Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G48400.1
CDS Infomation	\| F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein \| Chr1:17882136-17883855 REVERSE LENGTH=1542 \| 201606
Sequence	ATGGCTATGATGAGAACTTCTCCTAGAGATTCGATAAGCAATTTGCCAGATGAGATTCTT GGCAAAATCTTGTCTTTGCTCCCGACAAAAGTGGCTGCTTCCACATCGGTTCTGTCCAAG AGGTGGAGGAATCTGTTGGGTCTTGTAGACAACCTCTGCTTTGATGAGTCGATGGTTGTT TATCCCAACGAAGAAGAAGAAACAAGTGGTTCACTTCGCTTCTGTGATTTCGTAGACAAG ACATTTGCTCTGTTAAGCAATTCTCACATCAAGAAGTTCTCTCTGTCTCGTGTATATAAG TATAACGATGATGTAGACGGTATGGTCCGGCGTTGGATTCGGACTGTAATGGAACGCGGT TTATTGGAAATACACTTGCACGCCACCCCCATGTCTTTTGTTGCCATAGAAACTAAGCTG TTAACGAGCAACACACTGGTTAAGCTCACACTATCCGCTCGATGTTTTGTTGAAGTAGAG CGTGTGTTTTTCCCTGCCCTCAAATCACTTTCTCTCTTCTCAATTCTGGGTGATTATACC AACTATATACGGCTCATCGATGGCTGCCCTGTGTTGGAAGAATTATACATGCGTGATGGT GATTATCCGTTCTTGCGGCTTACTTGTGGTACCAACGTGGAAAGTGCATCCCTCAAGCGA CTTGTGATTTTTACCCATAATCCAAATGAAATGATTTGGCACGAACTGATTTATTTTGAA GCACCAAGTCTTGTCTACCTTGACTATTCCAGTTATGTCTCGGCTAAGTATGATGTTGTT GATTTCGATTTGCTTGTCGAAGCCAGGCTGAGTCTCAGGTTATGGGTGTCAACTAACGAT TATGATTATTCTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT GATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT GATGATGATGATGATGGTGATTATTATATTGTAGAACCAAAGGCGCCTATATTTGGTGAT GTTACAGAACTACTTGCGGCTATACGCAACATTACGACCCTTCACTTGTCTCCTGATTCC CTTGAGGTGTTTCATTTCTGCTGTAAATCCATGCCCGTGTTCAACAACCTCCTTAATTTA TCTATTGAGAGTAACAAGGATAAAGGTTGGCAAGTAATGCCACTTCTCCTCAAGAGTTGT CCAAATCTACACACCTTAGTCATCAAGGGTCTTGTCCACAGAGTAACTAGTAGATGTGGA GATGCATGCGCTTGCATACCTAAGAAGCAGAGGAAGATTGTACAGAAAGAAGAGGCATTA TGTTGTCTGCGGACATGTCAAGTGAAGGTGCTACAGATTTCAGAGTATGGAGGTTATTTT CAAGAGCTGAAACAGATGAGACATTTCTTGGGCAAGTTGGAATGTCTTGAAACCGTGAAA GTTGGTGTTCACGCAGAAAACAACAACAACAGTGAGTTCTTGCGAGCTAATGTGCTGACT CTTCCCAGAGTTTCAGCAAAGTGCAACGTCCACTTCATCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G48400.1
PEP Infomation	\| F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein \| Chr1:17882136-17883855 REVERSE LENGTH=513 \| 201606
Sequence	MAMMRTSPRDSISNLPDEILGKILSLLPTKVAASTSVLSKRWRNLLGLVDNLCFDESMVV YPNEEEETSGSLRFCDFVDKTFALLSNSHIKKFSLSRVYKYNDDVDGMVRRWIRTVMERG LLEIHLHATPMSFVAIETKLLTSNTLVKLTLSARCFVEVERVFFPALKSLSLFSILGDYT NYIRLIDGCPVLEELYMRDGDYPFLRLTCGTNVESASLKRLVIFTHNPNEMIWHELIYFE APSLVYLDYSSYVSAKYDVVDFDLLVEARLSLRLWVSTNDYDYSDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDGDYYIVEPKAPIFGDVTELLAAIRNITTLHLSPDS LEVFHFCCKSMPVFNNLLNLSIESNKDKGWQVMPLLLKSCPNLHTLVIKGLVHRVTSRCG DACACIPKKQRKIVQKEEALCCLRTCQVKVLQISEYGGYFQELKQMRHFLGKLECLETVK VGVHAENNNNSEFLRANVLTLPRVSAKCNVHFI

