Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G28440.1
CDS Infomation	\| HAESA-like 1 \| Chr1:9996914-10000171 FORWARD LENGTH=2991 \| 201606
Sequence	ATGTATCTTCTCTTTCTCTTCTTACTTTTCCCCACCGTCTTCTCTCTTAACCAAGACGGT TTCATTCTTCAACAAGTCAAGCTCTCGTTAGACGACCCAGACTCATATCTCTCTTCCTGG AACTCCAACGATGCTTCTCCTTGTCGGTGGTCCGGCGTTTCCTGCGCCGGTGATTTCTCC TCCGTCACTTCCGTAGACCTCTCCAGCGCTAATCTCGCCGGACCTTTTCCTTCAGTCATT TGTCGTCTCTCTAATCTGGCTCATCTCTCTTTGTACAATAACTCCATCAACTCTACTCTT CCTCTCAACATCGCTGCTTGTAAGAGTCTTCAAACTCTCGATCTCTCTCAGAATCTACTC ACCGGTGAGCTTCCACAAACTCTTGCCGATATTCCGACTTTGGTTCACTTAGATTTGACC GGTAACAACTTTTCCGGTGACATTCCGGCGAGTTTCGGCAAATTCGAAAACCTAGAGGTT CTTTCTCTTGTTTACAATCTCTTAGACGGTACGATTCCTCCGTTTCTCGGCAACATCAGC ACGTTGAAGATGCTGAATCTTTCGTATAACCCCTTTAGTCCGAGTCGGATCCCGCCGGAG TTCGGGAACTTGACGAATCTCGAGGTTATGTGGCTCACTGAGTGTCATTTAGTCGGACAG ATCCCTGACTCGCTGGGTCAACTCAGTAAACTCGTTGATTTAGACCTTGCGCTCAACGAC CTTGTAGGTCATATTCCTCCTTCGCTCGGTGGTTTGACTAACGTCGTTCAGATTGAGCTG TACAACAACTCGTTGACCGGAGAGATTCCACCGGAGCTCGGGAATTTGAAATCGTTGAGA CTTCTCGACGCGTCGATGAATCAGTTAACCGGGAAAATACCGGACGAGCTTTGCCGTGTG CCGTTGGAGAGTTTGAATCTCTACGAGAACAATCTAGAAGGTGAGCTTCCGGCGAGTATA GCGTTATCTCCGAACTTGTACGAGATTAGAATATTCGGAAACCGGTTAACCGGTGGATTA CCAAAAGACCTCGGTCTAAACTCGCCGTTGAGATGGTTGGATGTTTCGGAAAACGAATTT TCCGGCGACTTACCGGCGGATCTGTGTGCGAAAGGAGAGCTAGAGGAGTTGTTGATTATA CACAATTCCTTCTCCGGCGTTATACCGGAGAGTCTCGCCGATTGCAGGAGCTTGACACGT ATCCGGTTAGCTTATAACCGGTTTTCCGGTTCAGTTCCTACAGGTTTCTGGGGATTGCCT CATGTTAACTTGCTTGAGCTCGTCAACAACTCGTTCTCCGGTGAAATTTCGAAGTCCATT GGAGGTGCTTCAAATCTCTCGCTGTTGATTCTCTCCAACAATGAATTCACCGGATCTTTG CCGGAGGAAATTGGTTCTTTGGATAATCTTAATCAGTTGTCGGCAAGTGGGAACAAGTTC AGTGGCTCGTTGCCTGATAGCTTGATGAGTCTTGGAGAATTAGGTACTCTTGATCTTCAT GGTAATCAGTTTTCAGGAGAGTTAACTTCTGGAATCAAATCTTGGAAGAAGCTCAACGAG TTAAACTTAGCCGATAACGAATTCACCGGTAAAATTCCAGATGAAATCGGGAGTTTGTCA GTATTGAACTATCTTGATCTTTCTGGTAACATGTTCTCTGGCAAGATCCCGGTTTCATTG CAGAGTTTGAAGCTAAACCAGCTGAATCTGTCTTATAACCGGTTATCGGGTGACTTACCG CCTTCTTTAGCGAAAGATATGTATAAGAATAGCTTCATTGGGAACCCGGGATTGTGTGGG