Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G31430.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein \| Chr1:11254025-11255737 REVERSE LENGTH=1713 \| 201606
Sequence	ATGAACATGAGTTTGTTACAAACTCCATCACTTCTTATGTACAATAAGATGCTCAAATCT CTTGCTGATGGTAAAAGTTTCACGAAAGTTTTGGCTTTGTTCGGTGAATTGCGAGGACAA GGATTGTATCCTGATAATTTCACGTTACCGGTTGTTCTAAAGTCAATTGGTCGTTTGAGG AAGGTTATAGAAGGTGAGAAGGTTCATGGTTATGCTGTGAAAGCTGGGCTTGAGTTCGAT TCTTATGTATCTAATTCACTCATGGGAATGTATGCTTCATTGGGTAAGATAGAGATCACA CATAAAGTGTTCGATGAAATGCCTCAACGAGATGTTGTTTCTTGGAATGGGTTGATTTCT AGTTATGTTGGTAATGGGAGGTTTGAGGATGCCATTGGTGTGTTTAAGCGGATGAGTCAG GAGAGCAATTTGAAGTTTGATGAAGGTACAATTGTGAGCACTCTTTCGGCTTGTTCGGCT TTGAAGAATCTTGAAATTGGTGAAAGGATTTATAGGTTTGTTGTTACAGAATTTGAAATG AGTGTTAGGATTGGGAATGCGTTGGTGGATATGTTCTGTAAATGTGGGTGTCTCGATAAG GCTAGAGCGGTTTTCGATTCGATGAGAGACAAGAATGTTAAGTGTTGGACTAGTATGGTT TTTGGGTATGTTAGTACTGGTAGGATTGATGAGGCTAGAGTTTTGTTTGAGAGAAGTCCT GTAAAGGATGTTGTTTTGTGGACAGCTATGATGAATGGGTATGTTCAGTTTAACCGGTTT GATGAGGCATTGGAACTGTTCAGGTGCATGCAAACTGCGGGAATTAGGCCGGATAATTTC GTGCTAGTCTCTCTCTTGACAGGTTGCGCGCAAACGGGAGCTTTAGAGCAAGGAAAATGG ATTCATGGGTACATAAATGAGAACAGGGTTACAGTAGATAAAGTAGTTGGTACTGCTCTT GTAGACATGTATGCAAAATGTGGATGCATTGAGACAGCTCTAGAGGTTTTCTATGAAATA AAGGAGAGAGACACAGCTTCGTGGACATCACTTATCTACGGTCTTGCGATGAACGGGATG TCAGGAAGAGCGCTGGACTTGTATTACGAAATGGAAAATGTTGGTGTTAGACTAGACGCT ATAACATTTGTCGCGGTTTTAACAGCTTGCAATCATGGTGGATTTGTAGCAGAAGGCCGT AAGATTTTCCATTCGATGACCGAAAGACATAACGTCCAGCCTAAATCAGAGCACTGCAGC TGTCTGATTGACCTACTATGCAGAGCTGGTTTGTTAGATGAAGCAGAGGAATTGATAGAT AAGATGCGTGGTGAAAGCGATGAAACTCTAGTTCCTGTATACTGTTCTTTACTTAGTGCT GCTAGGAACTATGGGAATGTAAAAATAGCAGAACGGGTAGCGGAAAAGCTTGAGAAAGTG GAAGTAAGTGATTCCAGTGCTCATACTCTGCTTGCAAGTGTATATGCATCTGCTAATAGA TGGGAAGATGTAACTAATGTGAGAAGGAAAATGAAAGATTTGGGAATCAGAAAGTTTCCT GGTTGCAGCTCCATCGAGATTGATGGGGTTGGTCATGAGTTTATTGTTGGAGATGATCTA TTATCACACCCAAAAATGGATGAGATCAACTCAATGCTGCATCAAACGACAAATTTGATG TTGGATTTGGAACATAAAGAAATTGATAGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G31430.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein \| Chr1:11254025-11255737 REVERSE LENGTH=570 \| 201606
