Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G52190.1
CDS Infomation	\| Major facilitator superfamily protein \| Chr1:19434671-19438673 FORWARD LENGTH=1824 \| 201606
Sequence	ATGGAGAACCCTCCCAATGAAACCGAGGCTAAGCAAATCCAAACCAATGAAGGCAAAAAA ACAAAGGGTGGAATCATCACTATGCCTTTTATCATAGCTAACGAGGCGTTTGAGAAAGTG GCGAGTTATGGATTACTACCAAACATGATTATGTACTTAATCAGAGATTATAGATTTGGA GTAGCAAAAGGAACAAATGTGCTTTTCATGTGGTCTGCTGCATCAAATTTCACTCCTCTC TTGGGTGCTTTTCTCTCTGATTCCTATCTTGGTCGCTTCCTCACCATCTCCATTGCTTCT CTCTCCAGTTTCTTGGGAATGGTGCTTTTATGGCTAACTGCAATGTTACCACAAGTGAAG CCATCGCCTTGCGATCCCACAGCAGCCGGAAGCCACTGTGGGTCTTCGACCGCATCTCAG CTGGCTCTTTTGTATTCCGCATTTGCCCTTATATCGATCGGGTCAGGCGGGATCAGACCA TGTTCCTTAGCATTTGGAGCTGATCAACTAGACAACAAAGAGAACCCAAAAAATGAAAGA GTTCTCGAGAGTTTCTTTGGTTGGTACTACGCTTCCTCAGCTGTGGCGGTTCTCATCGCG TTCACGGGTATTGTATACATTCAGGAGCATCTCGGGTGGAAAATCGGGTTTGGAGTACCT GCGGTCCTCATGTTGATCGCTGCTTTGCTATTCATTCTTGCGTCTCCTCTCTATGTTACA CGTGGTGTGACCAAGAGTCTCTTCACCGGTTTAGCTCAAGCGATTGTTGCAGCTTACAAG AAGAGGAAGCTAAGTCTACCAGATCATCATGACTCCTTTGATTGTTATTATCACATGAAA GATTCTGAAATCAAAGCTCCAAGTCAAAAGTTGAGGTTTTTGAATAAAGCTTGTTTAATA AGTAACCGTGAGGAGGAGATTGGGTCAGATGGGTTTGCTTTGAATCCATGGAGGCTATGT ACAACAGACAAAGTAGAGGAGCTTAAGGCATTGATCAAAGTCATACCCATATGGTCCACA GGTATAATGATGTCCATAAACACTAGCCAAAGTTCGTTTCAGTTACTGCAAGCGACTTCC ATGGACAGGCGTCTGAGCCGCCATGGTTCAAGCTTTCAAGTTCCAGCTGGATCATTCGGT ATGTTCACAATCATAGCTCTAGCCCTATGGGTCATTCTATATGACCGTGCGGTTATCCCA TTAGCTTCCAAGATCCGAGGCAGACCTTTTAGACTTAGCGTTAAGCTAAGAATGGGATTA GGATTATTCATGTCATTCTTAGCAATGGCAATTTCCGCAATGGTTGAAAGCTTCAGAAGG AAAAAAGCTATAAGCCAAGGATATGCAAACAATTCAAATGCTGTGGTAGACATCTCAGCA ATGTGGCTTGTGCCACAATATGTTCTACATGGTTTAGCAGAGGCTCTTACCGCAATAGGA CAGACTGAGTTTTTCTACACCGAGTTTCCTAAAAGTATGTCTAGCATCGCGGCTTCTCTC TTCGGTTTAGGAATGGCTGTGGCTAGTCTATTGGCAAGCGTGGTCCTCAATGCGGTCAAT GAACTAACTTCTAGAAATGGTAAAGAGAGTTGGGTTTCAGACAACATTAACAAGGGTCAC TACAACTATTACTATTGGGTACTCGCGATAATGAGCTTCATCAATGTGATCTACTACGTG ATATGTAGCTGGTCGTATGGTCCTTTGGTCGACCAGGTAAGGAATGGTAGGGTTAATGGT GTGAGAGAGGAAGAGGAGTTGATTGACATTGTTGGCAAAGGATTCGAGAAGGAAGATCTA AGTCCAGTTGTTAAAACCAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G52190.1
PEP Infomation	\| Major facilitator superfamily protein \| Chr1:19434671-19438673 FORWARD LENGTH=607 \| 201606
Sequence	MENPPNETEAKQIQTNEGKKTKGGIITMPFIIANEAFEKVASYGLLPNMIMYLIRDYRFG VAKGTNVLFMWSAASNFTPLLGAFLSDSYLGRFLTISIASLSSFLGMVLLWLTAMLPQVK PSPCDPTAAGSHCGSSTASQLALLYSAFALISIGSGGIRPCSLAFGADQLDNKENPKNER VLESFFGWYYASSAVAVLIAFTGIVYIQEHLGWKIGFGVPAVLMLIAALLFILASPLYVT RGVTKSLFTGLAQAIVAAYKKRKLSLPDHHDSFDCYYHMKDSEIKAPSQKLRFLNKACLI SNREEEIGSDGFALNPWRLCTTDKVEELKALIKVIPIWSTGIMMSINTSQSSFQLLQATS MDRRLSRHGSSFQVPAGSFGMFTIIALALWVILYDRAVIPLASKIRGRPFRLSVKLRMGL GLFMSFLAMAISAMVESFRRKKAISQGYANNSNAVVDISAMWLVPQYVLHGLAEALTAIG QTEFFYTEFPKSMSSIAASLFGLGMAVASLLASVVLNAVNELTSRNGKESWVSDNINKGH YNYYYWVLAIMSFINVIYYVICSWSYGPLVDQVRNGRVNGVREEEELIDIVGKGFEKEDL SPVVKTN