GATATCAAGGGATTGTGTGGCTCTGAGAATGAAGCTAAGAAGAGAGGCTATGTATGGCTT CTTAGATCGATTTTCGTACTTGCTGCGATGGTGCTTCTTGCGGGTGTTGCTTGGTTCTAC TTCAAGTACAGGACTTTCAAGAAAGCAAGAGCCATGGAGAGATCTAAGTGGACTCTAATG TCGTTCCACAAACTCGGGTTCAGTGAGCATGAGATTCTTGAAAGCTTGGATGAAGATAAT GTGATTGGAGCTGGAGCTTCAGGTAAAGTTTACAAGGTTGTACTCACCAATGGGGAAACT GTTGCGGTTAAGCGTTTATGGACAGGTTCTGTTAAGGAAACTGGAGATTGTGATCCAGAG AAAGGTTACAAACCTGGAGTTCAAGATGAGGCTTTTGAAGCTGAAGTTGAGACATTGGGT AAGATTAGGCATAAGAACATTGTGAAGCTATGGTGTTGCTGTTCTACAAGAGACTGCAAG CTCTTGGTTTATGAGTACATGCCTAATGGTAGTTTGGGAGATTTGCTTCATAGCAGTAAA GGAGGAATGTTGGGATGGCAAACGAGGTTTAAGATTATCTTAGATGCGGCTGAGGGGCTT TCGTATCTTCACCATGATTCTGTTCCTCCGATTGTGCATAGAGATATTAAGTCAAACAAT ATTTTGATCGATGGAGATTATGGTGCAAGAGTTGCTGATTTTGGTGTGGCTAAAGCTGTC GACTTGACCGGAAAAGCTCCTAAATCGATGTCAGTGATCGCTGGTTCATGCGGTTATATC GCACCAGAATACGCATATACGCTTCGTGTGAACGAGAAAAGCGACATCTACAGTTTCGGG GTAGTGATCCTTGAGATAGTAACTAGGAAACGCCCGGTTGATCCAGAACTTGGGGAGAAG GATTTGGTGAAGTGGGTTTGCTCTACATTGGACCAAAAAGGCATAGAGCATGTGATAGAC CCGAAACTCGACTCTTGTTTCAAAGAAGAGATAAGCAAAATCCTCAACGTTGGACTCCTC TGCACGAGTCCGTTGCCCATTAACCGACCTTCCATGAGGCGTGTGGTTAAGATGTTGCAA GAAATTGGTGGTGGAGACGAAGATAGCCTACACAAGATAAGAGATGACAAGGATGGCAAG TTAACACCTTATTACAACGAAGACACCTCAGACCAAGGAAGTATAGCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G28440.1
PEP Infomation	\| HAESA-like 1 \| Chr1:9996914-10000171 FORWARD LENGTH=996 \| 201606
Sequence	MYLLFLFLLFPTVFSLNQDGFILQQVKLSLDDPDSYLSSWNSNDASPCRWSGVSCAGDFS SVTSVDLSSANLAGPFPSVICRLSNLAHLSLYNNSINSTLPLNIAACKSLQTLDLSQNLL TGELPQTLADIPTLVHLDLTGNNFSGDIPASFGKFENLEVLSLVYNLLDGTIPPFLGNIS TLKMLNLSYNPFSPSRIPPEFGNLTNLEVMWLTECHLVGQIPDSLGQLSKLVDLDLALND LVGHIPPSLGGLTNVVQIELYNNSLTGEIPPELGNLKSLRLLDASMNQLTGKIPDELCRV PLESLNLYENNLEGELPASIALSPNLYEIRIFGNRLTGGLPKDLGLNSPLRWLDVSENEF SGDLPADLCAKGELEELLIIHNSFSGVIPESLADCRSLTRIRLAYNRFSGSVPTGFWGLP HVNLLELVNNSFSGEISKSIGGASNLSLLILSNNEFTGSLPEEIGSLDNLNQLSASGNKF SGSLPDSLMSLGELGTLDLHGNQFSGELTSGIKSWKKLNELNLADNEFTGKIPDEIGSLS VLNYLDLSGNMFSGKIPVSLQSLKLNQLNLSYNRLSGDLPPSLAKDMYKNSFIGNPGLCG DIKGLCGSENEAKKRGYVWLLRSIFVLAAMVLLAGVAWFYFKYRTFKKARAMERSKWTLM