Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G32415.1
CDS Infomation	\| pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein \| Chr1:11695611-11697896 FORWARD LENGTH=2286 \| 201606
Sequence	ATGCGAGCTCTCTGTGTAAAGAAAGTTTGTGGCTTTCTCTCAAAATTATCTCTCAGATCT TCAATATCTTGTCGTCGATACTATGGAGATAAGATACCGAATTACGGAAGCTATCGTCGA GGTTTCTCTAATGAAGAAGCTCTTATACTTCGTCGTTTATCTGAGGGAGGTCTTGTACAT GCACGCCACTTGCTCGACAAAATTCCTCAGAGAGGAAGTATCAACCGTGTTGTTTACTGG ACTTCGCTTCTTAGTAAGTACGCGAAAACTGGATACTTGGATGAAGCAAGGGTTTTGTTT GAAGTAATGCCTGAGAGGAATATCGTTACTTGTAATGCGATGTTGACGGGTTATGTTAAA TGTAGGAGAATGAATGAGGCTTGGACATTGTTTAGGGAAATGCCGAAGAATGTTGTTTCT TGGACTGTGATGCTTACTGCGCTATGTGACGACGGAAGGAGTGAAGATGCAGTTGAGTTG TTCGATGAAATGCCTGAGAGAAATGTGGTTTCGTGGAACACTTTGGTAACGGGTTTGATT AGGAATGGTGATATGGAGAAGGCAAAACAGGTGTTTGATGCTATGCCTAGTAGAGATGTT GTGTCGTGGAACGCTATGATTAAAGGGTATATTGAGAATGATGGGATGGAGGAAGCGAAA CTATTGTTTGGGGATATGAGTGAGAAGAATGTAGTTACTTGGACGAGTATGGTATATGGT TATTGTAGGTATGGAGATGTTCGTGAAGCTTATAGATTGTTCTGTGAAATGCCGGAGAGA AATATCGTTTCTTGGACCGCTATGATTAGTGGGTTTGCTTGGAATGAGTTGTATAGAGAA GCGTTGATGCTTTTTCTTGAAATGAAGAAGGATGTTGATGCAGTATCACCAAATGGTGAG ACTCTCATTTCTCTTGCTTATGCTTGTGGTGGTCTTGGTGTTGAATTTCGTCGTCTTGGT GAGCAATTGCACGCACAAGTTATATCTAACGGTTGGGAAACTGTGGATCACGATGGAAGG TTGGCGAAAAGTCTTGTTCATATGTATGCATCATCTGGCTTGATTGCTTCAGCTCAATCT CTGCTTAATGAAAGCTTTGATTTGCAGTCTTGTAACATTATTATCAACCGTTATCTAAAG AACGGGGATTTGGAGCGAGCTGAAACTCTGTTCGAGAGAGTCAAGAGCTTACATGACAAA GTATCTTGGACATCGATGATCGATGGATATCTAGAAGCGGGTGATGTATCCAGGGCCTTT GGTCTGTTTCAGAAACTTCACGACAAAGACGGGGTTACATGGACGGTTATGATCTCAGGT CTTGTCCAAAACGAACTTTTTGCAGAAGCTGCATCCTTACTGTCAGATATGGTGAGATGT GGTCTGAAACCGTTGAACTCGACTTACTCTGTTCTTCTTAGTTCTGCGGGAGCCACATCG AATCTCGATCAAGGGAAGCATATACACTGCGTGATTGCAAAAACCACGGCTTGCTATGAT CCTGATCTCATCCTTCAAAACTCTCTTGTCTCTATGTACGCCAAATGCGGAGCCATAGAG GATGCTTATGAGATATTCGCAAAGATGGTTCAGAAAGATACAGTTTCATGGAACTCTATG ATCATGGGGTTATCGCATCACGGCTTAGCGGATAAAGCCTTAAATCTGTTCAAAGAGATG CTTGATTCGGGGAAGAAACCGAACTCTGTAACGTTTCTCGGAGTCCTCTCTGCTTGTAGT CACTCTGGACTCATCACCAGAGGTTTAGAACTATTCAAAGCGATGAAAGAAACCTATTCG