Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G55440.1
CDS Infomation	\| Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein \| Chr1:20701499-20703460 REVERSE LENGTH=1962 \| 201606
Sequence	ATGGTGTATTCTAGAACTAAACCCCCATGTCGTGTGTCTGATCCGGCTCAGCCCCACAAT CTTTGCAGACGACGACGGCCTTCTCCACTTTCTATCTGCTTTACATGCAAAGGCAAGAAT TTAACGTGCAGAAAGTACTATTACTACTGTGCAACTTGCAATTTAGAGTTCCACAGAGGT TGTCACCTCTTTCCGCCGAATCTAAGACACCCTTTTCATTCCTCTCACCCTCTCACCCTC ATCTCTTCAAACACACGCAACGGTTGGTGGGATGGCTCCTCCGGTTCAGAAGGATCAACA GATGATGATGATAGTGATGATGATGATCGTGATGGTGATGGTGATGGTGATGGTGATGGC AGCGTTGATATTGATGGTGATGATGATGCGTATGGCAGCGTTGATATTGATGGTGATGCT GATGCTGATGTTAATGTTGATGCCTCTTTATCCGATGGAAATCACAGGAGCTGCCGATGT TGTAACAAACCTTTGGACAAGACATATTATCATTGTTCTATCTGCAAGTTCAATCTCAAC TTGCCCTGCTCGATGATGCTACCACTTCTCACTATCTCACACATGAAAAGTCATGAGCAC ACGCTCACCCTCTTCTGTACACGACTCCCTATGTCATGTGATGCTTGTGGCTTGTCTCTA AGCACACGCAGCACTCTCCTTTACACGTGTCTCCCTTGCAGCCACACAGTCCACATAAAA TGTATCTATCTACCTCGTGTCATTCAGATCACCCGACACACACACCGACTCTCTTTCACT TTGTCCCTTCAACCTGGTGACTTCTCTTGCGGAGTTTGTCGCAAAACCGTCGACGTTAAC TATGGGCAATATTCTTGTATTAAGGGATGTCATTATGCTGTCCATTCGCATTGTGCAACG AGGAATGACGTGTGGGATGGAGAAGATCTTGAAGGAGTGCCTGAAGAACCTGATGAAGAT ATCGAGCCATTTGTGAGGATTGATGTGGAGACAATTCATCATTTCAGTCATGAACATTAT CTGAAGCTCCAAGAAAAGAAAACCATTTGCGAGAAAGACAAGTATTGTGTTGCATGCACG ATTCCAATTATAATCTCTCGGAGATTTTATGGTTGTATGGAGTGTGATTTTGTACTCGAC GAAGCATGTGCTTCTCTTCCTCGCAAAAAATACCTCCCAATACATAAACACCCACTTACC CTCCACCCCTTCCCGATTGGTGGGATCTCCAGGTTCGATTTTAATACAGTTGCTGCCAAA GACATATTCAAATGTAAAGCTTGCTACCGATTAAGTTGTGGTTTCGTGTACAAATGCGGT GAGGAATATTGTGAGTTTCAAATAGACGTCAGATGCGCTTCCCTTCCAGATCCTTTAATT CATGGCTGTCATCCACATGATCTCTTCTTCAACTTGACCCATGGTTATTGCATTGGGTGT AGACCACGAACCGACTTGACCAAGGCACGTATGCTCAGCTCACATGGGCCGGGCCTTTGT TCATCCTATGCAGTAGAATGTATTAAGTGCGACGACTCCTTTTTGGGTATGACATGTGCT AGTTTTCCTTGTGAGGCCTACTACAAGCACGATAGGCATCTACTCACACTTTGCTACGGT GACGAAAAAGATACAACAAGTGGTCAATATTGGTGTGAGATATGTGAATCAGAATTAAAT GCAGATGACTGGTTTTATACATGTGACTCTTGTATGATCACTTTACATATCGATTGTTTA CTTGGAAAAGATATGTACATGAAGCCCGGCCATATATTCGAAATAGGTGATGATGGTGAT GAAGTTGAAATTGTTCACAATGATGGTAACTCTCGGCTGATTTGCTCTGAATGTAATCTT CATTGTGCACAGGCTTGGGCATTCAAGATGATACGTGGATACAAATGGTATTGCACTCTT AATTGTATGGGAAAAGGTCTTGGCCTTGGACGTCTCAATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G55440.1
PEP Infomation	\| Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein \| Chr1:20701499-20703460 REVERSE LENGTH=653 \| 201606