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G48400.1
Transcript Infomation	\| F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein \| Chr1:17881968-17883967 REVERSE LENGTH=1822 \| 201606
Sequence	CCTAATTCTCTTTCTCTCAGATTTTCATCGTCAAGCTTTTGGAACACTTCCTCGTCTCTC TGCCATCGTAAGTTCCAAAAACTTTCTCTTCCTGTAGTTAAAACCCTAATTTATGGCTAT GATGAGAACTTCTCCTAGAGATTCGATAAGCAATTTGCCAGATGAGATTCTTGGCAAAAT CTTGTCTTTGCTCCCGACAAAAGTGGCTGCTTCCACATCGGTTCTGTCCAAGAGGTGGAG GAATCTGTTGGGTCTTGTAGACAACCTCTGCTTTGATGAGTCGATGGTTGTTTATCCCAA CGAAGAAGAAGAAACAAGTGGTTCACTTCGCTTCTGTGATTTCGTAGACAAGACATTTGC TCTGTTAAGCAATTCTCACATCAAGAAGTTCTCTCTGTCTCGTGTATATAAGTATAACGA TGATGTAGACGGTATGGTCCGGCGTTGGATTCGGACTGTAATGGAACGCGGTTTATTGGA AATACACTTGCACGCCACCCCCATGTCTTTTGTTGCCATAGAAACTAAGCTGTTAACGAG CAACACACTGGTTAAGCTCACACTATCCGCTCGATGTTTTGTTGAAGTAGAGCGTGTGTT TTTCCCTGCCCTCAAATCACTTTCTCTCTTCTCAATTCTGGGTGATTATACCAACTATAT ACGGCTCATCGATGGCTGCCCTGTGTTGGAAGAATTATACATGCGTGATGGTGATTATCC GTTCTTGCGGCTTACTTGTGGTACCAACGTGGAAAGTGCATCCCTCAAGCGACTTGTGAT TTTTACCCATAATCCAAATGAAATGATTTGGCACGAACTGATTTATTTTGAAGCACCAAG TCTTGTCTACCTTGACTATTCCAGTTATGTCTCGGCTAAGTATGATGTTGTTGATTTCGA TTTGCTTGTCGAAGCCAGGCTGAGTCTCAGGTTATGGGTGTCAACTAACGATTATGATTA TTCTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGA TGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGA TGATGATGGTGATTATTATATTGTAGAACCAAAGGCGCCTATATTTGGTGATGTTACAGA ACTACTTGCGGCTATACGCAACATTACGACCCTTCACTTGTCTCCTGATTCCCTTGAGGT GTTTCATTTCTGCTGTAAATCCATGCCCGTGTTCAACAACCTCCTTAATTTATCTATTGA GAGTAACAAGGATAAAGGTTGGCAAGTAATGCCACTTCTCCTCAAGAGTTGTCCAAATCT ACACACCTTAGTCATCAAGGGTCTTGTCCACAGAGTAACTAGTAGATGTGGAGATGCATG CGCTTGCATACCTAAGAAGCAGAGGAAGATTGTACAGAAAGAAGAGGCATTATGTTGTCT GCGGACATGTCAAGTGAAGGTGCTACAGATTTCAGAGTATGGAGGTTATTTTCAAGAGCT GAAACAGATGAGACATTTCTTGGGCAAGTTGGAATGTCTTGAAACCGTGAAAGTTGGTGT TCACGCAGAAAACAACAACAACAGTGAGTTCTTGCGAGCTAATGTGCTGACTCTTCCCAG AGTTTCAGCAAAGTGCAACGTCCACTTCATCTGATTTTCTTTCTTTATCTTTCTTTGTTA TATATATAGCAATAGTTTATGGTTAAGAGAAACGCAGAATATTGGGGAATTATCAATTAT GCAAGTTTAGTTGTGCTTGTGGCAGCAATCATCAAAACTTGCACATCAAATTGTATAAGT GACTCTTTTAGGTAAAAAATAA