ATCCAGCCCGGAATCGACCATTACATCTCGATGATAGACCTTTTAGGCAGAGCCGGAAAA CTAAAAGAAGCAGAGGAATTCATCTCAGCTCTGCCTTTCACTCCAGACCATACAGTCTAC GGCGCATTGTTAGGCTTATGCGGACTCAACTGGAGAGATAAAGATGCAGAAGGCATAGCG GAACGAGCTGCAATGCGGTTGCTAGAGCTTGACCCAGTCAATGCACCAGGACATGTGGCG CTATGCAACGTGTATGCGGGACTAGGGAGGCATGATATGGAGAAGGAAATGAGAAAAGAG ATGGGAATAAAAGGAGTGAAGAAGACACCAGGATGTAGTTGGGTTGTGGTTAATGGAAGA GCTAATGTGTTTCTCTCTGGTGATAAGTCTGCAAGTGAAGCTGCTCAGATGGTTTTGCCA ATCTTTTGTGGTAATGAAATGCTTGAGGAGGAAGAAGAGAAACCGTTGAGTCTATGCCAT TGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G32415.1
PEP Infomation	\| pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein \| Chr1:11695611-11697896 FORWARD LENGTH=761 \| 201606
Sequence	MRALCVKKVCGFLSKLSLRSSISCRRYYGDKIPNYGSYRRGFSNEEALILRRLSEGGLVH ARHLLDKIPQRGSINRVVYWTSLLSKYAKTGYLDEARVLFEVMPERNIVTCNAMLTGYVK CRRMNEAWTLFREMPKNVVSWTVMLTALCDDGRSEDAVELFDEMPERNVVSWNTLVTGLI RNGDMEKAKQVFDAMPSRDVVSWNAMIKGYIENDGMEEAKLLFGDMSEKNVVTWTSMVYG YCRYGDVREAYRLFCEMPERNIVSWTAMISGFAWNELYREALMLFLEMKKDVDAVSPNGE TLISLAYACGGLGVEFRRLGEQLHAQVISNGWETVDHDGRLAKSLVHMYASSGLIASAQS LLNESFDLQSCNIIINRYLKNGDLERAETLFERVKSLHDKVSWTSMIDGYLEAGDVSRAF GLFQKLHDKDGVTWTVMISGLVQNELFAEAASLLSDMVRCGLKPLNSTYSVLLSSAGATS NLDQGKHIHCVIAKTTACYDPDLILQNSLVSMYAKCGAIEDAYEIFAKMVQKDTVSWNSM IMGLSHHGLADKALNLFKEMLDSGKKPNSVTFLGVLSACSHSGLITRGLELFKAMKETYS IQPGIDHYISMIDLLGRAGKLKEAEEFISALPFTPDHTVYGALLGLCGLNWRDKDAEGIA ERAAMRLLELDPVNAPGHVALCNVYAGLGRHDMEKEMRKEMGIKGVKKTPGCSWVVVNGR ANVFLSGDKSASEAAQMVLPIFCGNEMLEEEEEKPLSLCHC

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G32415.1
Transcript Infomation	\| pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein \| Chr1:11695596-11697964 FORWARD LENGTH=2369 \| 201606
Sequence	GTGAAAAGTGTTTGAATGCGAGCTCTCTGTGTAAAGAAAGTTTGTGGCTTTCTCTCAAAA TTATCTCTCAGATCTTCAATATCTTGTCGTCGATACTATGGAGATAAGATACCGAATTAC GGAAGCTATCGTCGAGGTTTCTCTAATGAAGAAGCTCTTATACTTCGTCGTTTATCTGAG GGAGGTCTTGTACATGCACGCCACTTGCTCGACAAAATTCCTCAGAGAGGAAGTATCAAC CGTGTTGTTTACTGGACTTCGCTTCTTAGTAAGTACGCGAAAACTGGATACTTGGATGAA GCAAGGGTTTTGTTTGAAGTAATGCCTGAGAGGAATATCGTTACTTGTAATGCGATGTTG