Sequence	MVYSRTKPPCRVSDPAQPHNLCRRRRPSPLSICFTCKGKNLTCRKYYYYCATCNLEFHRG CHLFPPNLRHPFHSSHPLTLISSNTRNGWWDGSSGSEGSTDDDDSDDDDRDGDGDGDGDG SVDIDGDDDAYGSVDIDGDADADVNVDASLSDGNHRSCRCCNKPLDKTYYHCSICKFNLN LPCSMMLPLLTISHMKSHEHTLTLFCTRLPMSCDACGLSLSTRSTLLYTCLPCSHTVHIK CIYLPRVIQITRHTHRLSFTLSLQPGDFSCGVCRKTVDVNYGQYSCIKGCHYAVHSHCAT RNDVWDGEDLEGVPEEPDEDIEPFVRIDVETIHHFSHEHYLKLQEKKTICEKDKYCVACT IPIIISRRFYGCMECDFVLDEACASLPRKKYLPIHKHPLTLHPFPIGGISRFDFNTVAAK DIFKCKACYRLSCGFVYKCGEEYCEFQIDVRCASLPDPLIHGCHPHDLFFNLTHGYCIGC RPRTDLTKARMLSSHGPGLCSSYAVECIKCDDSFLGMTCASFPCEAYYKHDRHLLTLCYG DEKDTTSGQYWCEICESELNADDWFYTCDSCMITLHIDCLLGKDMYMKPGHIFEIGDDGD EVEIVHNDGNSRLICSECNLHCAQAWAFKMIRGYKWYCTLNCMGKGLGLGRLN

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G55440.1
Transcript Infomation	\| Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein \| Chr1:20701363-20703460 REVERSE LENGTH=2098 \| 201606
Sequence	ATGGTGTATTCTAGAACTAAACCCCCATGTCGTGTGTCTGATCCGGCTCAGCCCCACAAT CTTTGCAGACGACGACGGCCTTCTCCACTTTCTATCTGCTTTACATGCAAAGGCAAGAAT TTAACGTGCAGAAAGTACTATTACTACTGTGCAACTTGCAATTTAGAGTTCCACAGAGGT TGTCACCTCTTTCCGCCGAATCTAAGACACCCTTTTCATTCCTCTCACCCTCTCACCCTC ATCTCTTCAAACACACGCAACGGTTGGTGGGATGGCTCCTCCGGTTCAGAAGGATCAACA GATGATGATGATAGTGATGATGATGATCGTGATGGTGATGGTGATGGTGATGGTGATGGC AGCGTTGATATTGATGGTGATGATGATGCGTATGGCAGCGTTGATATTGATGGTGATGCT GATGCTGATGTTAATGTTGATGCCTCTTTATCCGATGGAAATCACAGGAGCTGCCGATGT TGTAACAAACCTTTGGACAAGACATATTATCATTGTTCTATCTGCAAGTTCAATCTCAAC TTGCCCTGCTCGATGATGCTACCACTTCTCACTATCTCACACATGAAAAGTCATGAGCAC ACGCTCACCCTCTTCTGTACACGACTCCCTATGTCATGTGATGCTTGTGGCTTGTCTCTA AGCACACGCAGCACTCTCCTTTACACGTGTCTCCCTTGCAGCCACACAGTCCACATAAAA TGTATCTATCTACCTCGTGTCATTCAGATCACCCGACACACACACCGACTCTCTTTCACT TTGTCCCTTCAACCTGGTGACTTCTCTTGCGGAGTTTGTCGCAAAACCGTCGACGTTAAC TATGGGCAATATTCTTGTATTAAGGGATGTCATTATGCTGTCCATTCGCATTGTGCAACG AGGAATGACGTGTGGGATGGAGAAGATCTTGAAGGAGTGCCTGAAGAACCTGATGAAGAT ATCGAGCCATTTGTGAGGATTGATGTGGAGACAATTCATCATTTCAGTCATGAACATTAT CTGAAGCTCCAAGAAAAGAAAACCATTTGCGAGAAAGACAAGTATTGTGTTGCATGCACG ATTCCAATTATAATCTCTCGGAGATTTTATGGTTGTATGGAGTGTGATTTTGTACTCGAC GAAGCATGTGCTTCTCTTCCTCGCAAAAAATACCTCCCAATACATAAACACCCACTTACC CTCCACCCCTTCCCGATTGGTGGGATCTCCAGGTTCGATTTTAATACAGTTGCTGCCAAA GACATATTCAAATGTAAAGCTTGCTACCGATTAAGTTGTGGTTTCGTGTACAAATGCGGT GAGGAATATTGTGAGTTTCAAATAGACGTCAGATGCGCTTCCCTTCCAGATCCTTTAATT CATGGCTGTCATCCACATGATCTCTTCTTCAACTTGACCCATGGTTATTGCATTGGGTGT AGACCACGAACCGACTTGACCAAGGCACGTATGCTCAGCTCACATGGGCCGGGCCTTTGT TCATCCTATGCAGTAGAATGTATTAAGTGCGACGACTCCTTTTTGGGTATGACATGTGCT AGTTTTCCTTGTGAGGCCTACTACAAGCACGATAGGCATCTACTCACACTTTGCTACGGT GACGAAAAAGATACAACAAGTGGTCAATATTGGTGTGAGATATGTGAATCAGAATTAAAT GCAGATGACTGGTTTTATACATGTGACTCTTGTATGATCACTTTACATATCGATTGTTTA CTTGGAAAAGATATGTACATGAAGCCCGGCCATATATTCGAAATAGGTGATGATGGTGAT GAAGTTGAAATTGTTCACAATGATGGTAACTCTCGGCTGATTTGCTCTGAATGTAATCTT CATTGTGCACAGGCTTGGGCATTCAAGATGATACGTGGATACAAATGGTATTGCACTCTT AATTGTATGGGAAAAGGTCTTGGCCTTGGACGTCTCAATTGAAGGTAGCCAAGACATTGT GATCAGCGCATCTTATGTGTTTCAGGGCTTTCGTCGAATACACGTTTCTTAGGGTTTAAT CTTTTGGTGTTAAATTTTATTTTTGTTTTCTTTTTTTTCTTTTGTGTTGATGAAAATG