Sequence	MNMSLLQTPSLLMYNKMLKSLADGKSFTKVLALFGELRGQGLYPDNFTLPVVLKSIGRLR KVIEGEKVHGYAVKAGLEFDSYVSNSLMGMYASLGKIEITHKVFDEMPQRDVVSWNGLIS SYVGNGRFEDAIGVFKRMSQESNLKFDEGTIVSTLSACSALKNLEIGERIYRFVVTEFEM SVRIGNALVDMFCKCGCLDKARAVFDSMRDKNVKCWTSMVFGYVSTGRIDEARVLFERSP VKDVVLWTAMMNGYVQFNRFDEALELFRCMQTAGIRPDNFVLVSLLTGCAQTGALEQGKW IHGYINENRVTVDKVVGTALVDMYAKCGCIETALEVFYEIKERDTASWTSLIYGLAMNGM SGRALDLYYEMENVGVRLDAITFVAVLTACNHGGFVAEGRKIFHSMTERHNVQPKSEHCS CLIDLLCRAGLLDEAEELIDKMRGESDETLVPVYCSLLSAARNYGNVKIAERVAEKLEKV EVSDSSAHTLLASVYASANRWEDVTNVRRKMKDLGIRKFPGCSSIEIDGVGHEFIVGDDL LSHPKMDEINSMLHQTTNLMLDLEHKEIDS

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G31430.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein \| Chr1:11253912-11255737 REVERSE LENGTH=1734 \| 201606
Sequence	ATGAACATGAGTTTGTTACAAACTCCATCACTTCTTATGTACAATAAGATGCTCAAATCT CTTGCTGATGGTAAAAGTTTCACGAAAGTTTTGGCTTTGTTCGGTGAATTGCGAGGACAA GGATTGTATCCTGATAATTTCACGTTACCGGTTGTTCTAAAGTCAATTGGTCGTTTGAGG AAGGTTATAGAAGGTGAGAAGGTTCATGGTTATGCTGTGAAAGCTGGGCTTGAGTTCGAT TCTTATGTATCTAATTCACTCATGGGAATGTATGCTTCATTGGGTAAGATAGAGATCACA CATAAAGTGTTCGATGAAATGCCTCAACGAGATGTTGTTTCTTGGAATGGGTTGATTTCT AGTTATGTTGGTAATGGGAGGTTTGAGGATGCCATTGGTGTGTTTAAGCGGATGAGTCAG GAGAGCAATTTGAAGTTTGATGAAGGTACAATTGTGAGCACTCTTTCGGCTTGTTCGGCT TTGAAGAATCTTGAAATTGGTGAAAGGATTTATAGGTTTGTTGTTACAGAATTTGAAATG AGTGTTAGGATTGGGAATGCGTTGGTGGATATGTTCTGTAAATGTGGGTGTCTCGATAAG GCTAGAGCGGTTTTCGATTCGATGAGAGACAAGAATGTTAAGTGTTGGACTAGTATGGTT TTTGGGTATGTTAGTACTGGTAGGATTGATGAGGCTAGAGTTTTGTTTGAGAGAAGTCCT GTAAAGGATGTTGTTTTGTGGACAGCTATGATGAATGGGTATGTTCAGTTTAACCGGTTT GATGAGGCATTGGAACTGTTCAGGTGCATGCAAACTGCGGGAATTAGGCCGGATAATTTC GTGCTAGTCTCTCTCTTGACAGGTTGCGCGCAAACGGGAGCTTTAGAGCAAGGAAAATGG ATTCATGGGTACATAAATGAGAACAGGGTTACAGTAGATAAAGTAGTTGGTACTGCTCTT GTAGACATGTATGCAAAATGTGGATGCATTGAGACAGCTCTAGAGGTTTTCTATGAAATA AAGGAGAGAGACACAGCTTCGTGGACATCACTTATCTACGGTCTTGCGATGAACGGGATG TCAGGAAGAGCGCTGGACTTGTATTACGAAATGGAAAATGTTGGTGTTAGACTAGACGCT ATAACATTTGTCGCGGTTTTAACAGCTTGCAATCATGGTGGATTTGTAGCAGAAGGCCGT AAGATTTTCCATTCGATGACCGAAAGACATAACGTCCAGCCTAAATCAGAGCACTGCAGC TGTCTGATTGACCTACTATGCAGAGCTGGTTTGTTAGATGAAGCAGAGGAATTGATAGAT AAGATGCGTGGTGAAAGCGATGAAACTCTAGTTCCTGTATACTGTTCTTTACTTAGTGCT GCTAGGAACTATGGGAATGTAAAAATAGCAGAACGGGTAGCGGAAAAGCTTGAGAAAGTG GAAGTAAGTGATTCCAGTGCTCATACTCTGCTTGCAAGTGTATATGCATCTGCTAATAGA TGGGAAGATGTAACTAATGTGAGAAGGAAAATGAAAGATTTGGGAATCAGAAAGTTTCCT GGTTGCAGCTCCATCGAGATTGATGGGGTTGGTCATGAGTTTATTGTTGGAGATGATCTA TTATCACACCCAAAAATGGATGAGATCAACTCAATGCTGCATCAAACGACAAATTTGATG TTGGATTTGGAACATAAAGAAATTGATAGCTGAAACTTTCTTCTTCTCTGTAAC