ACGGGTTATGTTAAATGTAGGAGAATGAATGAGGCTTGGACATTGTTTAGGGAAATGCCG AAGAATGTTGTTTCTTGGACTGTGATGCTTACTGCGCTATGTGACGACGGAAGGAGTGAA GATGCAGTTGAGTTGTTCGATGAAATGCCTGAGAGAAATGTGGTTTCGTGGAACACTTTG GTAACGGGTTTGATTAGGAATGGTGATATGGAGAAGGCAAAACAGGTGTTTGATGCTATG CCTAGTAGAGATGTTGTGTCGTGGAACGCTATGATTAAAGGGTATATTGAGAATGATGGG ATGGAGGAAGCGAAACTATTGTTTGGGGATATGAGTGAGAAGAATGTAGTTACTTGGACG AGTATGGTATATGGTTATTGTAGGTATGGAGATGTTCGTGAAGCTTATAGATTGTTCTGT GAAATGCCGGAGAGAAATATCGTTTCTTGGACCGCTATGATTAGTGGGTTTGCTTGGAAT GAGTTGTATAGAGAAGCGTTGATGCTTTTTCTTGAAATGAAGAAGGATGTTGATGCAGTA TCACCAAATGGTGAGACTCTCATTTCTCTTGCTTATGCTTGTGGTGGTCTTGGTGTTGAA TTTCGTCGTCTTGGTGAGCAATTGCACGCACAAGTTATATCTAACGGTTGGGAAACTGTG GATCACGATGGAAGGTTGGCGAAAAGTCTTGTTCATATGTATGCATCATCTGGCTTGATT GCTTCAGCTCAATCTCTGCTTAATGAAAGCTTTGATTTGCAGTCTTGTAACATTATTATC AACCGTTATCTAAAGAACGGGGATTTGGAGCGAGCTGAAACTCTGTTCGAGAGAGTCAAG AGCTTACATGACAAAGTATCTTGGACATCGATGATCGATGGATATCTAGAAGCGGGTGAT GTATCCAGGGCCTTTGGTCTGTTTCAGAAACTTCACGACAAAGACGGGGTTACATGGACG GTTATGATCTCAGGTCTTGTCCAAAACGAACTTTTTGCAGAAGCTGCATCCTTACTGTCA GATATGGTGAGATGTGGTCTGAAACCGTTGAACTCGACTTACTCTGTTCTTCTTAGTTCT GCGGGAGCCACATCGAATCTCGATCAAGGGAAGCATATACACTGCGTGATTGCAAAAACC ACGGCTTGCTATGATCCTGATCTCATCCTTCAAAACTCTCTTGTCTCTATGTACGCCAAA TGCGGAGCCATAGAGGATGCTTATGAGATATTCGCAAAGATGGTTCAGAAAGATACAGTT TCATGGAACTCTATGATCATGGGGTTATCGCATCACGGCTTAGCGGATAAAGCCTTAAAT CTGTTCAAAGAGATGCTTGATTCGGGGAAGAAACCGAACTCTGTAACGTTTCTCGGAGTC CTCTCTGCTTGTAGTCACTCTGGACTCATCACCAGAGGTTTAGAACTATTCAAAGCGATG AAAGAAACCTATTCGATCCAGCCCGGAATCGACCATTACATCTCGATGATAGACCTTTTA GGCAGAGCCGGAAAACTAAAAGAAGCAGAGGAATTCATCTCAGCTCTGCCTTTCACTCCA GACCATACAGTCTACGGCGCATTGTTAGGCTTATGCGGACTCAACTGGAGAGATAAAGAT GCAGAAGGCATAGCGGAACGAGCTGCAATGCGGTTGCTAGAGCTTGACCCAGTCAATGCA CCAGGACATGTGGCGCTATGCAACGTGTATGCGGGACTAGGGAGGCATGATATGGAGAAG GAAATGAGAAAAGAGATGGGAATAAAAGGAGTGAAGAAGACACCAGGATGTAGTTGGGTT GTGGTTAATGGAAGAGCTAATGTGTTTCTCTCTGGTGATAAGTCTGCAAGTGAAGCTGCT CAGATGGTTTTGCCAATCTTTTGTGGTAATGAAATGCTTGAGGAGGAAGAAGAGAAACCG TTGAGTCTATGCCATTGCTGAGAGTTAAGCACATATGTTCGCTATAGTTTGTGTATGCTC ACAACAACTTTGTTTACAAAAAATAAGAA