNAEQCYQGCLGNCSCTAFAYISGIGCLVWNGELADTVQFLSSGEFLFIRLASSE LAGSSRRKIIVGTTVSLSIFLILVFAAIMLWRYRAKQNDAWKNGFERQDVSGVNFFEMHT IRTATNNFSPSNKLGQGGFGPVYKGKLVDGKEIGVKRLASSSGQGTEEFMNEITLISKLQ HRNLVRLLGYCIDGEEKLLIYEFMVNKSLDIFIFDPCLKFELDWPKRFNIIQGIARGLLY LHRDSRLRVIHRDLKVSNILLDDRMNPKISDFGLARMFQGTQYQDNTRRVVGTLGYMSPE YAWAGLFSEKSDIYSFGVLMLEIISGKRISRFIYGDESKGLLAYTWDSWCETGGSNLLDR DLTDTCQAFEVARCVQIGLLCVQHEAVDRPNTLQVLSMLTSATDLPVPKQPIFAVHTLND MPMLQANSQDFLSVNEMTESMIQGR

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G61380.1
Transcript Infomation	\| S-domain-1 29 \| Chr1:22645923-22649521 REVERSE LENGTH=2892 \| 201606
Sequence	ATTTAATTATCTCAGGATACGTTAACATAAAAGTTTTTTTTTCTCTTGGTCTCAATGCTC ACTCTATCCCCATGAAGTTTTGCTCATACTCAAGTTATCTTGCAGAGAAATAGAAAAAAG ATGGGTATGGTTTTATTTGCTTGCTTGCTTTTACTAATCATATTCCCAACTTGTGGCTAT GCAGCTATAAACACATCAAGTCCTTTGTCAATAAGACAAACTCTGAGTTCTCCTGGTGGA TTTTATGAGTTAGGCTTCTTCAGTCCTAATAATACTCAGAATCAGTATGTCGGGATCTGG TTCAAGAAGATTGTTCCTCGTGTAGTTGTGTGGGTGGCTAACAGAGATACGCCAGTTACT AGCTCTGCAGCAAATCTCACTATCAGCAGCAATGGGAGCCTGATCTTGCTTGATGGGAAA CAAGATGTTATTTGGTCAACAGGAAAAGCTTTCACATCCAACAAATGTCATGCGGAGCTC TTAGATACCGGAAATTTTGTTGTAATTGATGATGTTTCAGGGAATAAATTATGGCAAAGC TTCGAGCATCTTGGTAATACTATGCTGCCTCAGTCATCATTGATGTATGATACTTCTAAT GGCAAGAAGCGTGTGTTGACTACATGGAAAAGTAACAGCGATCCTTCGCCTGGGGAGTTC TCACTGGAGATTACACCACAAATCCCCACACAAGGCCTTATAAGAAGAGGCTCAGTACCT TACTGGAGATGTGGTCCTTGGGCAAAAACAAGATTCTCTGGGATATCTGGAATTGATGCA TCATATGTAAGTCCATTCAGCGTTGTCCAGGATACAGCAGCCGGCACAGGATCTTTCTCT TATTCCACATTAAGAAACTATAATCTCTCATATGTTACGCTAACACCAGAAGGGAAAATG AAGATCCTCTGGGATGATGGAAATAATTGGAAGCTTCACTTGTCTCTCCCAGAGAACCCA TGTGATCTATATGGTAGATGCGGGCCTTATGGTTTGTGTGTGAGATCTGATCCCCCAAAG TGTGAATGCTTGAAAGGGTTTGTACCAAAGTCTGATGAGGAGTGGGGAAAAGGAAACTGG ACAAGTGGGTGTGTGAGACGTACAAAATTATCTTGCCAAGCAAAATCTTCTATGAAAACA CAAGGCAAAGACACAGACATCTTCTATCGTATGACAGATGTAAAGACTCCGGATCTGCAC CAATTTGCAAGCTTTCTCAATGCCGAACAGTGCTATCAAGGTTGTCTAGGCAACTGTTCT TGCACAGCCTTCGCCTATATTAGTGGAATTGGATGTTTGGTATGGAATGGGGAGCTAGCA GACACCGTTCAATTTTTGTCTAGCGGAGAGTTTCTCTTCATTCGTCTTGCAAGTTCAGAA TTGGCTGGAAGCAGTCGAAGGAAGATTATCGTAGGCACTACTGTCAGCCTTTCCATTTTC TTGATCTTGGTATTTGCTGCAATTATGTTGTGGAGATACAGAGCGAAACAAAATGATGCA TGGAAGAATGGTTTTGAACGACAAGATGTCTCCGGCGTCAATTTCTTTGAGATGCATACA ATACGAACTGCCACCAATAACTTCAGTCCTTCAAATAAACTTGGTCAAGGTGGATTTGGT CCAGTTTACAAGGGAAAGTTGGTAGATGGGAAGGAAATAGGTGTTAAACGCCTTGCTAGT AGTTCCGGTCAGGGTACAGAGGAGTTCATGAATGAAATAACACTGATCTCAAAATTGCAA CACAGAAACTTGGTTCGGCTTTTGGGATACTGCATCGACGGAGAAGAGAAGCTACTGATC TATGAGTTCATGGTGAACAAAAGTCTCGATATTTTTATATTTGATCCATGTCTAAAGTTT GAGCTTGATTGGCCAAAGAGATTTAATATCATTCAAGGTATTGCGCGTGGACTTCTCTAT CTCCACCGTGACTCACGCCTCAGAGTTATTCACCGAGACCTGAAGGTCAGCAATATTCTT CTGGACGACAGAATGAATCCAAAAATATCAGATTTTGGATTGGCTCGGATGTTCCAGGGA ACCCAATATCAAGACAACACTCGCAGAGTTGTAGGAACTCTAGGATATATGTCTCCCGAG TATGCATGGGCAGGATTGTTCTCTGAGAAGTCTGATATCTATAGCTTCGGAGTTCTGATG TTAGAAATCATCAGCGGAAAGAGAATTTCACGGTTCATCTATGGTGATGAAAGCAAAGGC CTTCTTGCTTATACATGGGATTCTTGGTGCGAGACCGGGGGATCAAATCTACTTGACAGA GATCTTACTGATACATGCCAAGCATTCGAAGTTGCGAGATGTGTTCAGATTGGTCTGCTC TGTGTTCAACACGAAGCCGTCGACAGACCCAACACTCTTCAAGTACTATCCATGCTTACT TCAGCAACAGATCTTCCAGTACCAAAACAGCCAATATTTGCAGTGCATACTCTAAACGAT ATGCCAATGTTACAGGCTAATTCTCAAGATTTCTTATCTGTAAATGAGATGACAGAATCT ATGATCCAAGGAAGGTAAGCCTAAGGATCTTGTTATCTCACTACAGAAGTAGTAGTATAT ACTTGTAAATTCATGAACATTTAAAGCTTAAGATTTTGATATCTCACTCTATTTTCTTAA GCATGTGATCTCATAAAGCCCCAATATTGCGTTGACACGTCATCATTTTCGGTATAATAT TGTTATTAAGCGTCGCAAAGATAAAAATATGCTTTTTGATGACTTCTCTGGCATTCTCTT CTCTGCATTTTATAAGATCATGTTGATGGAAAGTCTTCGACTTTGGTTACAAGCGTCGAT GCCCAGTTGGTTAGATTTGGATTTCTCCGCTATACTTTGTTTCTTTGTAATTAAAAACCA TGTTGCTTCGAA