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G52190.1
Transcript Infomation	\| Major facilitator superfamily protein \| Chr1:19434480-19439031 FORWARD LENGTH=2373 \| 201606
Sequence	TAATTGTCCACTCGTCGCGGAAATGTAACACACATTCCTCGCTCTCTCTCTCTCTCAAAT CACTTGCAAAGACAAAGATCTTCCACTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTCCTTTTTGCCTTTC TCTGTCTCCCTCTAGAGTCTCTTCTATATAAATATCACTAGATTTAGTGTTTGATCAAAT CACATTCAACAATGGAGAACCCTCCCAATGAAACCGAGGCTAAGCAAATCCAAACCAATG AAGGCAAAAAAACAAAGGGTGGAATCATCACTATGCCTTTTATCATAGCTAACGAGGCGT TTGAGAAAGTGGCGAGTTATGGATTACTACCAAACATGATTATGTACTTAATCAGAGATT ATAGATTTGGAGTAGCAAAAGGAACAAATGTGCTTTTCATGTGGTCTGCTGCATCAAATT TCACTCCTCTCTTGGGTGCTTTTCTCTCTGATTCCTATCTTGGTCGCTTCCTCACCATCT CCATTGCTTCTCTCTCCAGTTTCTTGGGAATGGTGCTTTTATGGCTAACTGCAATGTTAC CACAAGTGAAGCCATCGCCTTGCGATCCCACAGCAGCCGGAAGCCACTGTGGGTCTTCGA CCGCATCTCAGCTGGCTCTTTTGTATTCCGCATTTGCCCTTATATCGATCGGGTCAGGCG GGATCAGACCATGTTCCTTAGCATTTGGAGCTGATCAACTAGACAACAAAGAGAACCCAA AAAATGAAAGAGTTCTCGAGAGTTTCTTTGGTTGGTACTACGCTTCCTCAGCTGTGGCGG TTCTCATCGCGTTCACGGGTATTGTATACATTCAGGAGCATCTCGGGTGGAAAATCGGGT TTGGAGTACCTGCGGTCCTCATGTTGATCGCTGCTTTGCTATTCATTCTTGCGTCTCCTC TCTATGTTACACGTGGTGTGACCAAGAGTCTCTTCACCGGTTTAGCTCAAGCGATTGTTG CAGCTTACAAGAAGAGGAAGCTAAGTCTACCAGATCATCATGACTCCTTTGATTGTTATT ATCACATGAAAGATTCTGAAATCAAAGCTCCAAGTCAAAAGTTGAGGTTTTTGAATAAAG CTTGTTTAATAAGTAACCGTGAGGAGGAGATTGGGTCAGATGGGTTTGCTTTGAATCCAT GGAGGCTATGTACAACAGACAAAGTAGAGGAGCTTAAGGCATTGATCAAAGTCATACCCA TATGGTCCACAGGTATAATGATGTCCATAAACACTAGCCAAAGTTCGTTTCAGTTACTGC AAGCGACTTCCATGGACAGGCGTCTGAGCCGCCATGGTTCAAGCTTTCAAGTTCCAGCTG GATCATTCGGTATGTTCACAATCATAGCTCTAGCCCTATGGGTCATTCTATATGACCGTG CGGTTATCCCATTAGCTTCCAAGATCCGAGGCAGACCTTTTAGACTTAGCGTTAAGCTAA GAATGGGATTAGGATTATTCATGTCATTCTTAGCAATGGCAATTTCCGCAATGGTTGAAA GCTTCAGAAGGAAAAAAGCTATAAGCCAAGGATATGCAAACAATTCAAATGCTGTGGTAG ACATCTCAGCAATGTGGCTTGTGCCACAATATGTTCTACATGGTTTAGCAGAGGCTCTTA CCGCAATAGGACAGACTGAGTTTTTCTACACCGAGTTTCCTAAAAGTATGTCTAGCATCG CGGCTTCTCTCTTCGGTTTAGGAATGGCTGTGGCTAGTCTATTGGCAAGCGTGGTCCTCA ATGCGGTCAATGAACTAACTTCTAGAAATGGTAAAGAGAGTTGGGTTTCAGACAACATTA ACAAGGGTCACTACAACTATTACTATTGGGTACTCGCGATAATGAGCTTCATCAATGTGA TCTACTACGTGATATGTAGCTGGTCGTATGGTCCTTTGGTCGACCAGGTAAGGAATGGTA GGGTTAATGGTGTGAGAGAGGAAGAGGAGTTGATTGACATTGTTGGCAAAGGATTCGAGA AGGAAGATCTAAGTCCAGTTGTTAAAACCAATTAAGGAACAATAGGTCTTGCAAGCTTGT ATTTTGTTTATAAAGGGAGCGATAAACTATAGGAAATGATATTTTATTGCATTGGTGTGT GGTGTTATTAAGTGTTAATTAAAGTCTATATAGATTTGTAATTAGATTGAATTATGTGTT TGGGTTTTCATTAGGGTTTTTGATGAAAAGGTAATGGTTTTTGGTTGTATACAAGCCAAA GTGTTTGTTGTATTTTTTTTTTTCGTGTTATTGCAATTCAAGGAGTCTTGTGTATATATT TTGGTTATCTTCTTTGTATATCAGACGAAGTCTAAAAAATGAAAAAACATGAATTTTTGT TTCTTTCTTATTTTGGAAGTTATTGTAATTAAA