SFHKLGFSEHEILESLDEDNVIGAGASGKVYKVVLTNGETVAVKRLWTGSVKETGDCDPE KGYKPGVQDEAFEAEVETLGKIRHKNIVKLWCCCSTRDCKLLVYEYMPNGSLGDLLHSSK GGMLGWQTRFKIILDAAEGLSYLHHDSVPPIVHRDIKSNNILIDGDYGARVADFGVAKAV DLTGKAPKSMSVIAGSCGYIAPEYAYTLRVNEKSDIYSFGVVILEIVTRKRPVDPELGEK DLVKWVCSTLDQKGIEHVIDPKLDSCFKEEISKILNVGLLCTSPLPINRPSMRRVVKMLQ EIGGGDEDSLHKIRDDKDGKLTPYYNEDTSDQGSIA

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G28440.1
Transcript Infomation	\| HAESA-like 1 \| Chr1:9996713-10000455 FORWARD LENGTH=3476 \| 201606
Sequence	TGATAGTAGAAAAACAAATGATTTTTATAGCATTCACAGTCAGAGTCACGATAATTCACC TGTCTCCGGTCAACGCTTTTTATAGACTCTCTTCTTCTCTTCCTTCAAAGCACTCTCTCA CAAACACTCTCTTCTTCATACTCTCTTATCTCTCTCTCTTTCTTCAACCACCGTCATAGA TACCGGGGAAGACGAAGAAACATGTATCTTCTCTTTCTCTTCTTACTTTTCCCCACCGTC TTCTCTCTTAACCAAGACGGTTTCATTCTTCAACAAGTCAAGCTCTCGTTAGACGACCCA GACTCATATCTCTCTTCCTGGAACTCCAACGATGCTTCTCCTTGTCGGTGGTCCGGCGTT TCCTGCGCCGGTGATTTCTCCTCCGTCACTTCCGTAGACCTCTCCAGCGCTAATCTCGCC GGACCTTTTCCTTCAGTCATTTGTCGTCTCTCTAATCTGGCTCATCTCTCTTTGTACAAT AACTCCATCAACTCTACTCTTCCTCTCAACATCGCTGCTTGTAAGAGTCTTCAAACTCTC GATCTCTCTCAGAATCTACTCACCGGTGAGCTTCCACAAACTCTTGCCGATATTCCGACT TTGGTTCACTTAGATTTGACCGGTAACAACTTTTCCGGTGACATTCCGGCGAGTTTCGGC AAATTCGAAAACCTAGAGGTTCTTTCTCTTGTTTACAATCTCTTAGACGGTACGATTCCT CCGTTTCTCGGCAACATCAGCACGTTGAAGATGCTGAATCTTTCGTATAACCCCTTTAGT CCGAGTCGGATCCCGCCGGAGTTCGGGAACTTGACGAATCTCGAGGTTATGTGGCTCACT GAGTGTCATTTAGTCGGACAGATCCCTGACTCGCTGGGTCAACTCAGTAAACTCGTTGAT TTAGACCTTGCGCTCAACGACCTTGTAGGTCATATTCCTCCTTCGCTCGGTGGTTTGACT AACGTCGTTCAGATTGAGCTGTACAACAACTCGTTGACCGGAGAGATTCCACCGGAGCTC GGGAATTTGAAATCGTTGAGACTTCTCGACGCGTCGATGAATCAGTTAACCGGGAAAATA CCGGACGAGCTTTGCCGTGTGCCGTTGGAGAGTTTGAATCTCTACGAGAACAATCTAGAA GGTGAGCTTCCGGCGAGTATAGCGTTATCTCCGAACTTGTACGAGATTAGAATATTCGGA AACCGGTTAACCGGTGGATTACCAAAAGACCTCGGTCTAAACTCGCCGTTGAGATGGTTG GATGTTTCGGAAAACGAATTTTCCGGCGACTTACCGGCGGATCTGTGTGCGAAAGGAGAG CTAGAGGAGTTGTTGATTATACACAATTCCTTCTCCGGCGTTATACCGGAGAGTCTCGCC GATTGCAGGAGCTTGACACGTATCCGGTTAGCTTATAACCGGTTTTCCGGTTCAGTTCCT ACAGGTTTCTGGGGATTGCCTCATGTTAACTTGCTTGAGCTCGTCAACAACTCGTTCTCC GGTGAAATTTCGAAGTCCATTGGAGGTGCTTCAAATCTCTCGCTGTTGATTCTCTCCAAC AATGAATTCACCGGATCTTTGCCGGAGGAAATTGGTTCTTTGGATAATCTTAATCAGTTG TCGGCAAGTGGGAACAAGTTCAGTGGCTCGTTGCCTGATAGCTTGATGAGTCTTGGAGAA TTAGGTACTCTTGATCTTCATGGTAATCAGTTTTCAGGAGAGTTAACTTCTGGAATCAAA TCTTGGAAGAAGCTCAACGAGTTAAACTTAGCCGATAACGAATTCACCGGTAAAATTCCA GATGAAATCGGGAGTTTGTCAGTATTGAACTATCTTGATCTTTCTGGTAACATGTTCTCT GGCAAGATCCCGGTTTCATTGCAGAGTTTGAAGCTAAACCAGCTGAATCTGTCTTATAAC CGGTTATCGGGTGACTTACCGCCTTCTTTAGCGAAAGATATGTATAAGAATAGCTTCATT GGGAACCCGGGATTGTGTGGGGATATCAAGGGATTGTGTGGCTCTGAGAATGAAGCTAAG AAGAGAGGCTATGTATGGCTTCTTAGATCGATTTTCGTACTTGCTGCGATGGTGCTTCTT GCGGGTGTTGCTTGGTTCTACTTCAAGTACAGGACTTTCAAGAAAGCAAGAGCCATGGAG AGATCTAAGTGGACTCTAATGTCGTTCCACAAACTCGGGTTCAGTGAGCATGAGATTCTT GAAAGCTTGGATGAAGATAATGTGATTGGAGCTGGAGCTTCAGGTAAAGTTTACAAGGTT GTACTCACCAATGGGGAAACTGTTGCGGTTAAGCGTTTATGGACAGGTTCTGTTAAGGAA ACTGGAGATTGTGATCCAGAGAAAGGTTACAAACCTGGAGTTCAAGATGAGGCTTTTGAA GCTGAAGTTGAGACATTGGGTAAGATTAGGCATAAGAACATTGTGAAGCTATGGTGTTGC TGTTCTACAAGAGACTGCAAGCTCTTGGTTTATGAGTACATGCCTAATGGTAGTTTGGGA GATTTGCTTCATAGCAGTAAAGGAGGAATGTTGGGATGGCAAACGAGGTTTAAGATTATC TTAGATGCGGCTGAGGGGCTTTCGTATCTTCACCATGATTCTGTTCCTCCGATTGTGCAT AGAGATATTAAGTCAAACAATATTTTGATCGATGGAGATTATGGTGCAAGAGTTGCTGAT TTTGGTGTGGCTAAAGCTGTCGACTTGACCGGAAAAGCTCCTAAATCGATGTCAGTGATC GCTGGTTCATGCGGTTATATCGCACCAGAATACGCATATACGCTTCGTGTGAACGAGAAA AGCGACATCTACAGTTTCGGGGTAGTGATCCTTGAGATAGTAACTAGGAAACGCCCGGTT GATCCAGAACTTGGGGAGAAGGATTTGGTGAAGTGGGTTTGCTCTACATTGGACCAAAAA GGCATAGAGCATGTGATAGACCCGAAACTCGACTCTTGTTTCAAAGAAGAGATAAGCAAA ATCCTCAACGTTGGACTCCTCTGCACGAGTCCGTTGCCCATTAACCGACCTTCCATGAGG CGTGTGGTTAAGATGTTGCAAGAAATTGGTGGTGGAGACGAAGATAGCCTACACAAGATA AGAGATGACAAGGATGGCAAGTTAACACCTTATTACAACGAAGACACCTCAGACCAAGGA AGTATAGCTTGAGACACAAATGGAGAAAGAAAAGTGTTTTGCCCAAAAAAGCTCTCTCAA TTTTTGGTGCTTGAAGCTGTCAATTTAGGGCATTGAATCAAGATTCTCTCACCCCTTTTT AGGGTTTTGATCTAAAAGTGAGAATCAGAGATTGTCGAAATTTTTATAATATATATAAAG AAGTTTCTAATTCAGCGTTTCAGTTTCTCCACTGTATAAAGCTATTAGTAAACTCTGGTT TTGTAAGAGTTTTTATCTTTGGTAAATGCAAATGAAAAAGTTGCGATCTTTCTGGC